Miyakogusa Predicted Gene
- Lj5g3v1538690.3
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj5g3v1538690.3 Non Chatacterized Hit- tr|C6TKD8|C6TKD8_SOYBN
Uncharacterized protein OS=Glycine max GN=Gma.12309
PE,84,0,HAD-like,HAD-like domain; SUBFAMILY NOT NAMED,NULL; HALOACID
DEHALOGENASE-LIKE HYDROLASE,NULL; HAD_2,CUFF.55741.3
(735 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC73603 similar to UniRef100_A7Q0X4 Cluster: Chromosome... 1457 0.0
gnl|LJGI|TC68601 1201 0.0
>gnl|LJGI|TC73603 similar to UniRef100_A7Q0X4 Cluster: Chromosome chr7 scaffold_42,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr7 scaffold_42, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (71%)
Length = 1260
Score = 1457 bits (735), Expect = 0.0
Identities = 735/735 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggatgctcacaggattgatggagtcaaatacgagtgcttgctttttgatatagatgac 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 240 atggatgctcacaggattgatggagtcaaatacgagtgcttgctttttgatatagatgac 299
Query: 61 actctctacccattgagcttaggtctcaatttggcatgtcgcaagaacatacaagagtat 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 300 actctctacccattgagcttaggtctcaatttggcatgtcgcaagaacatacaagagtat 359
Query: 121 atgttggaacacttgcacattgaagaaagtgaagtgccaaagatgtgcctggatttgtat 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 360 atgttggaacacttgcacattgaagaaagtgaagtgccaaagatgtgcctggatttgtat 419
Query: 181 attgaacatgggacaactatggcaggattgaaggcccttggttatgagtttgacaatgat 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 420 attgaacatgggacaactatggcaggattgaaggcccttggttatgagtttgacaatgat 479
Query: 241 gagtttcatgcttatgtgcatggaagattaccatacgagaaactgaagccagattcagtg 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 480 gagtttcatgcttatgtgcatggaagattaccatacgagaaactgaagccagattcagtg 539
Query: 301 ttgaggaaccttcttctttccatgcctcagcgtaaaataatattcacaaactcagatcac 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 540 ttgaggaaccttcttctttccatgcctcagcgtaaaataatattcacaaactcagatcac 599
Query: 361 aaacatgcagttgaagttctcaacagattgggcttggaagattgttttgaaggcatcata 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 600 aaacatgcagttgaagttctcaacagattgggcttggaagattgttttgaaggcatcata 659
Query: 421 tgctttgaaactcttaatcctcccaacatagatgtatcagatgataatcatgtaacagag 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 660 tgctttgaaactcttaatcctcccaacatagatgtatcagatgataatcatgtaacagag 719
Query: 481 agtggacgtttcaactcccacacacaaatcctctgcaaaccttctgtggaagccttcgaa 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 720 agtggacgtttcaactcccacacacaaatcctctgcaaaccttctgtggaagccttcgaa 779
Query: 541 gctgcgattcggattgcaaatgtggatcctaagaaaacaattttctttgatgacagtact 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 780 gctgcgattcggattgcaaatgtggatcctaagaaaacaattttctttgatgacagtact 839
Query: 601 cgaaatattgcaagtgcaaaggtagctggacttcacactgttatggtgggtcgttcagat 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 840 cgaaatattgcaagtgcaaaggtagctggacttcacactgttatggtgggtcgttcagat 899
Query: 661 ttggtccctggtgctaaccatgccctgaacagcattcataatatcagagaagcattacct 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 900 ttggtccctggtgctaaccatgccctgaacagcattcataatatcagagaagcattacct 959
Query: 721 gaaatatgggaggtt 735
|||||||||||||||
Sbjct: 960 gaaatatgggaggtt 974
>gnl|LJGI|TC68601
Length = 707
Score = 1201 bits (606), Expect = 0.0
Identities = 613/614 (99%), Gaps = 1/614 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 114 agagtatatgttggaacacttgcacattgaagaaagtgaagtgccaaagatgtgcctgga 173
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 95 agagtatatgttggaacacttgcacattgaagaaagtgaagtgccaaagatgtgcctgga 154
Query: 174 tttgtatattgaacatgggacaactatggcaggattgaaggcccttggttatgagtttga 233
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 155 tttgtatattgaacatgggacaactatggcaggattgaaggcccttggttatgagtttga 214
Query: 234 caatgatgagtttcatgcttatgtgcatggaagattaccatacgagaaactgaagccaga 293
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 215 caatgatgagtttcatgcttatgtgcatggaagattaccatacgagaaactgaagccaga 274
Query: 294 ttcagtgttgaggaaccttcttctttccatgcctcagcgtaaaataatattcacaaactc 353
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 275 ttcagtgttgaggaaccttcttctttccatgcctcagcgtaaaataatattcacaaactc 334
Query: 354 agatcacaaacatgcagttgaagttctcaacagattgggcttggaagattgttttgaagg 413
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 335 agatcacaaacatgcagttgaagttctcaacagattgggcttggaagattgttttgaagg 394
Query: 414 catcatatgctttgaaactcttaatcctcccaacatagatgtatcagatgataatcatgt 473
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 395 catcatatgctttgaaactcttaatcctcccaacatagatgtatcagatgataatcatgt 454
Query: 474 aacagagagtggacgtttcaactcccacacacaaatcctctgcaaaccttctgtggaagc 533
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 455 aacagagagtggacgtttcaactcccacacacaaatcctctgcaaaccttctgtggaagc 514
Query: 534 cttcgaagctgcgattcggattgcaaatgtggatcctaagaaaacaattttctttgatga 593
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 515 cttcgaagctgcgattcggattgcaaatgtggatcctaagaaaacaattttctttgatga 574
Query: 594 cagtactcgaaatattgcaagtgcaaaggtagctggacttcacactgttatggtgggtcg 653
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 575 cagtactcgaaatattgcaagtgcaaaggtagctggacttcacactgttatggtgggtcg 634
Query: 654 ttcagatttggtccctggtgctaaccatgccctgaacagcattcataatatcagagaagc 713
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 635 ttcagatttggtccctggtgctaaccatgccctgaacagcattcataatatcagagaagc 694
Query: 714 attacctgaaatat 727
|||| |||||||||
Sbjct: 695 atta-ctgaaatat 707