Miyakogusa Predicted Gene
- Lj6g3v1468260.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj6g3v1468260.1 Non Chatacterized Hit- tr|I1MGN7|I1MGN7_SOYBN
Uncharacterized protein OS=Glycine max PE=3 SV=1,78.05,0,no
description,NULL; no description,Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase,
N-terminal; no description,Acyl-,CUFF.59544.1
(2472 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC75262 similar to UniRef100_Q67ZU5 Cluster: MRNA, comp... 1574 0.0
gnl|LJGI|TC65998 homologue to UniRef100_A7Q8G0 Cluster: Chromoso... 1429 0.0
gnl|LJGI|TC64693 similar to UniRef100_Q67ZU5 Cluster: MRNA, comp... 1253 0.0
gnl|LJGI|AV770620 similar to UniRef100_Q67ZU5 Cluster: MRNA, com... 337 2e-91
>gnl|LJGI|TC75262 similar to UniRef100_Q67ZU5 Cluster: MRNA, complete cds, clone:
RAFL22-73-C24; n=1; Arabidopsis thaliana|Rep: MRNA,
complete cds, clone: RAFL22-73-C24 - Arabidopsis thaliana
(Mouse-ear cress), partial (22%)
Length = 794
Score = 1574 bits (794), Expect = 0.0
Identities = 794/794 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 988 gtgtataatagatgggttaagggtaatgcatcaggaggtgagcgtgcgcgtcatacagaa 1047
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 gtgtataatagatgggttaagggtaatgcatcaggaggtgagcgtgcgcgtcatacagaa 60
Query: 1048 gtacttgctaatggtcttatagatgctgcttggaaatttattgaacgcaaatctgtgctt 1107
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 gtacttgctaatggtcttatagatgctgcttggaaatttattgaacgcaaatctgtgctt 120
Query: 1108 ccacagcatcctccctcagatgcaaacgcacgtgaccattcaaaagagttagtgaatggg 1167
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ccacagcatcctccctcagatgcaaacgcacgtgaccattcaaaagagttagtgaatggg 180
Query: 1168 gatgatatgctggggctatcaaatcaggggaagtttgttcctagccaaaaggttttaaac 1227
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 gatgatatgctggggctatcaaatcaggggaagtttgttcctagccaaaaggttttaaac 240
Query: 1228 ctcaggaacaaattaattcagtttatggaggaacacatataccccatggaaaatgagttt 1287
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 ctcaggaacaaattaattcagtttatggaggaacacatataccccatggaaaatgagttt 300
Query: 1288 tataaactcgcccagtcagaatcacgttggaccgttcaccctgcagaggaaaagttaaag 1347
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 tataaactcgcccagtcagaatcacgttggaccgttcaccctgcagaggaaaagttaaag 360
Query: 1348 gagttagcaaagaaagaaggcttgtggaacttatttattcctcttgacagtgctgcgagg 1407
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gagttagcaaagaaagaaggcttgtggaacttatttattcctcttgacagtgctgcgagg 420
Query: 1408 gcaaaaaatcttatttttgatgggagcaataatagtccctctactgatgcaaatgacttg 1467
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 gcaaaaaatcttatttttgatgggagcaataatagtccctctactgatgcaaatgacttg 480
Query: 1468 ttattgggtgctggtctaacaaatctcgaatatggatatctttgtgagaccatgggtcgc 1527
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 ttattgggtgctggtctaacaaatctcgaatatggatatctttgtgagaccatgggtcgc 540
Query: 1528 tctgtttgggctccacaagtatttaactgtggtgcacctgatacaggtaatatggaggta 1587
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 tctgtttgggctccacaagtatttaactgtggtgcacctgatacaggtaatatggaggta 600
Query: 1588 ttactgcgttatggaaataaagagcaacaacgagaatggcttattcctttgcttgagggg 1647
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 ttactgcgttatggaaataaagagcaacaacgagaatggcttattcctttgcttgagggg 660
Query: 1648 aagattaggtctggatttgcaatgacagaacctcgtgttgcgtcttctgatgcaaccaat 1707
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 aagattaggtctggatttgcaatgacagaacctcgtgttgcgtcttctgatgcaaccaat 720
Query: 1708 attgagtgttcgatcaaaagacaaggagattcatatattatcaatgggacaaaatggtgg 1767
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 attgagtgttcgatcaaaagacaaggagattcatatattatcaatgggacaaaatggtgg 780
Query: 1768 acaagtggtgccat 1781
||||||||||||||
Sbjct: 781 acaagtggtgccat 794
>gnl|LJGI|TC65998 homologue to UniRef100_A7Q8G0 Cluster: Chromosome chr5 scaffold_64,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr5 scaffold_64, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (55%)
Length = 1082
Score = 1429 bits (721), Expect = 0.0
Identities = 724/725 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1744 attatcaatgggacaaaatggtggacaagtggtgccatggatccaagatgcagaattctt 1803
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2 attatcaatgggacaaaatggtggacaagtggtgccatggatccaagatgcagaattctt 61
Query: 1804 atagtcatgggtaaaactgacttcaatgcagcgaagcataaacagcaatctatgatctta 1863
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 62 atagtcatgggtaaaactgacttcaatgcagcgaagcataaacagcaatctatgatctta 121
Query: 1864 gttgatatccagactcctggtgttcatataaagagaccattgttggtgtttggctttgat 1923
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 122 gttgatatccagactcctggtgttcatataaagagaccattgttggtgtttggctttgat 181
Query: 1924 gatgcacctcatgggcatgcagaagtaacatttgagaatgtacgtgtgccagcagaaaat 1983
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 182 gatgcacctcatgggcatgcagaagtaacatttgagaatgtacgtgtgccagcagaaaat 241
Query: 1984 atcttacttggtgaaggacgtggatttgagattgctcaaggtaggctaggtcctggaagg 2043
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 242 atcttacttggtgaaggacgtggatttgagattgctcaaggtaggctaggtcctggaagg 301
Query: 2044 ctgcaccattgtatgagactgataggtgctgctgagagaggcatgcaaatgatggctcaa 2103
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 302 ctgcaccattgtatgagactgataggtgctgctgagagaggcatgcaaatgatggctcaa 361
Query: 2104 agagctgtttgcagaagagtatttgggaaattgattgctcaacagggctcatttctttca 2163
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 362 agagctgttagcagaagagtatttgggaaattgattgctcaacagggctcatttctttca 421
Query: 2164 gatatggccaagtgccgaatagagctagagaagaccagattgttggtgttggaagctgcg 2223
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 422 gatatggccaagtgccgaatagagctagagaagaccagattgttggtgttggaagctgcg 481
Query: 2224 gaccaactagatagacatgggaacaagaaagctcgagggatattagcaatggcgaaggta 2283
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 482 gaccaactagatagacatgggaacaagaaagctcgagggatattagcaatggcgaaggta 541
Query: 2284 gccgcaccaaacatggcactaaaagtacttgacatggcaatgcaagtgcatggagctgct 2343
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 542 gccgcaccaaacatggcactaaaagtacttgacatggcaatgcaagtgcatggagctgct 601
Query: 2344 ggtgtgtcttctgatacagttctggcgcatctgtgggcaactgcaaggaccctaagaatt 2403
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 602 ggtgtgtcttctgatacagttctggcgcatctgtgggcaactgcaaggaccctaagaatt 661
Query: 2404 gcagacggtccagatgaagtccacttgggtaccattgccaagttagaactacagagagcc 2463
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 662 gcagacggtccagatgaagtccacttgggtaccattgccaagttagaactacagagagcc 721
Query: 2464 aagct 2468
|||||
Sbjct: 722 aagct 726
>gnl|LJGI|TC64693 similar to UniRef100_Q67ZU5 Cluster: MRNA, complete cds, clone:
RAFL22-73-C24; n=1; Arabidopsis thaliana|Rep: MRNA,
complete cds, clone: RAFL22-73-C24 - Arabidopsis
thaliana (Mouse-ear cress), partial (24%)
Length = 782
Score = 1253 bits (632), Expect = 0.0
Identities = 638/640 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggcgaagaatccatctgacccagctactcaccatttcaaccacgactctctgctccgc 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 143 atggcgaagaatccatctgacccagctactcaccatttcaaccacgactctctgctccgc 202
Query: 61 ttctgctcttccaacatttccggcttcccaccttcccccacacatttcaacctctcccag 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 203 ttctgctcttccaacatttccggcttcccaccttcccccacacatttcaacctctcccag 262
Query: 121 tttggacatggacagtccaaccccacctacttgatggaagtaggctcacacggctctgtg 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 263 tttggacatggacagtccaaccccacctacttgatggaagtaggctcacacggctctgtg 322
Query: 181 gtcaagcgctacgttctcaggaagaaacctgcaggggtgttactggcttcagctcatgct 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 323 gtcaagcgctacgttctcaggaagaaacctgcaggggtgttactggcttcagctcatgct 382
Query: 241 gtggaaagagagtttatggttctccaggcgttgggagctaacacgaaagttccggttcct 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 383 gtggaaagagagtttatggttctccaggcgttgggagctaacacgaaagttccggttcct 442
Query: 301 aaagttttctgtttgtgcaatgatccatctgttattggaacagctttttacattatggag 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 443 aaagttttctgtttgtgcaatgatccatctgttattggaacagctttttacattatggag 502
Query: 361 tatttggaggggcgcatatttgttgatcccaagctaccaggtatggcaccagagaggagg 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 503 tatttggaggggcgcatatttgttgatcccaagctaccaggtatggcaccagagaggagg 562
Query: 421 agggcgatttacctggaaactgcgaaagccttagcttctttacattctgctaatgtggac 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 563 agggcgatttacctggaaactgcgaaagccttagcttctttacattctgctaatgtggac 622
Query: 481 tccattggtctgggaaaatatgggcgtcgtaatgattattgcaaaagacaaattgagagg 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 623 tccattggtctgggaaaatatgggcgtcgtaatgattattgcaaaagacaaattgagagg 682
Query: 541 tgggctaagcaatatattgcctcaaccagtgagggtaaacctgcaacgaatccaaaaatg 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 683 tgggctaagcaatatattgcctcaaccagtgagggtaaacctgcaacgaatccaaaaatg 742
Query: 601 tttgccctggttgattggctaaagctcaacatccctcttg 640
|| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 743 ttggccctggtggattggctaaagctcaacatccctcttg 782
>gnl|LJGI|AV770620 similar to UniRef100_Q67ZU5 Cluster: MRNA, complete cds, clone:
RAFL22-73-C24; n=1; Arabidopsis thaliana|Rep: MRNA,
complete cds, clone: RAFL22-73-C24 - Arabidopsis thaliana
(Mouse-ear cress), partial (5%)
Length = 547
Score = 337 bits (170), Expect = 2e-91
Identities = 487/539 (90%), Gaps = 44/539 (8%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1449 tactgatgcaaatgacttgttattgggtgctggtctaacaaatctcgaatatggatatct 1508
||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 10 tactgatgcaaatgact-gtgattgggtgctggtctaacaaatctcgaatatggatatct 68
Query: 1509 ttgtgagaccatgggtcgctctgtttgggctccacaagtatttaact-gtggtgcacct- 1566
| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 69 tagtgagaccatgggtcgctctgttcgggctccacaagtatttaactggtggtgcaccta 128
Query: 1567 gatacaggtaatatg-gaggtattact-gcgttatggaa-ataaa-gagcaa-caacga- 1620
||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||
Sbjct: 129 gatacaggtaatatgtgaggtattactagcgttatggaagataaacgagcaagcaacgag 188
Query: 1621 gaatgg-cttattccttt--gctt--gaggggaagatt-aggtctgg-atttgc-aatga 1672
|||||| |||||||| || |||| |||| ||||||| |||||||| |||||| |||||
Sbjct: 189 gaatggccttattccgttgagcttgagaggagaagattgaggtctggcatttgcaaatga 248
Query: 1673 cag-aacctc-gtgttgc-gtcttctga-tgcaaccaa-tattga-gtgttcga-tcaaa 1725
||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||
Sbjct: 249 cagcaacctcggtgttgcggtcttctgactgcaaccaagtattgacgtgttcgagtcaaa 308
Query: 1726 -agacaagg-agattcata-tattat-caatgggacaa-aatggtggacaag--tggtg- 1777
|||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||
Sbjct: 309 gagacaaggcagattcatattattatgcaatgggacaagaatggtggacaagctgggtgc 368
Query: 1778 ccatggatcca-agatgcag-aattcttata-gtcatgg-gtaaaac-tgacttcaa-tg 1831
||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||
Sbjct: 369 ccatggatccacagatgcagcaattcttataggtcatggagtaaaacttgacttcaagtg 428
Query: 1832 cagcg-aagcataaa-cagcaat-ctatgatcttagt-tgatat-ccagactcc-tggtg 1885
||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||
Sbjct: 429 cagcgcaagcataaaccagcaatcctatgatcttagtctgatatcccagactccttggtg 488
Query: 1886 ttcatataaagagaccattgttggtgtttggctttgatgatgcacctcatgggcatgca 1944
|||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 489 ttcatataaagagaccatggttggggtttggctttgatgatgcacctcatgggcatgca 547