Miyakogusa Predicted Gene
- Lj4g3v2717180.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj4g3v2717180.1 CUFF.51555.1
(1731 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC63613 similar to UniRef100_A7P476 Cluster: Chromosome... 1562 0.0
gnl|LJGI|GO010749 similar to UniRef100_A7P476 Cluster: Chromosom... 1172 0.0
gnl|LJGI|TC70162 similar to UniRef100_A7P476 Cluster: Chromosome... 918 0.0
gnl|LJGI|TC65343 weakly similar to UniRef100_A7P476 Cluster: Chr... 850 0.0
>gnl|LJGI|TC63613 similar to UniRef100_A7P476 Cluster: Chromosome chr1 scaffold_5,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr1 scaffold_5, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (40%)
Length = 792
Score = 1562 bits (788), Expect = 0.0
Identities = 791/792 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 16 gctaatgctatgatgggaaacaaacacgaaatgatgggtagttggcggtggtggtgcaca 75
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 gctaatgctatgatgggaaacaaacacgaaatgatgggtagttggcggtggtggtgcaca 60
Query: 76 ttaatattattcaatcttctaataatcacaccggaagtagttaagccggtggtggccgtg 135
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 ttaatattattcaatcttctaataatcacaccggaagtagttaagccggtggtggccgtg 120
Query: 136 gcgggtgttccacttaacacaaattcacggtggatcgtgaaccaggatgggctgagggtg 195
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ccgggtgttccacttaacacaaattcacggtggatcgtgaaccaggatgggctgagggtg 180
Query: 196 aagctggcgtgtgtaaattgggtgtctcatctggatgcggtggtggcggaggggctgagc 255
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 aagctggcgtgtgtaaattgggtgtctcatctggatgcggtggtggcggaggggctgagc 240
Query: 256 aagcagcccgtggatgtaatttcaaagggaataaagtccatgggctttaactgtgtcagg 315
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 aagcagcccgtggatgtaatttcaaagggaataaagtccatgggctttaactgtgtcagg 300
Query: 316 ctcacttggcccattctcctcgtcaccaatgactctctttcttctctcactgttaggcaa 375
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ctcacttggcccattctcctcgtcaccaatgactctctttcttctctcactgttaggcaa 360
Query: 376 tcctttcagaatcttggcctccttgattctgttgctggtgtccaagccaacaacccctcc 435
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 tcctttcagaatcttggcctccttgattctgttgctggtgtccaagccaacaacccctcc 420
Query: 436 atcattgatctcaccctcatccaagctttccaggcagtggtgaagagtcttggggacaat 495
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 atcattgatctcaccctcatccaagctttccaggcagtggtgaagagtcttggggacaat 480
Query: 496 gatgtgatggcaattttggacaaccacataacccagccagggtggtgctgcagcaattcg 555
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 gatgtgatggcaattttggacaaccacataacccagccagggtggtgctgcagcaattcg 540
Query: 556 gatggcaatgggttctttggtgaccaatttttcgacccggaccagtggatcttgggccta 615
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gatggcaatgggttctttggtgaccaatttttcgacccggaccagtggatcttgggccta 600
Query: 616 accaaaatggccactcttttcaatggagtgcctaatgtggtgggcatgagcttgaggaat 675
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 accaaaatggccactcttttcaatggagtgcctaatgtggtgggcatgagcttgaggaat 660
Query: 676 gagctccgaggcccaaaacaaaatgtcaatgattggtacaggtacatggtgaaaggagca 735
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 gagctccgaggcccaaaacaaaatgtcaatgattggtacaggtacatggtgaaaggagca 720
Query: 736 gaagcggttcatgcagcaaacccagatgttcttgtcattctatctggtctaaactttgac 795
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 gaagcggttcatgcagcaaacccagatgttcttgtcattctatctggtctaaactttgac 780
Query: 796 aaggacttgtcg 807
||||||||||||
Sbjct: 781 aaggacttgtcg 792
>gnl|LJGI|GO010749 similar to UniRef100_A7P476 Cluster: Chromosome chr1 scaffold_5,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr1 scaffold_5, whole genome shotgun sequence
- Vitis vinifera (Grape), partial (33%)
Length = 659
Score = 1172 bits (591), Expect = 0.0
Identities = 591/591 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 466 caggcagtggtgaagagtcttggggacaatgatgtgatggcaattttggacaaccacata 525
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 69 caggcagtggtgaagagtcttggggacaatgatgtgatggcaattttggacaaccacata 128
Query: 526 acccagccagggtggtgctgcagcaattcggatggcaatgggttctttggtgaccaattt 585
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 129 acccagccagggtggtgctgcagcaattcggatggcaatgggttctttggtgaccaattt 188
Query: 586 ttcgacccggaccagtggatcttgggcctaaccaaaatggccactcttttcaatggagtg 645
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 189 ttcgacccggaccagtggatcttgggcctaaccaaaatggccactcttttcaatggagtg 248
Query: 646 cctaatgtggtgggcatgagcttgaggaatgagctccgaggcccaaaacaaaatgtcaat 705
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 249 cctaatgtggtgggcatgagcttgaggaatgagctccgaggcccaaaacaaaatgtcaat 308
Query: 706 gattggtacaggtacatggtgaaaggagcagaagcggttcatgcagcaaacccagatgtt 765
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 309 gattggtacaggtacatggtgaaaggagcagaagcggttcatgcagcaaacccagatgtt 368
Query: 766 cttgtcattctatctggtctaaactttgacaaggacttgtcgttcattaagaatagacca 825
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 369 cttgtcattctatctggtctaaactttgacaaggacttgtcgttcattaagaatagacca 428
Query: 826 gtgaatctcacattcaaggggaaactagtatatgaggcacattggtatggcttcactgat 885
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 429 gtgaatctcacattcaaggggaaactagtatatgaggcacattggtatggcttcactgat 488
Query: 886 ggtcaagcttgggtatcagggaacccaaaccaagtgtgtggtcaagtggctgggaacatg 945
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 489 ggtcaagcttgggtatcagggaacccaaaccaagtgtgtggtcaagtggctgggaacatg 548
Query: 946 aagagaacctctggcttcttggtggaccaaggttggccattgtttgtgagtgagtttggt 1005
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 549 aagagaacctctggcttcttggtggaccaaggttggccattgtttgtgagtgagtttggt 608
Query: 1006 gtggacttgagaggttcaaacgtgaacgacaaccgctaccttaactgtttc 1056
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 609 gtggacttgagaggttcaaacgtgaacgacaaccgctaccttaactgtttc 659
>gnl|LJGI|TC70162 similar to UniRef100_A7P476 Cluster: Chromosome chr1 scaffold_5,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr1 scaffold_5, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (20%)
Length = 568
Score = 918 bits (463), Expect = 0.0
Identities = 463/463 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 7 atatcatatgctaatgctatgatgggaaacaaacacgaaatgatgggtagttggcggtgg 66
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3 atatcatatgctaatgctatgatgggaaacaaacacgaaatgatgggtagttggcggtgg 62
Query: 67 tggtgcacattaatattattcaatcttctaataatcacaccggaagtagttaagccggtg 126
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 63 tggtgcacattaatattattcaatcttctaataatcacaccggaagtagttaagccggtg 122
Query: 127 gtggccgtggcgggtgttccacttaacacaaattcacggtggatcgtgaaccaggatggg 186
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 123 gtggccgtggcgggtgttccacttaacacaaattcacggtggatcgtgaaccaggatggg 182
Query: 187 ctgagggtgaagctggcgtgtgtaaattgggtgtctcatctggatgcggtggtggcggag 246
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 183 ctgagggtgaagctggcgtgtgtaaattgggtgtctcatctggatgcggtggtggcggag 242
Query: 247 gggctgagcaagcagcccgtggatgtaatttcaaagggaataaagtccatgggctttaac 306
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 243 gggctgagcaagcagcccgtggatgtaatttcaaagggaataaagtccatgggctttaac 302
Query: 307 tgtgtcaggctcacttggcccattctcctcgtcaccaatgactctctttcttctctcact 366
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 303 tgtgtcaggctcacttggcccattctcctcgtcaccaatgactctctttcttctctcact 362
Query: 367 gttaggcaatcctttcagaatcttggcctccttgattctgttgctggtgtccaagccaac 426
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 363 gttaggcaatcctttcagaatcttggcctccttgattctgttgctggtgtccaagccaac 422
Query: 427 aacccctccatcattgatctcaccctcatccaagctttccagg 469
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 423 aacccctccatcattgatctcaccctcatccaagctttccagg 465
>gnl|LJGI|TC65343 weakly similar to UniRef100_A7P476 Cluster: Chromosome chr1
scaffold_5, whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis
vinifera|Rep: Chromosome chr1 scaffold_5, whole genome
shotgun sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (20%)
Length = 688
Score = 850 bits (429), Expect = 0.0
Identities = 432/433 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1299 tgtcacaagaaagtcattgctagagccactaacattaggtccttgctctttttctgatgg 1358
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 tgtcacaagaaagtcattgctagagccactaacattaggtccttgctctttttctgatgg 60
Query: 1359 ttggaattacacaccccagaagaccctatcaataaagggaacctacttttgcatacaagc 1418
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 61 ttggaattacacaccccagaagaccctatcaataaagggaatctacttttgcatacaagc 120
Query: 1419 agagaatgaagggatgcctgcaaaacttagcataatatgctcgggtcctaacaataaatg 1478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 agagaatgaagggatgcctgcaaaacttagcataatatgctcgggtcctaacaataaatg 180
Query: 1479 ggaaatgatctcagattcaaaattgcacctttcatctaaagtcaacaatggttctagtgt 1538
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ggaaatgatctcagattcaaaattgcacctttcatctaaagtcaacaatggttctagtgt 240
Query: 1539 ttgtctagatgttgatgaaaacaacaacattgtgaccaactcttgtaaatgcttgagcag 1598
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 ttgtctagatgttgatgaaaacaacaacattgtgaccaactcttgtaaatgcttgagcag 300
Query: 1599 agatgtaaagtgtgacccaggaagccaatggttcaaactcattgacagtggaagaaggtc 1658
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 agatgtaaagtgtgacccaggaagccaatggttcaaactcattgacagtggaagaaggtc 360
Query: 1659 aatgtccacaacttcagcattgtccatgctgaatttaccagacctgttatggaaaccttt 1718
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 aatgtccacaacttcagcattgtccatgctgaatttaccagacctgttatggaaaccttt 420
Query: 1719 gagctcatcataa 1731
|||||||||||||
Sbjct: 421 gagctcatcataa 433