Miyakogusa Predicted Gene
- Lj5g3v1265040.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj5g3v1265040.1 Non Chatacterized Hit- tr|I1NII4|I1NII4_SOYBN
Uncharacterized protein OS=Glycine max PE=4 SV=1,74.51,0,JmjC,JmjC
domain; FYRC,FY-rich, C-terminal; JmjN,Transcription factor jumonji,
JmjN; zf-C5HC2,Zinc f,CUFF.55106.1
(3774 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC58947 similar to UniRef100_A7QMV3 Cluster: Chromosome... 2311 0.0
gnl|LJGI|TC67175 similar to UniRef100_Q9FRS3 Cluster: F22O13.10;... 1338 0.0
gnl|LJGI|TC76109 323 5e-87
>gnl|LJGI|TC58947 similar to UniRef100_A7QMV3 Cluster: Chromosome chr14 scaffold_128,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr14 scaffold_128, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (16%)
Length = 1166
Score = 2311 bits (1166), Expect = 0.0
Identities = 1166/1166 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1612 gataagctgttgcttggggcttctagggatgcagtacaagcccaatgggagctcaatttg 1671
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 gataagctgttgcttggggcttctagggatgcagtacaagcccaatgggagctcaatttg 60
Query: 1672 ctgaagaaaaacacttcgtgtaatctacaatggaaaggtttttgtggaaaggatggcctg 1731
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 ctgaagaaaaacacttcgtgtaatctacaatggaaaggtttttgtggaaaggatggcctg 120
Query: 1732 ctggcaaaagcactcaagacacgtgttggggtggaaaaagtaaaaagggaatttctctgc 1791
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ctggcaaaagcactcaagacacgtgttggggtggaaaaagtaaaaagggaatttctctgc 180
Query: 1792 ggttcttcgcgagcattaaaaatggagagtagttttgatgctataagtgaaagggaatgc 1851
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ggttcttcgcgagcattaaaaatggagagtagttttgatgctataagtgaaagggaatgc 240
Query: 1852 agcatttgcttttttgatttacacctatctgcagctggttgtcgctgttcccctgataga 1911
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 agcatttgcttttttgatttacacctatctgcagctggttgtcgctgttcccctgataga 300
Query: 1912 tatgcttgcttggatcatgcaaagcatttatgttcttgctctttggattctaaatttttc 1971
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 tatgcttgcttggatcatgcaaagcatttatgttcttgctctttggattctaaatttttc 360
Query: 1972 ctcttccgctatgatattagtgagctaaatattcttgttgaagcattggaaggaaagtta 2031
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 ctcttccgctatgatattagtgagctaaatattcttgttgaagcattggaaggaaagtta 420
Query: 2032 agtgcagtgtacagatgggcaaaattagatcttgggctggcactaacttcttatgtctca 2091
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 agtgcagtgtacagatgggcaaaattagatcttgggctggcactaacttcttatgtctca 480
Query: 2092 gcagacaaggaaacaatacttaaggaatggagatttcattcatccaactcatcttccagg 2151
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 gcagacaaggaaacaatacttaaggaatggagatttcattcatccaactcatcttccagg 540
Query: 2152 gccagtgcgaataaagaggtgactttggatccatcaaagaaatttactaaagattctcaa 2211
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gccagtgcgaataaagaggtgactttggatccatcaaagaaatttactaaagattctcaa 600
Query: 2212 ttgataattgttccaataaaggataaagcaaattcagcaaatagcaaggatcggagctat 2271
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 ttgataattgttccaataaaggataaagcaaattcagcaaatagcaaggatcggagctat 660
Query: 2272 cttcaacaaaggaaaccagtagtacttgccttgtctccttatagtcacatgaaagaaaag 2331
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 cttcaacaaaggaaaccagtagtacttgccttgtctccttatagtcacatgaaagaaaag 720
Query: 2332 ttaactttcaatagctcaaaacctgcatgtgagatggataatagtgagatctgtgttaat 2391
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 ttaactttcaatagctcaaaacctgcatgtgagatggataatagtgagatctgtgttaat 780
Query: 2392 aaaggagagtctgtgagttgcggatccaatccaactactgtttgtgaattgtctcaagag 2451
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 aaaggagagtctgtgagttgcggatccaatccaactactgtttgtgaattgtctcaagag 840
Query: 2452 gattcatcatatgctttatctctgtctcaagctcaacatggaggtgagaaaagttcactt 2511
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 gattcatcatatgctttatctctgtctcaagctcaacatggaggtgagaaaagttcactt 900
Query: 2512 tacaaacgtaacagtattatacttagtgatgacaaagatgttgaaatgaagatgctggat 2571
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901 tacaaacgtaacagtattatacttagtgatgacaaagatgttgaaatgaagatgctggat 960
Query: 2572 tcagatagaaggaaggaacttcctcatatgcttgcaggttctagaaataaagccagtcca 2631
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961 tcagatagaaggaaggaacttcctcatatgcttgcaggttctagaaataaagccagtcca 1020
Query: 2632 tgtaacaatgaagatacaaacttgaccctcgcagtgacagatgtagtcaggagtgaaaag 2691
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 tgtaacaatgaagatacaaacttgaccctcgcagtgacagatgtagtcaggagtgaaaag 1080
Query: 2692 gacactattacattgccctgtgaagatatgagttcaggttcaactcagcttttgcatgtg 2751
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 gacactattacattgccctgtgaagatatgagttcaggttcaactcagcttttgcatgtg 1140
Query: 2752 aaacaagaatctcttgaacggagaga 2777
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1141 aaacaagaatctcttgaacggagaga 1166
>gnl|LJGI|TC67175 similar to UniRef100_Q9FRS3 Cluster: F22O13.10; n=1; Arabidopsis
thaliana|Rep: F22O13.10 - Arabidopsis thaliana (Mouse-ear
cress), partial (12%)
Length = 1005
Score = 1338 bits (675), Expect = 0.0
Identities = 678/679 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgaggttaaagttaatgatggggactgagcttatgagaataagtgtaaaagatgataat 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 327 atgaggttaaagttaatgatggggactgagcttatgagaataagtgtaaaagatgataat 386
Query: 61 gatgactatccatcagtcccaccaggttttgaatcatatacatctttctcactgaagaga 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 387 gatgactatccatcagtcccaccaggttttgaatcatatacatctttctcactgaagaga 446
Query: 121 gtagaaggcaatgagaaacaagatgataagaatatgaccagttgttcagcctctacaagt 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 447 gtagaaggcaatgagaaacaagatgataagaatatgaccagttgttcagcctctacaagt 506
Query: 181 gcttctgaacctcagtcaactcaggtggaaaatgatggtcaagttggtggtactaaaaag 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 507 gcttctgaacctcagtcaactcaggtggaaaatgatggtcaagttggtggtactaaaaag 566
Query: 241 atttccagatcccttcgacgaagaccttggattaaccatggacattatgagaacaattca 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 567 atttccagatcccttcgacgaagaccttggattaaccatggacattatgagaacaattca 626
Query: 301 gaggaagactctgattgtgagcggcttgatcaaagtttatcctcaagaccttgtcttcct 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 627 gaggaagactctgattgtgagcggcttgatcaaagtttatcctcaagaccttgtcttcct 686
Query: 361 aagggagttatccgtggatgtccagattgcagtaattgccaaaaggttgttgccggatgg 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 687 aagggagttatccgtggatgtccagattgcagtaattgccaaaaggttgttgccggatgg 746
Query: 421 cgaccagaagatcctcataggccaaatctcgatgatgctcctgttttctatcccactgaa 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 747 cgaccagaagatcctcataggccaaatctcgatgatgctcctgttttctatcccactgaa 806
Query: 481 gaggagtttcaagatactttgaaatatatatcaagcattcgctccaaagctgaaccttat 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 807 gaggagtttcaagatactttgaaatatatatcaagcattcgctccaaagctgaaccttat 866
Query: 541 ggaatttgtcgcattgttcccccgtcgtcttggagacccccttgtcctctcaaggaacaa 600
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 867 ggaatttgtagcattgttcccccgtcgtcttggagacccccttgtcctctcaaggaacaa 926
Query: 601 agcatatgggagggctctaaattcgctacccgtgttcagaggattgacaaacttcagaat 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 927 agcatatgggagggctctaaattcgctacccgtgttcagaggattgacaaacttcagaat 986
Query: 661 cgtgggtcgggtagaaaaa 679
|||||||||||||||||||
Sbjct: 987 cgtgggtcgggtagaaaaa 1005
>gnl|LJGI|TC76109
Length = 516
Score = 323 bits (163), Expect = 5e-87
Identities = 181/187 (96%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3588 tggaaatgaccaagggcttcacgcgcccgttgaagctgctgcagtgctaaggagcctgtt 3647
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 tggaaatgaccaagggcttcacgcgcccgttgaagctgctgcagtgctaaggagcctgtt 60
Query: 3648 taaaaaggccaatgcagaagaattgaattctttgtacagcattcttactgacaataagct 3707
| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 61 tcaaaaggcccatgccgaagaattgaattctttgtacagcattcttactgaccataagct 120
Query: 3708 agccgctgaccggaccctaattgcacaacttctcaatgaagagattcacaaatcccgaca 3767
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 121 agccgctgaccggaccctaattgcacaacttctcaatgaagagattcaccaatcccgacc 180
Query: 3768 gccctag 3774
|||||||
Sbjct: 181 gccctag 187