Miyakogusa Predicted Gene
- Lj6g3v2078180.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj6g3v2078180.1 tr|G7ILF8|G7ILF8_MEDTR Lysine/histidine
transporter OS=Medicago truncatula GN=MTR_2g012470 PE=4
SV=1,94.81,0,AMINO ACID TRANSPORTER,NULL; Aa_trans,Amino acid
transporter, transmembrane; seg,NULL,CUFF.60624.1
(1563 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC57352 homologue to UniRef100_A7NTP0 Cluster: Chromoso... 2357 0.0
gnl|LJGI|TC62171 homologue to UniRef100_A7NTP0 Cluster: Chromoso... 1413 0.0
gnl|LJGI|TC60116 similar to UniRef100_A7NTP0 Cluster: Chromosome... 1051 0.0
>gnl|LJGI|TC57352 homologue to UniRef100_A7NTP0 Cluster: Chromosome chr18 scaffold_1,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr18 scaffold_1, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (76%)
Length = 1248
Score = 2357 bits (1189), Expect = 0.0
Identities = 1195/1197 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggaggagagaccagagacagagctgatatctataccagcaacaccaagagtgtcaaca 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 52 atggaggagagaccagagacagagctgatatctataccagcaacaccaagagtgtcaaca 111
Query: 61 ccagagattctgacaccgtcggggcagaggtcaccgagaccaccatcaaaggaagcaaaa 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 112 ccagagattctgacaccgtcggggcagaggtcaccgagaccaccatcaaaggaagcaaaa 171
Query: 121 tcttcaaatgcatggacaccaacctcgttcatatcaccaaggtttctgagtccaatagga 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 172 tcttcaaatgcatggacaccaacctcgttcatatcaccaaggtttctgagtccaatagga 231
Query: 181 accccaatgaagagagtgctcgtcaacatgaagggctacttggaggaggttggtcacctc 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 232 accccaatgaagagagtgctcgtcaacatgaagggctacttggaggaggttggtcacctc 291
Query: 241 actaagctcaaccctcaagatgcatggctccccatcactgaatctcgcaatggaaatgct 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 292 actaagctcaaccctcaagatgcatggctccccatcactgaatctcgcaatggaaatgct 351
Query: 301 cactactctgcgtttcacaacctcaatgctgggattggcttccaggccctccttttgcct 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 352 cactactctgcgtttcacaacctcaatgctgggattggcttccaggccctccttttgcct 411
Query: 361 gttgcttttgcttatcttggctggagttggggaattatttccttaaccatagcatatgtt 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 412 gttgcttttgcttatcttggctggagttggggaattatttccttaaccatagcatatgtt 471
Query: 421 tggcaactttacaccttatggattttggttcagctacatgaagcagttccaggtaaaagg 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 472 tggcaactttacaccttatggattttggttcagctacatgaagcagttccaggtaaaagg 531
Query: 481 tacaacagatatgtggagctagcacaagcagcatttggggaaagattaggagtttggcta 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 532 tacaacagatatgtggagctagcacaagcagcatttggggaaagattaggagtttggcta 591
Query: 541 gctctcttcccaactgtttatttgtcagcaggaacagctacagctttgattcttattgga 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 592 gctctcttcccaactgtttatttgtcagcaggaacagctacagctttgattcttattgga 651
Query: 601 ggggagaccatgaaactgttcttccaaatagtttgtggtcctacatgtacctcaaatcct 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 652 ggggagaccatgaaactgttcttccaaatagtttgtggtcctacatgtacctcaaatcct 711
Query: 661 ttaaccactgtggagtggtacctggttttcacttctctagcaattgtcctgtctcagctt 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 712 ttaaccactgtggagtggtacctggttttcacttctctagcaattgtcctgtctcagctt 771
Query: 721 ccaaacctcaattcaattgcaggcatctcactcataggtgctgttacagccatcacttac 780
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 772 tccaacctcaattcaattgcaggcatctcactcataggtgctgttacagccatcacttac 831
Query: 781 tccaccatggtctgggtactctctgtcagccaacaaaggccaccctctatctcttatgaa 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 832 tccaccatggtctgggtactctctgtcagccaacaaaggccaccctctatctcttatgaa 891
Query: 841 cccctgtctatgcaatcatcatcttcttctttgtttctggcattgaatgcacttggaatt 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 892 cccctgtctatgcaatcatcatcttcttctttgtttctggcattgaatgcacttggaatt 951
Query: 901 gtagccttttctttcagaggccacaatttggtccttgaagttcaggccacaatgccatca 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 952 gtagccttttctttcagaggccacaatttggtccttgaagttcaggccacaatgccatca 1011
Query: 961 acttttaagcaccctgcccgcgtgccaatgtggaaaggagccaaggttgcttatttcttc 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1012 acttttaagcaccctgcccgcgtgccaatgtggaaaggagccaaggttgcttatttcttc 1071
Query: 1021 attgcaatgtgcatcttccctgtttctattggtggattttgggcctatgggaaccaaatg 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1072 attgcaatgtgcatcttccctgtttctattggtggattttgggcctatgggaaccaaatg 1131
Query: 1081 cctcctggagggattctcactgccttatatgcatttcacagtcatgacatctcaagaggg 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1132 cctcctggagggattctcactgccttatatgcatttcacagtcatgacatctcaagaggg 1191
Query: 1141 attctggccttagcattccttcttgttgtgttcaactgcttgagcagtttccagata 1197
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1192 attctggccttagcattccttcttgttgtgttcaactgcttgagcagtttccagata 1248
>gnl|LJGI|TC62171 homologue to UniRef100_A7NTP0 Cluster: Chromosome chr18 scaffold_1,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr18 scaffold_1, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (45%)
Length = 1101
Score = 1413 bits (713), Expect = 0.0
Identities = 713/713 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggaggagagaccagagacagagctgatatctataccagcaacaccaagagtgtcaaca 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 389 atggaggagagaccagagacagagctgatatctataccagcaacaccaagagtgtcaaca 448
Query: 61 ccagagattctgacaccgtcggggcagaggtcaccgagaccaccatcaaaggaagcaaaa 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 449 ccagagattctgacaccgtcggggcagaggtcaccgagaccaccatcaaaggaagcaaaa 508
Query: 121 tcttcaaatgcatggacaccaacctcgttcatatcaccaaggtttctgagtccaatagga 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 509 tcttcaaatgcatggacaccaacctcgttcatatcaccaaggtttctgagtccaatagga 568
Query: 181 accccaatgaagagagtgctcgtcaacatgaagggctacttggaggaggttggtcacctc 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 569 accccaatgaagagagtgctcgtcaacatgaagggctacttggaggaggttggtcacctc 628
Query: 241 actaagctcaaccctcaagatgcatggctccccatcactgaatctcgcaatggaaatgct 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 629 actaagctcaaccctcaagatgcatggctccccatcactgaatctcgcaatggaaatgct 688
Query: 301 cactactctgcgtttcacaacctcaatgctgggattggcttccaggccctccttttgcct 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 689 cactactctgcgtttcacaacctcaatgctgggattggcttccaggccctccttttgcct 748
Query: 361 gttgcttttgcttatcttggctggagttggggaattatttccttaaccatagcatatgtt 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 749 gttgcttttgcttatcttggctggagttggggaattatttccttaaccatagcatatgtt 808
Query: 421 tggcaactttacaccttatggattttggttcagctacatgaagcagttccaggtaaaagg 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 809 tggcaactttacaccttatggattttggttcagctacatgaagcagttccaggtaaaagg 868
Query: 481 tacaacagatatgtggagctagcacaagcagcatttggggaaagattaggagtttggcta 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 869 tacaacagatatgtggagctagcacaagcagcatttggggaaagattaggagtttggcta 928
Query: 541 gctctcttcccaactgtttatttgtcagcaggaacagctacagctttgattcttattgga 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 929 gctctcttcccaactgtttatttgtcagcaggaacagctacagctttgattcttattgga 988
Query: 601 ggggagaccatgaaactgttcttccaaatagtttgtggtcctacatgtacctcaaatcct 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 989 ggggagaccatgaaactgttcttccaaatagtttgtggtcctacatgtacctcaaatcct 1048
Query: 661 ttaaccactgtggagtggtacctggttttcacttctctagcaattgtcctgtc 713
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1049 ttaaccactgtggagtggtacctggttttcacttctctagcaattgtcctgtc 1101
>gnl|LJGI|TC60116 similar to UniRef100_A7NTP0 Cluster: Chromosome chr18 scaffold_1,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr18 scaffold_1, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (34%)
Length = 943
Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0
Identities = 530/530 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1034 tcttccctgtttctattggtggattttgggcctatgggaaccaaatgcctcctggaggga 1093
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4 tcttccctgtttctattggtggattttgggcctatgggaaccaaatgcctcctggaggga 63
Query: 1094 ttctcactgccttatatgcatttcacagtcatgacatctcaagagggattctggccttag 1153
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 64 ttctcactgccttatatgcatttcacagtcatgacatctcaagagggattctggccttag 123
Query: 1154 cattccttcttgttgtgttcaactgcttgagcagtttccagatatactcaatgcctgctt 1213
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 124 cattccttcttgttgtgttcaactgcttgagcagtttccagatatactcaatgcctgctt 183
Query: 1214 ttgacagttttgaagctggatacaccagcagaacaaaccgtccctgctcgatatgggtcc 1273
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 184 ttgacagttttgaagctggatacaccagcagaacaaaccgtccctgctcgatatgggtcc 243
Query: 1274 ggtcaggttttagagtcttctttggatttgtctccttcttcataggagtggctcttccct 1333
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 244 ggtcaggttttagagtcttctttggatttgtctccttcttcataggagtggctcttccct 303
Query: 1334 tcctctcaagtcttgctggtttgttgggaggactcactcttccagtcacttttgcatatc 1393
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 304 tcctctcaagtcttgctggtttgttgggaggactcactcttccagtcacttttgcatatc 363
Query: 1394 cttgcttcatgtgggttctcattaaacagccaacaaaatacagcttcaattggtatttca 1453
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 364 cttgcttcatgtgggttctcattaaacagccaacaaaatacagcttcaattggtatttca 423
Query: 1454 actggattctaggctggttgggggttggttttagcttggctttctccattgggggaattt 1513
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 424 actggattctaggctggttgggggttggttttagcttggctttctccattgggggaattt 483
Query: 1514 ggagcatggtgaataatggactcaaattgaaattcttcaagcccagttga 1563
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 484 ggagcatggtgaataatggactcaaattgaaattcttcaagcccagttga 533