/app/bio/fasta-36.3.4/bin/fasta36 -T 2 -b50 -d10 -E1e-10 -O/www/docs/orfeome/clone/on19334/on19334.fasta.orfeome /cdna/full/known/on/on19334/on19334.ptfa /www/docs/orfeome/db/peplib 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: on19334, 787 aa 1>>>on19334 787 - 787 aa - 787 aa Library: /www/docs/orfeome/db/peplib 7456070 residues in 18318 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1567+/-0.00152; mu= 14.0782+/- 0.089 mean_var=151.2475+/-31.219, 0's: 0 Z-trim(108.8): 16 B-trim: 0 in 0/45 Lambda= 0.104287 statistics sampled from 7843 (7857) to 7843 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.75), E-opt: 0.2 (0.429), width: 16 Scan time: 1.270 The best scores are: opt bits E(18318) on19334 787 aa ( 787) 5464 834.1 0 on36628 581 aa ( 581) 545 93.9 4.6e-19 on24115 574 aa ( 574) 536 92.5 1.2e-18 on23043 585 aa ( 585) 535 92.4 1.3e-18 on15754 591 aa ( 591) 481 84.3 3.7e-16 on19383 591 aa ( 591) 481 84.3 3.7e-16 on20043 666 aa ( 666) 479 84.0 5e-16 on23006 666 aa ( 666) 479 84.0 5e-16 on35025 537 aa ( 537) 463 81.5 2.2e-15 >>on19334 787 aa (787 aa) initn: 5464 init1: 5464 opt: 5464 Z-score: 4449.2 bits: 834.1 E(18318): 0 Smith-Waterman score: 5464; 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