Miyakogusa Predicted Gene
- Lj6g3v1572430.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj6g3v1572430.1 Non Chatacterized Hit- tr|I1MGB0|I1MGB0_SOYBN
Uncharacterized protein OS=Glycine max PE=4 SV=1,82.25,0,S1,Ribosomal
protein S1, RNA-binding domain; coiled-coil,NULL; Nucleic acid-binding
proteins,Nucleic,CUFF.59629.1
(1215 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC75114 similar to UniRef100_A7Q8U9 Cluster: Chromosome... 2169 0.0
gnl|LJGI|TC61169 homologue to UniRef100_P29344 Cluster: 30S ribo... 1382 0.0
>gnl|LJGI|TC75114 similar to UniRef100_A7Q8U9 Cluster: Chromosome chr5 scaffold_64,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr5 scaffold_64, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (81%)
Length = 1202
Score = 2169 bits (1094), Expect = 0.0
Identities = 1125/1130 (99%), Gaps = 4/1130 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggcaatggcatctgtggctcagcaattgagtgctgttcggtggtctccaatgctatgg 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 77 atggcaatggcatctgtggctcagcaattgagtgctgttcggtggtctccaatgctatgg 136
Query: 61 aggcggagccagaagcagaggcgcggtgctggtaccatcgtctgttcggttgcaatctcg 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 aggcggagccagaagcagaggcgcggtgctggtaccatcgtctgttcggttgcaatctcg 196
Query: 121 aacgcacagaacaaagagagagccaagctcaaacagctctttgaagatgcttacgagagg 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 aacgcacagaacaaagagagagccaagctcaaacagctctttgaagatgcttacgagagg 256
Query: 181 tgccgcactgctcctacagatggtgtttccttcaccctcgagcagttcactaccgctctc 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 tgccgcactgctcctacagatggtgtttccttcaccctcgagcagttcactaccgctctc 316
Query: 241 gagaagtatgacttcgatgctgagattgggaccaaggttaagggcactgtgtttggtact 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 gagaagtatgacttcgatgctgagattgggaccaaggttaagggcactgtgtttggtact 376
Query: 301 gatgccagtggagcttatgttgatattactgcaaagtctacggcatacttgcccctccaa 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 gatgccagtggagcttatgttgatattactgcaaagtctacggcatacttgcccctccaa 436
Query: 361 gaggcatgcatccacaaaattaagcatgttgaagaagcaggtttagttccaggcgtgaga 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 gaggcatgcatccacaaaattaagcatgttgaagaagcaggtttagttccaggcgtgaga 496
Query: 421 gacgaatttgtaatcattggtgaaaatgaatctgatgataccttgttcttgagtttaaag 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 gacgaatttgtaatcattggtgaaaatgaatctgatgataccttgttcttgagtttaaag 556
Query: 481 tctattcagtttgggcttgcatgggaacgctgtagacagcttcaggctgaagatgctgtt 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 557 tctattcagtttgggcttgcatgggaacgctgtagacagcttcaggctgaagatgctgtt 616
Query: 541 gtcaagggtaaaattgttaatgcaaacaaaggtggtgtggtggctgaagtggaaggcctt 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 617 gtcaagggtaaaattgttaatgcaaacaaaggtggtgtggtggctgaagtggaaggcctt 676
Query: 601 aaggggtttgttccattctcacagatatcaacgaaatcgactggagaagagcttcttgag 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 677 aaggggtttgttccattctcacagatatcaacgaaatcgactggagaagagcttcttgag 736
Query: 661 aaggagattcctctaaagtttgtggaggtggatgaggaacagtctagactcatcctcagt 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 737 aaggagattcctctaaagtttgtggaggtggatgaggaacagtctagactcatcctcagt 796
Query: 721 caccggaaagctgtggccgacagccagggacagctaggaattggatcagtagtcaccgga 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 797 caccggaaagctgtggccgacagccagggacagctaggaattggatcagtagtcaccgga 856
Query: 781 tctgtgcaaagcctaaagccatatggtgccttcatcgacattggtgggatcagcggcctc 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 857 tctgtgcaaagcctaaagccatatggtgccttcatcgacattggtgggatcagcggcctc 916
Query: 841 cttcacgtcagtcagatcagtcatgatcgtataactgatatttcaactgttcttcaaccc 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 917 cttcacgtcagtcagatcagtcatgatcgtataactgatatttcaactgttcttcaaccc 976
Query: 901 ggtgacattctgaaggtgatgatattaagtcatgatcgggagagaggccgagtaagtctt 960
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 977 ggtgacattctgaa-gtgatgatattaagtcatgatcgggagagaggccgagtaagtctt 1035
Query: 961 tcaacaaagaagttagaacccacacctggagacatgattcgcaatccaaagcttgtcttt 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1036 tcaacaaagaagttagaacccacacctggagacatgattcgcaatccaaagcttgtcttt 1095
Query: 1021 gagaaggcggaagagatggctcagacattcagacagagaatagcccaagcagaagctatg 1080
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 1096 gagaa-gcggaagagatggctcagacattcagacagagaatagcccaagcagaaactatg 1154
Query: 1081 gctcgtgctgatatgcttaggttccagccagagagtggattaactctcag 1130
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 1155 gctcgtgctgatatgctta-gttccagccagagagtgga-taactctcag 1202
>gnl|LJGI|TC61169 homologue to UniRef100_P29344 Cluster: 30S ribosomal protein S1,
chloroplast precursor; n=1; Spinacia oleracea|Rep: 30S
ribosomal protein S1, chloroplast precursor - Spinacia
oleracea (Spinach), partial (55%)
Length = 919
Score = 1382 bits (697), Expect = 0.0
Identities = 711/713 (99%), Gaps = 2/713 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 503 gggaacgctgtagacagcttcaggctgaagatgctgttgtcaagggtaaaattgttaatg 562
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 16 gggaacgctgtagacagcttcaggct-aagatgctgt-gtcaagggtaaaattgttaatg 73
Query: 563 caaacaaaggtggtgtggtggctgaagtggaaggccttaaggggtttgttccattctcac 622
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 74 caaacaaaggtggtgtggtggctgaagtggaaggccttaaggggtttgttccattctcac 133
Query: 623 agatatcaacgaaatcgactggagaagagcttcttgagaaggagattcctctaaagtttg 682
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 134 agatatcaacgaaatcgactggagaagagcttcttgagaaggagattcctctaaagtttg 193
Query: 683 tggaggtggatgaggaacagtctagactcatcctcagtcaccggaaagctgtggccgaca 742
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 194 tggaggtggatgaggaacagtctagactcatcctcagtcaccggaaagctgtggccgaca 253
Query: 743 gccagggacagctaggaattggatcagtagtcaccggatctgtgcaaagcctaaagccat 802
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 254 gccagggacagctaggaattggatcagtagtcaccggatctgtgcaaagcctaaagccat 313
Query: 803 atggtgccttcatcgacattggtgggatcagcggcctccttcacgtcagtcagatcagtc 862
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 314 atggtgccttcatcgacattggtgggatcagcggcctccttcacgtcagtcagatcagtc 373
Query: 863 atgatcgtataactgatatttcaactgttcttcaacccggtgacattctgaaggtgatga 922
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 374 atgatcgtataactgatatttcaactgttcttcaacccggtgacattctgaaggtgatga 433
Query: 923 tattaagtcatgatcgggagagaggccgagtaagtctttcaacaaagaagttagaaccca 982
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 434 tattaagtcatgatcgggagagaggccgagtaagtctttcaacaaagaagttagaaccca 493
Query: 983 cacctggagacatgattcgcaatccaaagcttgtctttgagaaggcggaagagatggctc 1042
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 494 cacctggagacatgattcgcaatccaaagcttgtctttgagaaggcggaagagatggctc 553
Query: 1043 agacattcagacagagaatagcccaagcagaagctatggctcgtgctgatatgcttaggt 1102
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 554 agacattcagacagagaatagcccaagcagaagctatggctcgtgctgatatgcttaggt 613
Query: 1103 tccagccagagagtggattaactctcagcagtgatgggatcttaggaccacttggttcag 1162
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 614 tccagccagagagtggattaactctcagcagtgatgggatcttaggaccacttggttcag 673
Query: 1163 acttacctgcagaggggcttgatctgagtgatgaagtatccctacctgagtga 1215
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 674 acttacctgcagaggggcttgatctgagtgatgaagtatccctacctgagtga 726