Miyakogusa Predicted Gene

Lj5g3v0279140.1
Show Alignment: 

BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Lj5g3v0279140.1 Non Chatacterized Hit- tr|I3S981|I3S981_LOTJA
Uncharacterized protein OS=Lotus japonicus PE=2 SV=1,98.96,0,seg,NULL;
no description,NAD(P)-binding domain; 3Beta_HSD,3-beta hydroxysteroid
dehydrogenase/isomer,CUFF.52703.1
         (1443 letters)

Database: LJGI 
           47,486 sequences; 32,788,469 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gnl|LJGI|TC58353 similar to UniRef100_A7QPG5 Cluster: Chromosome...  2853   0.0  
gnl|LJGI|TC76013 similar to UniRef100_A7QPG5 Cluster: Chromosome...   488   e-137

>gnl|LJGI|TC58353 similar to UniRef100_A7QPG5 Cluster: Chromosome chr18 scaffold_137,
            whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
            Chromosome chr18 scaffold_137, whole genome shotgun
            sequence - Vitis vinifera (Grape), complete
          Length = 1938

 Score = 2853 bits (1439), Expect = 0.0
 Identities = 1442/1443 (99%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                        
Query: 1    atgcacctgagcgagaacgaaggaatagagggcaagaccttggtggtcacgggtggactc 60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 111  atgcacctgagcgagaacgaaggaatagagggcaagaccttggtggtcacgggtggactc 170

                                                                        
Query: 61   ggattcgtaggatctgctctgtgcttggaactcgtacgaagaggtgctcatgaggtgcga 120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 171  ggattcgtaggatctgctctgtgcttggaactcgtacgaagaggtgctcatgaggtgcga 230

                                                                        
Query: 121  gcctttgacctccgcgactcttctccttggttcgctattctcaaggacaatggagtccgt 180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 231  gcctttgacctccgcgactcttctccttggttcgctattctcaaggacaatggagtccgt 290

                                                                        
Query: 181  tgcattcaaggggatatcgttcgcaaagaggatgtggaaagcgccctccgcggtgccgat 240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 291  tgcattcaaggggatatcgttcgcaaagaggatgtggaaagcgccctccgcggtgccgat 350

                                                                        
Query: 241  tgtgtgttccaccttgctgcttttggaatgtcagggaaagagatgctccaattaactcgt 300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 351  tgtgtgttccaccttgctgcttttggaatgtcagggaaagagatgctccaattaactcgt 410

                                                                        
Query: 301  gttgatcaagtcaacataactgggacttgccatgttcttgatgcttgcctacaccttggc 360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 411  gttgatcaagtcaacataactgggacttgccatgttcttgatgcttgcctacaccttggc 470

                                                                        
Query: 361  atcaaaagacttgtctattgtagcacctacaatgttgtctttgccggtcaacgcatagtc 420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 471  atcaaaagacttgtctattgtagcacctacaatgttgtctttgccggtcaacgcatagtc 530

                                                                        
Query: 421  aacggaaatgagtccttgccttatttccctattgatcaccatgttgatccttatggccgc 480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 531  aacggaaatgagtccttgccttatttccctattgatcaccatgttgatccttatggccgc 590

                                                                        
Query: 481  tctaaatcaattgctgaacagttggttctcaagaacaatgcccgccctttcaagaacgat 540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 591  tctaaatcaattgctgaacagttggttctcaagaacaatgcccgccctttcaagaacgat 650

                                                                        
Query: 541  gctgggaattgtctttacacttgtgctgttcgtccagctgcaatctacggacccggcgaa 600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 651  gctgggaattgtctttacacttgtgctgttcgtccagctgcaatctacggacccggcgaa 710

                                                                        
Query: 601  gacagacaccttccaaggatcataaccacggcaaagttgggtctgcttctgttcacaatt 660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 711  gacagacaccttccaaggatcataaccacggcaaagttgggtctgcttctgttcacaatt 770

                                                                        
Query: 661  ggcgaccaaactgtaaaatcagattgggtttttgtagagaaccttgtccttgcccttata 720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 771  ggcgaccaaactgtaaaatcagattgggtttttgtagagaaccttgtccttgcccttata 830

                                                                        
Query: 721  ttggcaagcatgggacttctggatgacagtgctggcaagggaaaacaacgccctatagct 780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 831  ttggcaagcatgggacttctggatgacagtgctggcaagggaaaacaacgccctatagct 890

                                                                        
Query: 781  gctggccaggcatactttatatccgatggttcacctgtcaatacttttgaattcctccaa 840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 891  gctggccaggcatactttatatccgatggttcacctgtcaatacttttgaattcctccaa 950

                                                                        
Query: 841  cctctactcaggagcttggaatatgaactgcccaaaacttccttagctgttgaccatgct 900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 951  cctctactcaggagcttggaatatgaactgcccaaaacttccttagctgttgaccatgct 1010

                                                                        
Query: 901  cttgttctcgggaggatttgccagggcgtttatacaatcttatatccatggcttgaccgc 960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1011 cttgttctcgggaggatttgccagggcgtttatacaatcttatatccatggcttgaccgc 1070

                                                                        
Query: 961  tggtggctccctcagccattcatccttccctctgaagtacacaaggtgggggtgacccac 1020
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1071 tggtggctccctcagccattcatccttccctctgaagtacacaaggtgggggtgacccac 1130

                                                                        
Query: 1021 tatttctcttatcttaaagccaaagaagagattggctatgttcccatggtgagctcgcga 1080
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 1131 tatttctcttatcttaaagccaaagaagagattggctatgttcccatggcgagctcgcga 1190

                                                                        
Query: 1081 gaggggatggcttcgaccatatcttactggcaacagaggaaaatgataactctagatggc 1140
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1191 gaggggatggcttcgaccatatcttactggcaacagaggaaaatgataactctagatggc 1250

                                                                        
Query: 1141 cctacgatctacacgtggttgttttgtgtcattggaatgatctctctgttttgtgctgct 1200
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1251 cctacgatctacacgtggttgttttgtgtcattggaatgatctctctgttttgtgctgct 1310

                                                                        
Query: 1201 ttcctacctgacgtagggattgtgttccttctcagagctacgagtctatttgtctttcgg 1260
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1311 ttcctacctgacgtagggattgtgttccttctcagagctacgagtctatttgtctttcgg 1370

                                                                        
Query: 1261 tcaatgtggatgataaggctggtgtttattctagcaacagctgctcatgtctttgaggca 1320
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1371 tcaatgtggatgataaggctggtgtttattctagcaacagctgctcatgtctttgaggca 1430

                                                                        
Query: 1321 atttatgcttggtacctggctaaaagggtggatcatgctaatgcaagaggctggttttgg 1380
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1431 atttatgcttggtacctggctaaaagggtggatcatgctaatgcaagaggctggttttgg 1490

                                                                        
Query: 1381 caaacttttgctcttgggtatttttcattgcgttttctacttaaaagagcaaggaaataa 1440
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1491 caaacttttgctcttgggtatttttcattgcgttttctacttaaaagagcaaggaaataa 1550

               
Query: 1441 atg 1443
            |||
Sbjct: 1551 atg 1553


>gnl|LJGI|TC76013 similar to UniRef100_A7QPG5 Cluster: Chromosome chr18 scaffold_137,
            whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
            Chromosome chr18 scaffold_137, whole genome shotgun
            sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (17%)
          Length = 703

 Score =  488 bits (246), Expect = e-137
 Identities = 246/246 (100%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                        
Query: 1198 gctttcctacctgacgtagggattgtgttccttctcagagctacgagtctatttgtcttt 1257
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1    gctttcctacctgacgtagggattgtgttccttctcagagctacgagtctatttgtcttt 60

                                                                        
Query: 1258 cggtcaatgtggatgataaggctggtgtttattctagcaacagctgctcatgtctttgag 1317
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61   cggtcaatgtggatgataaggctggtgtttattctagcaacagctgctcatgtctttgag 120

                                                                        
Query: 1318 gcaatttatgcttggtacctggctaaaagggtggatcatgctaatgcaagaggctggttt 1377
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121  gcaatttatgcttggtacctggctaaaagggtggatcatgctaatgcaagaggctggttt 180

                                                                        
Query: 1378 tggcaaacttttgctcttgggtatttttcattgcgttttctacttaaaagagcaaggaaa 1437
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181  tggcaaacttttgctcttgggtatttttcattgcgttttctacttaaaagagcaaggaaa 240

                  
Query: 1438 taaatg 1443
            ||||||
Sbjct: 241  taaatg 246