Miyakogusa Predicted Gene
- Lj5g3v1914110.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj5g3v1914110.1 tr|E1CI63|E1CI63_SOYBN GIGANTEA OS=Glycine max
GN=GmGIb PE=2 SV=1,89.34,0,seg,NULL; GIGANTEA,GIGANTEA,CUFF.56194.1
(3498 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC63856 similar to UniRef100_A5Y6J2 Cluster: LATE BLOOM... 2413 0.0
gnl|LJGI|TC82023 homologue to UniRef100_A7QX53 Cluster: Chromoso... 1857 0.0
gnl|LJGI|TC65498 similar to UniRef100_A5Y6J2 Cluster: LATE BLOOM... 737 0.0
gnl|LJGI|DC598201 homologue to UniRef100_A5Y6J2 Cluster: LATE BL... 521 e-147
>gnl|LJGI|TC63856 similar to UniRef100_A5Y6J2 Cluster: LATE BLOOMER 1; n=1; Pisum
sativum|Rep: LATE BLOOMER 1 - Pisum sativum (Garden pea),
partial (34%)
Length = 1394
Score = 2413 bits (1217), Expect = 0.0
Identities = 1217/1217 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2282 gcaaatgggacaaagaaattcactccagggcatcatcattgtataatctcatcgatattc 2341
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 gcaaatgggacaaagaaattcactccagggcatcatcattgtataatctcatcgatattc 60
Query: 2342 atagcaaagctattgcatctataataaacaaggcagagccattagaagcagccttaattc 2401
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 atagcaaagctattgcatctataataaacaaggcagagccattagaagcagccttaattc 120
Query: 2402 atgcacctactttgagggactcccttgttagtttcgatagtaaaagaaagaatcagtgtg 2461
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 atgcacctactttgagggactcccttgttagtttcgatagtaaaagaaagaatcagtgtg 180
Query: 2462 aaaacagtagctgctttgaccctatgccgacttctattgcaccattggaagattcagccc 2521
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 aaaacagtagctgctttgaccctatgccgacttctattgcaccattggaagattcagccc 240
Query: 2522 cctctaaacctaaccataagtctgataaagctccatgttcaaatgaagcagcatcagggt 2581
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 cctctaaacctaaccataagtctgataaagctccatgttcaaatgaagcagcatcagggt 300
Query: 2582 gtaccttgggtaaagatttctccttggatgcttctgatctagccaacttcctcactatgg 2641
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gtaccttgggtaaagatttctccttggatgcttctgatctagccaacttcctcactatgg 360
Query: 2642 acaggcatatagggttgaattgcaatgcacaaatttttctgagatccacactggcagaaa 2701
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 acaggcatatagggttgaattgcaatgcacaaatttttctgagatccacactggcagaaa 420
Query: 2702 agcaagagttatgtttctctgtagtttcactactatggcataaattgattgcatcccctg 2761
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 agcaagagttatgtttctctgtagtttcactactatggcataaattgattgcatcccctg 480
Query: 2762 aaactcaaccatgtgcagaaagtacttctgcccaacagggctggaggcaggttgttgatg 2821
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 aaactcaaccatgtgcagaaagtacttctgcccaacagggctggaggcaggttgttgatg 540
Query: 2822 cattatgcaatgttgtatcggcctcaccattgaaggcagctacagcagttgttcttcagg 2881
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 cattatgcaatgttgtatcggcctcaccattgaaggcagctacagcagttgttcttcagg 600
Query: 2882 cggataaggacatgcagccctggattgcaaaggatgatgatctaggtactcagaagatgt 2941
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 cggataaggacatgcagccctggattgcaaaggatgatgatctaggtactcagaagatgt 660
Query: 2942 ggagaatcaatcagcggatcgtaaaattgatagtggaactaatgaggaatcatgatagtt 3001
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 ggagaatcaatcagcggatcgtaaaattgatagtggaactaatgaggaatcatgatagtt 720
Query: 3002 cagagtcattggtaattttggcaagtgcatcagatttactactacgagccacagatggga 3061
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 cagagtcattggtaattttggcaagtgcatcagatttactactacgagccacagatggga 780
Query: 3062 tgttggttgatggagaagcttgcactttaccacagctggagctattggaagcaacagcca 3121
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 tgttggttgatggagaagcttgcactttaccacagctggagctattggaagcaacagcca 840
Query: 3122 gagcagttcacccagttcttcagtttggaggatcaggattggcattagcagatggccttt 3181
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 gagcagttcacccagttcttcagtttggaggatcaggattggcattagcagatggccttt 900
Query: 3182 caaaccttttaaagtgtcgccttccagcaactgttaggtgcctttgtcatccaagtgcac 3241
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901 caaaccttttaaagtgtcgccttccagcaactgttaggtgcctttgtcatccaagtgcac 960
Query: 3242 atgtccgcactctgagcatctcagttcttcgtgacattctgcataccggttcaaccaggt 3301
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961 atgtccgcactctgagcatctcagttcttcgtgacattctgcataccggttcaaccaggt 1020
Query: 3302 gtagtcctaaatcacagcgaatgaatggcatccaccatccctcttatcaatacttcaatt 3361
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 gtagtcctaaatcacagcgaatgaatggcatccaccatccctcttatcaatacttcaatt 1080
Query: 3362 tggatgtcattgactggctagctgacatagaaaaatgcttgacatgggaagctcacacac 3421
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 tggatgtcattgactggctagctgacatagaaaaatgcttgacatgggaagctcacacac 1140
Query: 3422 gactttccaatgggttgtctattaactttcttgacactgcagccaaagagttaggctgta 3481
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1141 gactttccaatgggttgtctattaactttcttgacactgcagccaaagagttaggctgta 1200
Query: 3482 ctattgccgtatgaaaa 3498
|||||||||||||||||
Sbjct: 1201 ctattgccgtatgaaaa 1217
>gnl|LJGI|TC82023 homologue to UniRef100_A7QX53 Cluster: Chromosome undetermined
scaffold_213, whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis
vinifera|Rep: Chromosome undetermined scaffold_213, whole
genome shotgun sequence - Vitis vinifera (Grape), partial
(53%)
Length = 984
Score = 1857 bits (937), Expect = 0.0
Identities = 969/976 (99%), Gaps = 4/976 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 312 ttctccattcgcttctttcatatctttagtctgcccgaaaaatgagaatgactactcaga 371
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 ttctccattcgcttctttcatatctttagtctgcccgaaaaatgagaatgactactcaga 60
Query: 372 acaatgggctctggcatgtggtgaaattttgcgtattttaactcattataatcgccccat 431
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 acaatgggctctggcatgtggtgaaattttgcgtattttaactcattataatcgccccat 120
Query: 432 atacaaacatgttgaagcagaaagaagcagcagtggcagtcatgccacaactagtggccc 491
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 atacaaacatgttgaagcagaaagaagcagcagtggcagtcatgccacaactagtggccc 180
Query: 492 tgctgatgggaaatctgaacataattctttgacacagcaagagaagaaacctaccaggcc 551
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 tgctgatgggaaatctgaacataattctttgacacagcaagagaagaaacctaccaggcc 240
Query: 552 cttgtccccatggatttcggacatattgttagctgcacctgtaggcattagaagcgacta 611
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 cttgtccccatggatttcggacatattgttagctgcacctgtaggcattagaagcgacta 300
Query: 612 tttccggtggtgcagtggtgttatgggaaaatatgctgcaggagaactcaagcctccgtc 671
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 tttccggtggtgcagtggtgttatgggaaaatatgctgcaggagaactcaagcctccgtc 360
Query: 672 aactgctgcttcacgtggttctgggaaacatcctcaactcgtgccttccactccaagatg 731
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 aactgctgcttcacgtggttctgggaaacatcctcaactcgtgccttccactccaagatg 420
Query: 732 ggctgttgccaatggtgctggtgtgatattaagcgtttgtgatgatgaagtttctcgcta 791
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ggctgttgccaatggtgttggtgtgatattaagcgtttgtgatgatgaagtttctcgcta 480
Query: 792 tgaaactgctattttaacagcagctgctgtccctgcacttttgcttcctcctccaacaac 851
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 tgaaactgctattttaacagcagctgctgtccctgcacttttgcttcctcctccaacaac 540
Query: 852 agctctggatgagcatcttgttgctggattaccagctctagagccatatgcacgtttatt 911
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 agctctggatgagcatcttgttgctggattaccatctctagagccatatgcacgtttatt 600
Query: 912 tcatagatattatgcaattgctactccaagtgctacacaaagacttcttcttggactgct 971
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 tcatagatattatgcaattgctactccaagtgctacacaaagacttcttcttggactgct 660
Query: 972 agaagcacccccatcatgggctccggatgcacttgatgctgctgtgcagcttgtggagct 1031
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 agaagcacccccatcatgggctccggatgcacttgatgctgctgtgcagcttgtggagct 720
Query: 1032 tcttcgggctgctgaagaatatgcttctggcatcaggcttcctagaaattggatgcattt 1091
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 tcttcgggctgctgaagaatatgcttctggcatcaggcttcctagaaattggatgcattt 780
Query: 1092 gcatttcttgcgtgcaatagggactgcaatgtccatgagagctggtatagctgctgatgc 1151
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 gcatttcttgcgtgcaatagggactgcaatgtccatgagagctggtatagctgctgatgc 840
Query: 1152 tgcagcagcattgcttttccgtgtactttcacagcctgcattactttttcctccacttag 1211
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 tgcagcagcattgcttttccgtgtactttcacagcctgcattactttttcctccacttag 900
Query: 1212 gcaagttgacggtgttgaagttcagaatggaccttgttatatttcttcctacaaaaagca 1271
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 901 --cagttgacggtgttgaagttcag-atggaccttgttatatttcttcctac-aaaagca 956
Query: 1272 gatagaagttcctgcg 1287
||||||||||||||||
Sbjct: 957 gatagaagttcctgcg 972
>gnl|LJGI|TC65498 similar to UniRef100_A5Y6J2 Cluster: LATE BLOOMER 1; n=1; Pisum
sativum|Rep: LATE BLOOMER 1 - Pisum sativum (Garden pea),
partial (10%)
Length = 876
Score = 737 bits (372), Expect = 0.0
Identities = 372/372 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3127 gttcacccagttcttcagtttggaggatcaggattggcattagcagatggcctttcaaac 3186
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2 gttcacccagttcttcagtttggaggatcaggattggcattagcagatggcctttcaaac 61
Query: 3187 cttttaaagtgtcgccttccagcaactgttaggtgcctttgtcatccaagtgcacatgtc 3246
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 62 cttttaaagtgtcgccttccagcaactgttaggtgcctttgtcatccaagtgcacatgtc 121
Query: 3247 cgcactctgagcatctcagttcttcgtgacattctgcataccggttcaaccaggtgtagt 3306
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 122 cgcactctgagcatctcagttcttcgtgacattctgcataccggttcaaccaggtgtagt 181
Query: 3307 cctaaatcacagcgaatgaatggcatccaccatccctcttatcaatacttcaatttggat 3366
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 182 cctaaatcacagcgaatgaatggcatccaccatccctcttatcaatacttcaatttggat 241
Query: 3367 gtcattgactggctagctgacatagaaaaatgcttgacatgggaagctcacacacgactt 3426
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 242 gtcattgactggctagctgacatagaaaaatgcttgacatgggaagctcacacacgactt 301
Query: 3427 tccaatgggttgtctattaactttcttgacactgcagccaaagagttaggctgtactatt 3486
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 302 tccaatgggttgtctattaactttcttgacactgcagccaaagagttaggctgtactatt 361
Query: 3487 gccgtatgaaaa 3498
||||||||||||
Sbjct: 362 gccgtatgaaaa 373
>gnl|LJGI|DC598201 homologue to UniRef100_A5Y6J2 Cluster: LATE BLOOMER 1; n=1; Pisum
sativum|Rep: LATE BLOOMER 1 - Pisum sativum (Garden
pea), partial (9%)
Length = 574
Score = 521 bits (263), Expect = e-147
Identities = 322/349 (92%), Gaps = 20/349 (5%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggctgctaccagtgagaggtggatcgaccgccttcaatattcctcattgttctggcat 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 226 atggctgctaccagtgagaggtggatcgaccgccttcaatattcctcattgttctggcat 285
Query: 61 cccccacaagactatcaacnnnnnnnggatcaaattgctgcatatgttgaatacttcatt 120
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 286 cccccacaagactatcaacaaaaaaaggatcaaattgctgcatatgttgaatacttcatt 345
Query: 121 cagttcacatcagaacaatttgctgatgatattgctgagttaatccgtaaccgctatcca 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 346 cagttcacatcagaacaatttgctgatgatattgctgagttaatccgtaaccgctatcca 405
Query: 181 gccaaagacattcttctctttgatgatgttctgg--------------------caacat 220
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 406 gccaaagacattcttctctttgatgatgttctgggtatttatgctttatcccatcaacat 465
Query: 221 ttgtcctccatcatccagagcatgggcatgcagttgttcttccaattatttcatgtatta 280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 466 ttgtcctccatcatccagagcatgggcatgcagttgttcttccaattatttcatgtatta 525
Query: 281 ttgatggtacactagtctatgataagactagttctccattcgcttcttt 329
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 526 ttgatggtacactagtctatgataagactagttctccattcgcttcttt 574