Miyakogusa Predicted Gene
- Lj6g3v0028830.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj6g3v0028830.1 Non Chatacterized Hit- tr|I3SL18|I3SL18_LOTJA
Uncharacterized protein OS=Lotus japonicus PE=2 SV=1,99.28,0,seg,NULL;
no description,NADP-dependent oxidoreductase domain; NAD(P)-linked
oxidoreductase,NADP-dep,CUFF.57396.1
(1260 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC60379 similar to UniRef100_A7NXC7 Cluster: Chromosome... 2413 0.0
gnl|LJGI|TC65061 homologue to UniRef100_A7NXC7 Cluster: Chromoso... 1219 0.0
>gnl|LJGI|TC60379 similar to UniRef100_A7NXC7 Cluster: Chromosome chr5 scaffold_2,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr5 scaffold_2, whole genome shotgun sequence
- Vitis vinifera (Grape), partial (86%)
Length = 1484
Score = 2413 bits (1217), Expect = 0.0
Identities = 1248/1260 (99%), Gaps = 3/1260 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgacgtcatgctgcttcttctctccctcttcccctgacatgcttcctcactctctcaaa 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 38 atgacgtcatgctgcttcttctctccctcttcccctgacatgcttcctcactctctcaaa 97
Query: 61 ccctcaatgccactcaccactccacttccaacaacaacaacaagaagcttctttaggaag 120
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 98 ccctcaatgccactcaccactccacttccaacaacaacaa---gaagcttctttaggaag 154
Query: 121 agaacgagaactgggtctgtaactgtgagacctctcttttgtgccctcaacaacaacaac 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 155 agaacgagaactgggtctgtaactgtgagacctctcttttgtgccctcaacaacaacaac 214
Query: 181 gctttgcagtacaggaagcttggtgattctgacctcaacatcagtgaaatcactctcggt 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 215 gctttgcagtacaggaagcttggtgattctgacctcaacatcagtgaaatcactctcggt 274
Query: 241 actatgacatttggggagcaaaacacagagaaagaatctcatgacatcctcagttatgca 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 275 actatgacatttggggagcaaaacacagagaaagaatctcatgacatcctcagttatgca 334
Query: 301 tttgagcgcggtattaatgctctggacactgctgaggcttatccaattccaatgaagaaa 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 335 tttgagcgcggtattaatgctctggacactgctgaggcttatccaattccaatgaagaaa 394
Query: 361 gagacgcaaggaagaactgatctctatattagtagctggatgaagtctcaacctcgtgac 420
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 395 gagacgcaaggaagaactggtctctatattagtagctggatgaagtctcaacctcgtgac 454
Query: 421 aagattattttagcaacaaaagtgtgtggttattctgagaggtcaagttacttacgagac 480
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 455 aggattattttagcaacaaaagtgtgtggttattctgagaggtcaagttacttacgagac 514
Query: 481 aatgcaactgttttgcgggttgatgccgcaaatatcaaagaaagtgtggagaaaagcctt 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 515 aatgcaactgttttgcgggttgatgccgcaaatatcaaagaaagtgtggagaaaagcctt 574
Query: 541 aagcgtcttggcactgattatattgatttattgcaaattcactggccagatcgctacgtg 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 575 aagcgtcttggcactgattatattgatttattgcaaattcactggccagatcgctacgtg 634
Query: 601 gcattgtttggtgagnnnnnnnatgatccttcaaaatggaggcccagcgtgccatttgtt 660
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 635 gcattgtttggtgagtttttttatgatccttcaaaatggaggcccagcgtgccatttgtt 694
Query: 661 gaacagttgcaagcatttcaggaacttatcaatgaaggaaaggtacgctacttaggtgtt 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 695 gaacagttgcaagcatttcaggaacttatcaatgaaggaaaggtacgctacttaggtgtt 754
Query: 721 tcaaatgagacttcatatggagtgatggagtttgtccatgcagctaaagttgaggggctt 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 755 tcaaatgagacttcatatggagtgatggagtttgtccatgcagctaaagttgaggggctt 814
Query: 781 ccaaagattgtcagcattcaaaacagctatagcttgctttttagatgtcattttgaactt 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 815 ccaaagattgtcagcattcaaaacagctatagcttgctttttagatgtcattttgaactt 874
Query: 841 gatctcgtggaagtttgccatccaaagaatcacaatattgggttactagcttattcccca 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 875 gatctcgtggaagtttgccatccaaagaatcacaatattgggttactagcttattcccca 934
Query: 901 cttggaggtggaacactctcggggaaatacatagatatagattctgaagctgcaaaaagt 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 935 cttggaggtggaacactctcggggaaatacatagatatagattctgaagctgcaaaaagt 994
Query: 961 ggaaggttgaacctcttccctggctacatggaaagatacaacaaatcagtgtcacgggaa 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 995 ggaaggttgaacctcttccctggctacatggaaagatacaacaaatcagtgtcacgggaa 1054
Query: 1021 gcaactataaagtatcttgaggtggcgaagaagcatggtctaactcttgttgagcttgcg 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1055 gcaactataaagtatcttgaggtggcgaagaagcatggtctaactcttgttgagcttgcg 1114
Query: 1081 cttggattcgcaagagaccgtccattcatgacaagttcaattgtgggcgcaacctccgtg 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1115 cttggattcgcaagagaccgtccattcatgacaagttcaattgtgggcgcaacctccgtg 1174
Query: 1141 gatcaactaaaagaagacattgatgcttttacaacaactcagcggcctttaccagcagaa 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1175 gatcaactaaaagaagacattgatgcttttacaacaactcagcggcctttaccagcagaa 1234
Query: 1201 gtcatggcagacattgaagctgtcttcaagagatacaaggatcctgctattctttaaaga 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1235 gtcatggcagacattgaagctgtcttcaagagatacaaggatcctgctattctttaaaga 1294
>gnl|LJGI|TC65061 homologue to UniRef100_A7NXC7 Cluster: Chromosome chr5 scaffold_2,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr5 scaffold_2, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (35%)
Length = 702
Score = 1219 bits (615), Expect = 0.0
Identities = 615/615 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgacgtcatgctgcttcttctctccctcttcccctgacatgcttcctcactctctcaaa 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 38 atgacgtcatgctgcttcttctctccctcttcccctgacatgcttcctcactctctcaaa 97
Query: 61 ccctcaatgccactcaccactccacttccaacaacaacaacaagaagcttctttaggaag 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 98 ccctcaatgccactcaccactccacttccaacaacaacaacaagaagcttctttaggaag 157
Query: 121 agaacgagaactgggtctgtaactgtgagacctctcttttgtgccctcaacaacaacaac 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 158 agaacgagaactgggtctgtaactgtgagacctctcttttgtgccctcaacaacaacaac 217
Query: 181 gctttgcagtacaggaagcttggtgattctgacctcaacatcagtgaaatcactctcggt 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 218 gctttgcagtacaggaagcttggtgattctgacctcaacatcagtgaaatcactctcggt 277
Query: 241 actatgacatttggggagcaaaacacagagaaagaatctcatgacatcctcagttatgca 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 278 actatgacatttggggagcaaaacacagagaaagaatctcatgacatcctcagttatgca 337
Query: 301 tttgagcgcggtattaatgctctggacactgctgaggcttatccaattccaatgaagaaa 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 338 tttgagcgcggtattaatgctctggacactgctgaggcttatccaattccaatgaagaaa 397
Query: 361 gagacgcaaggaagaactgatctctatattagtagctggatgaagtctcaacctcgtgac 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 398 gagacgcaaggaagaactgatctctatattagtagctggatgaagtctcaacctcgtgac 457
Query: 421 aagattattttagcaacaaaagtgtgtggttattctgagaggtcaagttacttacgagac 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 458 aagattattttagcaacaaaagtgtgtggttattctgagaggtcaagttacttacgagac 517
Query: 481 aatgcaactgttttgcgggttgatgccgcaaatatcaaagaaagtgtggagaaaagcctt 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 518 aatgcaactgttttgcgggttgatgccgcaaatatcaaagaaagtgtggagaaaagcctt 577
Query: 541 aagcgtcttggcactgattatattgatttattgcaaattcactggccagatcgctacgtg 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 578 aagcgtcttggcactgattatattgatttattgcaaattcactggccagatcgctacgtg 637
Query: 601 gcattgtttggtgag 615
|||||||||||||||
Sbjct: 638 gcattgtttggtgag 652
Score = 61.9 bits (31), Expect = 9e-09
Identities = 38/39 (97%), Gaps = 1/39 (2%)
Strand = Plus / Plus
Query: 778 cttccaaagattgtcagcattcaaaacagctatagcttg 816
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 665 cttccaaagattgtcagcattc-aaacagctatagcttg 702