Miyakogusa Predicted Gene
- Lj6g3v0609710.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj6g3v0609710.1 tr|B9GIU6|B9GIU6_POPTR Predicted protein
(Fragment) OS=Populus trichocarpa GN=POPTRDRAFT_172390
PE=3,96.91,0,ThiC,Thiamine biosynthesis protein ThiC; THIAMINE
BIOSYNTHESIS PROTEIN THIC,NULL; thiC: thiamine
bio,NODE_6139_length_1701_cov_784.365662.path1.1
(1359 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC75914 2694 0.0
gnl|LJGI|TC71704 homologue to UniRef100_A7NYK2 Cluster: Chromoso... 636 0.0
gnl|LJGI|BP064953 similar to UniRef100_A5YU40 Cluster: THIC; n=1... 182 4e-45
>gnl|LJGI|TC75914
Length = 2296
Score = 2694 bits (1359), Expect = 0.0
Identities = 1359/1359 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgtactttgctaagcagggaatcattactgaggagatgctttactgtgctgctcgtgag 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 597 atgtactttgctaagcagggaatcattactgaggagatgctttactgtgctgctcgtgag 656
Query: 61 aagctcgacccagagtttgtgaggtcagaagttgctcgtggacgagctatcatcccttcc 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 657 aagctcgacccagagtttgtgaggtcagaagttgctcgtggacgagctatcatcccttcc 716
Query: 121 aacaagaagcacttggagttagagcccatgatagttggaagaaactttttggtgaaagta 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 717 aacaagaagcacttggagttagagcccatgatagttggaagaaactttttggtgaaagta 776
Query: 181 aatgccaatattggaaattctgcagttgcaagctctatagaagaggaagtttacaaggtt 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 777 aatgccaatattggaaattctgcagttgcaagctctatagaagaggaagtttacaaggtt 836
Query: 241 cagtgggcaactatgtggggagctgatacagtcatggatctctcaactggtcgccacatc 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 837 cagtgggcaactatgtggggagctgatacagtcatggatctctcaactggtcgccacatc 896
Query: 301 catgaaactcgagagtggatcttacgcaactctgctgtaccggttgggactgtacctatt 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 897 catgaaactcgagagtggatcttacgcaactctgctgtaccggttgggactgtacctatt 956
Query: 361 tatcaagcacttgagaaagttaatggaattgctgaagatcttagttgggaggttttcagg 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 957 tatcaagcacttgagaaagttaatggaattgctgaagatcttagttgggaggttttcagg 1016
Query: 421 gataccctgattgaacaagctgaacagggtgtagattacttcactatccatgcaggagtt 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1017 gataccctgattgaacaagctgaacagggtgtagattacttcactatccatgcaggagtt 1076
Query: 481 cttctgagatatattcctttaacagcaaaacgcatgacaggaatagtctccagaggagga 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1077 cttctgagatatattcctttaacagcaaaacgcatgacaggaatagtctccagaggagga 1136
Query: 541 tccattcatgcaaaatggtgcttagcttatcacaaagagaattttgcatatgagcactgg 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1137 tccattcatgcaaaatggtgcttagcttatcacaaagagaattttgcatatgagcactgg 1196
Query: 601 gatgacatacttgacatctgcaatcagtatgatgtggctctatccattggtgatgggtta 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1197 gatgacatacttgacatctgcaatcagtatgatgtggctctatccattggtgatgggtta 1256
Query: 661 agaccgggatccatctatgatgcaaatgatacagctcaatttgctgagctcttgacacaa 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1257 agaccgggatccatctatgatgcaaatgatacagctcaatttgctgagctcttgacacaa 1316
Query: 721 ggggaactgacccgaagagcatgggagaaggatgtccaggtgatgaatgaaggacctggg 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1317 ggggaactgacccgaagagcatgggagaaggatgtccaggtgatgaatgaaggacctggg 1376
Query: 781 catgttccaatgcacaagattcccgaaaatatgcagaaacaactagaatggtgtaatgaa 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1377 catgttccaatgcacaagattcccgaaaatatgcagaaacaactagaatggtgtaatgaa 1436
Query: 841 gctccattctacactcttggtcctttaacaactgatattgcccctggttatgatcatatc 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1437 gctccattctacactcttggtcctttaacaactgatattgcccctggttatgatcatatc 1496
Query: 901 acctctgctattggtgctgcgaatattggggcacttggcacagctcttctgtgttatgtg 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1497 acctctgctattggtgctgcgaatattggggcacttggcacagctcttctgtgttatgtg 1556
Query: 961 actccaaaagaacatcttgggttgccaaatcgggacgatgtgaagactggtgttatagct 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1557 actccaaaagaacatcttgggttgccaaatcgggacgatgtgaagactggtgttatagct 1616
Query: 1021 tataaaatagctgctcatgctgctgatttagccaaaggtcatccacatgctcaagaatgg 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1617 tataaaatagctgctcatgctgctgatttagccaaaggtcatccacatgctcaagaatgg 1676
Query: 1081 gatgatgcgttaagcaaggcaaggtttgaatttcgatggatggaccagtttgctttgtca 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1677 gatgatgcgttaagcaaggcaaggtttgaatttcgatggatggaccagtttgctttgtca 1736
Query: 1141 ttggatccaatgacagccatgtccttccatgatgaatcgttgccatcagaaggtgcaaag 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1737 ttggatccaatgacagccatgtccttccatgatgaatcgttgccatcagaaggtgcaaag 1796
Query: 1201 gtagcacatttctgctcaatgtgtggtcctaaattctgctctatgaaaataactgaagat 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1797 gtagcacatttctgctcaatgtgtggtcctaaattctgctctatgaaaataactgaagat 1856
Query: 1261 gtgaggaagtatgctgagaaacatggctatgggactgctgaggaagcgttgctgcgtgga 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1857 gtgaggaagtatgctgagaaacatggctatgggactgctgaggaagcgttgctgcgtgga 1916
Query: 1321 atggatgctatgagtgctgaatttcaatctgccaaaaaa 1359
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1917 atggatgctatgagtgctgaatttcaatctgccaaaaaa 1955
>gnl|LJGI|TC71704 homologue to UniRef100_A7NYK2 Cluster: Chromosome chr6 scaffold_3,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr6 scaffold_3, whole genome shotgun sequence
- Vitis vinifera (Grape), partial (27%)
Length = 515
Score = 636 bits (321), Expect = 0.0
Identities = 321/321 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1039 gctgctgatttagccaaaggtcatccacatgctcaagaatgggatgatgcgttaagcaag 1098
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 gctgctgatttagccaaaggtcatccacatgctcaagaatgggatgatgcgttaagcaag 60
Query: 1099 gcaaggtttgaatttcgatggatggaccagtttgctttgtcattggatccaatgacagcc 1158
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 gcaaggtttgaatttcgatggatggaccagtttgctttgtcattggatccaatgacagcc 120
Query: 1159 atgtccttccatgatgaatcgttgccatcagaaggtgcaaaggtagcacatttctgctca 1218
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 atgtccttccatgatgaatcgttgccatcagaaggtgcaaaggtagcacatttctgctca 180
Query: 1219 atgtgtggtcctaaattctgctctatgaaaataactgaagatgtgaggaagtatgctgag 1278
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 atgtgtggtcctaaattctgctctatgaaaataactgaagatgtgaggaagtatgctgag 240
Query: 1279 aaacatggctatgggactgctgaggaagcgttgctgcgtggaatggatgctatgagtgct 1338
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 aaacatggctatgggactgctgaggaagcgttgctgcgtggaatggatgctatgagtgct 300
Query: 1339 gaatttcaatctgccaaaaaa 1359
|||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gaatttcaatctgccaaaaaa 321
>gnl|LJGI|BP064953 similar to UniRef100_A5YU40 Cluster: THIC; n=1; Ocimum basilicum|Rep:
THIC - Ocimum basilicum (Sweet basil), partial (81%)
Length = 345
Score = 182 bits (92), Expect = 4e-45
Identities = 99/100 (99%), Gaps = 1/100 (1%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1261 gtgaggaagtatgctgagaaacatggctatgggactgctgagg-aagcgttgctgcgtgg 1319
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 345 gtgaggaagtatgctgagaaacatggctatgggactgctgagggaagcgttgctgcgtgg 286
Query: 1320 aatggatgctatgagtgctgaatttcaatctgccaaaaaa 1359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 285 aatggatgctatgagtgctgaatttcaatctgccaaaaaa 246