Miyakogusa Predicted Gene
- Lj4g3v2628840.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj4g3v2628840.1 Non Chatacterized Hit- tr|I3SJQ0|I3SJQ0_LOTJA
Uncharacterized protein OS=Lotus japonicus PE=2 SV=1,99.43,0,no
description,NULL; UNCHARACTERIZED,NULL; SH2 DOMAIN ADAPTOR
PROTEIN,NULL; Src homology,Src homolog,CUFF.51374.1
(1053 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC62334 similar to UniRef100_A5Y731 Cluster: Src homolo... 2072 0.0
gnl|LJGI|GO009067 similar to UniRef100_A5Y731 Cluster: Src homol... 884 0.0
>gnl|LJGI|TC62334 similar to UniRef100_A5Y731 Cluster: Src homology-3 domain protein 3;
n=1; Cucumis melo|Rep: Src homology-3 domain protein 3 -
Cucumis melo (Muskmelon), partial (97%)
Length = 1487
Score = 2072 bits (1045), Expect = 0.0
Identities = 1051/1053 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggatgctttgagaaaacaagccagcaagctcagagagcaagtttccaaacaacagcag 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 182 atggatgctttgagaaaacaagccagcaagctcagagagcaagtttccaaacaacagcag 241
Query: 61 ttgcaggctgtaataaagcagttcagcactagtggttatgagagctcagatgttgttgtc 120
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 242 ttgcaggctgtaataaagcagttcagcactagtggttatgagagctcagatgttgtggtc 301
Query: 121 attgatgagggtgaaatgcagatacatcaacagctggaaaagctgtacaaggccacccgt 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 302 attgatgagggtgaaatgcagatacatcaacagctggaaaagctgtacaaggccacccgt 361
Query: 181 acaatgagggactttcaaaaagaaatcgtaaaagcagcagagacatttacagctataggt 240
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 362 acaatgagggaatttcaaaaagaaatcgtaaaagcagcagagacatttacagctataggt 421
Query: 241 tataaacatattgaaacaggaacgaaactttctgaggattgctgtaaatatggagcagaa 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 422 tataaacatattgaaacaggaacgaaactttctgaggattgctgtaaatatggagcagaa 481
Query: 301 aacaacattgacaacatattggcaaaggctgcatcagtattaggtgatgctcgcaaacat 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 482 aacaacattgacaacatattggcaaaggctgcatcagtattaggtgatgctcgcaaacat 541
Query: 361 gtagaaaaggagcacgaagaattaaatcggcttttagcttcccaggttttggatcctttg 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 542 gtagaaaaggagcacgaagaattaaatcggcttttagcttcccaggttttggatcctttg 601
Query: 421 agacaaatgatcaatggcgtacctttggaggatgctcgccaccttgctcaacggtatagc 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 602 agacaaatgatcaatggcgtacctttggaggatgctcgccaccttgctcaacggtatagc 661
Query: 481 cggatgagacaagaagcagagacactgagggaggagatctctaaaagacaagtacgggtt 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 662 cggatgagacaagaagcagagacactgagggaggagatctctaaaagacaagtacgggtt 721
Query: 541 agggaatctccaacttccgaacaggttgccaaactgcatgctgctgaggcaaggatgaag 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 722 agggaatctccaacttccgaacaggttgccaaactgcatgctgctgaggcaaggatgaag 781
Query: 601 gagctgaaagcaaatatggctgtcctgggcaaggaagctgcagctgcattggcttctgtt 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 782 gagctgaaagcaaatatggctgtcctgggcaaggaagctgcagctgcattggcttctgtt 841
Query: 661 gatgcacaacagcagaggctgacttttcaaaggcttgttgctatggttgaaggtgaaaag 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 842 gatgcacaacagcagaggctgacttttcaaaggcttgttgctatggttgaaggtgaaaag 901
Query: 721 actttccatttaagagttgcagctattcttggtgaaattgaagctgagatggtctctgac 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 902 actttccatttaagagttgcagctattcttggtgaaattgaagctgagatggtctctgac 961
Query: 781 agacagaagaaagaatctgcccctccagtggttgtgtctgagaatggctcagggaaaacg 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 962 agacagaagaaagaatctgcccctccagtggttgtgtctgagaatggctcagggaaaacg 1021
Query: 841 atgtacttcttggctgaagcaacacatcccttctatggtgattcagaaaaggaactaagc 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1022 atgtacttcttggctgaagcaacacatcccttctatggtgattcagaaaaggaactaagc 1081
Query: 901 ttttcaaagggtgactttattgttgtgcgaaaggtgactccaacagggtggtccgaagga 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1082 ttttcaaagggtgactttattgttgtgcgaaaggtgactccaacagggtggtccgaagga 1141
Query: 961 gaatgcaatggtaaagcagggtggtttccttctgcatatgtggagaagcgacaaagagtc 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1142 gaatgcaatggtaaagcagggtggtttccttctgcatatgtggagaagcgacaaagagtc 1201
Query: 1021 ccctctagcaacttttctagtgaagtttactag 1053
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1202 ccctctagcaacttttctagtgaagtttactag 1234
>gnl|LJGI|GO009067 similar to UniRef100_A5Y731 Cluster: Src homology-3 domain protein 3;
n=1; Cucumis melo|Rep: Src homology-3 domain protein 3 -
Cucumis melo (Muskmelon), partial (41%)
Length = 737
Score = 884 bits (446), Expect = 0.0
Identities = 452/454 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 600 ggagctgaaagcaaatatggctgtcctgggcaaggaagctgcagctgcattggcttctgt 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2 ggagctgaaagcaaatatggctgtcctgggcaaggaagctgcagctgcattggcttctgt 61
Query: 660 tgatgcacaacagcagaggctgacttttcaaaggcttgttgctatggttgaaggtgaaaa 719
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 62 tgatgcgcaacagcagaggctgacttttcaaaggcttgttgctatggctgaaggtgaaaa 121
Query: 720 gactttccatttaagagttgcagctattcttggtgaaattgaagctgagatggtctctga 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 122 gactttccatttaagagttgcagctattcttggtgaaattgaagctgagatggtctctga 181
Query: 780 cagacagaagaaagaatctgcccctccagtggttgtgtctgagaatggctcagggaaaac 839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 182 cagacagaagaaagaatctgcccctccagtggttgtgtctgagaatggctcagggaaaac 241
Query: 840 gatgtacttcttggctgaagcaacacatcccttctatggtgattcagaaaaggaactaag 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 242 gatgtacttcttggctgaagcaacacatcccttctatggtgattcagaaaaggaactaag 301
Query: 900 cttttcaaagggtgactttattgttgtgcgaaaggtgactccaacagggtggtccgaagg 959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 302 cttttcaaagggtgactttattgttgtgcgaaaggtgactccaacagggtggtccgaagg 361
Query: 960 agaatgcaatggtaaagcagggtggtttccttctgcatatgtggagaagcgacaaagagt 1019
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 362 agaatgcaatggtaaagcagggtggtttccttctgcatatgtggagaagcgacaaagagt 421
Query: 1020 cccctctagcaacttttctagtgaagtttactag 1053
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 422 cccctctagcaacttttctagtgaagtttactag 455