Miyakogusa Predicted Gene
- Lj6g3v2134250.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj6g3v2134250.1 CUFF.60701.1
(1063 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC64413 similar to UniRef100_A7R6C3 Cluster: Chromosome... 2068 0.0
gnl|LJGI|BW599108 similar to UniRef100_A7R6C3 Cluster: Chromosom... 490 e-137
gnl|LJGI|FS343065 88 1e-16
>gnl|LJGI|TC64413 similar to UniRef100_A7R6C3 Cluster: Chromosome undetermined
scaffold_1227, whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis
vinifera|Rep: Chromosome undetermined scaffold_1227,
whole genome shotgun sequence - Vitis vinifera (Grape),
partial (14%)
Length = 1352
Score = 2068 bits (1043), Expect = 0.0
Identities = 1058/1063 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggcctactactacaactctgccaattctgggtctgaatatggtgagtacaatttcaac 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 162 atggcctactactacaactctgccaattctgggtctgaatatggtgagtacaatttcaac 221
Query: 61 tcttatgctgtcaattatgattatgctcctcaagttccaccctttatgaattacaatagc 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 222 tcttatgctgtcaattatgattatgctcctcaagttccaccctttatgaattacaatagc 281
Query: 121 catgagtacaatcaagtgaatcagccatattatggttatgatcaaagtttgtgttttgct 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 282 catgagtacaatcaagtgaatcagccatattatggttatgatcaaagtttgtgttttgct 341
Query: 181 cctaattattaccctgatcagtgttaccaaagggtatcatactctgccaccaattttagt 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 342 cctaattattaccctgatcagtgttaccaaagggtatcatactctgccaccaattttagt 401
Query: 241 gaaccaaaatcacttgtatatgatcctaattatggtatgagccagcttgtgatctcttac 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 402 gaaccaaaatcacttgtatatgatcctaattatggtatgagccagcttgtgatctcttac 461
Query: 301 tctaaattggaattcaatgagcctgaatttgaagaatatgacccaacaccttatggtgga 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 462 tctaaattggaattcaatgagcctgaatttgaagaatatgacccaacaccttatggtgga 521
Query: 361 gggtatgacattgttgagacctatggtaagcctttaccaccttcagataaaatttgccat 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 522 gggtatgacattgttgagacctatggtaagcctttaccaccttcagataaaatttgccat 581
Query: 421 ccacgttctgatgggccaagttcaaatagcatcatccccttggatactgttcctgctgtg 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 582 ccacgttctgatgggccaagttcaaatagcatcatccccttggatactgttcctgctgtg 641
Query: 481 tccatagtaccattgcctactgtgaaagagggaattgatgagaaggccatcataccccag 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 642 tccatagtaccattgcctactgtgaaagagggaattgatgagaaggccatcataccccag 701
Query: 541 aatggaactgcaggacaaatgcttgaagacaagccccaatcacaagatattattagcact 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 702 aatggaactgcaggacaaatgcttgaagacaagccccaatcacaagatattattagcact 761
Query: 601 gatcagccaaaggaagtagaaaacaataggcatgtcacttttgatctaaaggctgatgaa 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 762 gatcagccaaaggaagtagaaaacaataggcatgtcacttttgatctaaaggctgatgaa 821
Query: 661 ggggaagaagacattgaggaaagtgattatgaagatgattactcttctgagtcttgtaat 720
||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||
Sbjct: 822 ggggaagaagacagtgaggaaagtgatgatgaagatgattactcttttgagtctggtaat 881
Query: 721 ggatacagtggagtacagtatgatgagcatgagaagcaagtgcctctgcaatatcctagt 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 882 ggatacagtggagtacagtatgatgagcatgagaagcaagtgcctttgcaatatcctagt 941
Query: 781 ggatatgggttggaaactgtggacatttgtgaaagcttgtttgggaattggccttgtttg 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 942 ggatatgggttggaaactgtggacatttgtgaaagcttgtttgggaattggccttgtttg 1001
Query: 841 tctagaatgaagagagaacaacagcaagctttgggtggaaacaattgccaggacaacatg 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1002 tctagaatgaagagagaacaacagcaagctttgggtggaaacaattgccaggacaacatg 1061
Query: 901 tggcaagggactgcagactatctatttggcaatccatatccatatggtgggagaggggaa 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1062 tggcaagggactgcagactatctatttggcaatccatatccatatggtgggagaggggaa 1121
Query: 961 gatgggagtagctatggaggaaaccttgtctatggctatgaaaggcattatccaagtcaa 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1122 gatgggagtagctatggaggaaaccttgtctatggctatgaaaggcattatccaagtcaa 1181
Query: 1021 gcacagtgctggcagattgattatactgataaatcttggtgat 1063
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1182 gcacagtgctggcagattgattatactgataaatcttggtgat 1224
>gnl|LJGI|BW599108 similar to UniRef100_A7R6C3 Cluster: Chromosome undetermined
scaffold_1227, whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis
vinifera|Rep: Chromosome undetermined scaffold_1227,
whole genome shotgun sequence - Vitis vinifera (Grape),
partial (9%)
Length = 484
Score = 490 bits (247), Expect = e-137
Identities = 253/255 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 144 gccatattatggttatgatcaaagtttgtgttttgctcctaattattaccctgatcagtg 203
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 230 gccatattatggttatgatcaaagtttgtgttttgcacctaattattaccctgatcagtg 289
Query: 204 ttaccaaagggtatcatactctgccaccaattttagtgaaccaaaatcacttgtatatga 263
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 290 ttaccaaagggtatcatactctgccaccaattttagtgaaccaaaatcacttgtatatga 349
Query: 264 tcctaattatggtatgagccagcttgtgatctcttactctaaattggaattcaatgagcc 323
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 350 tcctaattatggtatgagccagcttgtgatctcttactctaaattggaattcaatgagcc 409
Query: 324 tgaatttgaagaatatgacccaacaccttatggtggagggtatgacattgttgagaccta 383
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 410 tgaatttgaagaatatgacccaacgccttatggtggagggtatgacattgttgagaccta 469
Query: 384 tggtaagcctttacc 398
|||||||||||||||
Sbjct: 470 tggtaagcctttacc 484
>gnl|LJGI|FS343065
Length = 502
Score = 87.7 bits (44), Expect = 1e-16
Identities = 155/194 (79%), Gaps = 16/194 (8%)
Strand = Plus / Plus
Query: 111 ttacaatagccatgagtacaatcaagtgaatcagccatattatggttatgatcaaagttt 170
|||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||| ||||||
Sbjct: 1 ttacgatagccatgagtacaatcaaatgaatcaaccatattatgggtactatcgaagttt 60
Query: 171 gtgttttgctcctaattattaccctgatcagtgttaccaaagggtatcatactctgccac 230
|| || ||||||||||| || || | |||||||| ||| | | |||||||||||| |
Sbjct: 61 gtattctgctcctaattg---ccttgcttagtgttactaaacgctgtcatactctgccgc 117
Query: 231 caattttagtgaaccaaaatcacttgtatatgatcctaattatggtatgagccagcttgt 290
|| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 118 cacttttagtgacccaaa-------------gatctcaattatggtatgagcaagcttgt 164
Query: 291 gatctcttactcta 304
||||||||||||||
Sbjct: 165 gatctcttactcta 178