Miyakogusa Predicted Gene
- Lj6g3v1887800.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj6g3v1887800.1 gi|18266052|gb|AF459587.1|.path1.1
(1296 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC74374 UniRef100_Q8GT61 Cluster: Glutamine synthetase;... 2569 0.0
gnl|LJGI|TC57157 UniRef100_Q8GT61 Cluster: Glutamine synthetase;... 2569 0.0
gnl|LJGI|BW623736 UniRef100_Q5QKQ5 Cluster: Glutamine synthetase... 533 e-151
gnl|LJGI|BP058404 homologue to UniRef100_P08281 Cluster: Glutami... 165 9e-40
gnl|LJGI|TC61595 homologue to UniRef100_Q84L15 Cluster: Glutamin... 78 2e-13
gnl|LJGI|TC72874 UniRef100_Q42899 Cluster: Glutamine synthetase ... 62 9e-09
>gnl|LJGI|TC74374 UniRef100_Q8GT61 Cluster: Glutamine synthetase; n=1; Lotus
japonicus|Rep: Glutamine synthetase - Lotus japonicus,
complete
Length = 1720
Score = 2569 bits (1296), Expect = 0.0
Identities = 1296/1296 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggcacagattttggcaccctcgacgcaatggcagacgagaatcaccaaaacctctccc 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 147 atggcacagattttggcaccctcgacgcaatggcagacgagaatcaccaaaacctctccc 206
Query: 61 aatgcaagtcccattacatcaaacatgtggagttctttattgtggaaacaaaacaagaaa 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 207 aatgcaagtcccattacatcaaacatgtggagttctttattgtggaaacaaaacaagaaa 266
Query: 121 gttgcacgtgcttctaagtttagagtactggcaatcaagtctgatggtagcaccatcaac 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 267 gttgcacgtgcttctaagtttagagtactggcaatcaagtctgatggtagcaccatcaac 326
Query: 181 aggctagagggtctgcttaatttggatgtcactccatacactgataagttcattgctgag 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 327 aggctagagggtctgcttaatttggatgtcactccatacactgataagttcattgctgag 386
Query: 241 tacatctggattggggggactggtgtcgatgttcgcagtaaatcaagaactatatcgaag 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 387 tacatctggattggggggactggtgtcgatgttcgcagtaaatcaagaactatatcgaag 446
Query: 301 cctgtttcacatccctctgagctccctaaatggaactatgatggatctagcactgggcag 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 447 cctgtttcacatccctctgagctccctaaatggaactatgatggatctagcactgggcag 506
Query: 361 gcaccgggcgatgatagtgaagtaattctatatcctcaagcaattttcagagatcctttc 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 507 gcaccgggcgatgatagtgaagtaattctatatcctcaagcaattttcagagatcctttc 566
Query: 421 cgtggtggtaacaatattttggttatttgcgatgcttacacaccacaaggtgagcctatc 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 567 cgtggtggtaacaatattttggttatttgcgatgcttacacaccacaaggtgagcctatc 626
Query: 481 cctacaaacaagcggcacagagctgctgaaatcttcagtaacccaaaggttcaagctgaa 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 627 cctacaaacaagcggcacagagctgctgaaatcttcagtaacccaaaggttcaagctgaa 686
Query: 541 attccatggtatggaatagaacaagagtacaccctacttcaaacggatgtgaagtggcct 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 687 attccatggtatggaatagaacaagagtacaccctacttcaaacggatgtgaagtggcct 746
Query: 601 ttgggatggcctgttggcggctatcctggtcctcagggtccctattactgtgctgccggg 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 747 ttgggatggcctgttggcggctatcctggtcctcagggtccctattactgtgctgccggg 806
Query: 661 gctgataagtcattcggacgtgatatatctgatgctcattacaaggcttgcttgtatgct 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 807 gctgataagtcattcggacgtgatatatctgatgctcattacaaggcttgcttgtatgct 866
Query: 721 ggaatcaacatcagtggcaccaatggggaggttatgcctgggcagtgggagtatcaagtt 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 867 ggaatcaacatcagtggcaccaatggggaggttatgcctgggcagtgggagtatcaagtt 926
Query: 781 ggtcctagtgtaggtattgaagctggtgatcatatctgggcttcaaggtacctccttgag 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 927 ggtcctagtgtaggtattgaagctggtgatcatatctgggcttcaaggtacctccttgag 986
Query: 841 agaatcactgaacaagctggtgttgtcctcactcttgatccaaaaccaattgagggtgac 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 987 agaatcactgaacaagctggtgttgtcctcactcttgatccaaaaccaattgagggtgac 1046
Query: 901 tggaacggtgccggagcccacaccaattacagcacaaagagcatgagggaagagggaggc 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1047 tggaacggtgccggagcccacaccaattacagcacaaagagcatgagggaagagggaggc 1106
Query: 961 tttgaggtaatcaagaaggcaattttgaatctatcccttcgccaccaggaccatattcgt 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1107 tttgaggtaatcaagaaggcaattttgaatctatcccttcgccaccaggaccatattcgt 1166
Query: 1021 gcttatggagaaggaaatgagagacgattgacgggaaagcatgaaacagccgacattaac 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1167 gcttatggagaaggaaatgagagacgattgacgggaaagcatgaaacagccgacattaac 1226
Query: 1081 acattttcttggggagtggctaaccggggttgctcaatccgtgtgggaagagacacagag 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1227 acattttcttggggagtggctaaccggggttgctcaatccgtgtgggaagagacacagag 1286
Query: 1141 aaggaaggaaaaggttacttggaagacaggcgccctgcttcaaacatggatccatatgtt 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1287 aaggaaggaaaaggttacttggaagacaggcgccctgcttcaaacatggatccatatgtt 1346
Query: 1201 gtgacagcattgctggcagagactaccttgttgtgggaaccaactctagaggctgaagct 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1347 gtgacagcattgctggcagagactaccttgttgtgggaaccaactctagaggctgaagct 1406
Query: 1261 cttgcagctcagaagatacaattgaaggtctaaatc 1296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1407 cttgcagctcagaagatacaattgaaggtctaaatc 1442
>gnl|LJGI|TC57157 UniRef100_Q8GT61 Cluster: Glutamine synthetase; n=1; Lotus
japonicus|Rep: Glutamine synthetase - Lotus japonicus,
complete
Length = 1585
Score = 2569 bits (1296), Expect = 0.0
Identities = 1296/1296 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggcacagattttggcaccctcgacgcaatggcagacgagaatcaccaaaacctctccc 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 100 atggcacagattttggcaccctcgacgcaatggcagacgagaatcaccaaaacctctccc 159
Query: 61 aatgcaagtcccattacatcaaacatgtggagttctttattgtggaaacaaaacaagaaa 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 160 aatgcaagtcccattacatcaaacatgtggagttctttattgtggaaacaaaacaagaaa 219
Query: 121 gttgcacgtgcttctaagtttagagtactggcaatcaagtctgatggtagcaccatcaac 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 220 gttgcacgtgcttctaagtttagagtactggcaatcaagtctgatggtagcaccatcaac 279
Query: 181 aggctagagggtctgcttaatttggatgtcactccatacactgataagttcattgctgag 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 280 aggctagagggtctgcttaatttggatgtcactccatacactgataagttcattgctgag 339
Query: 241 tacatctggattggggggactggtgtcgatgttcgcagtaaatcaagaactatatcgaag 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 340 tacatctggattggggggactggtgtcgatgttcgcagtaaatcaagaactatatcgaag 399
Query: 301 cctgtttcacatccctctgagctccctaaatggaactatgatggatctagcactgggcag 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 400 cctgtttcacatccctctgagctccctaaatggaactatgatggatctagcactgggcag 459
Query: 361 gcaccgggcgatgatagtgaagtaattctatatcctcaagcaattttcagagatcctttc 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 460 gcaccgggcgatgatagtgaagtaattctatatcctcaagcaattttcagagatcctttc 519
Query: 421 cgtggtggtaacaatattttggttatttgcgatgcttacacaccacaaggtgagcctatc 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 520 cgtggtggtaacaatattttggttatttgcgatgcttacacaccacaaggtgagcctatc 579
Query: 481 cctacaaacaagcggcacagagctgctgaaatcttcagtaacccaaaggttcaagctgaa 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 580 cctacaaacaagcggcacagagctgctgaaatcttcagtaacccaaaggttcaagctgaa 639
Query: 541 attccatggtatggaatagaacaagagtacaccctacttcaaacggatgtgaagtggcct 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 640 attccatggtatggaatagaacaagagtacaccctacttcaaacggatgtgaagtggcct 699
Query: 601 ttgggatggcctgttggcggctatcctggtcctcagggtccctattactgtgctgccggg 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 700 ttgggatggcctgttggcggctatcctggtcctcagggtccctattactgtgctgccggg 759
Query: 661 gctgataagtcattcggacgtgatatatctgatgctcattacaaggcttgcttgtatgct 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 760 gctgataagtcattcggacgtgatatatctgatgctcattacaaggcttgcttgtatgct 819
Query: 721 ggaatcaacatcagtggcaccaatggggaggttatgcctgggcagtgggagtatcaagtt 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 820 ggaatcaacatcagtggcaccaatggggaggttatgcctgggcagtgggagtatcaagtt 879
Query: 781 ggtcctagtgtaggtattgaagctggtgatcatatctgggcttcaaggtacctccttgag 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 880 ggtcctagtgtaggtattgaagctggtgatcatatctgggcttcaaggtacctccttgag 939
Query: 841 agaatcactgaacaagctggtgttgtcctcactcttgatccaaaaccaattgagggtgac 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 940 agaatcactgaacaagctggtgttgtcctcactcttgatccaaaaccaattgagggtgac 999
Query: 901 tggaacggtgccggagcccacaccaattacagcacaaagagcatgagggaagagggaggc 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1000 tggaacggtgccggagcccacaccaattacagcacaaagagcatgagggaagagggaggc 1059
Query: 961 tttgaggtaatcaagaaggcaattttgaatctatcccttcgccaccaggaccatattcgt 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1060 tttgaggtaatcaagaaggcaattttgaatctatcccttcgccaccaggaccatattcgt 1119
Query: 1021 gcttatggagaaggaaatgagagacgattgacgggaaagcatgaaacagccgacattaac 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1120 gcttatggagaaggaaatgagagacgattgacgggaaagcatgaaacagccgacattaac 1179
Query: 1081 acattttcttggggagtggctaaccggggttgctcaatccgtgtgggaagagacacagag 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1180 acattttcttggggagtggctaaccggggttgctcaatccgtgtgggaagagacacagag 1239
Query: 1141 aaggaaggaaaaggttacttggaagacaggcgccctgcttcaaacatggatccatatgtt 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1240 aaggaaggaaaaggttacttggaagacaggcgccctgcttcaaacatggatccatatgtt 1299
Query: 1201 gtgacagcattgctggcagagactaccttgttgtgggaaccaactctagaggctgaagct 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1300 gtgacagcattgctggcagagactaccttgttgtgggaaccaactctagaggctgaagct 1359
Query: 1261 cttgcagctcagaagatacaattgaaggtctaaatc 1296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1360 cttgcagctcagaagatacaattgaaggtctaaatc 1395
Score = 105 bits (53), Expect = 7e-22
Identities = 59/61 (96%)
Strand = Plus / Plus
Query: 44 tcaccaaaacctctcccaatgcaagtcccattacatcaaacatgtggagttctttattgt 103
|||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 39 tcaccaaaacctctgccaatgcaagccccattacatcaaacatgtggagttctttattgt 98
Query: 104 g 104
|
Sbjct: 99 g 99
>gnl|LJGI|BW623736 UniRef100_Q5QKQ5 Cluster: Glutamine synthetase PR2 mutant; n=1;
Lotus japonicus|Rep: Glutamine synthetase PR2 mutant -
Lotus japonicus, partial (21%)
Length = 470
Score = 533 bits (269), Expect = e-151
Identities = 276/277 (99%), Gaps = 1/277 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggcacagattttggcaccctcgacgcaatggcagacgagaatcaccaaaacctctccc 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 194 atggcacagattttggcaccctcgacgcaatggcagacgagaatcaccaaaacctctccc 253
Query: 61 aatgcaagtcccattacatcaaacatgtggagttctttattgtggaaacaaaacaagaaa 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 254 aatgcaagtcccattacatcaaacatgtggagttctttattgtggaaacaaaacaagaaa 313
Query: 121 gttgcacgtgcttctaag-tttagagtactggcaatcaagtctgatggtagcaccatcaa 179
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 314 gttgcacgtgcttctaaggtttagagtactggcaatcaagtctgatggtagcaccatcaa 373
Query: 180 caggctagagggtctgcttaatttggatgtcactccatacactgataagttcattgctga 239
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 374 caggctagagggtctgcttaatttggatgtcactccatacactgataagttcattgctga 433
Query: 240 gtacatctggattggggggactggtgtcgatgttcgc 276
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 434 gtacatctggattggggggactggtgtcgatgttcgc 470
>gnl|LJGI|BP058404 homologue to UniRef100_P08281 Cluster: Glutamine synthetase leaf
isozyme, chloroplast precursor; n=2; Pisum sativum|Rep:
Glutamine synthetase leaf isozyme, chloroplast precursor
- Pisum sativum (Garden pea), partial (7%)
Length = 348
Score = 165 bits (83), Expect = 9e-40
Identities = 122/131 (93%), Gaps = 3/131 (2%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1169 ggcgccctgcttcaaaca-tggatccatatgttgtgacagcattgctggc-agagactac 1226
||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct: 329 ggcgccctgcttccaaccctggatccatatgttgtgacagccttgctggccagagactac 270
Query: 1227 c-ttgttgtgggaaccaactctagaggctgaagctcttgcagctcagaagatacaattga 1285
| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||
Sbjct: 269 ccttgttgtgggaacccactctagaggctgaagctcttccagctcagaagataccattga 210
Query: 1286 aggtctaaatc 1296
|||||||||||
Sbjct: 209 aggtctaaatc 199
>gnl|LJGI|TC61595 homologue to UniRef100_Q84L15 Cluster: Glutamine synthetase; n=1;
Securigera parviflora|Rep: Glutamine synthetase -
Securigera parviflora, complete
Length = 1476
Score = 77.8 bits (39), Expect = 2e-13
Identities = 126/155 (81%)
Strand = Plus / Plus
Query: 691 gatgctcattacaaggcttgcttgtatgctggaatcaacatcagtggcaccaatggggag 750
||||| |||||||| ||||| | |||||||| || ||||| ||||| | |||||| |||
Sbjct: 679 gatgcacattacaaagcttgtctttatgctggcattaacattagtggtatcaatggagag 738
Query: 751 gttatgcctgggcagtgggagtatcaagttggtcctagtgtaggtattgaagctggtgat 810
||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||| ||||| |||||| |||
Sbjct: 739 gttatgcctggccagtgggaattccaagttggtccttctgttggtatctcagctggagat 798
Query: 811 catatctgggcttcaaggtacctccttgagagaat 845
| || |||||| |||| ||| | |||||||||||
Sbjct: 799 gagatatgggctgcaagatacattcttgagagaat 833
Score = 56.0 bits (28), Expect = 6e-07
Identities = 112/140 (80%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1060 catgaaacagccgacattaacacattttcttggggagtggctaaccggggttgctcaatc 1119
||||||||||| ||||| |||| || |||||||| ||||| ||||| || |||| |
Sbjct: 1048 catgaaacagctgacatccacaccttctcttggggtgtggcaaaccgtggagcctcagtt 1107
Query: 1120 cgtgtgggaagagacacagagaaggaaggaaaaggttacttggaagacaggcgccctgct 1179
| || |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || ||||| | |||||
Sbjct: 1108 agagttggaagagaaacagagaaagatgggaaaggttactttgaggacagaaggcctgcc 1167
Query: 1180 tcaaacatggatccatatgt 1199
|| ||||||||||| |||||
Sbjct: 1168 tctaacatggatccctatgt 1187
>gnl|LJGI|TC72874 UniRef100_Q42899 Cluster: Glutamine synthetase cytosolic isozyme;
n=1; Lotus japonicus|Rep: Glutamine synthetase cytosolic
isozyme - Lotus japonicus, complete
Length = 1483
Score = 61.9 bits (31), Expect = 9e-09
Identities = 82/99 (82%)
Strand = Plus / Plus
Query: 886 ccaattgagggtgactggaacggtgccggagcccacaccaattacagcacaaagagcatg 945
|||||| ||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |||| ||||
Sbjct: 805 ccaattaagggtgattggaatggtgctggtgctcacacaaattacagcactaagaccatg 864
Query: 946 agggaagagggaggctttgaggtaatcaagaaggcaatt 984
|| || || || |||| ||| || |||||||| ||||||
Sbjct: 865 agagaggatggtggctatgaagtgatcaagaaagcaatt 903
Score = 54.0 bits (27), Expect = 2e-06
Identities = 60/71 (84%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1132 gacacagagaaggaaggaaaaggttacttggaagacaggcgccctgcttcaaacatggat 1191
||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| | ||||| || ||||||||
Sbjct: 1051 gacacagagaaagaagggaagggttactttgaggacagaaggcctgcatctaacatggac 1110
Query: 1192 ccatatgttgt 1202
|||||||||||
Sbjct: 1111 ccatatgttgt 1121