FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4208.ptfa, 721 aa vs ./tmplib.26680 library 1768296 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3033+/-0.00482; mu= 8.2807+/- 0.319 mean_var=145.7403+/-33.993, 0's: 0 Z-trim: 34 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1062 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1246 ( 833 res) mbj01002 ( 833) 2375 376 7e-105 mKIAA1580 ( 640 res) mbf00310 ( 640) 338 64 5.6e-11 mKIAA4141 ( 1593 res) mbg03129 (1593) 332 63 2e-10 mKIAA0416 ( 528 res) mbg05717 ( 528) 318 61 4.2e-10 mKIAA0918 ( 839 res) mfj08110 ( 839) 319 61 5.1e-10 mKIAA1163 ( 638 res) mfj27154 ( 638) 294 57 6e-09 mKIAA4111 ( 619 res) mid39041 ( 619) 293 57 6.6e-09 mKIAA1465 ( 785 res) mfj00439 ( 785) 289 57 1.2e-08 mKIAA1497 ( 721 res) mid15001 ( 721) 280 55 2.9e-08 mKIAA1910 ( 760 res) mbg21737 ( 760) 277 55 4.1e-08 mKIAA0813 ( 1557 res) mbg05377 (1557) 277 55 6.7e-08 mKIAA0230 ( 1431 res) mbg10262 (1431) 268 54 1.6e-07 mKIAA0862 ( 584 res) mpj01572 ( 584) 258 52 2.6e-07 mKIAA1469 ( 663 res) mbj00677 ( 663) 250 50 6.6e-07 mKIAA1916 ( 588 res) mbg08812 ( 588) 232 48 4.1e-06 mKIAA1851 ( 705 res) mpg00887 ( 705) 218 46 2.1e-05 mKIAA0147 ( 1694 res) mbg04389 (1694) 221 46 2.7e-05 mKIAA0644 ( 837 res) mbg06261 ( 837) 199 43 0.00017 mKIAA1437 ( 811 res) mfj00342 ( 811) 194 42 0.00029 mKIAA0231 ( 815 res) mbp00073 ( 815) 192 42 0.00036 mKIAA4018 ( 606 res) mej02761 ( 606) 189 41 0.00041 mKIAA0405 ( 637 res) mbg12039 ( 637) 173 39 0.0023 mKIAA0343 ( 1202 res) mbg04270 (1202) 173 39 0.0035 mKIAA3016 ( 714 res) mph00541 ( 714) 169 38 0.0038 mKIAA0756 ( 1251 res) mbg20669 (1251) 170 39 0.005 mFLJ00376 ( 931 res) mbg07794 ( 931) 166 38 0.0063 >>mKIAA1246 ( 833 res) mbj01002 (833 aa) initn: 1745 init1: 1178 opt: 2375 Z-score: 1975.3 bits: 376.3 E(): 7e-105 Smith-Waterman score: 2382; 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