Miyakogusa Predicted Gene
- Lj6g3v2274300.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj6g3v2274300.1 CUFF.60991.1
(4851 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC62325 similar to UniRef100_A7PYK4 Cluster: Chromosome... 1826 0.0
gnl|LJGI|TC82176 similar to UniRef100_A7PYK4 Cluster: Chromosome... 1433 0.0
gnl|LJGI|TC72477 611 e-173
gnl|LJGI|TC73408 216 1e-54
>gnl|LJGI|TC62325 similar to UniRef100_A7PYK4 Cluster: Chromosome chr12 scaffold_38,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr12 scaffold_38, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (21%)
Length = 966
Score = 1826 bits (921), Expect = 0.0
Identities = 945/956 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3572 ggcaaatgaaagtctctcctggtgtttggttcttgcaacttgctcctggtaggagttctg 3631
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6 ggcaaatgaaagtctctcctggtgtttggttcttgcaacttgctcctggtaggagttctg 65
Query: 3632 agctctatattttaaaggaggaggatgatggaagtcagaataaacaatcatcaaaactca 3691
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 66 agctctatattttaaaggaggaggatgatggaantcanaataaacaatcatcaaaactca 125
Query: 3692 tcactattaatagtttacggggtaaagtagttcatatggaagtagtgaaaagaaagggca 3751
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 126 tcactattaatagtttacggggtaaagtagttcatatggaagtagtgaaaagaaagggca 185
Query: 3752 aggaacatgagaaattgctgattcctgatgatggtgaaaatgtgcaagatcagaagagag 3811
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 186 aggaacatgagaaattgctgattcctgatgatggtgaaaatgtgcaagatcagaagagag 245
Query: 3812 gaagtacctggaattccaacttactaaagtgggcttctggtttcattggtaacaatgaac 3871
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 246 gaagtacctggaattccaacttactaaagtgggcttctggtttcattggtaacaatgaac 305
Query: 3872 aatctaaaaaagctgaaagcaattcacctgagaaagcaannnnnnnacgccatggaaaaa 3931
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||
Sbjct: 306 aatctaaaaaagctgaaagcaattcacctgagaaagcaagggggggatgccatggaaaaa 365
Query: 3932 caattaatatcttttcaattgcttcgggtcatctatatgaacgctttttgaagattatga 3991
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 366 caattaatatcttttcaattgcttcgggtcatctatatgaacgctttttgaagattatga 425
Query: 3992 ttctaagtgttctaaagaatactcctcgtccagtgaaattctggttcataaaaaactacc 4051
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 426 ttctaagtgttctaaagaatactcctcgtccagtgaaattctggttcataaaaaactacc 485
Query: 4052 tttctcctcgttttaaggatctgattccccgcatggcccaagagtatggttttgaatatg 4111
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 486 tttctcctcgttttaaggatctgattccccgcatggcccaagagtatggttttgaatatg 545
Query: 4112 aactaatcacatacaaatggcctacttggttgcacaagcagaaagaaaagcagcgaataa 4171
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 546 aactaatcacatacaaatggcctacttggttgcacaagcagaaagaaaagcagcgaataa 605
Query: 4172 tttgggcgtataaaattttattcctggatgtcatctttcccctttccctggagaaggtca 4231
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 606 tttgggcgtataaaattttattcctggatgtcatctttcccctttccctggagaaggtca 665
Query: 4232 tttttgtagatgctgatcaggttgtcagggctgacatgggagaactatatgacatggatt 4291
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 666 tttttgtagatgctgatcaggttgtcagggctgacatgggagaactatatgacatggatt 725
Query: 4292 taaaaggaaaacctctggcatatactccattttgtgacaacaataaggagatggatggat 4351
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 726 taaaaggaaaacctctggcatatactccattttgtgacaacaataaggagatggatggat 785
Query: 4352 accggttttggagacaaggtttctggaaggatcatttgcggggaaaaccatatcatatta 4411
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 786 accggttttggagacaaggtttctggaaggatcatttgcggggaaaaccatatcatatta 845
Query: 4412 gtgctttgtatgttgttgatctgaagaagttccgagagactgcagctggagataatctca 4471
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 846 gtgctttgtatgttgttgatctgaagaagttctgagagactgcagctggagataatctca 905
Query: 4472 gagttttctatgaaacccttagcaaggatccaaatagtctatccaacttggatcag 4527
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 906 gagttttctatgaaacccttagcaaggatccaaatagtctatccaacttggatcag 961
>gnl|LJGI|TC82176 similar to UniRef100_A7PYK4 Cluster: Chromosome chr12 scaffold_38,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr12 scaffold_38, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (24%)
Length = 1298
Score = 1433 bits (723), Expect = 0.0
Identities = 723/723 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2506 agccataagaagaacgtattagacttcttggatcagttatgctccctttatcagaagaaa 2565
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 576 agccataagaagaacgtattagacttcttggatcagttatgctccctttatcagaagaaa 635
Query: 2566 ttcatcactacgtcagctttggaagtcgataccacccaagcatttattgacaaggtctgt 2625
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 636 ttcatcactacgtcagctttggaagtcgataccacccaagcatttattgacaaggtctgt 695
Query: 2626 gagcttgctgaggctaatgggttcccatccgaggactatagatctgccctctcagaattt 2685
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 696 gagcttgctgaggctaatgggttcccatccgaggactatagatctgccctctcagaattt 755
Query: 2686 tctgctgatgaagtgagaagtcaattgatgaaggtgggaaagtttttgtacagggtactt 2745
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 756 tctgctgatgaagtgagaagtcaattgatgaaggtgggaaagtttttgtacagggtactt 815
Query: 2746 ggatctgaatctggtgttaatgctgtcttcacgaatggaagggtaacttatcctattcat 2805
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 816 ggatctgaatctggtgttaatgctgtcttcacgaatggaagggtaacttatcctattcat 875
Query: 2806 gaaagcacatttttgagtgctgatctgcatcttcttgaatcaatagagcttaagaagagg 2865
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 876 gaaagcacatttttgagtgctgatctgcatcttcttgaatcaatagagcttaagaagagg 935
Query: 2866 ataaagcatattatggaaattattgaagaagttaaatggcaggatgttgaccctgacatg 2925
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 936 ataaagcatattatggaaattattgaagaagttaaatggcaggatgttgaccctgacatg 995
Query: 2926 ctgacaagcaaattccttagtgatattgtcatggctgtatcatcttcaatggctaccaga 2985
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 996 ctgacaagcaaattccttagtgatattgtcatggctgtatcatcttcaatggctaccaga 1055
Query: 2986 gagcggacttctgaaggtgctcgttttgagattttgaatgaccaatatagtgccattatt 3045
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1056 gagcggacttctgaaggtgctcgttttgagattttgaatgaccaatatagtgccattatt 1115
Query: 3046 ctaaacaatgaaaattctagcattcatattgatgcggttctggatcctttaagtccaacc 3105
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1116 ctaaacaatgaaaattctagcattcatattgatgcggttctggatcctttaagtccaacc 1175
Query: 3106 agccagaagttgtctggaattcttcgagttttgtggaaatatattcagcccagcatgagg 3165
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1176 agccagaagttgtctggaattcttcgagttttgtggaaatatattcagcccagcatgagg 1235
Query: 3166 attgtactgaatccattgagttcccttgctgatcttcctctgaagagctactacagatat 3225
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1236 attgtactgaatccattgagttcccttgctgatcttcctctgaagagctactacagatat 1295
Query: 3226 gta 3228
|||
Sbjct: 1296 gta 1298
Score = 613 bits (309), Expect = e-174
Identities = 309/309 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2199 gattatttctgataacaaaccaagattcatatctctttcaacgtttatttttggagaggc 2258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 232 gattatttctgataacaaaccaagattcatatctctttcaacgtttatttttggagaggc 291
Query: 2259 atctatactgaatgatattgactacttgcattctcctgagacaatggatgatttgaagcc 2318
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 292 atctatactgaatgatattgactacttgcattctcctgagacaatggatgatttgaagcc 351
Query: 2319 tgtgacacatcttcttggcgttgatatcacttcagcaagtgggatgaaattacttcgcca 2378
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 352 tgtgacacatcttcttggcgttgatatcacttcagcaagtgggatgaaattacttcgcca 411
Query: 2379 aggcttaaattatctgatggaagggtccacagatgctcgtgtaggtcttctgtttagtgc 2438
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 412 aggcttaaattatctgatggaagggtccacagatgctcgtgtaggtcttctgtttagtgc 471
Query: 2439 caatcaaagttcagattcgtttaccctccttttcgtgaaggcttttgatatcactacatc 2498
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 472 caatcaaagttcagattcgtttaccctccttttcgtgaaggcttttgatatcactacatc 531
Query: 2499 cacatatag 2507
|||||||||
Sbjct: 532 cacatatag 540
Score = 222 bits (112), Expect = 2e-56
Identities = 112/112 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2065 gaggctctactaaatgccttgaatgaagagactcagagaatacaagagcaagtttattat 2124
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gaggctctactaaatgccttgaatgaagagactcagagaatacaagagcaagtttattat 180
Query: 2125 ggacaaataaaaccgcacactgatgtattggccaagttcctatcagaagctg 2176
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ggacaaataaaaccgcacactgatgtattggccaagttcctatcagaagctg 232
>gnl|LJGI|TC72477
Length = 1380
Score = 611 bits (308), Expect = e-173
Identities = 323/328 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 4524 tcaggatcttcctaattatgctcagcataatgtgcccattttttccttgccacaagaatg 4583
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 26 tcaggatcttcctaattatgctcagcataatgtgcccattttttccttgccacaagaatg 85
Query: 4584 gctatggtgtgagtcatggtgtggtaatgctacaaaatccaaggcaaaaacaattgatct 4643
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 86 gctatggtgtgagtcatggtgtggtaatactacaaaatccaaggcaaaaacaattgatct 145
Query: 4644 ctgcaacaatcccatgacaaaagaacccaaacttcagggtgctagacgaatagtatctga 4703
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 146 ctgcaacaatcccatgacaaaagaacccaaacttcagggtgctagacgaatagtatctga 205
Query: 4704 gtggccagaccttgattcggaggcaagtagattcactgcacgaatcttgggtgatgatca 4763
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 206 gtggccagaccttgattcggaggcaagtagtttcactgcacgaatcttgggtgatgatca 265
Query: 4764 agaaccaacacaaacacctgaccagtctaaggatttgacaagtgaagattcattgaaaga 4823
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 266 agaaccaacacaatcacctgaccagtctaaggatttgacaagtgaagattcattgaaaga 325
Query: 4824 agacttggtatccaaggccgagttgtga 4851
|||||||| |||||| ||||||||||||
Sbjct: 326 agacttggaatccaaagccgagttgtga 353
>gnl|LJGI|TC73408
Length = 642
Score = 216 bits (109), Expect = 1e-54
Identities = 127/133 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 4719 ttcggaggcaagtagattcactgcacgaatcttgggtgatgatcaagaaccaacacaaac 4778
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |
Sbjct: 1 ttcggaggcaagtagattcactgcacgaatcttgggtgatgatcaagagccaacaccatc 60
Query: 4779 acctgaccagtctaaggatttgacaagtgaagattcattgaaagaagacttggtatccaa 4838
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 61 acctgaccggtctaaggatttgacaagtgaagattcattgaaagaagacttggaatccaa 120
Query: 4839 ggccgagttgtga 4851
||||||||||||
Sbjct: 121 agccgagttgtga 133