Miyakogusa Predicted Gene

Lj1g3v1798870.1
Show Alignment: 

BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Lj1g3v1798870.1 Non Chatacterized Hit- tr|I3SNG4|I3SNG4_LOTJA
Uncharacterized protein OS=Lotus japonicus PE=2
SV=1,97.52,0,UNCHARACTERIZED,NULL; NADH-UBIQUINONE OXIDOREDUCTASE 39
KDA SUBUNIT-RELATED,NULL; NAD_binding_10,NUL,CUFF.27966.1
         (849 letters)

Database: LJGI 
           47,486 sequences; 32,788,469 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gnl|LJGI|TC59886 similar to UniRef100_Q93VH5 Cluster: AT5g10730/...  1683   0.0  
gnl|LJGI|GO034892 similar to UniRef100_Q93VH5 Cluster: AT5g10730...  1023   0.0  

>gnl|LJGI|TC59886 similar to UniRef100_Q93VH5 Cluster: AT5g10730/MAJ23_90; n=1;
           Arabidopsis thaliana|Rep: AT5g10730/MAJ23_90 -
           Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress), partial (90%)
          Length = 1244

 Score = 1683 bits (849), Expect = 0.0
 Identities = 849/849 (100%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 1   atgaggacactggtttcgcgcttgatccattccactccctccatttccaggctcaatgca 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 147 atgaggacactggtttcgcgcttgatccattccactccctccatttccaggctcaatgca 206

                                                                       
Query: 61  acggctgtgagaaatctctgcacggaacctaacaaggttgacgagcccttcaaagttgaa 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 207 acggctgtgagaaatctctgcacggaacctaacaaggttgacgagcccttcaaagttgaa 266

                                                                       
Query: 121 gaagcagagactgtaaatgtgcctccacctccaacagagaagttgcttgtgttgggaggc 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 267 gaagcagagactgtaaatgtgcctccacctccaacagagaagttgcttgtgttgggaggc 326

                                                                       
Query: 181 aatggatttgttggatcacatgtttgtagagaagcattaaatcatgggttgtctgttgcc 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 327 aatggatttgttggatcacatgtttgtagagaagcattaaatcatgggttgtctgttgcc 386

                                                                       
Query: 241 agtcttagcaggtctggtaagtcatccctgcatgattcctgggctactgatgtcatctgg 300
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 387 agtcttagcaggtctggtaagtcatccctgcatgattcctgggctactgatgtcatctgg 446

                                                                       
Query: 301 tataaagggaatctcctttcaactgattcattgaaagaagctctgaatggggtcactgct 360
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 447 tataaagggaatctcctttcaactgattcattgaaagaagctctgaatggggtcactgct 506

                                                                       
Query: 361 gttatctcatgtgtcggtggttttggctccaactcatacatgtacaaaattaatgggact 420
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 507 gttatctcatgtgtcggtggttttggctccaactcatacatgtacaaaattaatgggact 566

                                                                       
Query: 421 gctaacatcaatgcaattagagcagcttctgatcaaggtgttaaaagatttgtctatatt 480
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 567 gctaacatcaatgcaattagagcagcttctgatcaaggtgttaaaagatttgtctatatt 626

                                                                       
Query: 481 tctgctgctgactttggtgtagtaaattacttactacaggggtattatgaaggaaagaga 540
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 627 tctgctgctgactttggtgtagtaaattacttactacaggggtattatgaaggaaagaga 686

                                                                       
Query: 541 gctgctgaaacagagcttttgaccagatttccttatggaggagtaattctgaggccagga 600
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 687 gctgctgaaacagagcttttgaccagatttccttatggaggagtaattctgaggccagga 746

                                                                       
Query: 601 tttattcatgggactcgaactgctgggagtatgaagataccccttggtgtgattggatct 660
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 747 tttattcatgggactcgaactgctgggagtatgaagataccccttggtgtgattggatct 806

                                                                       
Query: 661 ccattagagatggttctgcaacatgctaaaccattgacccagatcccacttatagggcct 720
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 807 ccattagagatggttctgcaacatgctaaaccattgacccagatcccacttatagggcct 866

                                                                       
Query: 721 ctattgacacctcctgtgaatgttatcgcggtggcaaaagttgctgttagagctgctact 780
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 867 ctattgacacctcctgtgaatgttatcgcggtggcaaaagttgctgttagagctgctact 926

                                                                       
Query: 781 gagcctgttttccctccggggatcttagatgtctatggaatacaacgttacagtcagcag 840
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 927 gagcctgttttccctccggggatcttagatgtctatggaatacaacgttacagtcagcag 986

                    
Query: 841 cataaataa 849
           |||||||||
Sbjct: 987 cataaataa 995


>gnl|LJGI|GO034892 similar to UniRef100_Q93VH5 Cluster: AT5g10730/MAJ23_90; n=1;
           Arabidopsis thaliana|Rep: AT5g10730/MAJ23_90 -
           Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress), partial (53%)
          Length = 710

 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0
 Identities = 529/532 (99%), Gaps = 1/532 (0%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 1   atgaggacactggtttcgcgcttgatccattccactccctccatttccaggctcaatgca 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 178 atgaggacactggtttcgcgcttgatccattccactccctccatttccaggctcaatgca 237

                                                                       
Query: 61  acggctgtgagaaatctctgcacggaacctaacaaggttgacgagcccttcaaagttgaa 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 238 acggctgtgagaaatctctgcacggaacctaacaaggttgacgagcccttcaaagttgaa 297

                                                                       
Query: 121 gaagcagagactgtaaatgtgcctccacctccaacagagaagttgcttgtgttgggaggc 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 298 gaagcagagactgtaaatgtgcctccacctccaacagagaagttgcttgtgttgggaggc 357

                                                                       
Query: 181 aatggatttgttggatcacatgtttgtagagaagcattaaatcatgggttgtctgttgcc 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 358 aatggatttgttggatcacatgtttgtagagaagcattaaatcatgggttgtctgttgcc 417

                                                                       
Query: 241 agtcttagcaggtctggtaagtcatccctgcatgattcctgggctactgatgtcatctgg 300
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 418 agtcttagcaggtctggtaagtcatccctgcatgattcctgggctaccgatgtcatctgg 477

                                                                       
Query: 301 tataaagggaatctcctttcaactgattcattgaaagaagctctgaatggggtcactgct 360
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 478 tataaagggaatctcctttcaactgattcattgaaagaagctctgaatggggtcactgct 537

                                                                       
Query: 361 gttatctcatgtgtcggtggttttggctccaactcatacatgtacaaaattaatgggact 420
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 538 gttatctcatgtgtcggtggttttggctccaactcatacatgtacaaaattaatgggact 597

                                                                       
Query: 421 gctaacatcaatgcaattagagcagcttctgatcaaggtgttaaaagatttgtctatatt 480
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 598 gctaacatcaatgcaattagagcagcttctgatcaaggtgttaaaagatttgtctatact 657

                                                               
Query: 481 tctgctgctgactttggtgtagtaaattacttactacaggggtattatgaag 532
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 658 tctgctgctgactttggtgtagtaaattacttactaca-gggtattatgaag 708