Miyakogusa Predicted Gene
- Lj6g3v0920410.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj6g3v0920410.1 Non Chatacterized Hit- tr|D7TZU9|D7TZU9_VITVI
Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera
GN=,35.77,0.000000000000009,SM-ATX,SM domain found in ataxin-2;
OS04G0625900 PROTEIN,NULL; ATAXIN 2-RELATED,NULL;
seg,NULL,CUFF.58499.1
(1302 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC80944 weakly similar to UniRef100_A7P0R6 Cluster: Chr... 1707 0.0
gnl|LJGI|TC76165 weakly similar to UniRef100_Q8RY61 Cluster: AT4... 1330 0.0
>gnl|LJGI|TC80944 weakly similar to UniRef100_A7P0R6 Cluster: Chromosome chr19
scaffold_4, whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis
vinifera|Rep: Chromosome chr19 scaffold_4, whole genome
shotgun sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (26%)
Length = 1201
Score = 1707 bits (861), Expect = 0.0
Identities = 914/937 (97%), Gaps = 21/937 (2%)
Strand = Plus / Plus
Query: 366 acccatgatcgatgcaaaactggtgaatcaatcaagccaagctgcggatgtattgtcaaa 425
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 acccatgatcgatgcaaaactggtgaatcaatcaagccaagctgcggatgtattgtcaaa 60
Query: 426 agggatagctgatgagtgcagacagaagtctgagtttgcaaatgaaagaagtgatgaaaa 485
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 agggatagctgatgagtgcagacagaagtctgagtttgcaaatgaaagaagtgatgaaaa 120
Query: 486 gattcaaagctctaattcaagccatgaaattgatacatgtgtgggcgaagtggaagctgt 545
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 121 gattcaaagctctaattcaagccatgaaat---------------------ggaagctgt 159
Query: 546 tgagcgtggaagtgctgatacaacatccagccctcatgacaatggtttgctctgcaacaa 605
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 160 tgagcgtggaagtgctgatacaacatccagccctcatgacaatggtttgctctgcaacaa 219
Query: 606 tgttcctgcatctgttaaagccaacaattcgtgtacaaattccaccctaggagtggatct 665
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 220 tgttcctgcatctgttaaagccaacaattcgtgtacaaattccaccctaggagtggatct 279
Query: 666 catctcagagtcacatgattttccagaaaaatctgttgagatatctaatcctctgggtac 725
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 280 catctcagagtcacatgattttccagaaaaatctgttgagatatctaatcctctgggtac 339
Query: 726 agattctatcaaaaatgctaaggaatttaagctcaacccaggtgccaaacttttctctcc 785
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 340 agattctatcaaaaatgctaaggaatttaagctcaacccaggtgccaaacttttctctcc 399
Query: 786 atctgtggtacatcctatgatagtgactactgctctgccaactgctccaaacatggttta 845
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 400 atctgtggtacatcctatgatagtgactactgctctgccaactgctccaaacatggttta 459
Query: 846 cataccaaatagctctctacctactactactattcaaccagaacgtggattcactacttt 905
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 460 cataccaaatagctctctacctactactactattcaaccagaacgtggattcactacttt 519
Query: 906 tgcttctcgaccttctgcacctgttaaggttgctcagtataataatttcacagcgggaaa 965
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 520 tgtttctcgaccttctgcacctgttaaggttgctcagtataataatttcacagcgggaaa 579
Query: 966 tggtgggagtggttctcaattttcacaacctttggcacataggacgcaacctctgcgata 1025
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 580 tggcgggagtggttctcaattttcacaacctttggcacataggacgcaacctctgcgata 639
Query: 1026 tgctgcacattatgatcctattttgtctgaacctgcttatttgcaaccaaactctcctgc 1085
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 640 tgctgcacattatgatcctattttgtctgaacctgcttatttgcaaccaaactctcctgc 699
Query: 1086 tgttatggctggacgttccacccaattagtctatccaacttcccaggattggattcatgg 1145
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 700 tgttatggctggacgttccacccaattagtctatccaacttcccaggattggattcatgg 759
Query: 1146 tgcaatggctatgtcacctgcctcagctcgtcctctgttgaatcatgtacaatatccgaa 1205
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 760 tgcaatggctatgtcacctgcctcagctcgtcctctgttgaatcatgtacaatatccgaa 819
Query: 1206 gcagcaaggtggaacagttggtcaagccatgccagcttgtatgcaccctcctgtcctaac 1265
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 820 gcagcaaggtggaacagttggtcaagccatgccagcttgtatgcaccctcctgtcctaac 879
Query: 1266 aagcgggcaacaaccctttccgcttcacagccacatt 1302
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 880 aagcgggcaacaaccctttccgcttcacagccacatt 916
>gnl|LJGI|TC76165 weakly similar to UniRef100_Q8RY61 Cluster: AT4g26990/F10M23_330;
n=1; Arabidopsis thaliana|Rep: AT4g26990/F10M23_330 -
Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress), partial (17%)
Length = 772
Score = 1330 bits (671), Expect = 0.0
Identities = 671/671 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggacagggacatgatcacagaggatcacactccttcacctacttccccacattgtcca 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 102 atggacagggacatgatcacagaggatcacactccttcacctacttccccacattgtcca 161
Query: 61 tcaatcaccgacgctttgctcgtcaccaccatgtgcatgattggcctcccagttgatgtt 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 162 tcaatcaccgacgctttgctcgtcaccaccatgtgcatgattggcctcccagttgatgtt 221
Query: 121 catgtcaaggatggctctgtctattctggaatcttccatactgcttctgcggacgctggt 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 222 catgtcaaggatggctctgtctattctggaatcttccatactgcttctgcggacgctggt 281
Query: 181 tatggtgttgttttgaaaaaagcaaggatgataaagaagggaaagtgcaatagtaatgtg 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 282 tatggtgttgttttgaaaaaagcaaggatgataaagaagggaaagtgcaatagtaatgtg 341
Query: 241 ggagagcaagccttggtagatacgcttttgattccgtccgatgatcttgtccaggttgtt 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 342 ggagagcaagccttggtagatacgcttttgattccgtccgatgatcttgtccaggttgtt 401
Query: 301 tcgaagggaataacacttccttcaaacggtgttggtggaacatgtgagatagagaatgat 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 402 tcgaagggaataacacttccttcaaacggtgttggtggaacatgtgagatagagaatgat 461
Query: 361 gttggacccatgatcgatgcaaaactggtgaatcaatcaagccaagctgcggatgtattg 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 462 gttggacccatgatcgatgcaaaactggtgaatcaatcaagccaagctgcggatgtattg 521
Query: 421 tcaaaagggatagctgatgagtgcagacagaagtctgagtttgcaaatgaaagaagtgat 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 522 tcaaaagggatagctgatgagtgcagacagaagtctgagtttgcaaatgaaagaagtgat 581
Query: 481 gaaaagattcaaagctctaattcaagccatgaaattgatacatgtgtgggcgaagtggaa 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 582 gaaaagattcaaagctctaattcaagccatgaaattgatacatgtgtgggcgaagtggaa 641
Query: 541 gctgttgagcgtggaagtgctgatacaacatccagccctcatgacaatggtttgctctgc 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 642 gctgttgagcgtggaagtgctgatacaacatccagccctcatgacaatggtttgctctgc 701
Query: 601 aacaatgttcctgcatctgttaaagccaacaattcgtgtacaaattccaccctaggagtg 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 702 aacaatgttcctgcatctgttaaagccaacaattcgtgtacaaattccaccctaggagtg 761
Query: 661 gatctcatctc 671
|||||||||||
Sbjct: 762 gatctcatctc 772