Miyakogusa Predicted Gene
- Lj6g3v0096480.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj6g3v0096480.1 tr|G7I6Q7|G7I6Q7_MEDTR 3-isopropylmalate
dehydratase OS=Medicago truncatula GN=MTR_1g045750 PE=4
SV=,91.39,0,seg,NULL; Aconitase iron-sulfur
domain,Aconitase/3-isopropylmalate dehydratase large subunit,
alpha/,CUFF.57501.1
(1536 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC60937 similar to UniRef100_A9TGU1 Cluster: Predicted ... 2843 0.0
>gnl|LJGI|TC60937 similar to UniRef100_A9TGU1 Cluster: Predicted protein; n=1;
Physcomitrella patens subsp. patens|Rep: Predicted
protein - Physcomitrella patens subsp. patens, partial
(89%)
Length = 1896
Score = 2843 bits (1434), Expect = 0.0
Identities = 1434/1434 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 103 caacgatgccagaagccagctcccaggagaatctcttgttccgttgcggcgcctcagcaa 162
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 152 caacgatgccagaagccagctcccaggagaatctcttgttccgttgcggcgcctcagcaa 211
Query: 163 ttgcagcgccaaccttctaccactggatcagtgaagactgcgatgaccatgacagagaag 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 212 ttgcagcgccaaccttctaccactggatcagtgaagactgcgatgaccatgacagagaag 271
Query: 223 atattggccagagcttctgagaaggcccacctgacccctggggacaatgtttgggtcaat 282
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 272 atattggccagagcttctgagaaggcccacctgacccctggggacaatgtttgggtcaat 331
Query: 283 gttgatattttgatgacacatgatgtgtgtggccctggctctattgggattttcaagaga 342
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 332 gttgatattttgatgacacatgatgtgtgtggccctggctctattgggattttcaagaga 391
Query: 343 gagtttggtcaggatgccaaggtttgggaccgtgaaaaggttgtaataatacctgatcac 402
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 392 gagtttggtcaggatgccaaggtttgggaccgtgaaaaggttgtaataatacctgatcac 451
Query: 403 tacatattcacaagtgatgaacgtgccaatcgcaatgtagacatattaagagatttctgc 462
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 452 tacatattcacaagtgatgaacgtgccaatcgcaatgtagacatattaagagatttctgc 511
Query: 463 catgagcagaatatcaagtacttctatgatattaaggatcttagtaattttaaggtaaat 522
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 512 catgagcagaatatcaagtacttctatgatattaaggatcttagtaattttaaggtaaat 571
Query: 523 ccagactacaaaggtgtttgccacattgcccttgctcaggaaggtcattgcaggccagga 582
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 572 ccagactacaaaggtgtttgccacattgcccttgctcaggaaggtcattgcaggccagga 631
Query: 583 gaggttctcttaggtactgattctcacacttgtactgctggagcatttggtcaattcgct 642
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 632 gaggttctcttaggtactgattctcacacttgtactgctggagcatttggtcaattcgct 691
Query: 643 acagggattggtaataccgatgcaggtttcgtgttgggagcagggaagcttttgcttaag 702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 692 acagggattggtaataccgatgcaggtttcgtgttgggagcagggaagcttttgcttaag 751
Query: 703 gtgcctccaactctgagatttgtaatggatggagaaatgcccaattatttgcttgcaaag 762
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 752 gtgcctccaactctgagatttgtaatggatggagaaatgcccaattatttgcttgcaaag 811
Query: 763 gatttaattctgcaaattattggtgaaataagtgtagctggtgcaacatataaatctatg 822
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 812 gatttaattctgcaaattattggtgaaataagtgtagctggtgcaacatataaatctatg 871
Query: 823 gagtttgttggcaccactgttgaaagtttaactatggaagaacggatgactttgtgcaac 882
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 872 gagtttgttggcaccactgttgaaagtttaactatggaagaacggatgactttgtgcaac 931
Query: 883 atggttgttgaagctggaggaaagaatggtgttgttcctgctgatagcactacatataaa 942
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 932 atggttgttgaagctggaggaaagaatggtgttgttcctgctgatagcactacatataaa 991
Query: 943 tatcttgagggtaagacatcagtagcctatgaaccggtttatagtgaccagcaagcaaga 1002
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 992 tatcttgagggtaagacatcagtagcctatgaaccggtttatagtgaccagcaagcaaga 1051
Query: 1003 ttcctttctgagtatagatttgatgtctcaaaattggaaccactggtggcaaagcctcat 1062
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1052 ttcctttctgagtatagatttgatgtctcaaaattggaaccactggtggcaaagcctcat 1111
Query: 1063 tcaccagataaccgtgctttggcaagagagtgcaaggatgtgaagattgacagagtatac 1122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1112 tcaccagataaccgtgctttggcaagagagtgcaaggatgtgaagattgacagagtatac 1171
Query: 1123 ataggatcttgtacaggtggaaaaacagaggattttatggctgcagcaaaaatttttcta 1182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1172 ataggatcttgtacaggtggaaaaacagaggattttatggctgcagcaaaaatttttcta 1231
Query: 1183 gcatcaggtaaaacggtcaaagttcccacatttcttgtacctgcaacacagaaggtttgg 1242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1232 gcatcaggtaaaacggtcaaagttcccacatttcttgtacctgcaacacagaaggtttgg 1291
Query: 1243 atggacgtatacagccttccggtccctggatctggtggtaagacttgctcacagatattt 1302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1292 atggacgtatacagccttccggtccctggatctggtggtaagacttgctcacagatattt 1351
Query: 1303 gaagaagctgggtgtgacacaccagctagtcctagttgtggtgcttgtttgggtggccca 1362
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1352 gaagaagctgggtgtgacacaccagctagtcctagttgtggtgcttgtttgggtggccca 1411
Query: 1363 aaagatacatatgcacgcatgaatgaacctaaggtttgtgtttccactacaaataggaac 1422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1412 aaagatacatatgcacgcatgaatgaacctaaggtttgtgtttccactacaaataggaac 1471
Query: 1423 ttcccgggccgaatgggccacaaggaaggtgaaatatatttggcttcaccatatacagct 1482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1472 ttcccgggccgaatgggccacaaggaaggtgaaatatatttggcttcaccatatacagct 1531
Query: 1483 gcggcatctgcattgactggttacgttactgatccaagagagttcttgcagtag 1536
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1532 gcggcatctgcattgactggttacgttactgatccaagagagttcttgcagtag 1585
Score = 111 bits (56), Expect = 1e-23
Identities = 56/56 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggcttcctctattgttgctccgtcttccacctccttcttcaacaccaagaagga 56
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 50 atggcttcctctattgttgctccgtcttccacctccttcttcaacaccaagaagga 105