Miyakogusa Predicted Gene
- chr1.CM0017.200.nc
BLASTN 2.2.18 [Mar-02-2008]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= chr1.CM0017.200.nc
(2054 letters)
Database: lotus_5dash_unigene
7353 sequences; 3,026,947 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
R_KMC000940A_C01 R_KMC000940A_c01 1122 0.0
R_KMC001906A_C01 R_KMC001906A_c01 52 1e-06
>R_KMC000940A_C01 R_KMC000940A_c01
Length = 1127
Score = 1122 bits (566), Expect = 0.0
Identities = 566/566 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 505 tcaaaatgaagatgaggttgggaatagcaatactggtgtcgtttatactagtaggatggt 564
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 tcaaaatgaagatgaggttgggaatagcaatactggtgtcgtttatactagtaggatggt 60
Query: 565 gcaggggagagcaatgcggaagccaagcagggggtgctctgtgtcccggtgggatatgtt 624
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 gcaggggagagcaatgcggaagccaagcagggggtgctctgtgtcccggtgggatatgtt 120
Query: 625 gcagcaaatacgggtggtgcggttcaacttctgagtactgcggcgaaggttgccagagtc 684
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gcagcaaatacgggtggtgcggttcaacttctgagtactgcggcgaaggttgccagagtc 180
Query: 685 aatgtggtggcagtaccggtggtggtgaccttgggagcatcatctcaagggacaccttca 744
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 aatgtggtggcagtaccggtggtggtgaccttgggagcatcatctcaagggacaccttca 240
Query: 745 acacgatgctcaagcatcgtgatgatggagggtgtccagctaaagggttttacacctatg 804
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 acacgatgctcaagcatcgtgatgatggagggtgtccagctaaagggttttacacctatg 300
Query: 805 atgcttttatttcagctgccaaggcttaccccagctttggtaccaccggcgatacctcca 864
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 atgcttttatttcagctgccaaggcttaccccagctttggtaccaccggcgatacctcca 360
Query: 865 ctcgcaaaagagaaattgctgctttcttcggccaaacttctcatgaaactactgggggtt 924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 ctcgcaaaagagaaattgctgctttcttcggccaaacttctcatgaaactactgggggtt 420
Query: 925 gggctactgcaccggatggcccttacgcttggggatattgctttgttagggaacaaaacc 984
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 gggctactgcaccggatggcccttacgcttggggatattgctttgttagggaacaaaacc 480
Query: 985 caagtgcctattgctccccaagttctcaatggccttgtgcttctggcaagcaatactatg 1044
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 caagtgcctattgctccccaagttctcaatggccttgtgcttctggcaagcaatactatg 540
Query: 1045 gtcgcggtccaatccaaatcacatgg 1070
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gtcgcggtccaatccaaatcacatgg 566
Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0
Identities = 563/563 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1157 ggaactacaactatgggcaatgcggaagagcaattggtgcggacttgctgaacaacccag 1216
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 565 ggaactacaactatgggcaatgcggaagagcaattggtgcggacttgctgaacaacccag 624
Query: 1217 atgctgtagcaactgacgcagtgatctcattcaagacagcgatctggttctggatgacgg 1276
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 625 atgctgtagcaactgacgcagtgatctcattcaagacagcgatctggttctggatgacgg 684
Query: 1277 cacaatcaccgaagccttcatgccacgacgtcatcaccggaagatggagtccatcaagtg 1336
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 685 cacaatcaccgaagccttcatgccacgacgtcatcaccggaagatggagtccatcaagtg 744
Query: 1337 ctgatcaggcagcagggagggtttccgggtacggcactgtcaccaacatcatcaacggtg 1396
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 745 ctgatcaggcagcagggagggtttccgggtacggcactgtcaccaacatcatcaacggtg 804
Query: 1397 gacttgaatgcgggaaagggcaggatagcagggtgcaggatcgcatagggttttataaga 1456
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 805 gacttgaatgcgggaaagggcaggatagcagggtgcaggatcgcatagggttttataaga 864
Query: 1457 gatactgtgacttgcttggagttgggtatggcaataaccttgactgtgcttctcagagac 1516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 865 gatactgtgacttgcttggagttgggtatggcaataaccttgactgtgcttctcagagac 924
Query: 1517 catttggctctaattcacagctccttctcgacaccatctagttactttttgttttaataa 1576
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 925 catttggctctaattcacagctccttctcgacaccatctagttactttttgttttaataa 984
Query: 1577 ataaataacctgaacatcaccagtgcgggttcattgggttgggttgggtctggccgtgac 1636
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 985 ataaataacctgaacatcaccagtgcgggttcattgggttgggttgggtctggccgtgac 1044
Query: 1637 ttgttactgtttcatctctgatcagatcatgatcatagatcacctcctatgtatggaata 1696
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1045 ttgttactgtttcatctctgatcagatcatgatcatagatcacctcctatgtatggaata 1104
Query: 1697 aaataatctgaacattttctgtc 1719
|||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1105 aaataatctgaacattttctgtc 1127
>R_KMC001906A_C01 R_KMC001906A_c01
Length = 443
Score = 52.0 bits (26), Expect = 1e-06
Identities = 68/82 (82%)
Strand = Plus / Plus
Query: 879 attgctgctttcttcggccaaacttctcatgaaactactgggggttgggctactgcaccg 938
||||||||||| | | ||||| ||| |||||||| || || || ||||||||||||||
Sbjct: 288 attgctgcttttcttgcccaaatttcacatgaaaccacaggtgggtgggctactgcacct 347
Query: 939 gatggcccttacgcttggggat 960
||||| || || ||||||||||
Sbjct: 348 gatggaccatatgcttggggat 369