FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1894.ptfa, 2796 aa vs ./tmplib.26680 library 1766221 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7478+/-0.0046; mu= 21.4046+/- 0.308 mean_var=94.9352+/-21.182, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1316 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 45, opt: 33, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1884 ( 1806 res) mib34059 (1806) 4996 961 0 mKIAA1890 ( 875 res) mbg14487 ( 875) 3082 597 9.1e-171 mKIAA0927 ( 713 res) mbg08305 ( 713) 850 173 3.2e-43 mKIAA4158 ( 761 res) mfj68139 ( 761) 768 158 1.6e-38 mKIAA0534 ( 1444 res) mpf00179 (1444) 252 60 7.5e-09 mKIAA4159 ( 511 res) mid27006 ( 511) 190 48 1.4e-05 mKIAA0815 ( 835 res) mpm01062 ( 835) 144 39 0.008 >>mKIAA1884 ( 1806 res) mib34059 (1806 aa) initn: 8495 init1: 4996 opt: 4996 Z-score: 5119.0 bits: 961.0 E(): 0 Smith-Waterman score: 7486; 57.753% identity (60.220% ungapped) in 1709 aa overlap 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::::::::.::.::.: mKIAA1 QWNVSAPTCVVPCGGNLTERRGTILSPGFPEPYLNSLNCVWKIMVPEGAGIQIQVISFVT 720 730 740 750 760 770 1080 1090 1100 1110 1120 1130 mKIAA1 EHNWDSLDFYDGGDNNAPRLGSYSGTTIPHLLNSTSNNLYLNFQSDISVSAAGFHLEYTA :.:::::. .::.::.. :::.::::.: :::::::.:::.: :::::::::::::: . mKIAA1 EQNWDSLEVFDGADNTVTMLGSFSGTTVPALLNSTSNQLYLHFYSDISVSAAGFHLEYKT 780 790 800 810 820 830 1140 1150 1160 1170 1180 1190 mKIAA1 IGLDSCPEPQTPSSGIKVGDRYMVGDVVSFQCDQGYSLQGHSHITCMPGPVRRWNYPIPI .::.::::: .::.:.:.:.::.:.:::::::. ::.::::.::.:::: ::::::: :. mKIAA1 VGLSSCPEPAVPSNGVKTGERYLVNDVVSFQCEPGYALQGHAHISCMPGTVRRWNYPPPL 840 850 860 870 880 890 1200 1210 1220 1230 1240 1250 mKIAA1 CLAQCGGAMSDFSGVILSPGFPGNYPSSLDCTWTIKLPIGFGVHLQFVNFSTETIHDYLE :.::::::. .. ::::::::::::::..::.: :.::.:::.:.::.::::: ::.:: mKIAA1 CIAQCGGAVEEMEGVILSPGFPGNYPSNMDCSWKISLPVGFGAHIQFLNFSTEPNHDFLE 900 910 920 930 940 950 1260 1270 1280 1290 1300 1310 mKIAA1 VRSGSSEISTVIGRLSGPQIPSSLFSTTHETSLYFHSDYSQNKQGFHIVYQAYQLQSCPD .::: :: : ..::.:: ..:.::.::.:.. .:::::.:::. ::.. ::::.:: ::: mKIAA1 IRSGPSETSRMMGRFSGSELPGSLLSTSHDSIVYFHSDHSQNRPGFKLEYQAYELQECPD 960 970 980 990 1000 1010 1320 1330 1340 1350 1360 1370 mKIAA1 PRPFRNGFVIGNDFTVGQTISFECFPGYTLIGNSALTCLHGVSRNWNHPLPRCEALCGGN :.:: ::.: : ..:::...:::.::: : :. .::: ::..:::.:::::::. :::: mKIAA1 PEPFANGIVRGAGYNVGQSVTFECLPGYQLTGQPVLTCQHGTNRNWDHPLPRCEVPCGGN 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1380 1390 1400 1410 1420 1430 mKIAA1 ITAMNGTIYSPGYPDEYPNFQDCFWLVRVPPGNGIYINFTVLQTEPIYDFITVWDGPDQN ::..:::.::::::. : . ::: : . :: :.:...:...:: ::. :.:::::::.:. mKIAA1 ITSFNGTVYSPGYPSPYSSSQDCVWQITVPIGHGVHLNLSLLQIEPFGDYITVWDGPQQT 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1440 1450 1460 1470 1480 1490 mKIAA1 SPQIGQFSGNTALESVYSTSNQILIKFHSDFTTSGFFVLSYHAYQLRVCQPPPPVPNAEI : :.: :. . . . ..:.:::.:.::: : .:.:.:.... :: : : :: .::::. mKIAA1 SLQLGVFTRSLSKKIAHSSSNQVLLKFHRDTATGGIFAIAFSAYPLTKCPPPTILPNAEV 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1500 1510 1520 1530 1540 1550 mKIAA1 LTEDDEFEIGDIIRYQCLPGFTLVGNAILTCRLGERLQMDGAPPVCQVLCPANELRLDST .::..::.::::.::.:::::::::. ::::.:: ::..: ::.:.: ::.::: ::: mKIAA1 VTENEEFNIGDIVRYRCLPGFTLVGSEILTCKLGTYLQFEGPPPICEVHCPTNELLTDST 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1560 1570 1580 1590 1600 1610 mKIAA1 GVILSPGYPDSYPNLQMCAWSISVEKGYNISMFVEFFQTEKEFDVLQVYDGPNIQSPVLI ::::: .:: :::..: :.: . :: ::::. ::.: .::..: ....:::. :::.: mKIAA1 GVILSQSYPGSYPQFQTCSWLVRVEPEYNISITVEYFLSEKQYDEFEIFDGPSGQSPLLK 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1620 1630 1640 1650 1660 1670 mKIAA1 SLSGDYSAAFNVTSNGHEVFLQWSADHGNNKKGFRIRYIAFYCSTPESPPHGYIISQTGG .:::.::: . :::... :.:.::.::. :.:::.::: : ::: :..: ::.:..:: mKIAA1 ALSGNYSAPLIVTSSSNSVYLRWSSDHAYNRKGFKIRYSAPYCSLPKAPLHGFILGQTTT 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1680 1690 1700 1710 1720 1730 mKIAA1 QLNSVVRWACDRGFRLVGKSSAVCRKSSYGYHSWDAPVPACQAISCGIPKAPTNGGILTT : .. ....:. :.::::.: :.: . ::: :. .: :::.:::.: :: :: .. mKIAA1 QPGGSIHFGCNTGYRLVGHSMAICTRHPQGYHLWSEAIPLCQALSCGLPDAPKNGIVFGK 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1740 1750 1760 1770 1780 1790 mKIAA1 DYLVGTRVTYFCNDGYRLSSKELTTATCQSDGTWSNHNKTPRCVVVTCPSINSFTLDHGR .: :::...: ::.::.:.. .:: : . : ::: : :.:: ::::.:.:....::: mKIAA1 EYTVGTKAVYSCNEGYHLQAGAEATAECLDTGLWSNSNVPPQCVPVTCPDISSISVEHGR 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1800 1810 1820 1830 1840 1850 mKIAA1 WRIVNGSHYEYKTKVVFSCDPGYHGLGPASIECLPNGTWSWRTERPYCQIISCGELPTPP ::.. ..:........ :::::. : :.: :: :: : ::::::::::::: mKIAA1 WRLIFETQYQFQAQLMLICDPGYYYTGQRVIRCQANGRWSLGESMPTCQIISCGELPTPP 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1860 1870 1880 1890 1900 1910 mKIAA1 NGNKIGTQTSYGSTAIFTCDLGFMLVGSAVRECLSSGLWSGSETRCLAGHCGIPELIVNG .:..:::.. ::.::::.:. :. :::: ::::...:::::::.:::::::: :: :::: mKIAA1 SGHRIGTMSVYGATAIFSCNSGYTLVGSRVRECMANGLWSGSEVRCLAGHCGTPEPIVNG 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1920 1930 1940 1950 1960 1970 mKIAA1 QVIGENYGYRDTVVYQCNPGFRLIGSSVRICQQDHNWSGQLPSCVPVSCGHPGSPIYGRT .. :::..:: .::::: :::::: :::::::::.:::. : :::..:::::.:. : : mKIAA1 HINGENFNYRGSVVYQCRAGFRLIGMSVRICQQDHHWSGKTPFCVPITCGHPGNPVNGLT 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1980 1990 2000 2010 2020 2030 mKIAA1 SGNGFNFNDVVTFSCNIGYLMQGPTKAQCQANRQWSHPPPVCKVVNCSDPGIPANSKRES .:. ::.:::: : :: ::. .: ...:: :. ::: :.:...::.::: :: :. mKIAA1 QGSQFNLNDVVKFICNPGYIAEGAARSQCLASGQWSDTLPTCRIINCTDPGHQENSVRQV 1680 1690 1700 1710 1720 1730 2040 2050 2060 2070 2080 2090 mKIAA1 KIEHGNFTYGTVVFYDCNPGYFLFGSSVLICQPNGQWDKPLPECIMIDCGHPGIPPNAVL mKIAA1 HTSGPHRLSPSPTIPVSTTSIPRGKKKSKTKTKKKSFVQRYIFIIQSLYSTKKRQEKKVY 1740 1750 1760 1770 1780 1790 >>mKIAA1890 ( 875 res) mbg14487 (875 aa) initn: 3849 init1: 2415 opt: 3082 Z-score: 3158.2 bits: 597.2 E(): 9.1e-171 Smith-Waterman score: 3818; 56.872% identity (58.506% ungapped) in 895 aa overlap (1904-2796:4-875) 1880 1890 1900 1910 1920 1930 mKIAA1 CDLGFMLVGSAVRECLSSGLWSGSETRCLAGHCGIPELIVNGQVIGENYGYRDTVVYQCN :::: :. ::::.. :....:::::::::: mKIAA1 ATPGHCGSPDPIVNGHISGDGFSYRDTVVYQCN 10 20 30 1940 1950 1960 1970 1980 1990 mKIAA1 PGFRLIGSSVRICQQDHNWSGQLPSCVPVSCGHPGSPIYGRTSGNGFNFNDVVTFSCNIG :::::.:.::::: :::.:::: : :::..:::::.: .: :.:. ::.::.:.:.:. : mKIAA1 PGFRLVGTSVRICLQDHKWSGQTPVCVPITCGHPGNPAHGLTNGTEFNLNDLVNFTCHTG 40 50 60 70 80 90 2000 2010 2020 2030 2040 2050 mKIAA1 YLMQGPTKAQCQANRQWSHPPPVCKVVNCSDPGIPANSKRESKIEHG-NFTYGTVVFYDC : .:: ..:::..: ::: : :.:.:::::::: :. :... . .: ::: :.: : mKIAA1 YRLQGASRAQCRSNGQWSSPLPICRVVNCSDPGSVENAVRHGQQNFPESFEYGTSVMYHC 100 110 120 130 140 150 2060 2070 2080 2090 2100 2110 mKIAA1 NPGYFLFGSSVLICQPNGQWDKPLPECIMIDCGHPGIPPNAVLSGEKYTFGSTVHYSCTG . :..:.:::.: :. .: ::. ::.:. :.:::::.: ::::.:: .:.:.::.::: : mKIAA1 KTGFYLLGSSALTCMASGLWDRSLPKCLAISCGHPGVPANAVLTGELFTYGATVQYSCKG 160 170 180 190 200 210 2120 2130 2140 2150 2160 2170 mKIAA1 KRSLLGQASRTCQLNGHWSGSQPHCSGDTTGTCGDPGTPGHGSRQESDFRTKSTVRFACD . : :...:.:: ..::::: :::::.. : :::::::.:::: ..:.::: .::.:. mKIAA1 GQILTGNSTRVCQEDSHWSGSLPHCSGNSPGFCGDPGTPAHGSRLGDEFKTKSLLRFSCE 220 230 240 250 260 270 2180 2190 2200 2210 2220 2230 mKIAA1 TGYILYGSEERTCLSNGSWTGRQPECKAVQCGNPGTTANGKVFRIDGTTFSSSVIYSCLE :. : :: ::::: ::::.: :: :.::.:::::: .:: .. :: :::::::.: : mKIAA1 MGHQLRGSAERTCLVNGSWSGVQPVCEAVSCGNPGTPTNGMILSSDGILFSSSVIYACWE 280 290 300 310 320 330 2240 2250 2260 2270 2280 2290 mKIAA1 GYILSGPSVRQCTANGTWSGSLPNCTIISCGDPGIPANGLRYGDDFVVGQNVSYMCQPGY :: :: .:.:::::::.:. :.:::::::::: ::...: ::. ...:::.:.::: mKIAA1 GYKTSGLMTRHCTANGTWTGTAPDCTIISCGDPGTLPNGIQFGTDFTFNKTVSYQCNPGY 340 350 360 370 380 390 2300 2310 2320 2330 2340 2350 mKIAA1 TIELNGSRVRTCTTNGTWSGVMPTCRAVTCSTPPQISNGRLEGTNFDWGFSISYICSAGY .: : . :: .:::. : :.:: :. :: . ::..::..: :: :::: : :: mKIAA1 LMEPPTSPTIRCTKDGTWNQSRPLCKAVLCNQPPPVPNGKVEGSDFRWGASISYSCVDGY 400 410 420 430 440 450 2360 2370 2380 2390 2400 2410 mKIAA1 ELSFPAVLTCVGNGTWSGEVPQCLPKFCGDPGIPSQGKREGKSFIYQSEVSFSCNSPFIL .:: :.:.: : :.:.:::::::: :::::: :..:. :::: ..::: ..:. ::.: mKIAA1 QLSHSAILSCEGRGVWKGEVPQCLPVFCGDPGTPAEGRLSGKSFTFKSEVFIQCKPPFVL 460 470 480 490 500 510 2420 2430 2440 2450 2460 2470 mKIAA1 VGSSTRLCQTDGTWSGSSPHCIEPTRTSCENPGVPRHGSQNNTFGFQVGSVVQFHCKKGH :::: : ::.:: ::: .: ::.:..:.: .::.:. : ::.. :..:::.: :.:.::. mKIAA1 VGSSRRTCQADGIWSGIQPTCIDPAHTACPDPGTPHFGIQNSSKGYEVGSTVFFRCRKGY 520 530 540 550 560 570 2480 2490 2500 2510 2520 2530 mKIAA1 LLQGSTTRTCLPDLTWSGIQPECIPHSCKQPESPAHANVVGMDLPSHGYTLIYTCQPGFF .::::::::: .::::::: :::::.:.:::.::::.: ..:::. ::::.:::.:::: mKIAA1 HIQGSTTRTCLANLTWSGIQTECIPHACRQPETPAHADVRAIDLPAFGYTLVYTCHPGFF 580 590 600 610 620 630 2540 2550 2560 2570 2580 2590 mKIAA1 LAGGTEHRVCRSDNTWTGKVPVCEAGSKILVKDPRPALGTPSPKLSVPDDVFAQNYIWKG ::::.:::.:..: :::: :::. .:.::: : .::: mKIAA1 LAGGSEHRTCKADMKWTGKSPVCK----------------------IPSDVFFINSVWKG 640 650 660 670 2600 2610 2620 2630 2640 2650 mKIAA1 SYNFKGRKQPMTLTVTSFNASTGRVNATLSN-SDMELLLSGVYKSQEARLMLHIYLIKVP :.. :..:: :::: :::....::::.. :...: :.::::..::.:.:. . :: : mKIAA1 YYEYLGKRQPATLTVDWFNATSSKVNATFTAASQVQLELTGVYKKEEAHLLLKAFHIKGP 680 690 700 710 720 730 2660 2670 2680 2690 2700 2710 mKIAA1 AHASVKKMKEENWAMDGFVSAEPDGATYVFQGFIKGKDYGQFGLQRLGLNTSEGSNSSNQ : :.:....::..::.::. . . . ::: :.:::.:.: :.: ..:. ..:::. mKIAA1 ADIFVSKFENDNWGLDGYVSSGLERGGFSFQGDIHGKDFGKFKLERQDPSNSD-ADSSNH 740 750 760 770 780 790 2720 2730 2740 2750 2760 2770 mKIAA1 PHGTNSSSVAIAILVPFFALIFAGFGFYLYKQRTAPKTQYTGCSVHENNNGQAAFENPMY .::.:.::: ::::::::::..::.:::::.:: ::.::.: . :::.::::.:::::: mKIAA1 YQGTSSGSVAAAILVPFFALILSGFAFYLYKHRTRPKVQYNGYAGHENSNGQASFENPMY 800 810 820 830 840 850 2780 2790 mKIAA1 DTNAKSVEGKAVRFDPNLNTVCTMV ::: : .:.:::::: .::::::.: mKIAA1 DTNLKPTEAKAVRFDTTLNTVCTVV 860 870 >>mKIAA0927 ( 713 res) mbg08305 (713 aa) initn: 318 init1: 206 opt: 850 Z-score: 868.4 bits: 173.2 E(): 3.2e-43 Smith-Waterman score: 902; 30.175% identity (32.150% ungapped) in 570 aa overlap (1028-1578:35-588) 1000 1010 1020 1030 1040 1050 mKIAA1 ILHGSRAIRCETVPNSLAQWNDSLPTCIVPCGGILTKRKGTILSPGYP-EPYDNNLNCVW :: .. .: : : .: .::.. :.:.. mKIAA0 TGSASEESQETTTSTIVTTTIITTEQAPALCGVSFSDPEGYIDSSDFPPQPYSSFLECTY 10 20 30 40 50 60 1060 1070 1080 1090 1100 1110 mKIAA1 KITVPEGAGIQVQVVSFA-TEHNWDSLDFYDGGDNNAPRLGSYSGTTI---PHLLNSTSN ..:: : :...:: : .: . :. :: : : .. :. ... : .: mKIAA0 NVTVYTGYGVELQVKSVNLSEGELLSIRGVDG-----PTLTVLANQTLLVEGQVIRSPTN 70 80 90 100 110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 mKIAA1 NLYLNFQSDISVSAAGFHLEYTAIGLDSCPEPQTPSSG-IKVGDRYMVGDVVSFQCDQGY .. . :.. . . . :.:.: :. : ::: :. :..: . : : . : :. :.: :: mKIAA0 TISVYFRTFQDDGLGTFQLHYQAFML-SCPFPRRPDAGEVTVMDLHS-GGVAHFHCHLGY 120 130 140 150 160 170 1180 1190 1200 1210 1220 1230 mKIAA1 SLQGHSHITCMPGPVRRWNYPIPICLAQCGGAMSDFS-GVILSPGFPGNYPSSLDCTWTI ::: . .::. . .:. :.: : ::::. . . : .:::.:::. .: :.::: mKIAA0 ELQGAKTLTCINASKPHWSSQEPVCSAPCGGAVHNATIGRVLSPSFPGTANGSQLCVWTI 180 190 200 210 220 230 1240 1250 1260 1270 1280 mKIAA1 KLPIGFGVHLQFVNFSTETIHDYLEVRSGSSEISTVI-GRLSGPQIP-SSLFSTTHETSL . : : .::.. . . .: . : :: .. :... : ..: .:.: . mKIAA0 EAPEGQKLHLHLERLLLHE-KDRMIVYSGRTNTSALLYDSLRTESVPFEGLLSEGSSIRI 240 250 260 270 280 290 1290 1300 1310 1320 1330 1340 mKIAA1 YFHSDYSQNKQGFHIVYQAYQLQSCPDPRPFRNGFVIGND--FTVGQTISFECFPGYTL- : :: .: ..:.: ..:.. : .: ..:: .: ...: . : : ::..: mKIAA0 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:. : : .: . : .::. .. : mKIAA4 HQAALRFQSLPLPAGPGTFHFRYQAYLLS-CHFPRRPAYGDVTVTSLHPGGSAHFH-CAT 100 110 120 130 140 150 550 560 570 580 590 600 mKIAA1 GYTLHGSSLLKCMTGERRAWDYPLPSCIAECGGRFKGESSGRILSPGYPFPYDNNLRCMW :: :.:. .: :... . :: : ::: ::: ... ..:::.:::.: :.::: : : mKIAA4 GYQLKGARFLTCLNATQPFWDSQEPVCIAACGGVIRNATTGRIVSPGFPGNYSNNLTCHW 160 170 180 190 200 210 610 620 630 640 650 mKIAA1 MIEVDPGNIVSLQFLAFDTEASHDILRVWDG-----PPENEMLLKEVSGSLIPDGIHSTL ..:. .. . :.: . . : : . .: :: . : : .:. :. mKIAA4 LLEAPESQRLHLHFEKVSLAEDDDRLIIRNGNNVEAPPVYDSYEVEY---LPIEGLLSSG 220 230 240 250 260 660 670 680 690 700 710 mKIAA1 NIVTIQFDTDFYISKSGFAIQFSSSVATACRDPGVPMNGTRNGDGREP-GDTVVFQCDPG ..:.:: . .:.:... . : .: : ... .. : : :: :.:::: mKIAA4 RHFFVEFSTDSSGAAAGMALRYEAFQQGHCYEPFVKYGNFSSSAPSYPVGTTVEFSCDPG 270 280 290 300 310 320 720 730 740 750 760 770 mKIAA1 YEL-QGQERITCIQVENRYFWQPSPPVCIAPCGGNLTGSSGFILSPNFPHPYPHSRDCDW : : ::. : :..... :. . :.: : :.:..: :.: .::::.:.:: ...:: : mKIAA4 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