Miyakogusa Predicted Gene

Lj5g3v2099600.1
Show Alignment: 

BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Lj5g3v2099600.1 tr|I1LEF0|I1LEF0_SOYBN ATP-dependent Clp protease
proteolytic subunit OS=Glycine max GN=Gma.8332
PE=,80.56,0,CLPPROTEASEP,ClpP; seg,NULL; CLP_protease,ClpP/TepA;
ClpP/crotonase,NULL; ATP-DEPENDENT CLP PROTEASE,CUFF.56653.1
         (1122 letters)

Database: LJGI 
           47,486 sequences; 32,788,469 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gnl|LJGI|TC68688 similar to UniRef100_A7QL58 Cluster: ATP-depend...  1719   0.0  
gnl|LJGI|TC64819 similar to UniRef100_A7QL58 Cluster: ATP-depend...  1437   0.0  

>gnl|LJGI|TC68688 similar to UniRef100_A7QL58 Cluster: ATP-dependent Clp protease
            proteolytic subunit; n=1; Vitis vinifera|Rep:
            ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit - Vitis
            vinifera (Grape), partial (74%)
          Length = 1394

 Score = 1719 bits (867), Expect = 0.0
 Identities = 870/871 (99%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                        
Query: 252  catgttcatgaccgaagataatcctgccagcaagcaggctgaaagagttacagaggatag 311
            |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 41   catgttcatgaccgaagataatcctgcctgcaagcaggctgaaagagttacagaggatag 100

                                                                        
Query: 312  catctcatctgccaagaattatttggatcatggtggaatgtggagtatgtctagctcgga 371
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 101  catctcatctgccaagaattatttggatcatggtggaatgtggagtatgtctagctcgga 160

                                                                        
Query: 372  caataatggccctgcaaaatacagcatgagtgttagtatgtatcgaggaggaggtagggg 431
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 161  caataatggccctgcaaaatacagcatgagtgttagtatgtatcgaggaggaggtagggg 220

                                                                        
Query: 432  aggcggaaggcctagaactgctcccccggacctgccttctctgcttttggatgctcgaat 491
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 221  aggcggaaggcctagaactgctcccccggacctgccttctctgcttttggatgctcgaat 280

                                                                        
Query: 492  atgctatctcggtatgccgattgttccagctgtcacagaacttcttgttgctcaatttat 551
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 281  atgctatctcggtatgccgattgttccagctgtcacagaacttcttgttgctcaatttat 340

                                                                        
Query: 552  gtggttggattatgataaccctaccaaacctatttacttatatattaattcatctggaac 611
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 341  gtggttggattatgataaccctaccaaacctatttacttatatattaattcatctggaac 400

                                                                        
Query: 612  ccaaaatgagaagaatgagaccgtgggatcagaaactgaagcctactctattgcggatat 671
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 401  ccaaaatgagaagaatgagaccgtgggatcagaaactgaagcctactctattgcggatat 460

                                                                        
Query: 672  gatgtcttatgtcaaagctgatgtctatactgtgaattgtggcatggcatatggccaagc 731
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 461  gatgtcttatgtcaaagctgatgtctatactgtgaattgtggcatggcatatggccaagc 520

                                                                        
Query: 732  agcaatgcttctctcacttggagcaaagggttatcgcgctctacagccaaattcatccac 791
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 521  agcaatgcttctctcacttggagcaaagggttatcgcgctctacagccaaattcatccac 580

                                                                        
Query: 792  aaaattatatcttccaaaagttaacagatcaagtggtgctgctatagacatgtggattaa 851
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 581  aaaattatatcttccaaaagttaacagatcaagtggtgctgctatagacatgtggattaa 640

                                                                        
Query: 852  ggcaaaagagttggaagcgaattctgattattacattgagctgttggcgaaaggaattgg 911
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 641  ggcaaaagagttggaagcgaattctgattattacattgagctgttggcgaaaggaattgg 700

                                                                        
Query: 912  gaaatcaaaggaagaagttgctaaagatgtccagaggcctagatattttcaaccaaagga 971
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 701  gaaatcaaaggaagaagttgctaaagatgtccagaggcctagatattttcaaccaaagga 760

                                                                        
Query: 972  agccatagagtacggaatcgctgacaaaataattgattctcaggatgctgcatttgagaa 1031
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 761  agccatagagtacggaatcgctgacaaaataattgattctcaggatgctgcatttgagaa 820

                                                                        
Query: 1032 gcggaattatgatgaaatgcttgctcaatcaagagctatgaggaaacaagctggtggcaa 1091
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 821  gcggaattatgatgaaatgcttgctcaatcaagagctatgaggaaacaagctggtggcaa 880

                                           
Query: 1092 tcctcaagcagctccttcaggatttaggtaa 1122
            |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 881  tcctcaagcagctccttcaggatttaggtaa 911


>gnl|LJGI|TC64819 similar to UniRef100_A7QL58 Cluster: ATP-dependent Clp protease
           proteolytic subunit; n=1; Vitis vinifera|Rep:
           ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit - Vitis
           vinifera (Grape), partial (51%)
          Length = 776

 Score = 1437 bits (725), Expect = 0.0
 Identities = 725/725 (100%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 1   atgtccacttcttctctcttatcgtcactctcttcccccttcatccacgattctgcacct 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 52  atgtccacttcttctctcttatcgtcactctcttcccccttcatccacgattctgcacct 111

                                                                       
Query: 61  gctcgccatggaacgaagctccttccttctcctcactccatcaccacgcgatgctccaag 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 112 gctcgccatggaacgaagctccttccttctcctcactccatcaccacgcgatgctccaag 171

                                                                       
Query: 121 tatttttctgctaagtgctccctcgaccacatccccaagcagttccggcaggaaaatctc 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 172 tatttttctgctaagtgctccctcgaccacatccccaagcagttccggcaggaaaatctc 231

                                                                       
Query: 181 aaagatggattgatggacaacttcaagaatgcacctaaatttttatatggcctttctcca 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 232 aaagatggattgatggacaacttcaagaatgcacctaaatttttatatggcctttctcca 291

                                                                       
Query: 241 tcacaaatggacatgttcatgaccgaagataatcctgccagcaagcaggctgaaagagtt 300
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 292 tcacaaatggacatgttcatgaccgaagataatcctgccagcaagcaggctgaaagagtt 351

                                                                       
Query: 301 acagaggatagcatctcatctgccaagaattatttggatcatggtggaatgtggagtatg 360
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 352 acagaggatagcatctcatctgccaagaattatttggatcatggtggaatgtggagtatg 411

                                                                       
Query: 361 tctagctcggacaataatggccctgcaaaatacagcatgagtgttagtatgtatcgagga 420
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 412 tctagctcggacaataatggccctgcaaaatacagcatgagtgttagtatgtatcgagga 471

                                                                       
Query: 421 ggaggtaggggaggcggaaggcctagaactgctcccccggacctgccttctctgcttttg 480
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 472 ggaggtaggggaggcggaaggcctagaactgctcccccggacctgccttctctgcttttg 531

                                                                       
Query: 481 gatgctcgaatatgctatctcggtatgccgattgttccagctgtcacagaacttcttgtt 540
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 532 gatgctcgaatatgctatctcggtatgccgattgttccagctgtcacagaacttcttgtt 591

                                                                       
Query: 541 gctcaatttatgtggttggattatgataaccctaccaaacctatttacttatatattaat 600
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 592 gctcaatttatgtggttggattatgataaccctaccaaacctatttacttatatattaat 651

                                                                       
Query: 601 tcatctggaacccaaaatgagaagaatgagaccgtgggatcagaaactgaagcctactct 660
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 652 tcatctggaacccaaaatgagaagaatgagaccgtgggatcagaaactgaagcctactct 711

                                                                       
Query: 661 attgcggatatgatgtcttatgtcaaagctgatgtctatactgtgaattgtggcatggca 720
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 712 attgcggatatgatgtcttatgtcaaagctgatgtctatactgtgaattgtggcatggca 771

                
Query: 721 tatgg 725
           |||||
Sbjct: 772 tatgg 776