Miyakogusa Predicted Gene
- Lj5g3v2099600.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj5g3v2099600.1 tr|I1LEF0|I1LEF0_SOYBN ATP-dependent Clp protease
proteolytic subunit OS=Glycine max GN=Gma.8332
PE=,80.56,0,CLPPROTEASEP,ClpP; seg,NULL; CLP_protease,ClpP/TepA;
ClpP/crotonase,NULL; ATP-DEPENDENT CLP PROTEASE,CUFF.56653.1
(1122 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC68688 similar to UniRef100_A7QL58 Cluster: ATP-depend... 1719 0.0
gnl|LJGI|TC64819 similar to UniRef100_A7QL58 Cluster: ATP-depend... 1437 0.0
>gnl|LJGI|TC68688 similar to UniRef100_A7QL58 Cluster: ATP-dependent Clp protease
proteolytic subunit; n=1; Vitis vinifera|Rep:
ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit - Vitis
vinifera (Grape), partial (74%)
Length = 1394
Score = 1719 bits (867), Expect = 0.0
Identities = 870/871 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 252 catgttcatgaccgaagataatcctgccagcaagcaggctgaaagagttacagaggatag 311
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 41 catgttcatgaccgaagataatcctgcctgcaagcaggctgaaagagttacagaggatag 100
Query: 312 catctcatctgccaagaattatttggatcatggtggaatgtggagtatgtctagctcgga 371
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 101 catctcatctgccaagaattatttggatcatggtggaatgtggagtatgtctagctcgga 160
Query: 372 caataatggccctgcaaaatacagcatgagtgttagtatgtatcgaggaggaggtagggg 431
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 161 caataatggccctgcaaaatacagcatgagtgttagtatgtatcgaggaggaggtagggg 220
Query: 432 aggcggaaggcctagaactgctcccccggacctgccttctctgcttttggatgctcgaat 491
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 221 aggcggaaggcctagaactgctcccccggacctgccttctctgcttttggatgctcgaat 280
Query: 492 atgctatctcggtatgccgattgttccagctgtcacagaacttcttgttgctcaatttat 551
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 281 atgctatctcggtatgccgattgttccagctgtcacagaacttcttgttgctcaatttat 340
Query: 552 gtggttggattatgataaccctaccaaacctatttacttatatattaattcatctggaac 611
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 341 gtggttggattatgataaccctaccaaacctatttacttatatattaattcatctggaac 400
Query: 612 ccaaaatgagaagaatgagaccgtgggatcagaaactgaagcctactctattgcggatat 671
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 401 ccaaaatgagaagaatgagaccgtgggatcagaaactgaagcctactctattgcggatat 460
Query: 672 gatgtcttatgtcaaagctgatgtctatactgtgaattgtggcatggcatatggccaagc 731
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 461 gatgtcttatgtcaaagctgatgtctatactgtgaattgtggcatggcatatggccaagc 520
Query: 732 agcaatgcttctctcacttggagcaaagggttatcgcgctctacagccaaattcatccac 791
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 521 agcaatgcttctctcacttggagcaaagggttatcgcgctctacagccaaattcatccac 580
Query: 792 aaaattatatcttccaaaagttaacagatcaagtggtgctgctatagacatgtggattaa 851
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 581 aaaattatatcttccaaaagttaacagatcaagtggtgctgctatagacatgtggattaa 640
Query: 852 ggcaaaagagttggaagcgaattctgattattacattgagctgttggcgaaaggaattgg 911
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 641 ggcaaaagagttggaagcgaattctgattattacattgagctgttggcgaaaggaattgg 700
Query: 912 gaaatcaaaggaagaagttgctaaagatgtccagaggcctagatattttcaaccaaagga 971
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 701 gaaatcaaaggaagaagttgctaaagatgtccagaggcctagatattttcaaccaaagga 760
Query: 972 agccatagagtacggaatcgctgacaaaataattgattctcaggatgctgcatttgagaa 1031
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 761 agccatagagtacggaatcgctgacaaaataattgattctcaggatgctgcatttgagaa 820
Query: 1032 gcggaattatgatgaaatgcttgctcaatcaagagctatgaggaaacaagctggtggcaa 1091
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 821 gcggaattatgatgaaatgcttgctcaatcaagagctatgaggaaacaagctggtggcaa 880
Query: 1092 tcctcaagcagctccttcaggatttaggtaa 1122
|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 881 tcctcaagcagctccttcaggatttaggtaa 911
>gnl|LJGI|TC64819 similar to UniRef100_A7QL58 Cluster: ATP-dependent Clp protease
proteolytic subunit; n=1; Vitis vinifera|Rep:
ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit - Vitis
vinifera (Grape), partial (51%)
Length = 776
Score = 1437 bits (725), Expect = 0.0
Identities = 725/725 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgtccacttcttctctcttatcgtcactctcttcccccttcatccacgattctgcacct 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 52 atgtccacttcttctctcttatcgtcactctcttcccccttcatccacgattctgcacct 111
Query: 61 gctcgccatggaacgaagctccttccttctcctcactccatcaccacgcgatgctccaag 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 112 gctcgccatggaacgaagctccttccttctcctcactccatcaccacgcgatgctccaag 171
Query: 121 tatttttctgctaagtgctccctcgaccacatccccaagcagttccggcaggaaaatctc 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 172 tatttttctgctaagtgctccctcgaccacatccccaagcagttccggcaggaaaatctc 231
Query: 181 aaagatggattgatggacaacttcaagaatgcacctaaatttttatatggcctttctcca 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 232 aaagatggattgatggacaacttcaagaatgcacctaaatttttatatggcctttctcca 291
Query: 241 tcacaaatggacatgttcatgaccgaagataatcctgccagcaagcaggctgaaagagtt 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 292 tcacaaatggacatgttcatgaccgaagataatcctgccagcaagcaggctgaaagagtt 351
Query: 301 acagaggatagcatctcatctgccaagaattatttggatcatggtggaatgtggagtatg 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 352 acagaggatagcatctcatctgccaagaattatttggatcatggtggaatgtggagtatg 411
Query: 361 tctagctcggacaataatggccctgcaaaatacagcatgagtgttagtatgtatcgagga 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 412 tctagctcggacaataatggccctgcaaaatacagcatgagtgttagtatgtatcgagga 471
Query: 421 ggaggtaggggaggcggaaggcctagaactgctcccccggacctgccttctctgcttttg 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 472 ggaggtaggggaggcggaaggcctagaactgctcccccggacctgccttctctgcttttg 531
Query: 481 gatgctcgaatatgctatctcggtatgccgattgttccagctgtcacagaacttcttgtt 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 532 gatgctcgaatatgctatctcggtatgccgattgttccagctgtcacagaacttcttgtt 591
Query: 541 gctcaatttatgtggttggattatgataaccctaccaaacctatttacttatatattaat 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 592 gctcaatttatgtggttggattatgataaccctaccaaacctatttacttatatattaat 651
Query: 601 tcatctggaacccaaaatgagaagaatgagaccgtgggatcagaaactgaagcctactct 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 652 tcatctggaacccaaaatgagaagaatgagaccgtgggatcagaaactgaagcctactct 711
Query: 661 attgcggatatgatgtcttatgtcaaagctgatgtctatactgtgaattgtggcatggca 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 712 attgcggatatgatgtcttatgtcaaagctgatgtctatactgtgaattgtggcatggca 771
Query: 721 tatgg 725
|||||
Sbjct: 772 tatgg 776