Miyakogusa Predicted Gene

Lj3g3v0382770.1
Show Alignment: 

BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Lj3g3v0382770.1 tr|Q2HUG6|Q2HUG6_MEDTR Peptidase C14, caspase
catalytic subunit p20 OS=Medicago truncatula
GN=MtrDRA,54.22,1e-18,SUBFAMILY NOT NAMED,NULL; FAMILY NOT NAMED,NULL;
seg,NULL; Peptidase_C14,Peptidase C14, caspase cata,CUFF.40654.1
         (1131 letters)

Database: LJGI 
           47,486 sequences; 32,788,469 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gnl|LJGI|TC57583 similar to UniRef100_Q9ZSP8 Cluster: Latex-abun...  2206   0.0  

>gnl|LJGI|TC57583 similar to UniRef100_Q9ZSP8 Cluster: Latex-abundant protein; n=1;
            Hevea brasiliensis|Rep: Latex-abundant protein - Hevea
            brasiliensis (Para rubber tree), partial (86%)
          Length = 1586

 Score = 2206 bits (1113), Expect = 0.0
 Identities = 1120/1121 (99%), Gaps = 1/1121 (0%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                        
Query: 11   cttcctacacggagcctaccgggaagaacatccgccgggagctgactagactcgtccgat 70
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 284  cttcctacacggagcctaccgggaagaacatccgccgggagctgactagactcgtccgat 343

                                                                        
Query: 71   cggctgagtccggcgacgtccttgtcgtccactacagcggtcatggtacccgccttcccg 130
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 344  cggctgagtccggcgacgtccttgtcgtccactacagcggtcatggtacccgccttcccg 403

                                                                        
Query: 131  ctgaaaccggtgaggatgatgatactgggtttgatgagtgcatcgttccctccgacatga 190
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 404  ctgaaaccggtgaggatgatgatactgggtttgatgagtgcatcgttccctccgacatga 463

                                                                        
Query: 191  acctcatcactgatgatgatttcagggaattcgtggaaaaagtctctagaggtgttaagc 250
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 464  acctcatcactgatgatgatttcagggaattcgtggaaaaagtctctagaggtgttaagc 523

                                                                        
Query: 251  tcaccattgtatcagattcttgtcatagtggtggcctgattgaagaagctaaggagcaga 310
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 524  tcaccattgtatcagattcttgtcatagtggtggcctgattgaagaagctaaggagcaga 583

                                                                        
Query: 311  taggagagagcaccaaagaagaaggggaaaagcactctggatccggctctggctctggct 370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 584  taggagagagcaccaaagaagaaggggaaaagcactctggatccggctctggctctggct 643

                                                                        
Query: 371  ttggattgtcaagctttctgcatcggactgtggaagatgctatcgagtctaggggatttc 430
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 644  ttggattgtcaagctttctgcatcggactgtggaagatgctatcgagtctaggggatttc 703

                                                                        
Query: 431  acgttccttcagcattgagccatcgcggacgcaatagggatgaagatgataatgatgagg 490
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 704  acgttccttcagcattgagccatcgcggacgcaatagggatgaagatgataatgatgagg 763

                                                                        
Query: 491  ttgcagatagggagattgagcttccagacgggagccgcggctatgttaagaataggtctc 550
            | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 764  t-gcagatagggagattgagcttccagacgggagccgcggctatgttaagaataggtctc 822

                                                                        
Query: 551  tgccactctcaacactcattgatattctcaagcagaaaactgggaaggatgatattgatg 610
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 823  tgccactctcaacactcattgatattctcaagcagaaaactgggaaggatgatattgatg 882

                                                                        
Query: 611  ttgggaaattgagacctaccctttttgatgtttttggggaagatgccagccctaaggtaa 670
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 883  ttgggaaattgagacctaccctttttgatgtttttggggaagatgccagccctaaggtaa 942

                                                                        
Query: 671  agaagttcatgaaggttatcctgaacaagctccaacatggtgagggtggtggtggtggag 730
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 943  agaagttcatgaaggttatcctgaacaagctccaacatggtgagggtggtggtggtggag 1002

                                                                        
Query: 731  gaatattggggatggtggggagcctagcacaggagtttctgaagcaaaagctggatgaga 790
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1003 gaatattggggatggtggggagcctagcacaggagtttctgaagcaaaagctggatgaga 1062

                                                                        
Query: 791  atgatgaggggtatgcaaaaccggccatggagacagaagtgggaagcaagcaagaggttt 850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1063 atgatgaggggtatgcaaaaccggccatggagacagaagtgggaagcaagcaagaggttt 1122

                                                                        
Query: 851  atgccggatcagccaaacgcgggcttccagatggtggggttctcttgagtgggtgccaga 910
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1123 atgccggatcagccaaacgcgggcttccagatggtggggttctcttgagtgggtgccaga 1182

                                                                        
Query: 911  cagaccagacttcagcagatgcaactcctgctggaaatcctaacaatgcttatggagctt 970
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1183 cagaccagacttcagcagatgcaactcctgctggaaatcctaacaatgcttatggagctt 1242

                                                                        
Query: 971  tcagcaatgcaattcagggtatacttgagaagagtgatggtgaaatcacaaattcagagc 1030
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1243 tcagcaatgcaattcagggtatacttgagaagagtgatggtgaaatcacaaattcagagc 1302

                                                                        
Query: 1031 ttgttctcaaggctaggaaggagctggagaggcagggtttcactcagagacctggactct 1090
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1303 ttgttctcaaggctaggaaggagctggagaggcagggtttcactcagagacctggactct 1362

                                                     
Query: 1091 attgcagtgaccaccatgttgatgcttcttttgtgtgctga 1131
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1363 attgcagtgaccaccatgttgatgcttcttttgtgtgctga 1403