Miyakogusa Predicted Gene

Lj5g3v1003860.1
Show Alignment: 

BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Lj5g3v1003860.1 Non Chatacterized Hit- tr|I1L9H5|I1L9H5_SOYBN
Uncharacterized protein OS=Glycine max PE=4
SV=1,27.14,1e-18,seg,NULL,CUFF.54737.1
         (1070 letters)

Database: LJGI 
           47,486 sequences; 32,788,469 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gnl|LJGI|BP067296                                                    1037   0.0  
gnl|LJGI|TC66882                                                      874   0.0  

>gnl|LJGI|BP067296 
          Length = 523

 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0
 Identities = 523/523 (100%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 437 gatttagcaaagataaagtgaggaagaagctctgcatcgaaggacttgatacaactaaaa 496
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 523 gatttagcaaagataaagtgaggaagaagctctgcatcgaaggacttgatacaactaaaa 464

                                                                       
Query: 497 tgaagggtgggatttacagagcctgcatgaaacaacttcctctcatctggatgaatttct 556
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 463 tgaagggtgggatttacagagcctgcatgaaacaacttcctctcatctggatgaatttct 404

                                                                       
Query: 557 tggttaccaacatgttgccttcttctcatgtatcagatcttccattaaccaaagcatgtt 616
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 403 tggttaccaacatgttgccttcttctcatgtatcagatcttccattaaccaaagcatgtt 344

                                                                       
Query: 617 tggtctattccattcttgagcaagatagtgtgaacatagcggctgtcatttctgatcacc 676
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 343 tggtctattccattcttgagcaagatagtgtgaacatagcggctgtcatttctgatcacc 284

                                                                       
Query: 677 ttgctaaatgtattggaaacggagtgaaatcaatgatttttccagctcttatacatgaat 736
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 283 ttgctaaatgtattggaaacggagtgaaatcaatgatttttccagctcttatacatgaat 224

                                                                       
Query: 737 tatgcaagttacacaatgtaccaatgaatgctgacaatgagctaccacttcaatacccaa 796
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 223 tatgcaagttacacaatgtaccaatgaatgctgacaatgagctaccacttcaatacccaa 164

                                                                       
Query: 797 tcactgcagcctatattcaacagaattgcaaagagaatgatttggatacagccaaagcag 856
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 163 tcactgcagcctatattcaacagaattgcaaagagaatgatttggatacagccaaagcag 104

                                                                       
Query: 857 aatttgccagaaaacttcatgaaacacaacctgaacagccagagcaagttccacccactc 916
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 103 aatttgccagaaaacttcatgaaacacaacctgaacagccagagcaagttccacccactc 44

                                                      
Query: 917 atgagccacaatcatcccagatggatcagattttatctcagct 959
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 43  atgagccacaatcatcccagatggatcagattttatctcagct 1


>gnl|LJGI|TC66882 
          Length = 631

 Score =  874 bits (441), Expect = 0.0
 Identities = 448/449 (99%), Gaps = 1/449 (0%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 1   atggaacgacaaagccgacgtagtgcacgagctaggagtgacacacaatttgacactagc 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 183 atggaacgacaaagccgacgtagtgcacgagctaggagtgacacacaatttgacactagc 242

                                                                       
Query: 61  aaattcaaatcttctgtgacagctatgcactatggcaggttacgcagtcttcgtttcatt 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 243 aaattcaaatcttctgtgacagctatgcactatggcaggttacgcagtcttcgtttcatt 302

                                                                       
Query: 121 gaggaaagaagggtagaacttggatcgaatgagttcccagattttcaaaaggagctagaa 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 303 gaggaaagaagggtagaacttggatcgaatgagttcccagattttcaaaaggagctagaa 362

                                                                       
Query: 181 gagagagggtggatgaagttggctaaaccacctcgatacttcaatcatgaggtagttcga 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 363 gagagagggtggatgaagttggctaaaccacctcgatacttcaatcatgaggtagttcga 422

                                                                       
Query: 241 caattttatgccaattccc-ttttttctgaagaggctaaagagcaaaggaagtcttgggt 299
           ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 423 caattttatgccaattccctttttttctgaagaggctaaagagcaaaggaagtcttgggt 482

                                                                       
Query: 300 gaatggaatccaggtgaattatgataaggatacaatcaataattgtctaggaaatccatg 359
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 483 gaatggaatccaggtgaattatgataaggatacaatcaataattgtctaggaaatccatg 542

                                                                       
Query: 360 ggacccacacaccgatgatgaagacgatttgtgtgactaccaaacacaggaacttaaagg 419
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 543 ggacccacacaccgatgatgaagacgatttgtgtgactaccaaacacaggaacttaaagg 602

                                        
Query: 420 catgaatcatctaaatggatttagcaaag 448
           |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 603 catgaatcatctaaatggatttagcaaag 631