Miyakogusa Predicted Gene

Lj6g3v0291930.1
Show Alignment: 

BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Lj6g3v0291930.1 gi|15485717|emb|AJ401227.1|.path1.1
         (1464 letters)

Database: LJGI 
           47,486 sequences; 32,788,469 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gnl|LJGI|TC57151 UniRef100_Q93VA1 Cluster: Selenium binding prot...  2831   0.0  

>gnl|LJGI|TC57151 UniRef100_Q93VA1 Cluster: Selenium binding protein; n=1; Lotus
            japonicus|Rep: Selenium binding protein - Lotus
            japonicus, complete
          Length = 1678

 Score = 2831 bits (1428), Expect = 0.0
 Identities = 1456/1465 (99%), Gaps = 2/1465 (0%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                        
Query: 1    atggctactgtgttggatcatggtgtggtgaatgagnnnnnnngtgttaatggatgctgc 60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||
Sbjct: 45   atggctactgtgttggatcatggtgtggtgaatgagaaaaaaagtgttaatggatgctgc 104

                                                                        
Query: 61   aaatcagggccaggttatgcttctccgattgaagccatgtctggtcccagagagtctctg 120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 105  aaatcagggccaggttatgcttctccgattgaagccatgtctggtcccagagagtctctg 164

                                                                        
Query: 121  atttatgtaactgctgtctatgcaggtaccggaattgaaaagccagattatttggctact 180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 165  atttatgtaactgctgtctatgcaggtaccggaattgaaaagccagattatttggctact 224

                                                                        
Query: 181  gtggatgtggatccaagctctccaacttactcaaaagtgatccacaggctacctgttcct 240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 225  gtggatgtggatccaagctctccaacttactcaaaagtgatccacaggctacctgttcct 284

                                                                        
Query: 241  tatgtgggtgatgaattgcaccatactggctggaattcttgcagctcttgccatggagac 300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 285  tatgtgggtgatgaattgcaccatactggctggaattcttgcagctcttgccatggagac 344

                                                                        
Query: 301  ccatccgcggagcgacgctttctcattgcaccttcacttgtatcaggccgtatatatgtg 360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 345  ccatccgcggagcgacgctttctcattgcaccttcacttgtatcaggccgtatatatgtg 404

                                                                        
Query: 361  attgacacaaaaacaaatccaaggtctccatctttgcacaaagttgttgaccctgcagat 420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 405  attgacacaaaaacaaatccaaggtctccatctttgcacaaagttgttgaccctgcagat 464

                                                                        
Query: 421  atcatacaaaagactggattagcttatccacacacatctcattgcctggcttccggtgag 480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 465  atcatacaaaagactggattagcttatccacacacatctcattgcctggcttccggtgag 524

                                                                        
Query: 481  ctaatgatctcatgcctcggagataaagatgggaatgctgaaggaaatggatttcttctt 540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 525  ctaatgatctcatgcctcggagataaagatgggaatgctgaaggaaatggatttcttctt 584

                                                                        
Query: 541  cttgattcagactttaatgtcaaaggaagatgggagaaaccaggacacagtccattattt 600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 585  cttgattcagactttaatgtcaaaggaagatgggagaaaccaggacacagtccattattt 644

                                                                        
Query: 601  gggtatgacttttggtaccagccgcggcacaatactatgattagcacatcctggggtgct 660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 645  gggtatgacttttggtaccagccgcggcacaatactatgattagcacatcctggggtgct 704

                                                                        
Query: 661  cctactgcttttaccaaaggttttgacttacagcatgtcgctgatggattgtatgggagg 720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 705  cctactgcttttaccaaaggttttgacttacagcatgtcgctgatggattgtatgggagg 764

                                                                        
Query: 721  catct-acatgtatacaattggcccgggggcgaactgagacaaacattggaccttggcaa 779
            ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 765  catcttacatgtatacaattggcccgggg-cgaactgagacaaacattggaccttggcaa 823

                                                                        
Query: 780  cacagggctcttgcctttggagataaggttcctacatgatcctgctaaagacaccggttt 839
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 824  cacagggctcttgcctttggagataaggttcctacatgatcctgctaaagacaccggttt 883

                                                                        
Query: 840  tgttgggagtgcattgtcaagtaacatgatacggtttttcaaaacccaagatggatcatg 899
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 884  tgttgggagtgcattgtcaagtaacatgatacggtttttcaaaacccaagatggatcatg 943

                                                                        
Query: 900  gagccatgagcttgcaataccagtgaaaccactgaaagtgcaaaactggattcttcctga 959
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 944  gagccatgagcttgcaataccagtgaaaccactgaaagtgcaaaactggattcttcctga 1003

                                                                        
Query: 960  gatgcctgggcttataacagattttctgatttctcttgatgaccggtttctgtatttcgt 1019
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1004 gatgcctgggcttataacagattttctgatttctcttgatgaccggtttctgtatttcgt 1063

                                                                        
Query: 1020 aaactggcttcacggggatataaggcagtataacattgaggaccttaagaatcctgtgct 1079
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1064 aaactggcttcacggggatataaggcagtataacattgaggaccttaagaatcctgtgct 1123

                                                                        
Query: 1080 gactggccaactatgggttggaggccttatccagaaaggaagccctgtagcagctatagg 1139
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1124 gactggccaactatgggttggaggccttatccagaaaggaagccctgtagcagctatagg 1183

                                                                        
Query: 1140 agaagatggtaaaacttggcaatctgatgttccagagattcagggacaaaagctgagagg 1199
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1184 agaagatggtaaaacttggcaatctgatgttccagagattcagggacaaaagctgagagg 1243

                                                                        
Query: 1200 gggccctcagatgattcaactgagcttggatgggaagaggctgtatgttactaactcact 1259
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1244 gggccctcagatgattcaactgagcttggatgggaagaggctgtatgttactaactcact 1303

                                                                        
Query: 1260 gtttagtgcttgggataaacaattttatccagggcttgtagagaaaggatcccatatatt 1319
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1304 gtttagtgcttgggataaacaattttatccagggcttgtagagaaaggatcccatatatt 1363

                                                                        
Query: 1320 gcagattgatgttgacactgagaaaggtggcctgaaaatcaaccccaacttctttgttga 1379
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1364 gcagattgatgttgacactgagaaaggtggcctgaaaatcaaccccaacttctttgttga 1423

                                                                        
Query: 1380 ctttggagctgagcctgatggtcctgcccttgcccatgagatgagatatcctggtggtga 1439
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1424 ctttggagctgagcctgatggtcctgcccttgcccatgagatgagatatcctggtggtga 1483

                                     
Query: 1440 ctgcacttcagatatatggatttaa 1464
            |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1484 ctgcacttcagatatatggatttaa 1508