Miyakogusa Predicted Gene
- Lj0g3v0323909.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj0g3v0323909.1 Non Chatacterized Hit- tr|K4BX01|K4BX01_SOLLC
Uncharacterized protein OS=Solanum lycopersicum
GN=Sol,75.95,0,seg,NULL; DUF3326,Protein of unknown function
DUF3326,NODE_38720_length_1458_cov_22.081619.path2.1
(1125 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC66308 similar to UniRef100_A9TWJ2 Cluster: Predicted ... 2230 0.0
>gnl|LJGI|TC66308 similar to UniRef100_A9TWJ2 Cluster: Predicted protein; n=1;
Physcomitrella patens subsp. patens|Rep: Predicted
protein - Physcomitrella patens subsp. patens, partial
(67%)
Length = 1357
Score = 2230 bits (1125), Expect = 0.0
Identities = 1125/1125 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgcagtgtaagagagagtacacgagcgtgatgatagtgcccaccggaatcggagctgct 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 188 atgcagtgtaagagagagtacacgagcgtgatgatagtgcccaccggaatcggagctgct 247
Query: 61 attggtggattcgccggcgacgccttgccagtggctcgcgccctctcttcggttgttgat 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 248 attggtggattcgccggcgacgccttgccagtggctcgcgccctctcttcggttgttgat 307
Query: 121 tgcctcatcactcaccctaatgttcttaatgcggcgatgctatactggccaatgcctaat 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 308 tgcctcatcactcaccctaatgttcttaatgcggcgatgctatactggccaatgcctaat 367
Query: 181 gcattatatgttgaaggttatgctcttgacagatttgcagaaggattatgggccttgcag 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 368 gcattatatgttgaaggttatgctcttgacagatttgcagaaggattatgggccttgcag 427
Query: 241 cctgttcaccaaaacagggtggggttagttcttgatgctggaatagaacaggagctccag 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 428 cctgttcaccaaaacagggtggggttagttcttgatgctggaatagaacaggagctccag 487
Query: 301 gttcgccagttacaagtagctgatgctgcaagagcttcccttggattgcctgttgtagaa 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 488 gttcgccagttacaagtagctgatgctgcaagagcttcccttggattgcctgttgtagaa 547
Query: 361 tatattgttacagacactccactgaaggtagagaagtgggttgatcctgaaactggccaa 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 548 tatattgttacagacactccactgaaggtagagaagtgggttgatcctgaaactggccaa 607
Query: 421 tcaacagggaggattaagcacccagattctttacttagagctgtgcagactttaatgaat 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 608 tcaacagggaggattaagcacccagattctttacttagagctgtgcagactttaatgaat 667
Query: 481 aggtcaaaagtgaatgccattgctgtggttggacgtttcccagatgatgatacagatgat 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 668 aggtcaaaagtgaatgccattgctgtggttggacgtttcccagatgatgatacagatgat 727
Query: 541 gtagatgactatcggcagggaatggggatagacctattggctggagttgaggcagttata 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 728 gtagatgactatcggcagggaatggggatagacctattggctggagttgaggcagttata 787
Query: 601 agccatctagtggtgaaggagttccaaattccttgtgcacatgctcctgcacttgctcca 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 788 agccatctagtggtgaaggagttccaaattccttgtgcacatgctcctgcacttgctcca 847
Query: 661 cttaccatgagcctatctctaagtccaaaatcagcagctgaggagattggttacaccttc 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 848 cttaccatgagcctatctctaagtccaaaatcagcagctgaggagattggttacaccttc 907
Query: 721 ctgccatgtgtgctcgctggcctaagcaacgctccacaatacatggtcatgcactccgaa 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 908 ctgccatgtgtgctcgctggcctaagcaacgctccacaatacatggtcatgcactccgaa 967
Query: 781 tccacggacaaaggttgcatagtggcacgtgatgtggattctttaatccttccaaaagat 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 968 tccacggacaaaggttgcatagtggcacgtgatgtggattctttaatccttccaaaagat 1027
Query: 841 gcttgtggaggggctggaactcttgcatttgcaagaaatggaaaaaataagccacttata 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1028 gcttgtggaggggctggaactcttgcatttgcaagaaatggaaaaaataagccacttata 1087
Query: 901 attgctgtggaagaaaatgaaacagttctggatgatactgcagataaacttggtcttgaa 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1088 attgctgtggaagaaaatgaaacagttctggatgatactgcagataaacttggtcttgaa 1147
Query: 961 gtgctgcatgtctcaaattattgggaggccattggagttattgcagctcacaaggcgggg 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1148 gtgctgcatgtctcaaattattgggaggccattggagttattgcagctcacaaggcgggg 1207
Query: 1021 atagatccatattctcttagacgaaataaaattcttaacatagggtgcactccttgtatg 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1208 atagatccatattctcttagacgaaataaaattcttaacatagggtgcactccttgtatg 1267
Query: 1081 cctgtcaatggtcattccatttcaagagaaagagctatctcctga 1125
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1268 cctgtcaatggtcattccatttcaagagaaagagctatctcctga 1312