Miyakogusa Predicted Gene

Lj0g3v0282049.1
Show Alignment: 

BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Lj0g3v0282049.1 Non Chatacterized Hit- tr|B9SZZ5|B9SZZ5_RICCO
Putative uncharacterized protein OS=Ricinus communis
G,28.9,0.000000000000008, ,CUFF.18762.1
         (645 letters)

Database: LJGI 
           47,486 sequences; 32,788,469 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gnl|LJGI|TC62078 similar to UniRef100_A9UWU2 Cluster: Predicted ...  1279   0.0  
gnl|LJGI|GO019061                                                    1178   0.0  

>gnl|LJGI|TC62078 similar to UniRef100_A9UWU2 Cluster: Predicted protein; n=1;
           Monosiga brevicollis MX1|Rep: Predicted protein -
           Monosiga brevicollis MX1, partial (3%)
          Length = 1003

 Score = 1279 bits (645), Expect = 0.0
 Identities = 645/645 (100%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
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           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 21  atggaggcaaatttcgagaacccatctcaaatcaacagattctgtgttgatggattgcac 80

                                                                       
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           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 561 gagtccggagataagggatttgaagatattctttattctaaaggggagaatcctaccaca 620

                                                        
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           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 621 tatgtcctttcatctggaagatggaatgtaaaccaagaggttcaa 665


>gnl|LJGI|GO019061 
          Length = 706

 Score = 1178 bits (594), Expect = 0.0
 Identities = 604/606 (99%), Gaps = 1/606 (0%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 1   atggaggcaaatttcgagaacccatctcaaatcaacagattctgtgttgatggattgcac 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 102 atggaggcaaatttcgagaacccatctcaaatcaacagattctgtgttgatggattgcac 161

                                                                       
Query: 61  aagacagatatcattgaatggaacaagaagagaaaaccacagagtgatccattggatttg 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 162 aagacagatatcattgaatggaacaagaagagaaaaccacagagtgatccattggatttg 221

                                                                       
Query: 121 cttagaccaaggcataaatgctggatagggaattcctcttctgaacatgatttaatatct 180
           |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 222 cttagaccaaggcataaatgctggatagggaactcctcttctgaacatgatttaatatct 281

                                                                       
Query: 181 gatgaaaatccagtattagagggcatgcacatgtacgttgtaaagggtagaatggatacg 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 282 gatgaaaatccagtattagagggcatgcacatgtacgttgtaaagggtagaatggatacg 341

                                                                       
Query: 241 gagttacttgacgtttgttcagaacctgaatctgccaaagacagcaatagttttattgaa 300
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 342 gagttacttgacgtttgttcagaacctgaatctgccaaagacagcaatagttttattgaa 401

                                                                       
Query: 301 gattccagtacatccatatctgtagattccaataatgttaaggatagtcattcctctttg 360
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 402 gattccagtacatccatatctgtagattccaataatgttaaggatagtcattcctctttg 461

                                                                       
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           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 462 gatgtatcagcatctgagaaggtatgctacgaggaagatgaaacatttgttgacaaagaa 521

                                                                       
Query: 421 tataatccatcttatcattttgctgatttaaatgctttgaagagtcttgaggagcacttt 480
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 522 tataatccatcttatcattttgctgatttaaatgctttgaagagtcttgaggagcacttt 581

                                                                       
Query: 481 ctgggaataggaagtggcacagatcacgtgtactcaggatatgctaatgaaaacattgag 540
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 582 ctgggaataggaagtggcacagatcacgtgtactcaggatatgctaatgaaaacattgag 641

                                                                       
Query: 541 gagtccggagataagggatttgaagatattctttattctaaaggggagaatcctaccaca 600
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Sbjct: 642 gagtccggagataagggatttgaagatattctttattctaaa-gggagaatcctaccaca 700

                 
Query: 601 tatgtc 606
           ||||||
Sbjct: 701 tatgtc 706