Miyakogusa Predicted Gene
- Lj1g3v0117750.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj1g3v0117750.1 Non Chatacterized Hit- tr|I1JAN8|I1JAN8_SOYBN
Uncharacterized protein OS=Glycine max PE=4
SV=1,80.26,0,PPR_2,Pentatricopeptide repeat; PPR,Pentatricopeptide
repeat; PPR_3,Pentatricopeptide repeat; DYW_de,CUFF.25835.1
(2297 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC82021 similar to UniRef100_A7QT63 Cluster: Chromosome... 2639 0.0
>gnl|LJGI|TC82021 similar to UniRef100_A7QT63 Cluster: Chromosome chr1 scaffold_166,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr1 scaffold_166, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (50%)
Length = 1370
Score = 2639 bits (1331), Expect = 0.0
Identities = 1346/1351 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 947 atagttacagtgtaaaacttggcttggaatctgaggtctcagttggtactccactagtgg 1006
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2 atagttacagtgtaaaacttggcttggaatctgaggtctcagttggtactccactagtgg 61
Query: 1007 acttttattctaagtgtggaaggtttgaagctgcatgtcaagcttttgagagcatacgtg 1066
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 62 acttttattctaagtgtggaaggtttgaagctgcatgtcaagcttttgagagcatacgtg 121
Query: 1067 aaccaaatgatttttcatggagtgctataatcactggatactgccaaagtggtagatttg 1126
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 122 aaccaaatgatttttcatggagtgctataatcactggatacggccaaagtggtagatttg 181
Query: 1127 ataaggctcttgaaacttttaaaaatataagaagtaaaggagtgatattgaattcattcg 1186
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 182 ataaggctcttgaaacttttaaaaatataagaagtaaaggagtgatattgaattcattcg 241
Query: 1187 tctataccaacatttttcaagcatgctctgctatctcagatttagtttatggtgctcagg 1246
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 242 tctataccaacatttttcaagcatgctctgctatctcagatttagtttatggtgctcagg 301
Query: 1247 ttcacgcagatgcaataaaaaaggggctagttcaatacctttccggggagagtgctatga 1306
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 302 ttcacgcagatgcaataaaaaaggggctagttcaatacctttccggggagagtgctatga 361
Query: 1307 tcacgatgtactcaaaatgcggaaaattggactatgcatatcaagcattcttgactatag 1366
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 362 tcacgatgtactcaaaatgcggaaaattggactatgcatatcaagcattcttgactatag 421
Query: 1367 agaaacctgatactattgcatggactgctatcatatgtgcttatgcttaccatggaaaat 1426
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 422 agaaacctgatactattgcatggactgctatcatatgtgcttatgcttaccatggaaaat 481
Query: 1427 ctgaagctgtgaagcttttccacaagatgctgaggtctggtgtaaggccaaatgctgtca 1486
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 482 ctgaagctgtgaagcttttccacaagatgctgaggtctggtgtaaggccaaatgctgtca 541
Query: 1487 cattcattggtttgttaaatgcttgtagtcattcaggtttagttaaagaaggaaagcagt 1546
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 542 cattcattggtttgttaaatgcttgtagtcattcaggtttagttaaagaaggaaagcagt 601
Query: 1547 ttttagattcaatgagtgtgaaatacggcgtcgacccaacaattgatcattacaattgca 1606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 602 ttttagattcaatgagtgtgaaatacggcgtcgacccaacaattgatcattacaattgca 661
Query: 1607 tgattggtgtatactctcgtgctggattattacaggaagctctggagatgataaggagta 1666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 662 tgattggtgtatactctcgtgctggattattacaggaggctctggagatgataaggagta 721
Query: 1667 tgccatttgaacctgatacattaagttggaaaactttactaggaggatgttggagccatc 1726
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 722 tgccgtttgaacctgatacattaagttggaaaactttactaggaggatgttggagccatc 781
Query: 1727 ggaatctcgagaccgcgtcgattgcagctggaaaaatctttcaccttgacccacttgact 1786
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 782 ggaatctcgagaccgcgtcgattgcagctggaaaaatctttcaccttgacccacttgact 841
Query: 1787 ctgctacttatgtgaccatgttcaacttacatgctttggctgggaactgggatgaagcag 1846
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 842 ctgccacttatgtgaccatgttcaacttacatgctttggctgggaactgggatgaagcag 901
Query: 1847 cccaatatagaaagatgatggctgaaaggaacttgaggaaggaagtgagctgcagttgga 1906
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 902 cccaatatagaaagatgatggctgaaaggaacttgaggaaggaagtgagctgcagttgga 961
Query: 1907 ttattgtgaagggtaaagtgcaccgtttcgtggtaggtgataggcaccatcctcaaacag 1966
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 962 ttattgtgaagggtaaagtgcaccgtttcgtggtaggtgataggcaccatcctcaaacag 1021
Query: 1967 aagagatatactctaaactaaaacagctatattctgctgtcaaaatgggtgaggagagcc 2026
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1022 aagagatatactctaaactaaaacagctatattctgctgtcaaaatgggtgaggagagcc 1081
Query: 2027 ttcttaatacagaggatgcactatgcggctttacagaacggaaagagcagcttcttgatc 2086
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1082 ttcttaatacagaggatgcactatgcggctttacagaacggaaagagcagcttcttgatc 1141
Query: 2087 atagtgagagacttgctatagcctatggtctgatatgcacggaagctgagacccccattt 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1142 atagtgagagacttgctatagcctatggtctgatatgcacggaagctgagacccccattt 1201
Query: 2147 tggtgttcaagaatactagatcatgcaaagactgccatgattttgcaaaaagagtttcaa 2206
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1202 tggtgttcaagaatactagatcatgcaaagactgccatgattttgcaaaaagagtttcaa 1261
Query: 2207 ctataactggtcgtgaattagttgtgagagatgccaataggttccatcatattaagtcag 2266
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1262 ctataactggtcgtgaattagttgtgagagatgtcaataggttccatcatattaagtcag 1321
Query: 2267 gggaatgttcttgtaatgactattggtaatt 2297
|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1322 gggaatgttcttgtaatgactattggtaatt 1352