Miyakogusa Predicted Gene
- Lj5g3v0280400.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj5g3v0280400.1 Non Chatacterized Hit- tr|I1NCV3|I1NCV3_SOYBN
Uncharacterized protein OS=Glycine max GN=Gma.56122 PE,84.45,0,no
description,NULL; PrmA,Ribosomal L11 methyltransferase, PrmA;
S-adenosyl-L-methionine-dependent m,CUFF.52721.1
(1254 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC62498 similar to UniRef100_A7QNM2 Cluster: Chromosome... 2383 0.0
gnl|LJGI|FS320722 similar to UniRef100_Q08A71 Cluster: Probable ... 1354 0.0
>gnl|LJGI|TC62498 similar to UniRef100_A7QNM2 Cluster: Chromosome undetermined
scaffold_133, whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis
vinifera|Rep: Chromosome undetermined scaffold_133, whole
genome shotgun sequence - Vitis vinifera (Grape), partial
(84%)
Length = 1581
Score = 2383 bits (1202), Expect = 0.0
Identities = 1202/1202 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 53 caccggcaatggtgtacggccaaaaccaccgatacagagagcgagtccgccgtggcagtc 112
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 77 caccggcaatggtgtacggccaaaaccaccgatacagagagcgagtccgccgtggcagtc 136
Query: 113 gcaggtcacgtgcttcctcttccagtccccttcccgttagggtttctgacaccgaccaac 172
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 gcaggtcacgtgcttcctcttccagtccccttcccgttagggtttctgacaccgaccaac 196
Query: 173 ctcgtcctccttgcaccgattacgacatggcctacttccattcctacgctcacctcggta 232
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 ctcgtcctccttgcaccgattacgacatggcctacttccattcctacgctcacctcggta 256
Query: 233 tccaccaggaaatgatcaaggatcgtgtgcggactgaaacttacagggaagcaatcatgc 292
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 tccaccaggaaatgatcaaggatcgtgtgcggactgaaacttacagggaagcaatcatgc 316
Query: 293 ggcatcagagttttattgcaggcaaagttgtagttgatgttggatgcggtacaggaatcc 352
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 ggcatcagagttttattgcaggcaaagttgtagttgatgttggatgcggtacaggaatcc 376
Query: 353 tttctatattttgtgctcaggccggtgcgaagcgggtgtatgcagttgatgcgagtgaca 412
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 tttctatattttgtgctcaggccggtgcgaagcgggtgtatgcagttgatgcgagtgaca 436
Query: 413 ttgccctgcaggcaaatgaagttgttaaagcaaataacctgtctgatgttatcgttgtat 472
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 ttgccctgcaggcaaatgaagttgttaaagcaaataacctgtctgatgttatcgttgtat 496
Query: 473 tgcatggacgagttgaggatgttgaaattaatgaagaggtggatgttataatttcagaat 532
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 tgcatggacgagttgaggatgttgaaattaatgaagaggtggatgttataatttcagaat 556
Query: 533 ggatgggctatatgcttctatatgagagtatgcttggaagtgttattactgccagagatc 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 557 ggatgggctatatgcttctatatgagagtatgcttggaagtgttattactgccagagatc 616
Query: 593 gttggctcaaacctggcggtcttattcttccttcaagtgcaacgttgtacatggctcctg 652
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 617 gttggctcaaacctggcggtcttattcttccttcaagtgcaacgttgtacatggctcctg 676
Query: 653 ttacacatactgacagatacagtgaaagcgttgacttttggcgcaatgtttatggaattg 712
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 677 ttacacatactgacagatacagtgaaagcgttgacttttggcgcaatgtttatggaattg 736
Query: 713 atatgtccgccatgttatcattagctaaacagtgtgcatttgaggaaccttcagtcgaga 772
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 737 atatgtccgccatgttatcattagctaaacagtgtgcatttgaggaaccttcagtcgaga 796
Query: 773 ccatatctggcgaaaatgttttgacatggcctcatgtggtgaaatatgttgatagttatt 832
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 797 ccatatctggcgaaaatgttttgacatggcctcatgtggtgaaatatgttgatagttatt 856
Query: 833 ctgttaccatcaatgaattagaaactgtaacaacaaagtttaagttcaactccatgatgc 892
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 857 ctgttaccatcaatgaattagaaactgtaacaacaaagtttaagttcaactccatgatgc 916
Query: 893 gagctccactacatggttttgcattttggtttgatgttgagtttaatgggcctgcaatag 952
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 917 gagctccactacatggttttgcattttggtttgatgttgagtttaatgggcctgcaatag 976
Query: 953 caccaaccaattatcattcgtcaacaccaattattgagaatcatcaggtgaatggtagtc 1012
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 977 caccaaccaattatcattcgtcaacaccaattattgagaatcatcaggtgaatggtagtc 1036
Query: 1013 agagaaaaaagcgaacaaatccaaatgaagcactggtcctgtccacggcacctgaggacc 1072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1037 agagaaaaaagcgaacaaatccaaatgaagcactggtcctgtccacggcacctgaggacc 1096
Query: 1073 ctccaacacattggcagcagactttgatatacttctacgatcctattgagctggaacaag 1132
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1097 ctccaacacattggcagcagactttgatatacttctacgatcctattgagctggaacaag 1156
Query: 1133 atcaacttattgaaggttcagtgacattgacacagagcaaagaaaatgttcgatttatga 1192
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1157 atcaacttattgaaggttcagtgacattgacacagagcaaagaaaatgttcgatttatga 1216
Query: 1193 atattcaccttgaatataattcaggtggtcgagcgtttgtgaaagagtctgttatgagat 1252
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1217 atattcaccttgaatataattcaggtggtcgagcgtttgtgaaagagtctgttatgagat 1276
Query: 1253 ga 1254
||
Sbjct: 1277 ga 1278
>gnl|LJGI|FS320722 similar to UniRef100_Q08A71 Cluster: Probable protein arginine
N-methyltransferase 6; n=1; Arabidopsis thaliana|Rep:
Probable protein arginine N-methyltransferase 6 -
Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress), partial (42%)
Length = 799
Score = 1354 bits (683), Expect = 0.0
Identities = 683/683 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 53 caccggcaatggtgtacggccaaaaccaccgatacagagagcgagtccgccgtggcagtc 112
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 117 caccggcaatggtgtacggccaaaaccaccgatacagagagcgagtccgccgtggcagtc 176
Query: 113 gcaggtcacgtgcttcctcttccagtccccttcccgttagggtttctgacaccgaccaac 172
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 177 gcaggtcacgtgcttcctcttccagtccccttcccgttagggtttctgacaccgaccaac 236
Query: 173 ctcgtcctccttgcaccgattacgacatggcctacttccattcctacgctcacctcggta 232
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 237 ctcgtcctccttgcaccgattacgacatggcctacttccattcctacgctcacctcggta 296
Query: 233 tccaccaggaaatgatcaaggatcgtgtgcggactgaaacttacagggaagcaatcatgc 292
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 297 tccaccaggaaatgatcaaggatcgtgtgcggactgaaacttacagggaagcaatcatgc 356
Query: 293 ggcatcagagttttattgcaggcaaagttgtagttgatgttggatgcggtacaggaatcc 352
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 357 ggcatcagagttttattgcaggcaaagttgtagttgatgttggatgcggtacaggaatcc 416
Query: 353 tttctatattttgtgctcaggccggtgcgaagcgggtgtatgcagttgatgcgagtgaca 412
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 417 tttctatattttgtgctcaggccggtgcgaagcgggtgtatgcagttgatgcgagtgaca 476
Query: 413 ttgccctgcaggcaaatgaagttgttaaagcaaataacctgtctgatgttatcgttgtat 472
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 477 ttgccctgcaggcaaatgaagttgttaaagcaaataacctgtctgatgttatcgttgtat 536
Query: 473 tgcatggacgagttgaggatgttgaaattaatgaagaggtggatgttataatttcagaat 532
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 537 tgcatggacgagttgaggatgttgaaattaatgaagaggtggatgttataatttcagaat 596
Query: 533 ggatgggctatatgcttctatatgagagtatgcttggaagtgttattactgccagagatc 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 597 ggatgggctatatgcttctatatgagagtatgcttggaagtgttattactgccagagatc 656
Query: 593 gttggctcaaacctggcggtcttattcttccttcaagtgcaacgttgtacatggctcctg 652
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 657 gttggctcaaacctggcggtcttattcttccttcaagtgcaacgttgtacatggctcctg 716
Query: 653 ttacacatactgacagatacagtgaaagcgttgacttttggcgcaatgtttatggaattg 712
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 717 ttacacatactgacagatacagtgaaagcgttgacttttggcgcaatgtttatggaattg 776
Query: 713 atatgtccgccatgttatcatta 735
|||||||||||||||||||||||
Sbjct: 777 atatgtccgccatgttatcatta 799
Score = 67.9 bits (34), Expect = 1e-10
Identities = 34/34 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgttctgtaaggagaataatggcaacggctacg 34
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 56 atgttctgtaaggagaataatggcaacggctacg 89