Miyakogusa Predicted Gene

Lj5g3v2045620.1

BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Lj5g3v2045620.1 tr|Q6VM27|Q6VM27_LUPAL Cycloidea-like protein
group 1A (Fragment) OS=Lupinus albus PE=4 SV=1,37.34,6e-19,seg,NULL;
TCP,Transcription factor TCP subgroup; R,CYC/TB1, R domain;
TCP,Transcription factor, TCP,CUFF.56523.1
         (673 letters)

Database: LJGI 
           47,486 sequences; 32,788,469 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gnl|LJGI|NP7225961 GB|DQ202477.1|ABB36473.1 CYC3;TCP box gene; L...  1332   0.0  

>gnl|LJGI|NP7225961 GB|DQ202477.1|ABB36473.1 CYC3;TCP box gene; LjCYC3
          Length = 1113

 Score = 1332 bits (672), Expect = 0.0
 Identities = 672/672 (100%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                        
Query: 1    atgctggagtttgacaagccaagcaacacacttgagtggctcttcacaaagtctgagagt 60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 442  atgctggagtttgacaagccaagcaacacacttgagtggctcttcacaaagtctgagagt 501

                                                                        
Query: 61   gcaatccaagagcttgcaaggagtaagaactgttcctgcagcagtaacagtaacaacaac 120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 502  gcaatccaagagcttgcaaggagtaagaactgttcctgcagcagtaacagtaacaacaac 561

                                                                        
Query: 121  ccttcaaataacaacaaatcattatttggtggtggtgataatcataatggaactaattcc 180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 562  ccttcaaataacaacaaatcattatttggtggtggtgataatcataatggaactaattcc 621

                                                                        
Query: 181  atcagagggaggggcaacagcaagttgaagtggactacacagagggatcaagatgtttgt 240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 622  atcagagggaggggcaacagcaagttgaagtggactacacagagggatcaagatgtttgt 681

                                                                        
Query: 241  gttcttcagaataagaaggagtcaagggagagagcaagagcaagagctagagaaagaacc 300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 682  gttcttcagaataagaaggagtcaagggagagagcaagagcaagagctagagaaagaacc 741

                                                                        
Query: 301  tgttacaagatgttggaagatcaaagatgccctgcaaatactactcaaataatgcatcaa 360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 742  tgttacaagatgttggaagatcaaagatgccctgcaaatactactcaaataatgcatcaa 801

                                                                        
Query: 361  ttgaggtcatcatcacctattcagcttcttcaaccctatcctcacctaatggataatagt 420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 802  ttgaggtcatcatcacctattcagcttcttcaaccctatcctcacctaatggataatagt 861

                                                                        
Query: 421  gaagcagtatctggtggtggtggtggagatgggtttaatgtgattgaggaatctatcatg 480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 862  gaagcagtatctggtggtggtggtggagatgggtttaatgtgattgaggaatctatcatg 921

                                                                        
Query: 481  ataaaaaggaacatgatgtcttctaattctcatccccacgaaaaccatcaccttgcaatc 540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 922  ataaaaaggaacatgatgtcttctaattctcatccccacgaaaaccatcaccttgcaatc 981

                                                                        
Query: 541  cctaataaggaagcaggtttcaacaacaactatattgactaccctctattgcagccctat 600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 982  cctaataaggaagcaggtttcaacaacaactatattgactaccctctattgcagccctat 1041

                                                                        
Query: 601  tccactaccccaaattgggaaatagccaccatgaacatgaatctctctacatgtttcatg 660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1042 tccactaccccaaattgggaaatagccaccatgaacatgaatctctctacatgtttcatg 1101

                        
Query: 661  aaccagtggtaa 672
            ||||||||||||
Sbjct: 1102 aaccagtggtaa 1113