Miyakogusa Predicted Gene
- Lj5g3v1201220.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj5g3v1201220.1 Non Chatacterized Hit- tr|D0NFZ7|D0NFZ7_PHYIT
Putative uncharacterized protein OS=Phytophthora
infes,27.46,1e-17,seg,NULL; Ank_2,Ankyrin repeat-containing domain;
zf-C3HC4_3,NULL; no description,Ankyrin repeat-con,CUFF.54968.1
(1365 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC61603 similar to UniRef100_A7NXC9 Cluster: Chromosome... 2706 0.0
gnl|LJGI|GO019815 similar to UniRef100_A7NXC9 Cluster: Chromosom... 1088 0.0
gnl|LJGI|TC72768 similar to UniRef100_Q9LTC1 Cluster: Similarity... 749 0.0
>gnl|LJGI|TC61603 similar to UniRef100_A7NXC9 Cluster: Chromosome chr5 scaffold_2,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr5 scaffold_2, whole genome shotgun sequence
- Vitis vinifera (Grape), partial (70%)
Length = 1873
Score = 2706 bits (1365), Expect = 0.0
Identities = 1365/1365 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggggcaaggacaatccaaaagcgagttgctctaccagcaagtcagttatgggaactcc 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 154 atggggcaaggacaatccaaaagcgagttgctctaccagcaagtcagttatgggaactcc 213
Query: 61 gaaggaatcaaaacccttcacagagaaggtgcaggccttgagtggatggacagagaaggg 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 214 gaaggaatcaaaacccttcacagagaaggtgcaggccttgagtggatggacagagaaggg 273
Query: 121 aagacacctttgattgttgcttgtatgaatcctgagctttgtaatgttgctaaaactttg 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 274 aagacacctttgattgttgcttgtatgaatcctgagctttgtaatgttgctaaaactttg 333
Query: 181 atagaacttggagccaatgtcaatgcttatcgtcccggacgtcatgctgggactccattg 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 334 atagaacttggagccaatgtcaatgcttatcgtcccggacgtcatgctgggactccattg 393
Query: 241 catcatgcagctaaaaggggccttgaaagtattgttaagttacttctagcgagtggagcc 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 394 catcatgcagctaaaaggggccttgaaagtattgttaagttacttctagcgagtggagcc 453
Query: 301 aatcctttggtcttgaatgatgattgtcaaactgctcttgaggttgccagggctaaagga 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 454 aatcctttggtcttgaatgatgattgtcaaactgctcttgaggttgccagggctaaagga 513
Query: 361 cacagcaatgttgttcgggcaattgagagccatctatgcttgttctccggttggttgcgg 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 514 cacagcaatgttgttcgggcaattgagagccatctatgcttgttctccggttggttgcgg 573
Query: 421 gagtttcatggacctgggtttctagaagttgtagctccgcagttggtatcaagaaaagtt 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 574 gagtttcatggacctgggtttctagaagttgtagctccgcagttggtatcaagaaaagtt 633
Query: 481 tgggtggctgttttaccagttggctcccgtaatcttacccgaccttacaagttggagctt 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 634 tgggtggctgttttaccagttggctcccgtaatcttacccgaccttacaagttggagctt 693
Query: 541 gccgtgtattcttctttgcaggaagcacaaccacggacaattattcctctgtggaaagcc 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 694 gccgtgtattcttctttgcaggaagcacaaccacggacaattattcctctgtggaaagcc 753
Query: 601 aatttggaagaaccaaagcttcaccagtctgatccgtcggtgacaatcgctgatttcact 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 754 aatttggaagaaccaaagcttcaccagtctgatccgtcggtgacaatcgctgatttcact 813
Query: 661 tcaagaaaacgctttaaatttgggcctgcaagtgagaatgataggcaacaacttacatgg 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 814 tcaagaaaacgctttaaatttgggcctgcaagtgagaatgataggcaacaacttacatgg 873
Query: 721 ttttctaatgcttgcaaaggaattccgcaggcaaatccagcatttttgctaagtaatgtg 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 874 ttttctaatgcttgcaaaggaattccgcaggcaaatccagcatttttgctaagtaatgtg 933
Query: 781 actacagttcccccaacagcaccaccagctgcagaagatccagagttggctatggctatc 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 934 actacagttcccccaacagcaccaccagctgcagaagatccagagttggctatggctatc 993
Query: 841 aatgcatccattcagcatgccttgcaagaaaggccaaccgttcctgacgcccatccaaac 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 994 aatgcatccattcagcatgccttgcaagaaaggccaaccgttcctgacgcccatccaaac 1053
Query: 901 atcgaagcaagctcttcagtcagtggagtggatacaagcaagcatggttttctgggtaca 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1054 atcgaagcaagctcttcagtcagtggagtggatacaagcaagcatggttttctgggtaca 1113
Query: 961 ccaaatccaggcacaaattttagtgagtctgtacatgaagctaacacaggtgtcagtgtt 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1114 ccaaatccaggcacaaattttagtgagtctgtacatgaagctaacacaggtgtcagtgtt 1173
Query: 1021 tcagctggccttcctagtggtctggatttcaatccatcggctcctcctattaatgatgaa 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1174 tcagctggccttcctagtggtctggatttcaatccatcggctcctcctattaatgatgaa 1233
Query: 1081 attccagtagatggccccattcattatccatcaatcgatttaagccctctggatatatca 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1234 attccagtagatggccccattcattatccatcaatcgatttaagccctctggatatatca 1293
Query: 1141 tcatcatcttcagctgttgagaagctacctgaagaaggacaaagtgctggtgaaatcggt 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1294 tcatcatcttcagctgttgagaagctacctgaagaaggacaaagtgctggtgaaatcggt 1353
Query: 1201 tcaacatgcgtgatatgtttagatgctcctgcagaaggggcatgcataccttgtggccat 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1354 tcaacatgcgtgatatgtttagatgctcctgcagaaggggcatgcataccttgtggccat 1413
Query: 1261 gttgctggatgcatgtcttgcttgaacgaggtgaaaacaaagaaatggggttgccctgtg 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1414 gttgctggatgcatgtcttgcttgaacgaggtgaaaacaaagaaatggggttgccctgtg 1473
Query: 1321 tgtcgagctaagatagaccaggtcataaagttatatcgtgtttga 1365
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1474 tgtcgagctaagatagaccaggtcataaagttatatcgtgtttga 1518
>gnl|LJGI|GO019815 similar to UniRef100_A7NXC9 Cluster: Chromosome chr5 scaffold_2,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr5 scaffold_2, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (41%)
Length = 748
Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0
Identities = 555/557 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggggcaaggacaatccaaaagcgagttgctctaccagcaagtcagttatgggaactcc 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 192 atggggcaaggacaatccaaaagcgagttgctctaccagcaagtcagttatgggaactcc 251
Query: 61 gaaggaatcaaaacccttcacagagaaggtgcaggccttgagtggatggacagagaaggg 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 252 gaaggaatcaaaacccttcacagagaaggtgcaggccttgagtggatggacagagaaggg 311
Query: 121 aagacacctttgattgttgcttgtatgaatcctgagctttgtaatgttgctaaaactttg 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 312 aagacacctttgattgttgcttgtatgaatcctgagctttgtaatgttgctaaaactttg 371
Query: 181 atagaacttggagccaatgtcaatgcttatcgtcccggacgtcatgctgggactccattg 240
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 372 atagaacttggagccaatgtcaatgctcatcgtcccggacgtcatgctgggactccattg 431
Query: 241 catcatgcagctaaaaggggccttgaaagtattgttaagttacttctagcgagtggagcc 300
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 432 catcatgcaactaaaaggggccttgaaagtattgttaagttacttctagcgagtggagcc 491
Query: 301 aatcctttggtcttgaatgatgattgtcaaactgctcttgaggttgccagggctaaagga 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 492 aatcctttggtcttgaatgatgattgtcaaactgctcttgaggttgccagggctaaagga 551
Query: 361 cacagcaatgttgttcgggcaattgagagccatctatgcttgttctccggttggttgcgg 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 552 cacagcaatgttgttcgggcaattgagagccatctatgcttgttctccggttggttgcgg 611
Query: 421 gagtttcatggacctgggtttctagaagttgtagctccgcagttggtatcaagaaaagtt 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 612 gagtttcatggacctgggtttctagaagttgtagctccgcagttggtatcaagaaaagtt 671
Query: 481 tgggtggctgttttaccagttggctcccgtaatcttacccgaccttacaagttggagctt 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 672 tgggtggctgttttaccagttggctcccgtaatcttacccgaccttacaagttggagctt 731
Query: 541 gccgtgtattcttcttt 557
|||||||||||||||||
Sbjct: 732 gccgtgtattcttcttt 748
>gnl|LJGI|TC72768 similar to UniRef100_Q9LTC1 Cluster: Similarity to ankyrin like
protein; n=1; Arabidopsis thaliana|Rep: Similarity to
ankyrin like protein - Arabidopsis thaliana (Mouse-ear
cress), partial (28%)
Length = 564
Score = 749 bits (378), Expect = 0.0
Identities = 378/378 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggggcaaggacaatccaaaagcgagttgctctaccagcaagtcagttatgggaactcc 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 187 atggggcaaggacaatccaaaagcgagttgctctaccagcaagtcagttatgggaactcc 246
Query: 61 gaaggaatcaaaacccttcacagagaaggtgcaggccttgagtggatggacagagaaggg 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 247 gaaggaatcaaaacccttcacagagaaggtgcaggccttgagtggatggacagagaaggg 306
Query: 121 aagacacctttgattgttgcttgtatgaatcctgagctttgtaatgttgctaaaactttg 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 307 aagacacctttgattgttgcttgtatgaatcctgagctttgtaatgttgctaaaactttg 366
Query: 181 atagaacttggagccaatgtcaatgcttatcgtcccggacgtcatgctgggactccattg 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 367 atagaacttggagccaatgtcaatgcttatcgtcccggacgtcatgctgggactccattg 426
Query: 241 catcatgcagctaaaaggggccttgaaagtattgttaagttacttctagcgagtggagcc 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 427 catcatgcagctaaaaggggccttgaaagtattgttaagttacttctagcgagtggagcc 486
Query: 301 aatcctttggtcttgaatgatgattgtcaaactgctcttgaggttgccagggctaaagga 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 487 aatcctttggtcttgaatgatgattgtcaaactgctcttgaggttgccagggctaaagga 546
Query: 361 cacagcaatgttgttcgg 378
||||||||||||||||||
Sbjct: 547 cacagcaatgttgttcgg 564