Miyakogusa Predicted Gene
- Lj5g3v0404800.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj5g3v0404800.1 Non Chatacterized Hit- tr|I1M923|I1M923_SOYBN
Uncharacterized protein OS=Glycine max PE=3 SV=1,89.53,0,PLP-dependent
transferases,Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major domain;
GDC-P,Glycine cl,CUFF.52994.1
(3081 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC69624 homologue to UniRef100_P26969 Cluster: Glycine ... 6066 0.0
gnl|LJGI|BP056701 similar to UniRef100_P26969 Cluster: Glycine d... 714 0.0
gnl|LJGI|FS321825 similar to UniRef100_P26969 Cluster: Glycine d... 464 e-129
gnl|LJGI|AV766160 similar to UniRef100_P26969 Cluster: Glycine d... 234 3e-60
>gnl|LJGI|TC69624 homologue to UniRef100_P26969 Cluster: Glycine dehydrogenase
[decarboxylating], mitochondrial precursor; n=1; Pisum
sativum|Rep: Glycine dehydrogenase [decarboxylating],
mitochondrial precursor - Pisum sativum (Garden pea),
partial (97%)
Length = 3552
Score = 6066 bits (3060), Expect = 0.0
Identities = 3074/3081 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggagcgcgcacggagactcgccaaccgcgccattctcaagcgtttggtttccgaagcg 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 119 atggagcgcgcacggagactcgccaaccgcgccattctcaagcgtttggtttccgaagcg 178
Query: 61 aagcacaaccgaaagcatgaaccggtgtggaactccgccgccgcctccaccaccaccgtg 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 179 aagcacaaccgaaagcatgaaccggtgtggaactccgccgccgcctccaccaccaccgtg 238
Query: 121 ccgttttactccgcttcttcctcccggtacgtgtcctctgtttctcactctgttctcaga 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 239 ccgttttactccgcttcttcctcccggtacgtgtcctctgtttctcactctgttctcaga 298
Query: 181 aacagaggatccaaatcagccaccaacattccacgcgccgccgcgggtttatcccagacc 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 299 aacagaggatccaaatcagccaccaacattccacgcgccgccgcgggtttatcccagacc 358
Query: 241 cgatcgatctccgtggaggcgcttcaacccagcgacacgttcccgagacggcacaactcc 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 359 cgatcgatctccgtggaggcgcttcaacccagcgacacgttcccgagacggcacaactcc 418
Query: 301 gctacaccagaagaacaagccaagatgtcactggcttgtggcttcgacaacgttgattcc 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 419 gctacaccagaagaacaagccaagatgtcactggcttgtggcttcgacaacgttgattcc 478
Query: 361 ctcgtagacgctactgtaccgaaatcgattcggttgaaggagatgaagttcaacaagttc 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 479 ctcgtagacgctactgtaccgaaatcgattcggttgaaggagatgaagttcaacaagttc 538
Query: 421 gatggaggattaacagaagggcaaatgatcgagcacatgaaggagttagcatcgaagaac 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 539 gatggaggattaacagaagggcaaatgatcgagcacatgaaggagttagcatcgaagaac 598
Query: 481 aaggttttcaagtcgttcattggaatggggtactacaacacccatgttcctcctgtgatc 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 599 aaggttttcaagtcgttcattggaatggggtactacaacacccatgttcctcctgtgatc 658
Query: 541 ttgaggaacatcatggagaatccagcttggtacacacagtacactccttaccaggctgag 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 659 ttgaggaacatcatggagaatccagcttggtacacacagtacactccttaccaggctgag 718
Query: 601 atttctcaggggaggcttgaatcgttgttgaattatcagaccatgattacggatctcact 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 719 atttctcaggggaggcttgaatcgttgttgaattatcagaccatgattacggatctcact 778
Query: 661 ggtttgcctatgtccaatgcttcattgcttgatgaaggtactgctgcagctgaagcaatg 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 779 ggtttgcctatgtccaatgcttcattgcttgatgaaggtactgctgcagctgaagcaatg 838
Query: 721 tctatgtgcaacaacattcagaaggggaagaagaagacattcatcattgcaagtaactgc 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 839 tctatgtgcaacaacattcagaaggggaagaagaagacattcatcattgcaagtaactgc 898
Query: 781 cacccacaaaccattgatatttgcaagaccagagctgatggttttgaactcaaggttgtg 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 899 cacccacaaaccattgatatttgcaagaccagagctgatggttttgaactcaaggttgtg 958
Query: 841 gtggctgatcttaaggacattgattacaaatctggtgatgtttgtggtgttcttgttcag 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 959 gtggctgatcttaaggacattgattacaaatctggtgatgtttgtggtgttcttgttcag 1018
Query: 901 tatcctggtactgagggtgaggttttggattatggggagtttattaagaaagctcatgct 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1019 tatcctggtactgagggtgaggttttggattatggggagtttattaagaaagctcatgct 1078
Query: 961 catgaggtgaaggttgttatggcttctgatcttttggcattgactgcgttgaagcctccc 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1079 catgaggtgaaggttgttatggcttctgatcttttggcattgactgcgttgaagcctccc 1138
Query: 1021 ggtgagttcggggcagatattgtcgttggctcggctcagaggttcggggttccaatgggt 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1139 ggtgagttcggggcagatattgtcgttggctcggctcagaggttcggggttccaatgggt 1198
Query: 1081 tatggtggtcctcatgctgcttttctggccacatcacaggagtacaagaggatgatgcct 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1199 tatggtggtcctcatgctgcttttctggccacatcacaggagtacaagaggatgatgcct 1258
Query: 1141 gggagaatcattggtgttagtgttgattcttcaggaaagagtgctttgagaatggcaatg 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1259 gggagaatcattggtgttagtgttgattcttcaggaaagagtgctttgagaatggcaatg 1318
Query: 1201 caaactagggagcagcatatccgtagggacaaggctaccagcaacatttgcactgctcag 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1319 caaactagggagcagcatatccgtagggacaaggctaccagcaacatttgcactgctcag 1378
Query: 1261 gcactgcttgcaaacatggctgccatgtatgctgtatatcatggacctgaaggccttaaa 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1379 gcactgcttgcaaacatggctgccatgtatgctgtatatcatggacctgaaggccttaaa 1438
Query: 1321 gccattagccaacgtgttcatggtcttgctggggcatttgctctggggttaaagaaactt 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1439 gccattagccaacgtgttcatggtcttgctggggcatttgctctggggttaaagaaactt 1498
Query: 1381 ggaactgtggaagttcaggatcttcccttctttgacactgtgaaggttaagacttccaat 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1499 ggaactgtggaagttcaggatcttcccttctttgacactgtgaaggttaagacttccaat 1558
Query: 1441 gcacatgcaattgctgatgctgctctcaaaagtgaaataaacttgcgagttgtagatgga 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1559 gcacatgcaattgctgatgctgctctcaaaagtgaaataaacttgcgagttgtagatgga 1618
Query: 1501 aacactattactgttgcttttgatgaaacaatcacattagaggatgttgacaagcttttc 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1619 aacactattactgttgcttttgatgaaacaatcacattagaggatgttgacaagcttttc 1678
Query: 1561 caagtgtttgctggtggcaagcctgtctccttcacatctgcatcacttgcgccagaagtc 1620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1679 caagtgtttgctggtggcaagcctgtctccttcacatctgcatcacttgcgccagaagtc 1738
Query: 1621 cagagtccaattccttctggactagctagggagagcccttttctgacacaccctatcttt 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1739 cagagtccaattccttctggactagctagggagagcccttttctgacacaccctatcttt 1798
Query: 1681 aacacgtaccaaactgagcatgagttgctcagatacattcataggctgcaatcgaaggat 1740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1799 aacacgtaccaaactgagcatgagttgctcagatacattcataggctgcaatcgaaggat 1858
Query: 1741 ctatcactatgccacagtatgatcccactgggatcttgtacaatgaagctgaatgcaaca 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1859 ctatcactatgccacagtatgatcccactgggatcttgtacaatgaagctgaatgcaaca 1918
Query: 1801 actgaaatgatgcctgtgacatggcccagcttcactgatattcacccttttgcaccagtt 1860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1919 actgaaatgatgcctgtgacatggcccagcttcactgatattcacccttttgcaccagtt 1978
Query: 1861 gaacaggctcaaggttatcaggaaatgttcaacaatttgggtgatctgttgtgtaccatc 1920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1979 gaacaggctcaaggttatcaggaaatgttcaacaatttgggtgatctgttgtgtaccatc 2038
Query: 1921 actgggtttgactctttctccttgcaaccgaatgctggtgctgctggagaatatgctgga 1980
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2039 actgggtttgactctttctccttgcaaccgaatgctggtgctgctggagaatatgctgga 2098
Query: 1981 ctgatggttattcgcgcatatcatttgtcaagaggagatcaccaccgcaatgtttgcatt 2040
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2099 ctgatggttattcgcgcatatcatttgtcaagaggagatcaccaccgcaatgtttgcatt 2158
Query: 2041 atacctgtctcagcacatggtaccaatcctgctagtgctgctatgtgtggaatgaaaatt 2100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2159 atacctgtctcagcacatggtaccaatcctgctagtgctgctatgtgtggaatgaaaatt 2218
Query: 2101 gtcacaatcggaaccgatgccaaaggaaacattaacattgatgagttgaggacggctgct 2160
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2219 gtcacaatcggaaccgatgccaaaggaaacattaacattgatgagttgaggacggctgct 2278
Query: 2161 gnnnnnnntaaggacaacttatctgcacttatggtgacatatccttccacccatggtgtt 2220
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2279 gaaaaaaataaggacaacttatctgcacttatggtgacatatccttccacccatggtgtt 2338
Query: 2221 tatgaagaaggtattgatgagatttgcaagatcattcatgataatggaggccaagtgtat 2280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2339 tatgaagaaggtattgatgagatttgcaagatcattcatgataatggaggccaagtgtat 2398
Query: 2281 atggatggtgccaacatgaatgcacaggtgggacttacaagcccaggttggattggagca 2340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2399 atggatggtgccaacatgaatgcacaggtgggacttacaagcccaggttggattggagca 2458
Query: 2341 gatgtttgtcatctcaatctccacaagacattttgcattcctcatggaggaggtggccct 2400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2459 gatgtttgtcatctcaatctccacaagacattttgcattcctcatggaggaggtggccct 2518
Query: 2401 ggcatgggtcctattggtgtaaagcaacacttggcaccatttttaccttcacacccagtg 2460
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2519 ggcatgggtcctattggtgtaaagcaacacttggcaccatttttaccttcacacccagtg 2578
Query: 2461 atacccactggtggaattcctgcccctgacaactctcaaccacttggtaccatctctgct 2520
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2579 atacccactggtggaattcctgcccctgacaactctcaaccacttggtaccatctctgct 2638
Query: 2521 gcaccttggggttcagcactcatcttgccaatctcttacacttacattgccatgatgggt 2580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2639 gcaccttggggttcagcactcatcttgccaatctcttacacttacattgccatgatgggt 2698
Query: 2581 tctcaaggactcacagatgcatcaaagatagccattttaaatgcaaactacatggccaaa 2640
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2699 tctcaaggactcacagatgcatcaaagatagccattttaaatgcaaactacatggccaaa 2758
Query: 2641 cgattggagaactattaccctgttcttttccgtggagtcaatggaacagttgctcatgaa 2700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2759 cgattggagaactattaccctgttcttttccgtggagtcaatggaacagttgctcatgaa 2818
Query: 2701 ttcattattgacttgagaggctttaagaatactgctggaattgagcccgaagatgtcgcg 2760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2819 ttcattattgacttgagaggctttaagaatactgctggaattgagcccgaagatgtcgcg 2878
Query: 2761 aaacgcctcatggattacgggttccatggaccaacaatgtcatggcctgtgcctggcaca 2820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2879 aaacgcctcatggattacgggttccatggaccaacaatgtcatggcctgtgcctggcaca 2938
Query: 2821 ctcatgattgagcccactgaaagtgaaagcaaggctgagttagacaggttttgtgatgct 2880
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2939 ctcatgattgagcccactgaaagtgaaagcaaggctgagttagacaggttttgtgatgct 2998
Query: 2881 cttatttccataagacaagaaattgctgagattgagaaaggaaaggctgacattaacaac 2940
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2999 cttatttccataagacaagaaattgctgagattgagaaaggaaaggctgacattaacaac 3058
Query: 2941 aatgtactcaagggagctcctcatccaccatcattgctcatggcagatgcatggacaaaa 3000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3059 aatgtactcaagggagctcctcatccaccatcattgctcatggcagatgcatggacaaaa 3118
Query: 3001 ccatactccagggagtgcgcagccttcccagcttcatggctcagggttgccaagttctgg 3060
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3119 ccatactccagggagtgcgcagccttcccagcttcatggctcagggttgccaagttctgg 3178
Query: 3061 cctaccacaggacgtgttgac 3081
|||||||||||||||||||||
Sbjct: 3179 cctaccacaggacgtgttgac 3199
>gnl|LJGI|BP056701 similar to UniRef100_P26969 Cluster: Glycine dehydrogenase
[decarboxylating], mitochondrial precursor; n=1; Pisum
sativum|Rep: Glycine dehydrogenase [decarboxylating],
mitochondrial precursor - Pisum sativum (Garden pea),
partial (9%)
Length = 560
Score = 714 bits (360), Expect = 0.0
Identities = 362/363 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggagcgcgcacggagactcgccaaccgcgccattctcaagcgtttggtttccgaagcg 60
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 198 atggagcgcgcacggagactcgccaaccgcgccattctcaagcgttnggtttccgaagcg 257
Query: 61 aagcacaaccgaaagcatgaaccggtgtggaactccgccgccgcctccaccaccaccgtg 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 258 aagcacaaccgaaagcatgaaccggtgtggaactccgccgccgcctccaccaccaccgtg 317
Query: 121 ccgttttactccgcttcttcctcccggtacgtgtcctctgtttctcactctgttctcaga 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 318 ccgttttactccgcttcttcctcccggtacgtgtcctctgtttctcactctgttctcaga 377
Query: 181 aacagaggatccaaatcagccaccaacattccacgcgccgccgcgggtttatcccagacc 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 378 aacagaggatccaaatcagccaccaacattccacgcgccgccgcgggtttatcccagacc 437
Query: 241 cgatcgatctccgtggaggcgcttcaacccagcgacacgttcccgagacggcacaactcc 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 438 cgatcgatctccgtggaggcgcttcaacccagcgacacgttcccgagacggcacaactcc 497
Query: 301 gctacaccagaagaacaagccaagatgtcactggcttgtggcttcgacaacgttgattcc 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 498 gctacaccagaagaacaagccaagatgtcactggcttgtggcttcgacaacgttgattcc 557
Query: 361 ctc 363
|||
Sbjct: 558 ctc 560
>gnl|LJGI|FS321825 similar to UniRef100_P26969 Cluster: Glycine dehydrogenase
[decarboxylating], mitochondrial precursor; n=1; Pisum
sativum|Rep: Glycine dehydrogenase [decarboxylating],
mitochondrial precursor - Pisum sativum (Garden pea),
partial (5%)
Length = 567
Score = 464 bits (234), Expect = e-129
Identities = 234/234 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggagcgcgcacggagactcgccaaccgcgccattctcaagcgtttggtttccgaagcg 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 334 atggagcgcgcacggagactcgccaaccgcgccattctcaagcgtttggtttccgaagcg 393
Query: 61 aagcacaaccgaaagcatgaaccggtgtggaactccgccgccgcctccaccaccaccgtg 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 394 aagcacaaccgaaagcatgaaccggtgtggaactccgccgccgcctccaccaccaccgtg 453
Query: 121 ccgttttactccgcttcttcctcccggtacgtgtcctctgtttctcactctgttctcaga 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 454 ccgttttactccgcttcttcctcccggtacgtgtcctctgtttctcactctgttctcaga 513
Query: 181 aacagaggatccaaatcagccaccaacattccacgcgccgccgcgggtttatcc 234
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 514 aacagaggatccaaatcagccaccaacattccacgcgccgccgcgggtttatcc 567
>gnl|LJGI|AV766160 similar to UniRef100_P26969 Cluster: Glycine dehydrogenase
[decarboxylating], mitochondrial precursor; n=1; Pisum
sativum|Rep: Glycine dehydrogenase [decarboxylating],
mitochondrial precursor - Pisum sativum (Garden pea),
partial (8%)
Length = 343
Score = 234 bits (118), Expect = 3e-60
Identities = 170/186 (91%), Gaps = 1/186 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 2895 acaagaaattgctgagattgagaaaggaaaggctgacattaacaacaatgtactcaaggg 2954
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||
Sbjct: 343 acaagaaattgctgagattgagaaaggaaaggatgacattcacttcaatgtactcaaggg 284
Query: 2955 agctcctcatccaccatcattgctcatggcagatgcatggacaaaaccatactccaggga 3014
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 283 agctcctcctccaccatcattgctcatggcagatgcatggacaaaaccatcctccaggga 224
Query: 3015 gtgcgca-gccttcccagcttcatggctcagggttgccaagttctggcctaccacaggac 3073
||| ||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||| | || |||||||||| |
Sbjct: 223 gtgagcaggccttcccagcctcatggatcagggatgccaagctatgtcctaccacagcaa 164
Query: 3074 gtgttg 3079
||||||
Sbjct: 163 gtgttg 158