FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0474.ptfa, 726 aa vs ./tmplib.26680 library 1768291 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2472+/-0.00537; mu= 5.8460+/- 0.356 mean_var=186.2393+/-44.248, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0940 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1039 ( 336 res) mbg02540 ( 336) 765 116 6.6e-27 mKIAA0440 ( 1510 res) mbg05561 (1510) 682 105 4.5e-23 mKIAA1389 ( 1185 res) mbh01631 (1185) 665 103 1.9e-22 mKIAA4074 ( 1099 res) mfj12253 (1099) 632 98 4e-21 mKIAA1272 ( 467 res) mic25008 ( 467) 281 50 4.7e-07 >>mKIAA1039 ( 336 res) mbg02540 (336 aa) initn: 622 init1: 443 opt: 765 Z-score: 575.4 bits: 115.9 E(): 6.6e-27 Smith-Waterman score: 765; 42.604% identity (44.582% ungapped) in 338 aa overlap (396-725:5-335) 370 380 390 400 410 420 mKIAA0 PFVPDMIASNFLHAYVVVQAEGGGPDGPLYKVSVTARDDVPFFGPPLPDPAVFRKGPEFQ .::::::.::: ::::::.: ::.:: ::. mKIAA1 NCFIQVSVTAREDVPAFGPPLPSPPVFQKGAEFR 10 20 30 430 440 450 460 470 480 mKIAA0 EFLLTKLINAEYACYKAEKFAKLEERTRAALLETLYEELHIHSQSMMGLGSDDDKMENGS ::::::: ::: :: :..::::::.:::::::..:..::: :.: :.:.: ..::.::: mKIAA1 EFLLTKLTNAENACCKSDKFAKLEDRTRAALLDNLHDELHTHTQVMLGMGPEEDKFENG- 40 50 60 70 80 90 490 500 510 520 530 mKIAA0 GGGGFFESFKRVIRSRSQSMDAMGLSNKK--PNTVSTSHSGSFTPNNPDLAKA------A : :::.:::::.:: ::.::..: :..: ... : ::... :. ...:. : mKIAA1 GHGGFLESFKRAIRVRSHSMETMVGSQRKLHGGNLPGSLSGGIVHNSMEVTKTTFSPPVA 100 110 120 130 140 150 540 550 560 570 580 590 mKIAA0 GISLIVPGKSPTRKKSGPFGSRRSSAIGIENIQEVQEKRESPPAGQKTPDSGHVSQEPKS . . ..:: ...:: : .: : :. . . . .: . ::::.:: ::: :: mKIAA1 AATAKNQSRSPIKRRSGLFPRLHS---GSEGQGDSRTRCDSASSTPKTPDGGHSSQEIKS 160 170 180 190 200 210 600 610 620 630 640 650 mKIAA0 ENSSTQSSPEMPTTKNRVESAAQRTEVLQGFSRSSSSASSFTSVVEETEGVDGDDTGLES :.::. ::::. .:.. . . ..::::::.:::.:.. : :... :.: : mKIAA1 ETSSNPSSPEICPNKEK-PFIKLKENGRANISRSSSSTSSFSSTAGEGEAMEECDSG-SS 220 230 240 250 260 660 670 680 690 700 710 mKIAA0 VSSSGTPHKRDSFLYSTWLDDSVSTTSGGSSPGLTRSPHPDVGKSGDPACPEIKIQLETS :. .: :.. : :: .: : . :... . : : .:: . ..:.... mKIAA1 QPSTTSPFKQEVFAYSP-SPSSESPSLGAAATPIIMSRSPTDAKSRNSPRSNLKFRFDKL 270 280 290 300 310 320 720 mKIAA0 EQHTPQMGC . . . : mKIAA1 SHASSSAGH 330 >>mKIAA0440 ( 1510 res) mbg05561 (1510 aa) initn: 819 init1: 423 opt: 682 Z-score: 506.6 bits: 105.4 E(): 4.5e-23 Smith-Waterman score: 746; 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