Miyakogusa Predicted Gene
- Lj5g3v1315650.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj5g3v1315650.1 tr|G7I669|G7I669_MEDTR Vacuolar protein
sorting-associated protein-like protein OS=Medicago
truncatu,93.67,0,coiled-coil,NULL; ARE1-LIKE PROTEIN,NULL; SUPPRESSOR
OF ACTIN MUTATIONS 2/VACUOLAR PROTEIN SORTING 5,CUFF.55149.1
(1851 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|BI417275 similar to UniRef100_A7P2R4 Cluster: Chromosom... 1221 0.0
gnl|LJGI|TC66723 similar to UniRef100_Q9FVV3 Cluster: ARE1-like ... 1102 0.0
>gnl|LJGI|BI417275 similar to UniRef100_A7P2R4 Cluster: Chromosome chr1 scaffold_5,
whole genome shotgun sequence; n=2; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr1 scaffold_5, whole genome shotgun sequence
- Vitis vinifera (Grape), partial (30%)
Length = 637
Score = 1221 bits (616), Expect = 0.0
Identities = 630/637 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1095 caggagcttgcagaagctgcttatggacactgctacttcagaatataatttctgtgatga 1154
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 caggagcttgcagaagctgcttatggacactgctacttcagaatataatttctgtgatga 60
Query: 1155 nnnnnnnggagaacaacatatgttctatgaaatttttgcaggtccttttggtgtcataga 1214
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 tttttttggagaacaacatatgttctatgaaatttttgcaggtccttttggtgtcataga 120
Query: 1215 tgagcacttcaattcaatacttccaaattgctatgatgctattggtctaatgcttatgat 1274
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 tgagcacttcaattcaatacttccaaattgctatgatgctattggtctaatgcttatgat 180
Query: 1275 tcgcataatacaccaacatcagctcattatgtctcggaggcggattccatgcttggattc 1334
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 tcgcataatacaccaacatcagctcattatgtctcggaggcggattccatgcttggattc 240
Query: 1335 ttatttagacaaggtcaacattgccctatggcctcggtttaagatggtatttgatatgca 1394
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 ttatttagacaaggtcaacattgccctatggcctcggtttaagatggtatttgatatgca 300
Query: 1395 tctcaacagcctccgtaatgccaatgtgaagacgttatgggaagatgatgttcatcctca 1454
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 tctcaacagcctccgtaatgccaatgtgaagacgttatgggaagatgatgttcatcctca 360
Query: 1455 ttatgtcatgaggcgctatgctgagtttactgcttcgcttatccacttaaactctgagta 1514
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 ttatgtcatgaggcgctatgctgagtttactgcttcgcttatccacttaaactctgagta 420
Query: 1515 tggagatggtcagcttgaattgaattcagaaagacttagaatggctgttgatgatttaat 1574
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 tggagatggtcagcttgaattgaattcagaaagacttagaatggctgttgatgatttaat 480
Query: 1575 tatcaagcttgccaagaatttcaccaaaccaaaacaacaaacagtgtttcttataaacaa 1634
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 tatcaagcttgccaagaatttcaccaaaccaaaacaacaaacagtgtttcttataaacaa 540
Query: 1635 ctatgatatgaccattgctgtcctgaaggaggcaggtcccgaaggtgggaaaattcaaat 1694
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 ctatgatatgaccattgctgtcctgaaggaggcaggtcccgaaggtgggaaaattcaaat 600
Query: 1695 gcactttgaggaactactgaagagcaatacagcatta 1731
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 gcactttgaggaactactgaagagcaatacagcatta 637
>gnl|LJGI|TC66723 similar to UniRef100_Q9FVV3 Cluster: ARE1-like protein;
78992-73047; n=1; Arabidopsis thaliana|Rep: ARE1-like
protein; 78992-73047 - Arabidopsis thaliana (Mouse-ear
cress), partial (23%)
Length = 715
Score = 1102 bits (556), Expect = 0.0
Identities = 556/556 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggccgatgtcgccggaagcacagtgagtccatccagtacatttgatctgggagcattc 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 160 atggccgatgtcgccggaagcacagtgagtccatccagtacatttgatctgggagcattc 219
Query: 61 gttggcgacctaaccatcgaagaggatctaagcagtgatgatatttcattggaaggatta 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 220 gttggcgacctaaccatcgaagaggatctaagcagtgatgatatttcattggaaggatta 279
Query: 121 caacaggagcttgaagaatgtaaaaatgatgaggtagttgcgaacattctatccaaaggt 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 280 caacaggagcttgaagaatgtaaaaatgatgaggtagttgcgaacattctatccaaaggt 339
Query: 181 acaaaacttagggattatgcaaagggagttgagaatgatctgcgcaaagttgaattggat 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 340 acaaaacttagggattatgcaaagggagttgagaatgatctgcgcaaagttgaattggat 399
Query: 241 tcaattcaggattatattaaagaaagtgataatctagtctctcttcatgatcaaattcga 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 400 tcaattcaggattatattaaagaaagtgataatctagtctctcttcatgatcaaattcga 459
Query: 301 gattgtgatagtatcttgtcacatatggaaactcttcttagtggatttcaggctgagatt 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 460 gattgtgatagtatcttgtcacatatggaaactcttcttagtggatttcaggctgagatt 519
Query: 361 ggttccattagttcagacattaagattctgcaggagaagtctatggatatgggtttgagg 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 520 ggttccattagttcagacattaagattctgcaggagaagtctatggatatgggtttgagg 579
Query: 421 cttaagaatcgcaaggtagctgagtccaaattggctaagtttgtggaagacataattatc 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 580 cttaagaatcgcaaggtagctgagtccaaattggctaagtttgtggaagacataattatc 639
Query: 481 cctccaaggatggtggacatccttgttgatggagaggtcaatgaggaatatatgagaact 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 640 cctccaaggatggtggacatccttgttgatggagaggtcaatgaggaatatatgagaact 699
Query: 541 cttgagattttgagta 556
||||||||||||||||
Sbjct: 700 cttgagattttgagta 715