Miyakogusa Predicted Gene
- Lj5g3v2240840.2
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj5g3v2240840.2 tr|A9RXF8|A9RXF8_PHYPA Predicted protein
OS=Physcomitrella patens subsp. patens
GN=PHYPADRAFT_179087,23.73,0.0000000000003,no description,WD40/YVTN
repeat-like-containing domain; WD40,WD40 repeat; TRANSDUCIN FAMILY
PROTEIN ,CUFF.57002.2
(1176 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC60154 similar to UniRef100_A7QLT1 Cluster: Chromosome... 2083 0.0
gnl|LJGI|TC64894 similar to UniRef100_A7L4A5 Cluster: Transducin... 1116 0.0
>gnl|LJGI|TC60154 similar to UniRef100_A7QLT1 Cluster: Chromosome chr18 scaffold_121,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr18 scaffold_121, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (86%)
Length = 1522
Score = 2083 bits (1051), Expect = 0.0
Identities = 1146/1177 (97%), Gaps = 3/1177 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgagtgacccaaatgctccacatgtccatgatgatgaagatg---atgacaatgaagtg 57
||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 34 atgagtgacccaagtgttccacatgttcatgatgatgaagatgatgatgacaatgaagtt 93
Query: 58 ttccttgatgagtctgacatcatgcatgaagtttcattcgacaatgaagatcttcctgat 117
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 94 ttccttgatgagtctgacatcatgcatgaagtttcattcgacaatgaagatcttcctgat 153
Query: 118 gctgatgatgattctgaaaccgaacatgttgatgaggttgatgattctgtacacatattt 177
|| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 154 gccgatgatgattatgaacccgaacatgttgatgagattgatgattctgtgcacatattt 213
Query: 178 actggtcatactggggaactatactctgttgcctgtagcccaacagatgcgacattggtg 237
||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 214 actggtcataccggggaactatactctgttgcctgttgcccaacagatgcgacattggtg 273
Query: 238 gcaacagggggtggtgatgacaaaggatttttctggaggattggccaaggagattgggct 297
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 274 gcaacagggggtggtgatgacaagggatttttctggaggattggtcaaggagattgggct 333
Query: 298 tctgagcttcaaggtcatacagattctatagctagtttagcttttagctacgatgggaag 357
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 334 tctgagcttcaaggtcacacagattctatagctagtttagcttttagctacgatgggaag 393
Query: 358 tttcttgcatcaggaagcctagatggaattgttcaagtctgggatgaatttggaaatctg 417
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 394 tttcttgcatcaggaagcttagatggaattgttcaagtctgggatgaatttggaaatctg 453
Query: 418 aaaggtccactggaaggtcctggagggggcattgagtggctcaggtggcatccaagagga 477
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 454 aagggtccactggaaggtcctggagggggcattgagtggctcaggtggcatccaagagga 513
Query: 478 cacatactcttagctggttctgaggattccacagtttggatgtggaataccgatcatgct 537
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 514 cacatactcttagctggttctgaggattccacagtttggatgtggaataccgatcatgct 573
Query: 538 gcctttcttaatatgtttgctggtcatggtagtagtgtgacctgtggtgattttactcct 597
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 574 gcctttcttaatatgtttgctggtcatggtagtagtgtgacctgtggtgattttactcct 633
Query: 598 gatgggaaaattatatgtactggttctgatgatgcaaccttgagaatatggaatccaaga 657
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 634 gatgggaaaattatatgtactggttctgatgatgcaaccttgagaatatggaatccaaga 693
Query: 658 agtggagaaaacattcatgttgtgcagggtcatccataccatactgagggattaacatgc 717
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 694 agtggagaaaacattcatgttgtgcagggtcatccatatcatactgagggattaacatgc 753
Query: 718 ttagcaataagttcaacttcaacccttgctcttactggttccaaggatggatctgctcat 777
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 754 ttagcaataagttcaacttcaacccttgctctaactggttccaaggatggatctgctcat 813
Query: 778 attgtaaatattactacaggaagagtggttaataccctgagttctcattcagattccatt 837
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct: 814 attgtaaatattactacaggaagagttgttaataccgtggcttctcattcagattccatt 873
Query: 838 gagtgtattgggttcgcaccaagtgattcctgggctgcaattggaggcatggataaaaaa 897
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 874 gagtgtattgggttcgcaccaagtgattcctgggctgcaattggaggcatggataaaaaa 933
Query: 898 ctgatgatctgggatgtagagcactccttatcccggaacatttgtgagcatgaggatgga 957
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 934 ctgatgatctgggatgtagagcactccttatcccggaacacttgtgagcatgaggatgga 993
Query: 958 gtgacatgtttggcatggcttggtgcattgtatgtagctaccgggggtgttgatggaaat 1017
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||
Sbjct: 994 gtgacatgtttggcatggcttggtgcattgtatgtagctactgggtgtgttgatggaaat 1053
Query: 1018 gtgagattgtgggatagccgttctggtgaatgtgtaagaacattcaggggccactctgat 1077
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 1054 gtgagattgtgggatagccgttctggtgaatgtgtaagaacattcagggggcactctgat 1113
Query: 1078 gccattcaatctctttctttttctgcgaatcgggattaccttgtctcggcttccattgat 1137
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct: 1114 gccattcaatctctttctttttctgcgaatcgggattacctcgtctcagcttccattgat 1173
Query: 1138 ggtacagctcgtgtttttgaggttgaagggtttcagt 1174
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1174 ggtacagctcgtgtttttgaggttgaagggtttcagt 1210
>gnl|LJGI|TC64894 similar to UniRef100_A7L4A5 Cluster: Transducin family protein;
n=1; Carica papaya|Rep: Transducin family protein -
Carica papaya (Papaya), partial (41%)
Length = 723
Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0
Identities = 634/657 (96%), Gaps = 3/657 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgagtgacccaaatgctccacatgtccatgatgatgaagatg---atgacaatgaagtg 57
||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 67 atgagtgacccaagtgttccacatgttcatgatgatgaagatgatgatgacaatgaagtt 126
Query: 58 ttccttgatgagtctgacatcatgcatgaagtttcattcgacaatgaagatcttcctgat 117
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 127 ttccttgatgagtctgacatcacgcatgaagtttcattcgacaatgaagatcttcctgat 186
Query: 118 gctgatgatgattctgaaaccgaacatgttgatgaggttgatgattctgtacacatattt 177
|| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||
Sbjct: 187 gccgatgatgattatgaacccgaacatgttgatgagattgatgattctgcgcacatattt 246
Query: 178 actggtcatactggggaactatactctgttgcctgtagcccaacagatgcgacattggtg 237
||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 247 actggtcataccggggaactatactctgttgcctgttgcccaacagatgcgacattggcg 306
Query: 238 gcaacagggggtggtgatgacaaaggatttttctggaggattggccaaggagattgggct 297
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 307 gcaacagggggtggtgatgacaagggatttttctggaggattggtcaaggagattgggct 366
Query: 298 tctgagcttcaaggtcatacagattctatagctagtttagcttttagctacgatgggaag 357
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 367 tctgagcttcaaggtcacacagattctatagctagtttagcttttagctacgatgggaag 426
Query: 358 tttcttgcatcaggaagcctagatggaattgttcaagtctgggatgaatttggaaatctg 417
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 427 tttcttgcatcaggaagcttagatggaattgttcaagtctgggatgaatttggaaatctg 486
Query: 418 aaaggtccactggaaggtcctggagggggcattgagtggctcaggtggcatccaagagga 477
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 487 aagggtccactggaaggtcctggagggggcattgagtggctcaggtggcatccaagagga 546
Query: 478 cacatactcttagctggttctgaggattccacagtttggatgtggaataccgatcatgct 537
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 547 cacatactcttagctggttctgaggattccacagtttggatgtggaataccgatcatgct 606
Query: 538 gcctttcttaatatgtttgctggtcatggtagtagtgtgacctgtggtgattttactcct 597
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 607 gcctttcttaatatgtttgctggtcatggtagtagtgtgacctgtggtgattttactcct 666
Query: 598 gatgggaaaattatatgtactggttctgatgatgcaaccttgagaatatggaatcca 654
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 667 gatgggaaaattatatgtactggttctgatgacgcaaccttgagaatatggaatcca 723