Miyakogusa Predicted Gene
- Lj6g3v0027680.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj6g3v0027680.1 tr|G7I3R9|G7I3R9_MEDTR NADH-quinone
oxidoreductase subunit F OS=Medicago truncatula GN=MTR_1g042300
,94.62,0,Nqo1 FMN-binding domain-like,NULL; Nqo1C-terminal
domain-like,NULL; Nqo1 middle domain-like,NULL; se,CUFF.57401.1
(1453 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC78405 homologue to UniRef100_Q8LAL7 Cluster: NADH deh... 2153 0.0
>gnl|LJGI|TC78405 homologue to UniRef100_Q8LAL7 Cluster: NADH dehydrogenase; n=1;
Arabidopsis thaliana|Rep: NADH dehydrogenase -
Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress), partial (74%)
Length = 1358
Score = 2153 bits (1086), Expect = 0.0
Identities = 1095/1098 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 356 ggtcttttatgcccaaagtatctgatggccgcccttcttatcttgttgttaatgctgatg 415
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2 ggtcttttatgcccaaagtatctgatggccgcccttcttatcttgttgttaatgctgatg 61
Query: 416 aaagtgagcctggaacttgcaaagacagggaaattatgcgtcatgacccgcataagttgt 475
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 62 aaagtgagcctggaacttgcaaagacagggaaattatgcgtcatgacccgcataagttgt 121
Query: 476 tagaaggttgcttgattgctggagtaggaatgagggcaagtgctgcatacagctacatca 535
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 122 tagaaggttgcttgattgctggagtaggaatgagggcaagtgctgcatacatctacatca 181
Query: 536 ggggtgaatacgtaaatgaacgtataaatcttgaaaaggctaggaaggaggcttacgccg 595
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 182 ggggtgaatacgtaaacgaacgtataaatcttgaaaaggctaggaaggaggcttacgccg 241
Query: 596 ctggtttactgggtaagaatgcttgtggctcaggctatgattttgatgtttatatccact 655
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 242 ctggtttactgggtaagaatgcttgtggctcaggctatgattttgatgtttatatccact 301
Query: 656 atggtgctggagcttatatttgcggtgaggaaacagccctcttggagagtcttgaaggga 715
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 302 atggtgctggagcttatatttgcggtgaggaaacagccctcttggagagtcttgaaggga 361
Query: 716 agcaaggtaaaccaagattaaagccaccgttcccagctaatgcagggttgtatggctgtc 775
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 362 agcaaggtaaaccaagattaaagccaccgttcccagctaatgcagggttgtatggctgtc 421
Query: 776 ccaccactgtaacaaatgtggaaactgtggctgtttctccaaccattctaaggcgtggtc 835
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 422 ccaccactgtaacaaatgtggaagctgtggctgtttctccaaccattctaaggcgtggtc 481
Query: 836 ctgaatggtttgctagttttggtaggaagaacaattctgggactaagctgttttgcgtgt 895
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 482 ctgaatggtttgctagttttggtaggaagaacaattctgggactaagctgttttgcgtgt 541
Query: 896 cagggcatgttaacaagccatgcactgttgaggaagaaatgagtataccactgaaggagt 955
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 542 cagggcatgttaacaagccatgcactgttgaggaagaaatgagtataccactgaaggagt 601
Query: 956 tgatagagaggcactgtggaggtgttagaggaggatgggataatttacttgctgtaattc 1015
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 602 tgatagagaggcactgtggaggtgttagaggaggatgggataatttacttgctgtaattc 661
Query: 1016 caggaggatcatctgttccactgcttccaaagcatatatgtgatgatgttctgatggatt 1075
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 662 caggaggatcatctgttccactgcttccaaagcatatatgtgatgatgttctgatggatt 721
Query: 1076 atgatgcattgaaggctgtcacgtcagggttggggactgcagccgtgattgtgatggata 1135
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 722 atgatgcattgaaggctgtcacgtcagggttggggactgcagccgtgattgtgatggata 781
Query: 1136 agtctactgatgttgtggatgctattgcaaggctctcctacttctacaagcatgaaagct 1195
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 782 agtctactgatgttgtggatgctattgcaaggctctcctacttctacaagcatgaaagct 841
Query: 1196 gtgggcagtgtacaccctgcagggagggaacaggatggctttggatgatcatggaaagac 1255
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 842 gtgggcagtgtacaccctgcagggagggaacaggatggctttggatgatcatggaaagac 901
Query: 1256 tgaaagttgggaatgccaaactagaagagattgatatgctgcaggaggtgactaagcaaa 1315
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 902 tgaaagttgggaatgccaaactagaagagattgatatgctgcaggaggtgactaagcaaa 961
Query: 1316 ttgaagggcacacaatctgtgccttgggagatgctgctgcatggccagtgcagggtctta 1375
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 962 ttgaagggcacacaatctgtgccttgggagatgctgctgcatggccagtgcagggtctta 1021
Query: 1376 tcaggcatttcagacccgagcttgagagaaggattaaagagtatgcacaaagggagttgc 1435
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1022 tcaggcatttcagacccgagcttgagagaaggattaaagagtatgcacaaagggagttgc 1081
Query: 1436 tccaggctactggttaga 1453
||||||||||||||||||
Sbjct: 1082 tccaggctactggttaga 1099