Miyakogusa Predicted Gene
- Lj6g3v1918250.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj6g3v1918250.1 tr|G7ISJ8|G7ISJ8_MEDTR Beta-amylase OS=Medicago
truncatula GN=MTR_2g020240 PE=3 SV=1,77.59,0,seg,NULL; SUBFAMILY NOT
NAMED,NULL; FAMILY NOT NAMED,NULL; no description,Glycoside hydrolase,
catal,CUFF.60195.1
(1617 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC69629 similar to UniRef100_Q5F304 Cluster: Beta-amyla... 3079 0.0
gnl|LJGI|TC61538 similar to UniRef100_Q5F304 Cluster: Beta-amyla... 785 0.0
gnl|LJGI|GO020251 similar to UniRef100_Q5F304 Cluster: Beta-amyl... 688 0.0
gnl|LJGI|FS324643 weakly similar to UniRef100_Q5F304 Cluster: Be... 391 e-107
>gnl|LJGI|TC69629 similar to UniRef100_Q5F304 Cluster: Beta-amylase; n=1; Glycine
max|Rep: Beta-amylase - Glycine max (Soybean), partial
(86%)
Length = 1986
Score = 3079 bits (1553), Expect = 0.0
Identities = 1596/1617 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggaggtttcggttattggaagctctcaagcgaagttgggaaagtctgatttggtgact 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 133 atggaggtttcggttattggaagctctcaagcgaagttgggaaagtctgatttggtgact 192
Query: 61 agggaacagggtttttgttttgtgaaggaaagttgcaggattgaaaataatagagttagt 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 193 agggaacagggtttttgttttgtgaaggaaagttgcaggattgaaaataatagagttagt 252
Query: 121 tttggtgggaatatgaggtggaagaaggatggtttgcgtttcagtttgagagctgttcat 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 253 tttggtgggaatatgaggtggaagaaggatggtttgcgtttcagtttgagagctgttcat 312
Query: 181 catgctgaaccagttctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtcattctgggtctggaacagga 240
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 313 catgctgaaccagttctagagaagaagaagaagaagagtcattctgggtctggaacagga 372
Query: 241 tcatccaattcggtagatggtgtaagattatttgtagggctgcctctagatgccgtttct 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 373 tcatccaattcggtagatggtgtaagattatttgtagggctgcctctagatgccgtttct 432
Query: 301 tacgactgcagttcattaaatcattctagagcaattgcagctggcctaagagcgttgaag 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 433 tacgactgcagttcattaaatcattctagagcaattgcagctggcctaagagcgttgaag 492
Query: 361 ctattaggagtagaaggtgttgagctccctgtttggtggggaattgttgagaaagaggcc 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 493 ctattaggagtagaaggtgttgagctccctgtttggtggggaattgttgagaaagaggcc 552
Query: 421 atgggagaatataattggtcaggctatcttgccattgctgagatggttcagaaagcgggt 480
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 553 atgggagaatataattggtcaggctatcttgccattgctgagatggttcaaaaagcgggt 612
Query: 481 ctcaagctccatatgaccctttgctttcatgggtctgaaaaaccaaacattcccctaccc 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 613 ctcaagctccatatgaccctttgctttcatgggtctgaaaaaccaaacattcccctaccc 672
Query: 541 aaatgggtgtccaagattggtgaatctcagtccagtattttcttcacagaccggtcagga 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 673 aaatgggtgtccaagattggtgaatctcagtccagtattttcttcacagaccggtcagga 732
Query: 601 cagcgttataacgaatatctgtcgctagcggttgataatcttccagttcttgatgggaag 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 733 cagcgttataacgaatatctgtcgctagcggttgataatcttccagttcttgatgggaag 792
Query: 661 acaccagttcaagtgtaccaaagtttctgtgagagcttcaagtcttcattctctgccttc 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 793 acaccagttcaagtgtaccaaagtttctgtgagagcttcaagtcttcattctctgccttc 852
Query: 721 atgggctctacaattacgggcatttccatgggtttaggaccagaaggcgagctacggtat 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 853 atgggctctacaattacgggcatttccatgggtttaggaccagaaggcgagctacggtat 912
Query: 781 ccatctcaccaccacagtaatggtaaaactcaaggagtaggggaatttcagtgctatgac 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 913 ccatctcaccaccacagtaatggtaaaactcaaggagtaggggaatttcagtgctatgac 972
Query: 841 caaaacatgctccaacttctcaagcaacatgctgaggcatctggaaatcctttatggggg 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 973 caaaacatgctccaacttctcaagcaacatgctgaggcatctggaaatcctttatggggg 1032
Query: 901 cttggtggtcctcatgatgtccccacctatgaccagccaccacactccaataacttcttc 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1033 cttggtggtcctcatgatgtccccacctatgaccagccaccacactccaataacttcttc 1092
Query: 961 aaggatgggggttcttgggagtctcaatatggagacttcttcctttcctggtattctaat 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1093 aaggatgggggttcttgggagtctcaatatggagacttcttcctttcctggtattctaat 1152
Query: 1021 cagcttatcactcatggtgattgcctcctctcactagcagcttctactttcggtgacacc 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1153 cagcttatcactcatggtgattgcctcctctcactagcagcttctactttcggtgacacc 1212
Query: 1081 ggagtgacaatacatggaaaaatcccactcatgcacacttggtatggaactcaatcccat 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1213 ggagtgacaatacatggaaaaatcccactcatgcacacttggtatggaactcaatcccat 1272
Query: 1141 ccttccgagctaacagcagggttctataacacagctaacagggagggttatgaacccgtt 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1273 ccttccgagctaacagcagggttctataacacagctaacagggagggttatgaacccgtt 1332
Query: 1201 gcaaaaatctttgctaagaactcttgcaagattatgttgcctggattggacctttccgac 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1333 gcaaaaatctttgctaagaactcttgcaagattatgttgcctggattggacctttccgac 1392
Query: 1261 gcaaaccagccgagtgaaacccgctcgagccctgagtcacttcttgcacaaattatggca 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1393 gcaaaccagccgagtgaaacccgctcgagccctgagtcacttcttgcacaaattatggca 1452
Query: 1321 tcttgcagaaatcatggtgtaagggtttcaggtcaaaattcttcagtttttggtgcacca 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1453 tcttgcagaaatcatggtgtaagggtttcaggtcaaaattcttcagtttttggtgcacca 1512
Query: 1381 gagggttttgatcaaattaagaagaatttatcaggagataatgtgctggacttgttcaca 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1513 gagggttttgatcaaattaagaagaatttatcaggagataatgtgctggacttgttcaca 1572
Query: 1441 tatcagagaatgggagcatatttcttttctcctgagcattttccttcattcacagagttt 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1573 tatcagagaatgggagcatatttcttttctcctgagcattttccttcattcacagagttt 1632
Query: 1501 gttcgaagccttaatcaaccggaactgcactcagatgatcttcctaccgtagaggaagaa 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1633 gttcgaagccttaatcaaccggaactgcactcagatgatcttcctaccgtagaggaagaa 1692
Query: 1561 ggcactgaatctgcagttaatagtcaagaatcaagcataagcatgcaagcggcctaa 1617
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1693 ggcactgaatctgcagttaatagtcaagaatcaagcataagcatgcaagcggcctaa 1749
>gnl|LJGI|TC61538 similar to UniRef100_Q5F304 Cluster: Beta-amylase; n=1; Glycine
max|Rep: Beta-amylase - Glycine max (Soybean), partial
(22%)
Length = 708
Score = 785 bits (396), Expect = 0.0
Identities = 396/396 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1222 tcttgcaagattatgttgcctggattggacctttccgacgcaaaccagccgagtgaaacc 1281
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2 tcttgcaagattatgttgcctggattggacctttccgacgcaaaccagccgagtgaaacc 61
Query: 1282 cgctcgagccctgagtcacttcttgcacaaattatggcatcttgcagaaatcatggtgta 1341
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 62 cgctcgagccctgagtcacttcttgcacaaattatggcatcttgcagaaatcatggtgta 121
Query: 1342 agggtttcaggtcaaaattcttcagtttttggtgcaccagagggttttgatcaaattaag 1401
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 122 agggtttcaggtcaaaattcttcagtttttggtgcaccagagggttttgatcaaattaag 181
Query: 1402 aagaatttatcaggagataatgtgctggacttgttcacatatcagagaatgggagcatat 1461
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 182 aagaatttatcaggagataatgtgctggacttgttcacatatcagagaatgggagcatat 241
Query: 1462 ttcttttctcctgagcattttccttcattcacagagtttgttcgaagccttaatcaaccg 1521
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 242 ttcttttctcctgagcattttccttcattcacagagtttgttcgaagccttaatcaaccg 301
Query: 1522 gaactgcactcagatgatcttcctaccgtagaggaagaaggcactgaatctgcagttaat 1581
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 302 gaactgcactcagatgatcttcctaccgtagaggaagaaggcactgaatctgcagttaat 361
Query: 1582 agtcaagaatcaagcataagcatgcaagcggcctaa 1617
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 362 agtcaagaatcaagcataagcatgcaagcggcctaa 397
>gnl|LJGI|GO020251 similar to UniRef100_Q5F304 Cluster: Beta-amylase; n=1; Glycine
max|Rep: Beta-amylase - Glycine max (Soybean), partial
(40%)
Length = 710
Score = 688 bits (347), Expect = 0.0
Identities = 354/355 (99%), Gaps = 1/355 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1108 ctcatgcacacttggtatggaactcaatcccatccttccgagctaacagcagggttctat 1167
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 352 ctcatgcacacttggtatggaactcaatcccatccttccgagctaacagcagggttctat 411
Query: 1168 aacacagctaacagggagggttatgaacccgttgcaaaaatctttgctaagaactcttgc 1227
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 412 aacacagctaacagggagggttatgaacccgttgcaaaaatctttgctaagaactcttgc 471
Query: 1228 aagattatgttgcctggattggacctttccgacgcaaaccagccgagtgaaacccgctcg 1287
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 472 aagattatgttgcctggattggacctttccgacgcaaaccagccgagtgaaacccgctcg 531
Query: 1288 agccctgagtcacttcttgcacaaattatggcatcttgcagaaatcatggtgtaagggtt 1347
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 532 agccctgagtcacttcttgcacaaattatggcatcttgcagaaatcatggtgtaagggtt 591
Query: 1348 tcaggtcaaaattcttcagtttttggtgcaccagagggttttgatcaaattaagaagaat 1407
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 592 tcaggtcaaaattcttcagtttttggtgcaccagagggttttgatcaaattaagaagaat 651
Query: 1408 ttatcaggagataatgtgctggacttgttcacatatcagagaatgggagcatatt 1462
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 652 ttatca-gagataatgtgctggacttgttcacatatcagagaatgggagcatatt 705
Score = 430 bits (217), Expect = e-119
Identities = 220/221 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 542 aatgggtgtccaagattggtgaatctcagtccagtattttcttcacagaccggtcaggac 601
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 63 aatgggtgtccaagattggtgaatctcagtccagtattttcttcacagaccggtcaggac 122
Query: 602 agcgttataacgaatatctgtcgctagcggttgataatcttccagttcttgatgggaaga 661
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 123 agcgttataacgaatatctgtcgctagcggttgataatcttccagttcttgatgggaaga 182
Query: 662 caccagttcaagtgtaccaaagtttctgtgagagcttcaagtcttcattctctgccttca 721
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 183 caccagttcaagtgtaccaaagtttctgtgagagcttcaagtcttcattctctgccttca 242
Query: 722 tgggctctacaattacgggcatttccatgggtttaggacca 762
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 243 tgggccctacaattacgggcatttccatgggtttaggacca 283
Score = 149 bits (75), Expect = 6e-35
Identities = 78/79 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 838 gaccaaaacatgctccaacttctcaagcaacatgctgaggcatctggaaatcctttatgg 897
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 279 gaccaaaacatgctccaactactcaagcaacatgctgaggcatctggaaatcctttatgg 338
Query: 898 gggcttggtggtcctcatg 916
|||||||||||||||||||
Sbjct: 339 gggcttggtggtcctcatg 357
Score = 85.7 bits (43), Expect = 8e-16
Identities = 43/43 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 761 cagaaggcgagctacggtatccatctcaccaccacagtaatgg 803
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 25 cagaaggcgagctacggtatccatctcaccaccacagtaatgg 67
Score = 54.0 bits (27), Expect = 3e-06
Identities = 27/27 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 72 tttttgttttgtgaaggaaagttgcag 98
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 tttttgttttgtgaaggaaagttgcag 27
>gnl|LJGI|FS324643 weakly similar to UniRef100_Q5F304 Cluster: Beta-amylase; n=1;
Glycine max|Rep: Beta-amylase - Glycine max (Soybean),
partial (8%)
Length = 475
Score = 391 bits (197), Expect = e-107
Identities = 197/197 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggaggtttcggttattggaagctctcaagcgaagttgggaaagtctgatttggtgact 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 131 atggaggtttcggttattggaagctctcaagcgaagttgggaaagtctgatttggtgact 190
Query: 61 agggaacagggtttttgttttgtgaaggaaagttgcaggattgaaaataatagagttagt 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 191 agggaacagggtttttgttttgtgaaggaaagttgcaggattgaaaataatagagttagt 250
Query: 121 tttggtgggaatatgaggtggaagaaggatggtttgcgtttcagtttgagagctgttcat 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 251 tttggtgggaatatgaggtggaagaaggatggtttgcgtttcagtttgagagctgttcat 310
Query: 181 catgctgaaccagttct 197
|||||||||||||||||
Sbjct: 311 catgctgaaccagttct 327