Miyakogusa Predicted Gene
- Lj6g3v2193640.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj6g3v2193640.1 Non Chatacterized Hit- tr|I3RZT1|I3RZT1_LOTJA
Uncharacterized protein OS=Lotus japonicus PE=2 SV=1,99.42,0,seg,NULL;
PENTATRICOPEPTIDE (PPR) REPEAT-CONTAINING PROTEIN,NULL; FAMILY NOT
NAMED,NULL; PPR,Pentatr,CUFF.60791.1
(1200 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC64859 similar to UniRef100_A7QVW6 Cluster: Chromosome... 2379 0.0
>gnl|LJGI|TC64859 similar to UniRef100_A7QVW6 Cluster: Chromosome undetermined
scaffold_194, whole genome shotgun sequence; n=2; Vitis
vinifera|Rep: Chromosome undetermined scaffold_194, whole
genome shotgun sequence - Vitis vinifera (Grape), partial
(77%)
Length = 1480
Score = 2379 bits (1200), Expect = 0.0
Identities = 1200/1200 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggcgtatcgctcactgttcctctctctccggcggaatagcggtttcatcagcaccaac 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 49 atggcgtatcgctcactgttcctctctctccggcggaatagcggtttcatcagcaccaac 108
Query: 61 agtcaccaccatcaatcacgttgtctcctcaacagagccagatttgtttcttcaggtgct 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 109 agtcaccaccatcaatcacgttgtctcctcaacagagccagatttgtttcttcaggtgct 168
Query: 121 gtgagtactgattttgtggaaagtgatgatgatctaaggagcagaatcttgaggctaagg 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 169 gtgagtactgattttgtggaaagtgatgatgatctaaggagcagaatcttgaggctaagg 228
Query: 181 ctccccaagcgaagtgccacaaacattcttcacaaatgggtccttgaagggaactctgtt 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 229 ctccccaagcgaagtgccacaaacattcttcacaaatgggtccttgaagggaactctgtt 288
Query: 241 acagtgtctgagcttcgggatattgccaaagagcttagaagatctcagcgttacaaacac 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 289 acagtgtctgagcttcgggatattgccaaagagcttagaagatctcagcgttacaaacac 348
Query: 301 gctttggagatatcagaatggatgattactcatgaagaacatggcttatcagactctgat 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 349 gctttggagatatcagaatggatgattactcatgaagaacatggcttatcagactctgat 408
Query: 361 tatgctatgcgcatagatttgatgacgaaagttttcggcattgacgctgcagagcgatac 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 409 tatgctatgcgcatagatttgatgacgaaagttttcggcattgacgctgcagagcgatac 468
Query: 421 tttgaggctctaccagttgctgcaaagacaagtgaaacttacacagccctcctccactct 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 469 tttgaggctctaccagttgctgcaaagacaagtgaaacttacacagccctcctccactct 528
Query: 481 tatgctggagccaaaatgactgaaaaagctgaggaactatatcaaaggataaaggattct 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 529 tatgctggagccaaaatgactgaaaaagctgaggaactatatcaaaggataaaggattct 588
Query: 541 aacctctcctttgatgcccttacttacaatgaaatgatgactctttacatgtcagttggg 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 589 aacctctcctttgatgcccttacttacaatgaaatgatgactctttacatgtcagttggg 648
Query: 601 caggttgaaaaggtgccatcagttgttgaagaactaaaacagcgaaatgtctccccagat 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 649 caggttgaaaaggtgccatcagttgttgaagaactaaaacagcgaaatgtctccccagat 708
Query: 661 atatttacgtacaatttatggataagttcctgtgctgctactcttaatattgatgaagtt 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 709 atatttacgtacaatttatggataagttcctgtgctgctactcttaatattgatgaagtt 768
Query: 721 cgaaggattctcgatgaaatgagccatggtgctgattctaatgaaagttggacaagatat 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 769 cgaaggattctcgatgaaatgagccatggtgctgattctaatgaaagttggacaagatat 828
Query: 781 ttgaacctggccaacgtatacgtcactgcaagtcatcttgataattcaagttcaaactca 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 829 ttgaacctggccaacgtatacgtcactgcaagtcatcttgataattcaagttcaaactca 888
Query: 841 cttgctgagaccgagaagaggatcactcaaagtcaatggataacttatgacttcttgatc 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 889 cttgctgagaccgagaagaggatcactcaaagtcaatggataacttatgacttcttgatc 948
Query: 901 attctttatgctgggctgggaagtaaggataaacttgatcagatatggaattcgttgaga 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 949 attctttatgctgggctgggaagtaaggataaacttgatcagatatggaattcgttgaga 1008
Query: 961 atgacgaaacagaaaatgattaacaggaattatagctgcataatttctgcatatctgatg 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1009 atgacgaaacagaaaatgattaacaggaattatagctgcataatttctgcatatctgatg 1068
Query: 1021 cttggtcatgtaaaagaagtaggtgaggttattgatcagtggaagaactcaactatagat 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1069 cttggtcatgtaaaagaagtaggtgaggttattgatcagtggaagaactcaactatagat 1128
Query: 1081 tttgatatgcttgcgtgtaaaaagattatggatgcttttagagccactggcttagctgat 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1129 tttgatatgcttgcgtgtaaaaagattatggatgcttttagagccactggcttagctgat 1188
Query: 1141 atagccaacaacctgaatatgattcttattgagaagaacatcaatccaggaaataactga 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1189 atagccaacaacctgaatatgattcttattgagaagaacatcaatccaggaaataactga 1248