Miyakogusa Predicted Gene
- Lj6g3v0815690.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj6g3v0815690.1 Non Chatacterized Hit- tr|B9T219|B9T219_RICCO
Putative uncharacterized protein OS=Ricinus communis
G,57.47,4e-18,seg,NULL,CUFF.58335.1
(1914 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC81372 similar to UniRef100_A7P0H2 Cluster: Chromosome... 2488 0.0
gnl|LJGI|TC80201 355 7e-97
>gnl|LJGI|TC81372 similar to UniRef100_A7P0H2 Cluster: Chromosome chr19 scaffold_4,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr19 scaffold_4, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (17%)
Length = 1299
Score = 2488 bits (1255), Expect = 0.0
Identities = 1289/1299 (99%), Gaps = 1/1299 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 456 atcatatggtcgccattttacacaagtggaaaaactggaagggattgttgataaactgca 515
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2 atcacatggtcgccattttacacaagtggaaaaactggaagggattgttgataaactgca 61
Query: 516 gtggtatgttcaaaatggcgatacaattgtggacttttgttgtggagctaacgacttcag 575
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 62 gtggtatgttcaaaatgggtatacaattgtggacttttgttgtggagctaacgactccag 121
Query: 576 cactcttatgaagaaaaagcttgaagagacggggaagaaatgctcatacaaaaactatga 635
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 122 cactcttatgaagaaaaagcttgaagagacggggaagaaatgctcatacaaaaactatga 181
Query: 636 tttacttccaacaaagaatgattttaattttgagatgagagattggatgagtgtccagcg 695
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 182 tttacttccaacaaagaatgattttaattttgagatgagagatgagatgagtgtccagcg 241
Query: 696 aaaggagttgcctgaagggtcgcaattgatcatgggcctcaatcctccctttgggctaaa 755
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 242 aaaggagttgcctgaagggtcgcaattgatcatgggcctcaatcctccctttgggctaaa 301
Query: 756 agctgctttggctaacaagtttattaacaaggctcttgagtttgaaccaaagctcatgat 815
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 302 ggctgctttggctaacaagtttattaacaaggctcttgagtttgaaccaaagctcatgat 361
Query: 816 tcttatcgtaccaccagaaacagagaggctagatagaaaacggtctccgtacgatcttgt 875
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 362 tcttatcgtaccaccagaaacagagagggtagatagaaaacggtctccgtacgatcttgt 421
Query: 876 gtgggaggataagaagtttctatcaggcaagtcattttatctacctggatctattgatgc 935
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 422 gtgggaggataagaagtttctatcaggcaagtcattttatctacctggatctattgatgc 481
Query: 936 taacgacaagcaaatggaacaatggaatataacgacacccccactctacctttggagccg 995
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 482 taac-acaagcaaatggaacaatggaatataacgacacccccactctacctttggagccg 540
Query: 996 cccggactggactgttaagcataagggcatagccaaagagcacggtcacctgttcagcca 1055
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 cccggactggactgttaagcataagggcatagccaaagagcacggtcacctgttcagcca 600
Query: 1056 gcatgaagtatcaaacatggaaagccctgataatgaagaagcacctgctagtcatactat 1115
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 gcatgaagtatcaaacatggaaagccctgataatgaagaagcacctgctagtcatactat 660
Query: 1116 ggatgacaaggatggaaatgatgtcatgttgggtcatgattccttgaggttaactgatga 1175
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 ggatgacaaggatggaaatgatgtcatgttgggtcatgattccttgaggttaactgatga 720
Query: 1176 tgaagatcacacatcatctatgaatggagggcagaaaggaagctcggctcttggtagtac 1235
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 tgaagatcacacatcatctatgaatggagggcagaaaggaagctcggctcttggtagtac 780
Query: 1236 cgatcgacagagtcaatgggtgagcaaggctgacagtgacaagtcctcctggaagaggaa 1295
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 cgatcgacagagtcaatgggtgagcaaggctgacagtgacaagtcctcctggaagaggaa 840
Query: 1296 acgaactgaggaaaatgatggaagagctgtgacctcaccagccaaaaggcaggctataaa 1355
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 acgaactgaggaaaatgatggaagagctgtgacctcaccagccaaaaggcaggctataaa 900
Query: 1356 tcaaatgcatgaggaagaactggaccatagcatatctcatccaattgatagaggaccctc 1415
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901 tcaaatgcatgaggaagaactggaccatagcatatctcatccaattgatagaggaccctc 960
Query: 1416 cgttgaaggttttcagcccaaatcttatttgctacccccgtattctgaggctggtgatag 1475
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961 cgttgaaggttttcagcccaaatcttatttgctacccccgtattctgaggctggtgatag 1020
Query: 1476 tggttatgggcatttagagccgagctcttttggggtagcctatgttgggacccaaaagta 1535
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 tggttatgggcatttagagccgagctcttttggggtagcctatgttgggacccaaaagta 1080
Query: 1536 cctgagagaatcagagatgaggcaacagagcgggctttacgggctgcagaatcctgattc 1595
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 cctgagagaatcagagatgaggcaacagagcgggctttacgggctgcagaatcctgattc 1140
Query: 1596 tatgaggaatgattatctatctggacatgatcctgcttataacttaggatctagttattt 1655
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1141 tatgaggaatgattatctatctggacatgatcctgcttataacttaggatctagttattt 1200
Query: 1656 gcctcctggttcagtatccgagccaccgtacatgatgactgcaccagctatgcaacgtta 1715
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1201 gcctcctggttcagtatccgagccgccgtacatgatgactgcaccagctatgcaacgtta 1260
Query: 1716 tgcacctcgccttgatgagttaaaccatgtcagcagggt 1754
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1261 tgcacctcgccttgatgagttaaaccatgtcagcagggt 1299
>gnl|LJGI|TC80201
Length = 801
Score = 355 bits (179), Expect = 7e-97
Identities = 185/187 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1728 tgatgagttaaaccatgtcagcagggtggatcctttgaggcctgaacctcctataattgg 1787
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 tgatgagttaaaccatgtcagcagggtggatcctttgaggcctgaacctcctataattgg 60
Query: 1788 tcgaattggcgcttctgaacatacattgccccaacctggaaatggaaatggactgccggg 1847
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 tcgaattggcgcttctgaacatacattgcccccacctggaaatggaaatggactgccggg 120
Query: 1848 ttttgcaactggttctcaccaattttattcacgtcggaattcatcaggtcggttcaatag 1907
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ttttgcaactggttctcacccattttattcacgtcggaattcatcaggtcggttcaatag 180
Query: 1908 gtaattt 1914
|||||||
Sbjct: 181 gtaattt 187