Miyakogusa Predicted Gene

Lj6g3v1371860.1
Show Alignment: 

BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Lj6g3v1371860.1 Non Chatacterized Hit- tr|I3RZN6|I3RZN6_LOTJA
Uncharacterized protein OS=Lotus japonicus PE=2 SV=1,100,0,FAMILY NOT
NAMED,NULL; DUF247,Protein of unknown function DUF247,
plant,CUFF.59399.1
         (1539 letters)

Database: LJGI 
           47,486 sequences; 32,788,469 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gnl|LJGI|TC76688 similar to UniRef100_A7QTC1 Cluster: Chromosome...  2266   0.0  

>gnl|LJGI|TC76688 similar to UniRef100_A7QTC1 Cluster: Chromosome chr1 scaffold_166,
            whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
            Chromosome chr1 scaffold_166, whole genome shotgun
            sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (5%)
          Length = 1253

 Score = 2266 bits (1143), Expect = 0.0
 Identities = 1146/1147 (99%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                        
Query: 393  ggatgaaatcaaactgagcagcgatgagttcctccagatgatgctagttgatggctcctt 452
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1    ggatgaaatcaaactgagcagcgatgagttcctccagatgatgctagttgatggctcctt 60

                                                                        
Query: 453  cattgttcagctgctgagggatctatcagagtgtgagtttggacaagtcccatatctcag 512
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61   cattgttcagctgctgagggatctatcagagtgtgagtttggacaagtcccatatctcag 120

                                                                        
Query: 513  tagatggatgctacccatcattagaagagagttaatcatgcttgaaaaccagcttccaat 572
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121  tagatggatgctacccatcattagaagagagttaatcatgcttgaaaaccagcttccaat 180

                                                                        
Query: 573  gtttgttctgagcaagctatttgagttgacagataatactcaagctaattcagaaccagg 632
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181  gtttgttctgagcaagctatttgagttgacagataatactcaagctaattcagaaccagg 240

                                                                        
Query: 633  tacaggtctcaatctcaaagctcttgctcttcggttcttttaccctttgctgcaggtgga 692
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241  tacaggtctcaatctcaaagctcttgctcttcggttcttttaccctttgctgcaggtgga 300

                                                                        
Query: 693  ctcagacaacattccagaatgtgaggagaaaggagatgagctgagaggacatcattttct 752
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301  ctcagacaacattccagaatgtgaggagaaaggagatgagctgagaggacatcattttct 360

                                                                        
Query: 753  cgatcttcttcgatcgagtgttcggccaaaactaaagggggaaaagccaagaggatctca 812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361  cgatcttcttcgatcgagtgttcggccaaaactaaagggggaaaagccaagaggatctca 420

                                                                        
Query: 813  gcaccacatgattcgatctgtaacggagcttaagcaggctggtgtgaagatcaaagctga 872
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421  gcaccacatgattcgatctgtaacggagcttaagcaggctggtgtgaagatcaaagctga 480

                                                                        
Query: 873  tgaaacccggaaaattcttgatataagctttggaagaaagtggggagtgcttatgaggga 932
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481  tgaaacccggaaaattcttgatataagctttggaagaaagtggggagtgcttatgaggga 540

                                                                        
Query: 933  gctcaatatccctcctctgtacatcaatgatcacagagggactgtggttcgtaacataat 992
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541  gctcaatatccctcctctgtacatcaatgatcacagagggactgtggttcgtaacataat 600

                                                                        
Query: 993  ggcatttgagaagtgccataaggaatgcaaccctgatgtgacaacctacttgtttttctt 1052
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601  ggcatttgagaagtgccataaggaatgcaaccctgatgtgacaacctacttgtttttctt 660

                                                                        
Query: 1053 caatggactcatcaactcagcagaagatgtggctcttcttcattacaaaggggtgcttca 1112
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661  caatggactcatcaactcagcagaagatgtggctcttcttcattacaaaggggtgcttca 720

                                                                        
Query: 1113 ccattctttaggtaatgactatgcagtgtctgagcttatcaacaaaatttctgaaggggt 1172
            |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721  ccattctttaggtaatgactatgccgtgtctgagcttatcaacaaaatttctgaaggggt 780

                                                                        
Query: 1173 ggctcttgacaagaatgagtcctacttgcatgaagtggtgaatggtgcaaatgcctactt 1232
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781  ggctcttgacaagaatgagtcctacttgcatgaagtggtgaatggtgcaaatgcctactt 840

                                                                        
Query: 1233 tggttccttctatgcaagaaagagagcaacactggtgcattactatttcaccagctgggt 1292
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841  tggttccttctatgcaagaaagagagcaacactggtgcattactatttcaccagctgggt 900

                                                                        
Query: 1293 ggtggggatctcaacaattggtgcgctcttggccctttacttcactgtcctacaggctct 1352
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901  ggtggggatctcaacaattggtgcgctcttggccctttacttcactgtcctacaggctct 960

                                                                        
Query: 1353 ttgcggaattgcagatgcgtcaatggccatgaagaactaccactttggatctctcctcat 1412
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961  ttgcggaattgcagatgcgtcaatggccatgaagaactaccactttggatctctcctcat 1020

                                                                        
Query: 1413 agaagcatttcgtttcccagttcgtggaattcctagcaccgatagtaaaggcatacacaa 1472
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 agaagcatttcgtttcccagttcgtggaattcctagcaccgatagtaaaggcatacacaa 1080

                                                                        
Query: 1473 ttctaaatgtggtgacttatgcagagaagttcgagatttgtgtatggaaatttgtctcac 1532
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 ttctaaatgtggtgacttatgcagagaagttcgagatttgtgtatggaaatttgtctcac 1140

                   
Query: 1533 tgagtaa 1539
            |||||||
Sbjct: 1141 tgagtaa 1147