Miyakogusa Predicted Gene
- Lj6g3v2275010.2
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj6g3v2275010.2 tr|G7IN96|G7IN96_MEDTR DMI1 protein OS=Medicago
truncatula GN=MTR_2g005870 PE=4 SV=1,80.75,0,NAD(P)-binding
Rossmann-fold domains,NULL; Voltage-gated potassium channels,NULL;
FAMILY NOT NAMED,N,CUFF.61010.2
(2757 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC57123 homologue to UniRef100_A9Q1K1 Cluster: SYM8; n=... 4651 0.0
gnl|LJGI|CB829199 similar to UniRef100_Q1A3R6 Cluster: POLLUX pr... 442 e-123
gnl|LJGI|TC70794 ion channel 151 3e-35
>gnl|LJGI|TC57123 homologue to UniRef100_A9Q1K1 Cluster: SYM8; n=1; Pisum sativum|Rep:
SYM8 - Pisum sativum (Garden pea), partial (83%)
Length = 3269
Score = 4651 bits (2346), Expect = 0.0
Identities = 2346/2346 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 412 gaccttcctcctcctcccgttccttcctcttcccccgtcgccagaccgcaacaccataac 471
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 489 gaccttcctcctcctcccgttccttcctcttcccccgtcgccagaccgcaacaccataac 548
Query: 472 caccgctctcctccgatcttctatctgctcatcatcacttgtattatttttgtaccctat 531
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 549 caccgctctcctccgatcttctatctgctcatcatcacttgtattatttttgtaccctat 608
Query: 532 tcctcttatctacagtacaagcttgccaaactcgaggatcacaaacttcacctgtgtcgt 591
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 609 tcctcttatctacagtacaagcttgccaaactcgaggatcacaaacttcacctgtgtcgt 668
Query: 592 caaagtcaaattcatttttcttccggtcatggaaatggaaaaatctctataccaatacac 651
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 669 caaagtcaaattcatttttcttccggtcatggaaatggaaaaatctctataccaatacac 728
Query: 652 gacgcctccttttcttatatcctcagtagaaaagcagctttgtatattgtgctcttcacg 711
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 729 gacgcctccttttcttatatcctcagtagaaaagcagctttgtatattgtgctcttcacg 788
Query: 712 ctcattttgccttttctgctctacaaatatcttgactaccttcctcaaattatcaatttc 771
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 789 ctcattttgccttttctgctctacaaatatcttgactaccttcctcaaattatcaatttc 848
Query: 772 ttgaggagaacacacaataacaaggaggatgtaccgttaaagaagaggattgcttatatg 831
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 849 ttgaggagaacacacaataacaaggaggatgtaccgttaaagaagaggattgcttatatg 908
Query: 832 ctagatgtctttttctccatatatccttatgcaaagctgctcgcgcttctctttgcaact 891
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 909 ctagatgtctttttctccatatatccttatgcaaagctgctcgcgcttctctttgcaact 968
Query: 892 ctatttctcataggatttggtggtttagcactctatgccgtcactggtggtagccttgct 951
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 969 ctatttctcataggatttggtggtttagcactctatgccgtcactggtggtagccttgct 1028
Query: 952 gaagcactttggcactcttggacttatgtggctgactcaggaaatcatgctgaaacacaa 1011
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1029 gaagcactttggcactcttggacttatgtggctgactcaggaaatcatgctgaaacacaa 1088
Query: 1012 ggaaccgggcagagggtcgtctctgtctcaattagttcaggtggcatgctcatatttgct 1071
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1089 ggaaccgggcagagggtcgtctctgtctcaattagttcaggtggcatgctcatatttgct 1148
Query: 1072 atgatgcttgggcttgtttcagatgctatatcagagaaggtagattcactcagaaaaggc 1131
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1149 atgatgcttgggcttgtttcagatgctatatcagagaaggtagattcactcagaaaaggc 1208
Query: 1132 aagtgtgaagtcattgaaagaaaccacatactcattcttggctggagtgacaaattgggt 1191
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1209 aagtgtgaagtcattgaaagaaaccacatactcattcttggctggagtgacaaattgggt 1268
Query: 1192 tcactgttgaagcagctagcaatagcaaataagagtgttggtggtggtgttattgtggtg 1251
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1269 tcactgttgaagcagctagcaatagcaaataagagtgttggtggtggtgttattgtggtg 1328
Query: 1252 cttgcagaaaaagaaaaggaggaaatggaaatggatataacaaagctggaatttgatttc 1311
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1329 cttgcagaaaaagaaaaggaggaaatggaaatggatataacaaagctggaatttgatttc 1388
Query: 1312 atggggacatctgtgatttgtaggagcggcagtcctcttatacttgctgacctaaagaag 1371
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1389 atggggacatctgtgatttgtaggagcggcagtcctcttatacttgctgacctaaagaag 1448
Query: 1372 gtttcagtttcaaaggcacgagcaatcattgtattagcttcagatgaaaatgcagatcag 1431
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1449 gtttcagtttcaaaggcacgagcaatcattgtattagcttcagatgaaaatgcagatcag 1508
Query: 1432 agtgatgcacgtgctttgagagttgttttgagcttaacaggcgtaaaggagggcttaagg 1491
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1509 agtgatgcacgtgctttgagagttgttttgagcttaacaggcgtaaaggagggcttaagg 1568
Query: 1492 ggacatgttgtcgtcgagatgagtgaccttgacaatgaacccctagtgaaacttgttggt 1551
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1569 ggacatgttgtcgtcgagatgagtgaccttgacaatgaacccctagtgaaacttgttggt 1628
Query: 1552 ggagaactcattgaaacagttgttgcacatgatgtaattggacgattgatgattcagtgt 1611
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1629 ggagaactcattgaaacagttgttgcacatgatgtaattggacgattgatgattcagtgt 1688
Query: 1612 gctctgcagcctggccttgcacagatatgggaagatattctgggatttgagaatgctgag 1671
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1689 gctctgcagcctggccttgcacagatatgggaagatattctgggatttgagaatgctgag 1748
Query: 1672 ttttacatcaaaagatggcctgaactggatggcttatctttcaaagacatattaatttca 1731
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1749 ttttacatcaaaagatggcctgaactggatggcttatctttcaaagacatattaatttca 1808
Query: 1732 tttcctgatgcaataccttgtggagttaaggttgctgcagatggggggaagattgtcata 1791
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1809 tttcctgatgcaataccttgtggagttaaggttgctgcagatggggggaagattgtcata 1868
Query: 1792 aatcctgatgatagttatgttatgagagatggtgatgaagtccttgttatagctgaagat 1851
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1869 aatcctgatgatagttatgttatgagagatggtgatgaagtccttgttatagctgaagat 1928
Query: 1852 gatgacacttactctcctggttctcttccagaggtgctcaagggctttttccctaggata 1911
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1929 gatgacacttactctcctggttctcttccagaggtgctcaagggctttttccctaggata 1988
Query: 1912 cctgatgcaccaaaatatccggaaaagatattattttgtgggtggcgccgtgatattgat 1971
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1989 cctgatgcaccaaaatatccggaaaagatattattttgtgggtggcgccgtgatattgat 2048
Query: 1972 gatatgatcatggttttagaagcattcttggctccaggttcagaactctggatgttcaat 2031
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2049 gatatgatcatggttttagaagcattcttggctccaggttcagaactctggatgttcaat 2108
Query: 2032 gaggttcctgaaaaggaaagagagaagaagcttgccgctggtggacttgatgtttttggg 2091
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2109 gaggttcctgaaaaggaaagagagaagaagcttgccgctggtggacttgatgtttttggg 2168
Query: 2092 ctagagaacataaagcttgtccatagggagggaaatgctgtcattaggcggcacctagag 2151
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2169 ctagagaacataaagcttgtccatagggagggaaatgctgtcattaggcggcacctagag 2228
Query: 2152 agtcttccattggagacttttgattccatccttattcttgcagatgagtcagtggaggac 2211
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2229 agtcttccattggagacttttgattccatccttattcttgcagatgagtcagtggaggac 2288
Query: 2212 tctgttgctcattctgactcaagatctctagctacccttctgctcatccgtgatatacag 2271
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2289 tctgttgctcattctgactcaagatctctagctacccttctgctcatccgtgatatacag 2348
Query: 2272 tcaagacgtctaccatacaaagacacaaagtcaacgtctttgaggttatctgggttctct 2331
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2349 tcaagacgtctaccatacaaagacacaaagtcaacgtctttgaggttatctgggttctct 2408
Query: 2332 cacaactcttggatccgtgaaatgcagcaagcttcagataaatcaattataattagcgaa 2391
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2409 cacaactcttggatccgtgaaatgcagcaagcttcagataaatcaattataattagcgaa 2468
Query: 2392 attttggattctaggactagaaatctagtgtctgtgtccagaatcagtgattatgtgtta 2451
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2469 attttggattctaggactagaaatctagtgtctgtgtccagaatcagtgattatgtgtta 2528
Query: 2452 tctaatgaactggtaagcatggcactagctatggttgctgaagataagcaaatcaaccgt 2511
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2529 tctaatgaactggtaagcatggcactagctatggttgctgaagataagcaaatcaaccgt 2588
Query: 2512 gttcttgaggaattatttgcagagcaggggaacgagatgtgcattaagcctgcagagttt 2571
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2589 gttcttgaggaattatttgcagagcaggggaacgagatgtgcattaagcctgcagagttt 2648
Query: 2572 tatttatttgaccaggaggagctctgtttttatgatataatgattaggggtcgtgcaaga 2631
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2649 tatttatttgaccaggaggagctctgtttttatgatataatgattaggggtcgtgcaaga 2708
Query: 2632 caggagattattataggctatcgcctcgctaaccaagagcgtgctattatcaacccttca 2691
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2709 caggagattattataggctatcgcctcgctaaccaagagcgtgctattatcaacccttca 2768
Query: 2692 gaaaaattggtggcaagaaaatggtcccttggtgatgtttttgttgtaattgcttcaggc 2751
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2769 gaaaaattggtggcaagaaaatggtcccttggtgatgtttttgttgtaattgcttcaggc 2828
Query: 2752 gattga 2757
||||||
Sbjct: 2829 gattga 2834
Score = 278 bits (140), Expect = 2e-73
Identities = 234/278 (84%), Gaps = 3/278 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 60 tgacgaagaatctcccaatctcagtactgtcatcaagccaccattgaagaagactaagac 119
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 140 tgacgaagaatctcccaatctcagtactgtcatcaagccaccattgaagaagactaagac 199
Query: 120 cctacttccaccacnnnnnnnnnnnnnnnnnaaccgccccttgcatctcagagtctccat 179
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 200 cctacttccaccaccatcatcatcatcatcaaaccgccccttgcatctcagagtctccat 259
Query: 180 tgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngctcctcctcctcccgctgatttctcagatcacca 239
|| |||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 260 tgacaacaacaacaacaacaacgctcctcctcctcc---cgctgatttctcagatcacca 316
Query: 240 gtggaactatccttctttcctcggcaccaccaccaggaaaagaagaccctcctccgtcaa 299
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 gtggaactatccttctttcctcggcaccaccaccaggaaaagaagaccctcctccgtcaa 376
Query: 300 acccccttctacttctaacctccgcttcgataccattc 337
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 acccccttctacttctaacctccgcttcgataccattc 414
>gnl|LJGI|CB829199 similar to UniRef100_Q1A3R6 Cluster: POLLUX protein; n=1; Glycine
max|Rep: POLLUX protein - Glycine max (Soybean), partial
(46%)
Length = 554
Score = 442 bits (223), Expect = e-123
Identities = 223/223 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2535 gcaggggaacgagatgtgcattaagcctgcagagttttatttatttgaccaggaggagct 2594
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 73 gcaggggaacgagatgtgcattaagcctgcagagttttatttatttgaccaggaggagct 132
Query: 2595 ctgtttttatgatataatgattaggggtcgtgcaagacaggagattattataggctatcg 2654
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 133 ctgtttttatgatataatgattaggggtcgtgcaagacaggagattattataggctatcg 192
Query: 2655 cctcgctaaccaagagcgtgctattatcaacccttcagaaaaattggtggcaagaaaatg 2714
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 193 cctcgctaaccaagagcgtgctattatcaacccttcagaaaaattggtggcaagaaaatg 252
Query: 2715 gtcccttggtgatgtttttgttgtaattgcttcaggcgattga 2757
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 253 gtcccttggtgatgtttttgttgtaattgcttcaggcgattga 295
>gnl|LJGI|TC70794 ion channel
Length = 2897
Score = 151 bits (76), Expect = 3e-35
Identities = 271/336 (80%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1369 aaggtttcagtttcaaaggcacgagcaatcattgtattagcttcagatgaaaatgcagat 1428
|||||||| |||||||||||||| |||| || || | ||| ||||| |||||| |||
Sbjct: 1255 aaggtttctgtttcaaaggcacgtacaataatcgtccttgctgaagatggaaatgctgat 1314
Query: 1429 cagagtgatgcacgtgctttgagagttgttttgagcttaacaggcgtaaaggagggctta 1488
||||||||||| |||||||||||| || || || | || || || || || || |||
Sbjct: 1315 cagagtgatgcccgtgctttgagaacagtcttaagtctgactggagtcaaagaaggatta 1374
Query: 1489 aggggacatgttgtcgtcgagatgagtgaccttgacaatgaacccctagtgaaacttgtt 1548
| ||||| | || || || |||||||| || |||||||| ||| || ||||||||
Sbjct: 1375 cgaggacacatagtggttgaaatgagtgatctagacaatgaggtccttgttaaacttgtg 1434
Query: 1549 ggtggagaactcattgaaacagttgttgcacatgatgtaattggacgattgatgattcag 1608
||||| || || ||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct: 1435 ggtggggatcttgttgaaactgttgtagctcatgatgtcattggtcgattgatgattcaa 1494
Query: 1609 tgtgctctgcagcctggccttgcacagatatgggaagatattctgggatttgagaatgct 1668
||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |
Sbjct: 1495 tgtgctcggcagcctggacttgcacagatttgggaagatatacttggatttgaaaattgt 1554
Query: 1669 gagttttacatcaaaagatggcctgaactggatggc 1704
|| || |||||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct: 1555 gaattctacatcaaaagatggcctcagctggatggc 1590
Score = 85.7 bits (43), Expect = 1e-15
Identities = 121/147 (82%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2350 gaaatgcagcaagcttcagataaatcaattataattagcgaaattttggattctaggact 2409
|||||| |||| |||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct: 2233 gaaatgaagcaggcttcagacaaaacagttataattagtgaaattttggaccctaggaca 2292
Query: 2410 agaaatctagtgtctgtgtccagaatcagtgattatgtgttatctaatgaactggtaagc 2469
| |||||| | ||| |||| | || ||||||||||| ||||| |||||||| || |||
Sbjct: 2293 aaaaatcttttatctatgtcaaagattagtgattatgttttatccaatgaacttgtcagc 2352
Query: 2470 atggcactagctatggttgctgaagat 2496
||||| | ||||||||||| ||||||
Sbjct: 2353 atggctttggctatggttgcagaagat 2379