Miyakogusa Predicted Gene
- Lj4g3v3114350.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj4g3v3114350.1 Non Chatacterized Hit- tr|H2N132|H2N132_ORYLA
Uncharacterized protein OS=Oryzias latipes GN=PEX3
PE=,26.77,1e-18,coiled-coil,NULL; Peroxin-3,Peroxin-3; AMINO ACID
TRANSPORTER,NULL;
seg,NULL,NODE_34779_length_2096_cov_29.596851.path2.1
(1110 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC78846 similar to UniRef100_A7PH34 Cluster: Chromosome... 2151 0.0
>gnl|LJGI|TC78846 similar to UniRef100_A7PH34 Cluster: Chromosome chr17 scaffold_16,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr17 scaffold_16, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (84%)
Length = 1676
Score = 2151 bits (1085), Expect = 0.0
Identities = 1102/1110 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgctttctgtcagggatttttggaggcgccataggaggaagctttatcttacagctggt 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 250 atgctttctgtcagggatttttggaggcgccataggaggaagctttatcttacagctggt 309
Query: 61 gtttttggtggtggctattttttgtataagctttatgatactcacaggcaaaggctccat 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 310 gtttttggtggtggctattttttgtataagctttatgatactcacaggcaaaggctccat 369
Query: 121 gcacttgagagggaactccaacttcagagggaaagtgaggagcttatcaaggctcagata 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 370 gcacttgagagggaactccaacttcagagggaaagtgaggagcttatcaaggctcagata 429
Query: 181 caagctcactttgagaatattcagagaatttctgataccattacattgcctcatgctatg 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 430 caagctcactttgagaatattcagagaatttctgataccattacattgcctcatgctatg 489
Query: 241 cacaacttgagttgccggatagcacaagagttggatctttctcaccttctcgagaggcta 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 490 cacaacttgagttgccggatagcacaagagttggatctttctcaccttctcgagaggcta 549
Query: 301 atacaaggaaagggtcagccaaccaccttaacacaatcagagaaactagatttatgggga 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 550 atacaaggaaagggtcagccaaccaccttaacacaatcagagaaactagatttatgggga 609
Query: 361 aaactcaaaattttaagttttacacgaatggcattgtcaatatgggcaacaatactgctt 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 610 aaactcaaaattttaagttttacacgaatggcattgtcaatatgggcaacaatactgctt 669
Query: 421 agcttatatacaaaagttcaagtcaatatactaggaaggcatctatacattgatactgca 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 670 agcttatatacaaaagttcaagtcaatatactaggaaggcatctatacattgatactgca 729
Query: 481 cggaaccttggaatatctaattcaatggaaagcggagatgtggttgatagggaggaccag 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 730 cggaaccttggaatatctaattcaatggaaagcggagatgtggttgatagggaggaccag 789
Query: 541 cagaaatttctaggaactgctgattttctctctcaacatggtatgcctgccttgatttct 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 790 cagaaatttctaggaactgctgattttctctctcaacatggtatgcctgccttgatttct 849
Query: 601 gacatggaggcagcaacgaaagaagttatcaaaggaaagcaattgagcagtttattcaac 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 850 gacatggaggcagcaacgaaagaagttatcaaaggaaagcaattgagcagtttattcaac 909
Query: 661 aacacaacacttcatgaaactatcatgcagattctcgacaccttcatgagtatggggagt 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 910 aacacaacacttcatgaaactatcatgcagattctcgacaccttcatgagtatggggagt 969
Query: 721 ccacattcctggataaagtatatgatgcctgaggatgttagatcacactctattaccgct 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 970 ccacattcctggataaagtatatgatgcctgaggatgttagatcacactctattaccgct 1029
Query: 781 ggcaatgatgaaacagttccatatgatgtgactgaatttgaacaacttatggtggaagtg 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1030 ggcaatgatgaaacagttccatatgatgtgactgaatttgaacaacttatggtggaagtg 1089
Query: 841 cgtgcagtattgtcaagcgctgaatttgggagcattgtagagatagctctgaaagttgtg 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1090 cgtgcagtattgtcaagcgctgaatttgggagcattgtagagatagctctgaaagttgtg 1149
Query: 901 gtggataaactggtggagctcatgggggctaaatttggagggaatttaaccacaggcttg 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1150 gtggataaactggtggagctcatgggggctaaatttggagggaatttaaccacaggcttg 1209
Query: 961 ccgctggccagagtattgcctcaagttgcacagatgtgtcctttcctccttgaagaaccc 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1210 ccgctggccagagtattgcctcaagttgcacagatgtgtcctttcctccttgaagaaccc 1269
Query: 1021 agcaagaatcagttcatccaagttattaaaaatatgcaagaggttgaacnnnnnnncact 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 1270 agcaagaatcagttcatccaagttattaaaaatatgcaagaggttgaactttttttcact 1329
Query: 1081 ctcctctatgcaaacatgccaagtgcatag 1110
||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1330 ctcctatatgcaaacatgccaagtgcatag 1359