Miyakogusa Predicted Gene

Lj6g3v1878790.1
Show Alignment: 

BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Lj6g3v1878790.1 Non Chatacterized Hit- tr|I1MFG6|I1MFG6_SOYBN
Uncharacterized protein OS=Glycine max GN=Gma.23091
PE,89.18,0,seg,NULL; zf-MYND,Zinc finger, MYND-type; HIT/MYND zinc
finger-like,NULL; ZF_MYND_1,Zinc finger, MYN,CUFF.60021.1
         (1808 letters)

Database: LJGI 
           47,486 sequences; 32,788,469 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gnl|LJGI|TC75356 similar to UniRef100_A7R0M0 Cluster: Chromosome...  3098   0.0  

>gnl|LJGI|TC75356 similar to UniRef100_A7R0M0 Cluster: Chromosome chr10 scaffold_312,
            whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
            Chromosome chr10 scaffold_312, whole genome shotgun
            sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (82%)
          Length = 1804

 Score = 3098 bits (1563), Expect = 0.0
 Identities = 1569/1571 (99%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                        
Query: 238  atgacagggcctagagagaccgttcgtgttccaaatgttgagcttctcagggttacatat 297
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2    atgacagggcctagagagaccgttcgtgttccaaatgttgagcttctcagggttacatat 61

                                                                        
Query: 298  gaaaaggagtccatgatgttcccttctaatcgcaagatgatcaagtctttgtcgctggaa 357
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 62   gaaaaggagtccatgatgttcccttctaatcgcaagatgatcaagtctttgtcgctggaa 121

                                                                        
Query: 358  gcgtccggcatggatcgatttcctgtgattgatgttgcccgatgcacgatttctggtgag 417
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 122  gcgtccggcatggatcgatttcctgtgattgatgttgcccgatgcacgatttctggtgag 181

                                                                        
Query: 418  cttcgatttagaaatcctacactggaagagcttaagtttgtctatggattcatgaaagcc 477
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 182  cttcgatttagaaatcctacactggaagagcttaagtttgtctatggattcatgaaagcc 241

                                                                        
Query: 478  atttctctggtccactctttacttcaggtggacagggaaattggttcaaagtattcaaca 537
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 242  atttctctggtccactctttacttcaggtggacagggaaattggttcaaagtattcaaca 301

                                                                        
Query: 538  gcggtgaattttgaacatttcatagagacggttgatgttcagtggcctccagaagtaact 597
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 302  gcggtgaattttgaacatttcatagagacggttgatgttcagtggcctccagaagtaact 361

                                                                        
Query: 598  aaaggaggttatgaccttgttgctgttactatctcacacccacctggtcaggcatatgat 657
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 362  aaaggaggttatgaccttgttgctgttactatctcacacccacctggtcaggcatatgat 421

                                                                        
Query: 658  gacaaatctagtagcatgagtgctggatcaaccccaaccaaatttagagaaccccccagc 717
            |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 422  gacaaatctagtagcatgagtgctagatcaaccccaaccaaatttagagaaccccccagc 481

                                                                        
Query: 718  gaggatactttcaatgacacaaaagcatactcaagtactggtataagagagtgtgcaatg 777
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 482  gaggatactttcaatgacacaaaagcatactcaagtactggtataagagagtgtgcaatg 541

                                                                        
Query: 778  tgtgagaaggaagtgcatggagaacagtcactttgttgtgggcggtgcagagcagttatt 837
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 542  tgtgagaaggaagtgcatggagaacagtcactttgttgtgggcggtgcagagcagttatt 601

                                                                        
Query: 838  tactgcagttcaatctgccagaagcaacactggagtgaggcacacaaaagcttgtgtgga 897
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 602  tactgcagttcaatctgccagaagcaacactggagtgaggcacacaaaagcttgtgtgga 661

                                                                        
Query: 898  ctttacaaggccatgatggaaagggaagaagagcttactataaaaatcttcttgttccca 957
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 662  ctttacaaggccatgatggaaagggaagaagagcttactataaaaatcttcttgttccca 721

                                                                        
Query: 958  tgttctgctgaccagccttgcaagtggcttgaatcattaggcatccaccagaagggtatg 1017
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 722  tgttctgctgaccagccttgcaagtggcttgaatcattaggcatccaccagaagggtatg 781

                                                                        
Query: 1018 tggagcagaaagtgcagttgcaattcacactgccctcttggtctccttccagtgaaaggt 1077
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 782  tggagcagaaagtgcagttgcaattcacactgccctcttggtctccttccagtgaaaggt 841

                                                                        
Query: 1078 ggactgcgggaactatggggtgaactggatgattatgaatatcctcatgactccccattc 1137
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 842  ggactgcgggaactatggggtgaactggatgattatgaatatcctcatgactccccattc 901

                                                                        
Query: 1138 aacaaccatttcagctcaagcccgtttcttctctctggttggtccgagtactacacgctt 1197
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 902  aacaaccatttcagctcaagcccgtttcttctctctggttggtccgagtactacacgctt 961

                                                                        
Query: 1198 cgctcacttccattgtcaagtcctgttgccgacattctctcgcatccattgaccgtgtat 1257
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 962  cgctcacttccattgtcaagtcctgttgccgacattctctcgcatccattgaccgtgtat 1021

                                                                        
Query: 1258 cacatactgactactcttaacataagttcaaagaacctgatactgcaagggaaggaggta 1317
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1022 cacatactgactactcttaacataagttcaaagaacctgatactgcaagggaaggaggta 1081

                                                                        
Query: 1318 attgttcactaccttggacctgaaggcgagttggattggatgccagcatttgcagaagtt 1377
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1082 attgttcactaccttggacctgaaggcgagttggattggatgccagcatttgcagaagtt 1141

                                                                        
Query: 1378 ggtcatttgcttaatggattgggtaatgtacagatagtgatggtgggaccagaagttcca 1437
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1142 ggtcatttgcttaatggattgggtaatgtacagatagtgatggtgggaccagaagttcca 1201

                                                                        
Query: 1438 acgaatttgtcaggtacaacttcaggaataggtagcagagtcagggtgaatcttgtgagg 1497
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1202 acgaatttgtcaggtacaacttcaggaataggtagcagagtcagggtgaatcttgtgagg 1261

                                                                        
Query: 1498 ggtatttatcaggtggaagcctcttacctaccttctccccatgttgtcattgctttaaac 1557
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1262 ggtatttatcaggtggaagcctcttacctaccttctccccatgttgtcattgctttaaac 1321

                                                                        
Query: 1558 tccaaattagaaagctattctacctggggtggagctcttgatttgattaaatcaatggat 1617
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1322 tccaaattagaaagctattctacctggggtggagctcttgatttgattaaatcaatggat 1381

                                                                        
Query: 1618 gtgcctgctttcttcactgatcaatctgaagtttcatgtgtaaatgctaaacaagtcctt 1677
            ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1382 gtgcctgctctcttcactgatcaatctgaagtttcatgtgtaaatgctaaacaagtcctt 1441

                                                                        
Query: 1678 cgcaatgctggactgcacatcacgcaaccggtgaccccaaatcctttccggtcacccgtg 1737
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1442 cgcaatgctggactgcacatcacgcaaccggtgaccccaaatcctttccggtcacccgtg 1501

                                                                        
Query: 1738 aaaaacctcactccttctagcaatcttccttcatacagcaatggttttgtgtttggggtg 1797
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1502 aaaaacctcactccttctagcaatcttccttcatacagcaatggttttgtgtttggggtg 1561

                       
Query: 1798 aacacttgaat 1808
            |||||||||||
Sbjct: 1562 aacacttgaat 1572