Miyakogusa Predicted Gene
- Lj5g3v2300390.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj5g3v2300390.1 Non Chatacterized Hit- tr|I1NJC2|I1NJC2_SOYBN
Uncharacterized protein OS=Glycine max PE=3 SV=1,83.11,0,seg,NULL;
UPF0061,Uncharacterised protein family UPF0061; SUBFAMILY NOT
NAMED,NULL; FAMILY NOT NAMED,CUFF.57319.1
(1851 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC80432 similar to UniRef100_A7NZZ2 Cluster: Chromosome... 1304 0.0
gnl|LJGI|TC66137 similar to UniRef100_Q67YJ0 Cluster: MRNA, part... 1253 0.0
gnl|LJGI|TC63146 similar to UniRef100_A7NZZ2 Cluster: Chromosome... 906 0.0
gnl|LJGI|TC82179 similar to UniRef100_Q67YJ0 Cluster: MRNA, part... 898 0.0
>gnl|LJGI|TC80432 similar to UniRef100_A7NZZ2 Cluster: Chromosome chr6 scaffold_3,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr6 scaffold_3, whole genome shotgun sequence
- Vitis vinifera (Grape), partial (61%)
Length = 722
Score = 1304 bits (658), Expect = 0.0
Identities = 664/666 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1186 acagatcttcctggtagaagatactgttttgcaaaccagcctgacattggtttatggaat 1245
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4 acagatcttcctggtagaagatactgttttgcaaaccagcctgacattggtttatggaat 63
Query: 1246 cttgcacagttcacagcagcactgtcaacggctcatttaatagacgataaagaggcaaac 1305
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 64 cttgcacagttcacagcagcactgtcaacggctcatttaatagacgataaagaggcaaac 123
Query: 1306 tatgctttggaaagatatggaacaagatttatggatgattatcaagctataatgaccaaa 1365
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 124 tatgctttggaaagatatggaacaagatttatggatgattatcaagctataatgaccaaa 183
Query: 1366 aagcttggcctccctaagtacaataagcagctgattggtaaacttcttagtaacatggct 1425
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 184 aagcttggcctccctaagtacaataagcagctgattggtaaacttcttagtaacatggct 243
Query: 1426 gttgacaaagttgattatacaaacttctttcgtacactatcaaatattaaagcagacaca 1485
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 244 gttgacaaagttgattatacaaacttctttcgtacactatcaaatattaaagcagacaca 303
Query: 1486 agcattccagatgatgaattgctagtcccactaaagtcggtgctcttagatatgggcaag 1545
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 304 agcattccagatgatgaattgctagtcccactaaagtcggtgctcttagatatgggcaag 363
Query: 1546 gagcgtaaggaagcttggaccagttggttaaaaacctacatacatgagctgtacaccggt 1605
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 364 gagcgtaaggaagcttggaccagttggttaaaaacctacatacatgagctgtccaccggt 423
Query: 1606 ggtatttctgatgaagagaggaagacctcaatggatttgataaatcctaaatatattctg 1665
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 424 ggtatttctgatgaagagaggaagacctcaatggatttggtaaatcctaaatatattctg 483
Query: 1666 aggaactatctttgccagactgcaattgatgctgctgaaattggtgattttggagaagtc 1725
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 484 aggaactatctttgccagactgcaattgatgctgctgaaattggtgattttggagaagtc 543
Query: 1726 cgtaggttgctcaaattaatggagcatccttttgatgagcaacctggaatggaaaagtat 1785
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 544 cgtaggttgctcaaattaatggagcatccttttgatgagcaacctggaatggaaaagtat 603
Query: 1786 gctcgcttgcccccagcgtgggcatatcgaccaggcgtatgtatgctttcttgttcttca 1845
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 604 gctcgcttgcccccagcgtgggcatatcgaccaggcgtatgtatgctttcttgttcttca 663
Query: 1846 tgagtt 1851
||||||
Sbjct: 664 tgagtt 669
>gnl|LJGI|TC66137 similar to UniRef100_Q67YJ0 Cluster: MRNA, partial cds, clone:
RAFL24-27-O06; n=2; Arabidopsis thaliana|Rep: MRNA,
partial cds, clone: RAFL24-27-O06 - Arabidopsis thaliana
(Mouse-ear cress), partial (22%)
Length = 689
Score = 1253 bits (632), Expect = 0.0
Identities = 632/632 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggtggtgacgctcactcatttcttcttcttcaccttctctcctaaaactaaaactgca 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 58 atggtggtgacgctcactcatttcttcttcttcaccttctctcctaaaactaaaactgca 117
Query: 61 ctttcttcctctctccgacgcgccgccacaaaattccatttctaccctcctcctcctgcc 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 118 ctttcttcctctctccgacgcgccgccacaaaattccatttctaccctcctcctcctgcc 177
Query: 121 accgttgcatgcacccgccgtgccatggaggaccaggaccttcactccgtcactcaagac 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 178 accgttgcatgcacccgccgtgccatggaggaccaggaccttcactccgtcactcaagac 237
Query: 181 tttaagaatcacagtctccacggtggtcgcaagttgaatctcgaagatctcaattgggac 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 238 tttaagaatcacagtctccacggtggtcgcaagttgaatctcgaagatctcaattgggac 297
Query: 241 aattccttcgttcgagaattgccccctgatcccagaaccgattcccttccccgagaggtg 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 298 aattccttcgttcgagaattgccccctgatcccagaaccgattcccttccccgagaggtg 357
Query: 301 ctgcatgcttgttattctaaagtatcaccttcagtggaagtggatgatcctcaacttgtg 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 358 ctgcatgcttgttattctaaagtatcaccttcagtggaagtggatgatcctcaacttgtg 417
Query: 361 gcttggtcccaaccggttgctgacctgctcgatttggaccatcaagaatttgaaaggcca 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 418 gcttggtcccaaccggttgctgacctgctcgatttggaccatcaagaatttgaaaggcca 477
Query: 421 gaatttccccttttcttctctggtgcaacacctttggttggagcgttcccttatgctcag 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 478 gaatttccccttttcttctctggtgcaacacctttggttggagcgttcccttatgctcag 537
Query: 481 tgctacggtggacaccaatttggtatgtgggctgggcagttgggtgatggtagggcaatt 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 538 tgctacggtggacaccaatttggtatgtgggctgggcagttgggtgatggtagggcaatt 597
Query: 541 acgctaggggagatactaaatgcaaagtctgaaaggtgggaactgcaacttaaaggctcg 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 598 acgctaggggagatactaaatgcaaagtctgaaaggtgggaactgcaacttaaaggctcg 657
Query: 601 ggcaagactccttatagtcggtttgctgatgg 632
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 658 ggcaagactccttatagtcggtttgctgatgg 689
>gnl|LJGI|TC63146 similar to UniRef100_A7NZZ2 Cluster: Chromosome chr6 scaffold_3,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr6 scaffold_3, whole genome shotgun sequence
- Vitis vinifera (Grape), partial (42%)
Length = 711
Score = 906 bits (457), Expect = 0.0
Identities = 463/465 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1387 aataagcagctgattggtaaacttcttagtaacatggctgttgacaaagttgattataca 1446
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3 aataagcagctgattggtaaacttcttagtaacatggctgttgacaaagttgattataca 62
Query: 1447 aacttctttcgtacactatcaaatattaaagcagacacaagcattccagatgatgaattg 1506
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 63 aacttctttcgtacactatcaaatattaaagcagacacaagcattccagatgatgaattg 122
Query: 1507 ctagtcccactaaagtcggtgctcttagatatgggcaaggagcgtaaggaagcttggacc 1566
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 123 ctagtcccactaaagtcggtgctcttagatatgggcaaggagcgtaaggaagcttggacc 182
Query: 1567 agttggttaaaaacctacatacatgagctgtacaccggtggtatttctgatgaagagagg 1626
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 183 agttggttaaaaacctacatacatgagctgtccaccggtggtatttctgatgaagagagg 242
Query: 1627 aagacctcaatggatttgataaatcctaaatatattctgaggaactatctttgccagact 1686
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 243 aagacctcaatggatttggtaaatcctaaatatattctgaggaactatctttgccagact 302
Query: 1687 gcaattgatgctgctgaaattggtgattttggagaagtccgtaggttgctcaaattaatg 1746
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 303 gcaattgatgctgctgaaattggtgattttggagaagtccgtaggttgctcaaattaatg 362
Query: 1747 gagcatccttttgatgagcaacctggaatggaaaagtatgctcgcttgcccccagcgtgg 1806
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 363 gagcatccttttgatgagcaacctggaatggaaaagtatgctcgcttgcccccagcgtgg 422
Query: 1807 gcatatcgaccaggcgtatgtatgctttcttgttcttcatgagtt 1851
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 423 gcatatcgaccaggcgtatgtatgctttcttgttcttcatgagtt 467
>gnl|LJGI|TC82179 similar to UniRef100_Q67YJ0 Cluster: MRNA, partial cds, clone:
RAFL24-27-O06; n=2; Arabidopsis thaliana|Rep: MRNA,
partial cds, clone: RAFL24-27-O06 - Arabidopsis thaliana
(Mouse-ear cress), partial (24%)
Length = 465
Score = 898 bits (453), Expect = 0.0
Identities = 461/464 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 676 gaagcaatgcaccacctggggataccaacaagtcgtgccctttgtctagtgaccactggg 735
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2 gaagcaatgcaccacctggggataccaacaagtcgtgccctttgtctagtgaccactggg 61
Query: 736 aagctggtcactcgagatatgttctatgatggaaatccaaaagaagaacctggtgcaatc 795
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 62 aagctggtcactcgagatatgttctatgatggaaatccaaaagaagaacctggtgcaatc 121
Query: 796 gtttgcagagtagcccaatcttttctacgttttgggtcattccaaatacatgcctccaga 855
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 122 gtttgcagagtagcccaatcttttctacgttttgggtcattccaaatacatgcctccaga 181
Query: 856 ggtaatgaggacataggtattgttcgtggtttggcagactatgctatcaagcaccacttt 915
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 182 ggtaatgaggacataggtattgttcgtggtttggcagactatgctatcaagcaccacttt 241
Query: 916 cctcatattgagaacatgagcaagagtgaaaccttatctttcagcaccggtgatgaagat 975
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 242 cctcatattgagaacatgagcaagagtgaaaccttatctttcagcaccggtgatgaagat 301
Query: 976 cattccgttgtggatcttacttcaaacaagtatgcagcgtgggcggtggaggttgctgaa 1035
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 302 cattccgttgtggatcttacttcaaacaagtatgcagcgtgggcggtggaggttgctgaa 361
Query: 1036 cgtaccgcttccttaattgctagatggcagggggttggtttcactcatggtgtgatgaac 1095
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 362 cgtaccgcttccttaattgctagatggcagggggttggttncactcatggtgtgatgaac 421
Query: 1096 acggataatatgagcattttgggtcttactatcgattatggtcc 1139
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 422 acggataatatgagcattttgggtcttactatacattatggtcc 465