Miyakogusa Predicted Gene
- Lj6g3v1966340.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj6g3v1966340.1 tr|C6ZJY9|C6ZJY9_SOYBN Serine
hydroxymethyltransferase 4 OS=Glycine max PE=2
SV=1,84.01,0,SHMT,Serine hydroxymethyltransferase; PLP-dependent
transferases,Pyridoxal phosphate-dependent trans,CUFF.60308.1
(1554 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC80734 similar to UniRef100_A9PL11 Cluster: Plastid se... 3081 0.0
>gnl|LJGI|TC80734 similar to UniRef100_A9PL11 Cluster: Plastid serine
hydroxymethyltransferase; n=1; Populus tremuloides|Rep:
Plastid serine hydroxymethyltransferase - Populus
tremuloides (Quaking aspen), partial (88%)
Length = 2011
Score = 3081 bits (1554), Expect = 0.0
Identities = 1554/1554 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgcaagcctgtactggagttgcaatgatgggttctatgcaacaacctgcttggaccaag 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 163 atgcaagcctgtactggagttgcaatgatgggttctatgcaacaacctgcttggaccaag 222
Query: 61 gggcagagtttccctgcaatagggtatggcagcaatggctttatacctcaagtcaagttc 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 223 gggcagagtttccctgcaatagggtatggcagcaatggctttatacctcaagtcaagttc 282
Query: 121 tgcaatgtcaagccatgcaaagcatcatctttgtctatctccgtgcctgaaattaaaggt 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 283 tgcaatgtcaagccatgcaaagcatcatctttgtctatctccgtgcctgaaattaaaggt 342
Query: 181 gacggtagtagaatcctggactctggcttgagtgaagttgatcctgaggtttatgcaatt 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 343 gacggtagtagaatcctggactctggcttgagtgaagttgatcctgaggtttatgcaatt 402
Query: 241 atcggcaaggaaaaagaccgtcaatttaaaagtcttgagcttattgcttctgaaaatttt 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 403 atcggcaaggaaaaagaccgtcaatttaaaagtcttgagcttattgcttctgaaaatttt 462
Query: 301 acatctagagcagtgatggaagcagttggttcatgcctcacaaacaagtactcagaagga 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 463 acatctagagcagtgatggaagcagttggttcatgcctcacaaacaagtactcagaagga 522
Query: 361 cttcctggtaaaaggtactatggtggcaatgagttcattgatgagcttgaaatcaaatgt 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 523 cttcctggtaaaaggtactatggtggcaatgagttcattgatgagcttgaaatcaaatgt 582
Query: 421 caagaaagggcactggctgcatttcatgtagatggtaataagtggggtgttaatgttcaa 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 583 caagaaagggcactggctgcatttcatgtagatggtaataagtggggtgttaatgttcaa 642
Query: 481 ccattatctggttctccagctaactttgcagtgtacactgcattacttaaacctcatgat 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 643 ccattatctggttctccagctaactttgcagtgtacactgcattacttaaacctcatgat 702
Query: 541 cgaataatgggtttggacttgcctcatgggggccatttgtctcatggatttatgacgcct 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 703 cgaataatgggtttggacttgcctcatgggggccatttgtctcatggatttatgacgcct 762
Query: 601 aaaagacgtgtatcagccacatcaatttattttgaatctatgccttatcgacttgatgaa 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 763 aaaagacgtgtatcagccacatcaatttattttgaatctatgccttatcgacttgatgaa 822
Query: 661 tcaacaggttttattgattatgatatgctggagaaaactgctattctcttccgaccaaaa 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 823 tcaacaggttttattgattatgatatgctggagaaaactgctattctcttccgaccaaaa 882
Query: 721 ctcataattgctggtgctagtgcttatcctcgagacattgactatcctcgcatgagaaaa 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 883 ctcataattgctggtgctagtgcttatcctcgagacattgactatcctcgcatgagaaaa 942
Query: 781 attgcagatcaagtaggagctttccttatgatggatatggctcacataagtggacttgtt 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 943 attgcagatcaagtaggagctttccttatgatggatatggctcacataagtggacttgtt 1002
Query: 841 gctgcatctgtgcttgctaatccctttgatttctgtgacatcgtgaccaccacaacccac 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1003 gctgcatctgtgcttgctaatccctttgatttctgtgacatcgtgaccaccacaacccac 1062
Query: 901 aagtctttgagaggccctagaggtggtatgatattcttcaagaaggatacagtgcatggg 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1063 aagtctttgagaggccctagaggtggtatgatattcttcaagaaggatacagtgcatggg 1122
Query: 961 gttgatctggagcctgccattaacaatgctgttttccccggtctccaggggggtcctcat 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1123 gttgatctggagcctgccattaacaatgctgttttccccggtctccaggggggtcctcat 1182
Query: 1021 aaccacacaatcggaggactagcggtttgcttggagcatgcccagtctccagaattcaaa 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1183 aaccacacaatcggaggactagcggtttgcttggagcatgcccagtctccagaattcaaa 1242
Query: 1081 gtttaccaaaaccaggtggttgctaactgtagagctttggctaaccggttagtcgagctg 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1243 gtttaccaaaaccaggtggttgctaactgtagagctttggctaaccggttagtcgagctg 1302
Query: 1141 gggtataaactggtttctggtggtagtgataatcacctggttcttgttgatctgaggcca 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1303 gggtataaactggtttctggtggtagtgataatcacctggttcttgttgatctgaggcca 1362
Query: 1201 tctggtattgatggtgctcggacagagaaaattcttgatctggcttctataacactcaac 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1363 tctggtattgatggtgctcggacagagaaaattcttgatctggcttctataacactcaac 1422
Query: 1261 aagaactcagtgcctggtgataagagtgccctagttccaggtggcattcgcatcgggtca 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1423 aagaactcagtgcctggtgataagagtgccctagttccaggtggcattcgcatcgggtca 1482
Query: 1321 cctgcaatgacaacaagaggacttggtgaaaaagaatttgcactaattgcagacttaatt 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1483 cctgcaatgacaacaagaggacttggtgaaaaagaatttgcactaattgcagacttaatt 1542
Query: 1381 cacgagggtgtgcagataagtcttgaagccaaaagtttggcctcaggatcaaagctccaa 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1543 cacgagggtgtgcagataagtcttgaagccaaaagtttggcctcaggatcaaagctccaa 1602
Query: 1441 gattttatgaaccttgttttatctcctgaatttcctttgcaagacaaggttacagagtta 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1603 gattttatgaaccttgttttatctcctgaatttcctttgcaagacaaggttacagagtta 1662
Query: 1501 cgtaagaaagttgaagcacttgctactcggtatccaattcctggagtctaattg 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1663 cgtaagaaagttgaagcacttgctactcggtatccaattcctggagtctaattg 1716