# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mbe05005.fasta.nr -Q ../query/mKIAA0381.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA0381, 1032 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7896846 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5881+/-0.000209; mu= 8.6525+/- 0.012 mean_var=160.6905+/-30.796, 0's: 41 Z-trim: 104 B-trim: 427 in 1/65 Lambda= 0.101176 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|114607301|ref|XP_518453.2| PREDICTED: dishevell (1184) 3868 577.6 1.3e-161 gi|73972767|ref|XP_538904.2| PREDICTED: similar to (1067) 3846 574.3 1.1e-160 gi|73972769|ref|XP_864808.1| PREDICTED: similar to (1068) 3837 573.0 2.8e-160 gi|224047044|ref|XP_002186640.1| PREDICTED: dishev (1009) 3324 498.1 9.4e-138 gi|109486649|ref|XP_001062791.1| PREDICTED: simila (1064) 3156 473.6 2.3e-130 gi|73963066|ref|XP_865040.1| PREDICTED: similar to (1059) 2834 426.6 3.3e-116 gi|73963070|ref|XP_865077.1| PREDICTED: similar to (1058) 2812 423.4 3e-115 gi|73963072|ref|XP_547836.2| PREDICTED: similar to (1068) 2804 422.2 6.9e-115 gi|109083786|ref|XP_001093729.1| PREDICTED: simila (1058) 2803 422.1 7.6e-115 gi|40675526|gb|AAH64999.1| DAAM1 protein [Homo sap (1068) 2800 421.6 1e-114 gi|109083788|ref|XP_001093489.1| PREDICTED: simila ( 923) 2795 420.8 1.6e-114 gi|109083782|ref|XP_001093054.1| PREDICTED: simila (1068) 2795 420.9 1.7e-114 gi|158257012|dbj|BAF84479.1| unnamed protein produ (1068) 2789 420.0 3.1e-114 gi|149737146|ref|XP_001497307.1| PREDICTED: dishev (1068) 2789 420.0 3.1e-114 gi|224051885|ref|XP_002200643.1| PREDICTED: dishev (1064) 2787 419.7 3.8e-114 gi|74184667|dbj|BAE27943.1| unnamed protein produc (1068) 2787 419.7 3.8e-114 gi|224051887|ref|XP_002200644.1| PREDICTED: dishev (1074) 2787 419.7 3.9e-114 gi|19353264|gb|AAH24781.1| Similar to dishevelled ( 662) 2780 418.5 5.7e-114 gi|190338424|gb|AAI63491.1| Daam1l protein [Danio (1069) 2776 418.1 1.2e-113 gi|124828497|gb|AAI33281.1| Dishevelled associated (1068) 2775 418.0 1.3e-113 gi|148691688|gb|EDL23635.1| mCG141144 [Mus musculu ( 425) 2645 398.6 3.6e-108 gi|116089318|ref|NP_001008232.2| dishevelled assoc (1115) 2592 391.3 1.5e-105 gi|158518623|sp|Q80U19.3|DAAM2_MOUSE RecName: Full (1115) 2577 389.1 6.7e-105 gi|194039214|ref|XP_001926042.1| PREDICTED: dishev ( 451) 2556 385.6 3.1e-104 gi|149069514|gb|EDM18955.1| rCG43552 [Rattus norve ( 425) 2524 380.9 7.5e-103 gi|125841467|ref|XP_707353.2| PREDICTED: dishevell (1068) 2460 372.0 9e-100 gi|29477075|gb|AAH50043.1| Daam2 protein [Mus musc ( 524) 2433 367.7 8.6e-99 gi|109485690|ref|XP_236909.4| PREDICTED: similar t (1090) 2364 358.0 1.5e-95 gi|194121758|gb|EDW43801.1| GM18987 [Drosophila se (1410) 2341 354.8 1.8e-94 gi|109071044|ref|XP_001113947.1| PREDICTED: dishev (1097) 2322 351.9 1.1e-93 gi|194039212|ref|XP_001928568.1| PREDICTED: dishev (1066) 2319 351.4 1.4e-93 gi|119915237|ref|XP_001252206.1| PREDICTED: simila (1066) 2317 351.1 1.7e-93 gi|194039210|ref|XP_001925996.1| PREDICTED: dishev ( 434) 2308 349.4 2.4e-93 gi|149732169|ref|XP_001500776.1| PREDICTED: dishev (1066) 2308 349.8 4.3e-93 gi|190691145|gb|ACE87347.1| dishevelled associated (1067) 2288 346.9 3.2e-92 gi|119624401|gb|EAX03996.1| dishevelled associated (1067) 2287 346.8 3.6e-92 gi|30268369|emb|CAD89973.1| hypothetical protein [ (1067) 2287 346.8 3.6e-92 gi|62906888|sp|Q86T65.3|DAAM2_HUMAN RecName: Full= (1068) 2287 346.8 3.6e-92 gi|119624400|gb|EAX03995.1| dishevelled associated (1077) 2287 346.8 3.6e-92 gi|118092154|ref|XP_421429.2| PREDICTED: similar t (1059) 2273 344.7 1.5e-91 gi|149069516|gb|EDM18957.1| rCG43495 [Rattus norve ( 368) 2244 340.0 1.4e-90 gi|118087983|ref|XP_419476.2| PREDICTED: similar t (1086) 2118 322.1 9.7e-85 gi|55962347|emb|CAI12056.1| novel protein similar (1079) 2096 318.9 8.9e-84 gi|109083780|ref|XP_001093607.1| PREDICTED: simila (1078) 2068 314.8 1.5e-82 gi|73963060|ref|XP_852088.1| PREDICTED: similar to (1078) 2067 314.7 1.7e-82 gi|34098767|sp|Q9Y4D1.2|DAAM1_HUMAN RecName: Full= (1078) 2065 314.4 2.1e-82 gi|158518626|sp|Q8BPM0.3|DAAM1_MOUSE RecName: Full (1077) 2056 313.0 5.1e-82 gi|49900993|gb|AAH76585.1| Dishevelled associated (1077) 2056 313.0 5.1e-82 gi|149737142|ref|XP_001497343.1| PREDICTED: dishev (1078) 2056 313.0 5.1e-82 gi|210115706|gb|EEA63456.1| hypothetical protein B (1299) 2054 312.8 7.1e-82 >>gi|114607301|ref|XP_518453.2| PREDICTED: dishevelled a (1184 aa) initn: 4523 init1: 2111 opt: 3868 Z-score: 3057.7 bits: 577.6 E(): 1.3e-161 Smith-Waterman score: 5947; 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