Miyakogusa Predicted Gene
- Lj5g3v1118370.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj5g3v1118370.1 tr|A5HIG2|A5HIG2_9FABA Succinyl-CoA ligase beta
subunit OS=Caragana jubata PE=2 SV=1,94.99,0,Glutathione synthetase
ATP-binding domain-like,NULL; Succinyl-CoA synthetase
domains,Succinyl-CoA sy,CUFF.54867.1
(1269 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC61761 homologue to UniRef100_A5HIG2 Cluster: Succinyl... 2516 0.0
>gnl|LJGI|TC61761 homologue to UniRef100_A5HIG2 Cluster: Succinyl-CoA ligase beta
subunit; n=1; Caragana jubata|Rep: Succinyl-CoA ligase
beta subunit - Caragana jubata, complete
Length = 1776
Score = 2516 bits (1269), Expect = 0.0
Identities = 1269/1269 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggtgagaggattgctcaacaagctcgtctcccgctccctctccgtcgccggaaaatcg 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 120 atggtgagaggattgctcaacaagctcgtctcccgctccctctccgtcgccggaaaatcg 179
Query: 61 cagaaccaacagctccgccgcctcaacatccatgaataccagggtgctgagttgatgagt 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 180 cagaaccaacagctccgccgcctcaacatccatgaataccagggtgctgagttgatgagt 239
Query: 121 aaatatggagttaacgttccgagaggtgtagctgtttcctctgttgaagaaaccagaaag 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 240 aaatatggagttaacgttccgagaggtgtagctgtttcctctgttgaagaaaccagaaag 299
Query: 181 gccatcaaggacgtgttccctggtcaaaatgagttggtggttaagagtcagattttagct 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 300 gccatcaaggacgtgttccctggtcaaaatgagttggtggttaagagtcagattttagct 359
Query: 241 ggtggacgaggattgggaacttttaaaagtggccttaagggaggagtgcacattgttaag 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 360 ggtggacgaggattgggaacttttaaaagtggccttaagggaggagtgcacattgttaag 419
Query: 301 actgaccaggttgaagacattgctggtaagatgcttgggcagatactagttaccaaacag 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 420 actgaccaggttgaagacattgctggtaagatgcttgggcagatactagttaccaaacag 479
Query: 361 actggtcctgagggaaaagttgttagcaaggtttacttgtgtgaaaagctatcacttgtg 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 480 actggtcctgagggaaaagttgttagcaaggtttacttgtgtgaaaagctatcacttgtg 539
Query: 421 aatgagatgtactttgctataactcttgatcggaagactgctggtccgcttattattgct 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 540 aatgagatgtactttgctataactcttgatcggaagactgctggtccgcttattattgct 599
Query: 481 tgtagaaaaggaggaaccagcattgaagaccttgcagagaaattcccagatatgattata 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 600 tgtagaaaaggaggaaccagcattgaagaccttgcagagaaattcccagatatgattata 659
Query: 541 aaggtgcctattgatgtttttgaaggaattactgatgaagatgcagctaaggttgttgat 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 660 aaggtgcctattgatgtttttgaaggaattactgatgaagatgcagctaaggttgttgat 719
Query: 601 ggtttggctcccaaaggggctgatagaaatcaatcaattgaacaagtgaagaatttgtat 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 720 ggtttggctcccaaaggggctgatagaaatcaatcaattgaacaagtgaagaatttgtat 779
Query: 661 aaactttttgttgatagtgactgcactcttttggaaatcaatcccatagctgagacagct 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 780 aaactttttgttgatagtgactgcactcttttggaaatcaatcccatagctgagacagct 839
Query: 721 gataaccaactggtcgctgctgatgctaagttgaattttgatgataatgctgcgtatcgt 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 840 gataaccaactggtcgctgctgatgctaagttgaattttgatgataatgctgcgtatcgt 899
Query: 781 cagaaagagatatttgctcttcgtgacacaacacaagaagatccacgagaggtgactgct 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 900 cagaaagagatatttgctcttcgtgacacaacacaagaagatccacgagaggtgactgct 959
Query: 841 gcaaaagcagatttaaattatattgggctagatggagaaattggttgcatggtgaatggg 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 960 gcaaaagcagatttaaattatattgggctagatggagaaattggttgcatggtgaatggg 1019
Query: 901 gcaggattagcaatggccacaatggatattattaaattgcatgggggtactcctgccaat 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1020 gcaggattagcaatggccacaatggatattattaaattgcatgggggtactcctgccaat 1079
Query: 961 tttctggatgtaggtgggaatgcctccgaaggacaggttgttgaggcatttaaaatattg 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1080 tttctggatgtaggtgggaatgcctccgaaggacaggttgttgaggcatttaaaatattg 1139
Query: 1021 accgccgatagcaaagtgaaggcaattttggttaatatttttggtggtataatgaagtgt 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1140 accgccgatagcaaagtgaaggcaattttggttaatatttttggtggtataatgaagtgt 1199
Query: 1081 gatgttattgcaagtggaatagtgaatgctgcaaaacaggttgcactgaaagtcccagta 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1200 gatgttattgcaagtggaatagtgaatgctgcaaaacaggttgcactgaaagtcccagta 1259
Query: 1141 atcgttcgtcttgaaggcaccaatgttgatcaaggaaaaagaattttgaaggaaagtggt 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1260 atcgttcgtcttgaaggcaccaatgttgatcaaggaaaaagaattttgaaggaaagtggt 1319
Query: 1201 atgacattaataacggctgaagatttagatgatgcagctcacaaagcagtgaaagccatt 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1320 atgacattaataacggctgaagatttagatgatgcagctcacaaagcagtgaaagccatt 1379
Query: 1261 aacaaatga 1269
|||||||||
Sbjct: 1380 aacaaatga 1388