Miyakogusa Predicted Gene
- Lj6g3v1984420.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj6g3v1984420.1 tr|B9GJ67|B9GJ67_POPTR Predicted protein
OS=Populus trichocarpa GN=POPTRDRAFT_753597 PE=4
SV=1,28.05,6e-18,seg,NULL,CUFF.60387.1
(1809 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC62503 1513 0.0
>gnl|LJGI|TC62503
Length = 789
Score = 1513 bits (763), Expect = 0.0
Identities = 780/788 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 123 aacgaagaagatgatgaatcagagcaagcaagtagcctcgttgaccacctctcgtttgtc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2 aacgaagaagatgatgaatcagagcaagcaagtagcctcgttgaccacctctcgtttgtc 61
Query: 183 accgcttgcagaacccttcaccctcaaccgctctccctatcaacaacaaccacccacttc 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 62 accgcttgcagaacccttcaccctcaaccgctctccctatcaacaacaaccacccacttc 121
Query: 243 gtattcatcatctcctctcgatgaccctttcagctccttgcttgattctttcctagaatg 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 122 gtattcatcatctcctctcgatgaccctttcagctccttgcttgattctttcctagaatg 181
Query: 303 taacatgggttcaatctcaaagtctcactctgtgggtgactctgtcataccaactttgcc 362
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 182 taacatgggttcaatctcaaagtctcactctgtgggtgactctgtcataccaactttgcc 241
Query: 363 ccttgaaattgccgaggagaaatcaatttttgagcaacacccatctctggaattgccaag 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 242 ccttgaaattgccgaggagaaatcaatttttgagcaacacccatctctggaattgccaag 301
Query: 423 ttatggtgagtttaatgggccactgtttgatgtttcgttacccgctaactcaccgtcagt 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 302 ttatggtgagtttaatgggccactgtttgatgtttcgttacccgctaactcaccgtcagt 361
Query: 483 tactggcttaggctatgggatacaactacaaggagtggattttcatcagggtttgtttgg 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 362 tactggcttaggctatgggatacaactacaaggagtggattttcatcagggtttgtttgg 421
Query: 543 taaaggaaatgatgatgctggcacttcagttgctgatagtgatgcgggcaagtttcagaa 602
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 422 taaaggaaatgatgatgctggcacttcagttgctgatagtgatgcgggcaagtttcagaa 481
Query: 603 aggtaagcatgccgttgatgagttaactccctctctaacaatgtcggaaggcattttggn 662
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 482 aggtaagcatgccgttgatgagttaactccctctctaacaatgtcggaaggcattttgga 541
Query: 663 nnnnnncaccggtataattgtggcaaatgacattctatcaaattctgaaggcatagtaca 722
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 542 aaaaaacaccggtataattgtggcaaatgacattctatcaaattatgaaggcatagtaca 601
Query: 723 cactgctgatgaatatagctcctttcttatctccaattgtaaggttgccccactcaagtt 782
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 602 cactgctgatgaatatagctcctttcttatctccaattgtaaggttgccccactcaagtt 661
Query: 783 atcaacaactgatatgtcctccactaaaagcacccctcaaaatcatttctcccctatttt 842
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 662 atcaacaactgatatgtcctccactaaaagcacccctcaaaatcatttctcccctatttt 721
Query: 843 ggatgacaatgaccctgatgtggattctccttgttggaagggaaccgctgcttttagcct 902
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 722 ggatgacaatgaccctgatgtggattctccttgttggaagggaaccgctgcttttagcct 781
Query: 903 acctccat 910
||||||||
Sbjct: 782 acctccat 789