Miyakogusa Predicted Gene

chr4.CM0087.70.nd
Show Alignment: 

BLASTN 2.2.18 [Mar-02-2008]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= chr4.CM0087.70.nd
         (4219 letters)

Database: lotus_EST_unigene 
           20,423 sequences; 9,996,863 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

KMC000228A_C01 KMC000228A_c01                                        1548   0.0  
KMC000899A_C01 KMC000899A_c01                                        1142   0.0  

>KMC000228A_C01 KMC000228A_c01;
          Length = 1014

 Score = 1548 bits (781), Expect = 0.0
 Identities = 803/808 (99%), Gaps = 3/808 (0%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                        
Query: 497  ggaaatgaatcctgacaaattcacccacaagacaaatgaagctcttgctggggctcatga 556
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 210  ggaaatgaatcctgacaaattcacccacaagacaaatgaagctcttgctggggctcatga 269

                                                                        
Query: 557  actggcaatgagttctggacatgctcagatgactcctctgcacctagcaagcaccttgat 616
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 270  actggcaatgagttctggacatgctcagatgactcctctgcacctagcaagcaccttgat 329

                                                                        
Query: 617  ttctgaccctaatggcattttcttccaagcaatttccaattccagtggagaagaatctgc 676
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 330  ttctgaccctaatggcattttcttccaagcaatttccaattccagtggagaagaatctgc 389

                                                                        
Query: 677  acgtgctgtggagagggttttgaaccaggctttgaagaagttaccttctcagtcccctcc 736
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 390  acgtgctgtggagagggttttgaaccaggctttgaagaagttaccttctcagtcccctcc 449

                                                                        
Query: 737  tcctgatgagattccggcgagcacgacgcttattaaggccattcggagagcacaggcggc 796
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 450  tcctgatgagattccggcgagcacgacgcttattaaggccattcggagagcacaggcggc 509

                                                                        
Query: 797  gcagaagtccaggggtgatacacatttagcagtggatcagttgattttgggcattcttga 856
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 510  gcagaagtccaggggtgatacacatttagcagtggatcagttgattttgggcattcttga 569

                                                                        
Query: 857  ggattctcaaattggtgacttgttgaaggaagctggtgtggctgctgctaaggttaaatc 916
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 570  ggattctcaaattggtgacttgttgaaggaagctggtgtggctgctgctaaggttaaatc 629

                                                                        
Query: 917  agagcttgacaagcttcgtgggaaggtagggaagaaggttgagagtgcatctggtgatac 976
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 630  agagcttgacaagcttcgtgggaaggtagggaagaaggttgagagtgcatctggtgatac 689

                                                                        
Query: 977  tacttttcaggctttgaagacttatgggagagaccttgtggagcaagcagggaagcttga 1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 690  tacttttcaggctttgaagacttatgggagagaccttgtggagcaagcagggaagcttga 749

                                                                        
Query: 1037 tccagtaattgggcgtgatgaggagataagaagggttgtgaggattttgtcaaggaggac 1096
            |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 750  tccagttattgggcgtgatgaggagataagaagggttgtgaggattttgtcaaggaggac 809

                                                                        
Query: 1097 taagaataacccggttctgattggagagcctggtgttggtaaaactgctgtggtggaagg 1156
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 810  taagaataacccggttctgattggagagcctggtgttggtaaaactgctgtggtggaagg 869

                                                                        
Query: 1157 cttggcacagaggattgttagaggggatgttcccagcaatctttctgatgttaggcttat 1216
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 870  cttggcacagaggattgttagaggggatgttcccagc-atctttctgatgttaggcttat 928

                                                                        
Query: 1217 tgcattggacatgggtgctttggttgctggtgctaagtataggggagaatttgaggagag 1276
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 929  tgcattggacatgggtgctttggttgctggtgctaagtataggggagaatttgaggagag 988

                                        
Query: 1277 gttgaaggcagttttgaaagaagtggag 1304
            ||   |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 989  gt--gaggcagttttgaaagaagtggag 1014



 Score =  278 bits (140), Expect = 8e-74
 Identities = 140/140 (100%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 1   acaagcacctctcgtttccactctcaccgcttcaatcaaacaacgcacaaatcttcattc 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 66  acaagcacctctcgtttccactctcaccgcttcaatcaaacaacgcacaaatcttcattc 125

                                                                       
Query: 61  tcacaccgccatcactcactcgtttgctttcctggtacccttttctcgctagcaagacct 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 126 tcacaccgccatcactcactcgtttgctttcctggtacccttttctcgctagcaagacct 185

                               
Query: 121 ttcatctttcacaaacaaag 140
           ||||||||||||||||||||
Sbjct: 186 ttcatctttcacaaacaaag 205


>KMC000899A_C01 KMC000899A_c01;
          Length = 760

 Score = 1142 bits (576), Expect = 0.0
 Identities = 633/649 (97%), Gaps = 4/649 (0%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                        
Query: 3429 gtttatggtgctagaccaattaggaggtggcttgagaggaaagtggtgacagagctttcc 3488
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 673  gtttatggtgctagaccaattaggaggtggcttgagaggaaagtggtgacagagctttcc 614

                                                                        
Query: 3489 agaatgcttataagggatgaaattgatgagaactcaacagtgtacat-cgatgctggcac 3547
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 613  agaatgcttataagggatgaaattgatgagaactcaacagtgtacatgcgatgctggcac 554

                                                                        
Query: 3548 caagggtagtgagttggtctaccgtgtagagaagaatggtgggctggttaatgctgcaa- 3606
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct: 553  caagggtagtgagttggtctaccgtgtagagaagaatggtgggctggttaatgctgcaag 494

                                                                        
Query: 3607 ctggtcagaagtctgatatcttgattcagatacctaatggaccaaaaagtgatgctgctc 3666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 493  ctggtcagaagtctgatatcttgattcagatacctaatggacccaaaagtgatgctgctc 434

                                                                        
Query: 3667 aagctgtgaagaagatgaggattgaggaaattgatgatggtgagatggaagagtgaattt 3726
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 433  cagctgtgaagaagatgaggattgaggaaattgatgatggtgagatggaagagtgaattt 374

                                                                        
Query: 3727 tgtgacaactgtaattaggtttgatgaatggagtgtctctcaagtatttgctccttgtaa 3786
            |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 373  tgtgaccactgtaattaggtttgatgaatggagtgtctctccagtatttgctccttgtaa 314

                                                                        
Query: 3787 acctgnnnnnnngtctgtttttctaagtggttgtgatggaagaatgagaatctaatgtaa 3846
            |||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 313  acctgtttttttgtctgtttttctaagtggttgtgatggaagaatgagaatctaatgtaa 254

                                                                        
Query: 3847 tagctgtcttttctttaagc-aataaattttgttgctgtacaaagtattactacctgttt 3905
            |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 253  tagctgtcttttctttaagccaataaattttgttgctgtaccaagtattactacctgttt 194

                                                                        
Query: 3906 tctgtcacataattccatattagaatttaggaaggcgacattgatggccagttaaatgct 3965
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 193  tctgtcacataattccatattagaatttaggaaggcgacattgatggccagttaaatgct 134

                                                                        
Query: 3966 actggcagttactgtttgttctgctgttgcagattcagccttggccttttgttttgtata 4025
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 133  actggcagttactgtttgttctgctgttgcagattcagccttggccttttgttttgtata 74

                                                             
Query: 4026 catctctctgattaattacataccagggaactggttttcttcctggcta 4074
            |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 73   catctctctgattaattacataccagggaact-gttttcttcctggcta 26



 Score =  176 bits (89), Expect = 2e-43
 Identities = 89/89 (100%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                        
Query: 3255 gttgctagtagacttgctgagagaggaatagccatggcagtaacagatgcagcattagat 3314
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 760  gttgctagtagacttgctgagagaggaatagccatggcagtaacagatgcagcattagat 701

                                         
Query: 3315 tatatacttgctgagagctatgatcctgt 3343
            |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 700  tatatacttgctgagagctatgatcctgt 672