Miyakogusa Predicted Gene
- Lj4g3v2313530.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj4g3v2313530.1 CUFF.50839.1
(1413 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC57768 similar to UniRef100_Q38IW9 Cluster: Ornithine ... 2436 0.0
gnl|LJGI|TC57746 similar to UniRef100_Q38IW9 Cluster: Ornithine ... 1671 0.0
gnl|LJGI|GO005718 similar to UniRef100_Q38IW9 Cluster: Ornithine... 1057 0.0
gnl|LJGI|AU088859 similar to UniRef100_Q38IW9 Cluster: Ornithine... 795 0.0
gnl|LJGI|BP049692 similar to UniRef100_Q8GUA8 Cluster: Ornithine... 262 5e-69
gnl|LJGI|TC81817 homologue to UniRef100_A8GCC7 Cluster: Threonin... 230 2e-59
>gnl|LJGI|TC57768 similar to UniRef100_Q38IW9 Cluster: Ornithine aminotransferase; n=1;
Glycine max|Rep: Ornithine aminotransferase - Glycine max
(Soybean), partial (90%)
Length = 1603
Score = 2436 bits (1229), Expect = 0.0
Identities = 1262/1273 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 141 ttaccatccacttcccattgtattttctcaagcaaagggagcttgtgtatgggatccaga 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 72 ttaccatccacttcccattgtattttctcaagcaaagggagcttgtgtatgggatccaga 131
Query: 201 ggggaacaagtatattgattttctatctggttactctgctgttaatcagggacattgcca 260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 132 ggggaacaagtatattgattttctatctggttactctgctgttaatcagggacattgcca 191
Query: 261 tcctaaaattctgaaagcattacaagagcaggcagaaagcctgactgtgagttcccgagc 320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 192 tcctaaaattctgaaagcattacaagagcaggcagaaagcctgactgtgagttcccgagc 251
Query: 321 cttctacaatgatcgctttccgctgtttgctgagtatgtgaccaacatgtttggttatga 380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 252 cttctacaatgatcgctttccgctgtttgctgagtatgtgaccaacatgtttggttatga 311
Query: 381 tatggtgcttcctatgaataccggtgctgaaggtgtggaaacagctatgaaattagcaag 440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 312 tatggtgcttcctatgaataccggtgctgaaggtgtggaaacagctatgaaattagcaag 371
Query: 441 gaagtggggttatgaaaagaaaaggattcccaataatgaggctcttatcgtctcatgctg 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 372 gaagtggggttatgaaaagaaaaggattcccaataatgaggctcttatcgtctcatgctg 431
Query: 501 tggctgctttaatggtcgtacactaggtgtcatatctatgagctgtgacaatgaagctac 560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 432 tggctgctttaatggtcgtacactaggtgtcatatctatgagctgtgacaatgaagctac 491
Query: 561 ccggggttttggtcctttaatgccaggcaatcttaaagttgattttggtgatgcagaggc 620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 492 ccggggttttggtcctttaatgccaggcaatcttaaagttgattttggtgatgcagaggc 551
Query: 621 cctcgaaagaatttttaaagaacatggagacaaaatagctggatttattttagaacctat 680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 552 cctcgaaagaatttttaaagaacatggagacaaaatagctggatttattttagaacctat 611
Query: 681 tcaaggtgaagctgggatcaaaatccctccagttggctatttgaaagctgtaagagatct 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 612 tcaaggtgaagctgggatcaaaatccctccagttggctatttgaaagctgtaagagatct 671
Query: 741 ttgctccaaatataatgtgttgatgattgctgatgaaatccaatctggattaggaagagc 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 672 ttgctccaaatataatgtgttgatgattgctgatgaaatccaatctggattaggaagagc 731
Query: 801 agggaagatgctggcttgtgactgggaagatgtccgtcccgatgtagtgatactggcaaa 860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 732 agggaagatgctggcttgtgactgggaagatgtccgtcccgatgtagtgatactggcaaa 791
Query: 861 agcattgggtggtggaattttaccagttagtgcagttcttgcagacaaagatgtcatgct 920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 792 agcattgggtggtggaattttaccagttagtgcagttcttgcagacaaagatgtcatgct 851
Query: 921 ttgtataaaacctggacagcatggaagtacctttgggggaaatccattggccagtgcagt 980
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 852 ttgtataaaacctggacagcatggaagtacctttgggggaaatccattggccagtgcagt 911
Query: 981 tgctattgcctcactagatgtgatcaaggaggagagacttgtagagagatctgcccaaat 1040
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 912 tgctattgcctcactagatgtgatcaaggaggagagacttgtagagagatctgcccaaat 971
Query: 1041 gggagaggagcttcttaatcagctgcgtaagattcagcagaaattcccggatcacgtgaa 1100
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 972 gggagaggagcttcttaatcagctgcgtaagattcagcagaaattcccggatcatgtgaa 1031
Query: 1101 ggaagtccggggcaaaggattattcattggactggagcttaacagcaaaaggttattccc 1160
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 1032 ggaagtccgaggcaaaggattattcattggactggagcttaacagcaaaagtttattccc 1091
Query: 1161 tgtatcaggctttgagttaagtgataaacttaaggatagaggagtccttgccaagccaac 1220
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1092 tgtatcaggctttgagttaagtgaaaaacttaaggacagaggagtccttgccaagccaac 1151
Query: 1221 acatgatacaattattcgctttactccccctctctgtataagtcgggatgagattctgga 1280
||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1152 acatgatacaattatccgctttactcccccactctgcataagtcgggatgagattctgga 1211
Query: 1281 agcttctaaggccctgtctgatgttctggaaactgatctgccaaagttgctgaagatgaa 1340
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1212 agcctctaaggccctgtctgatgttctggaaactgatctgccaaagttgctgaagatgaa 1271
Query: 1341 gccaaaggatgctgctcctccagctgcccctgaagcatgtgatcgctgtggtcgagtctt 1400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 1272 gccaaaggatgctgctcctccagctgcccctgaagcatgcgatcgctgtggtcgagtctt 1331
Query: 1401 gtatggttagacc 1413
|||| ||||||||
Sbjct: 1332 gtatagttagacc 1344
>gnl|LJGI|TC57746 similar to UniRef100_Q38IW9 Cluster: Ornithine aminotransferase;
n=1; Glycine max|Rep: Ornithine aminotransferase -
Glycine max (Soybean), partial (67%)
Length = 1188
Score = 1671 bits (843), Expect = 0.0
Identities = 921/947 (97%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggctaccatgagacaagttcagtgtttgatgcgaagaatttccagaggaagtaggagt 60
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 53 atggctaccatgagacaagttcagtgtttgatgcgaagaatttccagaggaagtagaagc 112
Query: 61 tatggggtcgccacacaactcaacgcttcttcctcttctcagacagtgattgacaaggag 120
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||
Sbjct: 113 tatggggtcgccacacaactcaatgcttcttcctcttcccaggcagtgattgacaaggag 172
Query: 121 tataagcacagtgcccacaattaccatccacttcccattgtattttctcaagcaaaggga 180
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 173 tatcagcacagtgcccacaattaccatccacttcccattgtgttttctcaagcaaagggg 232
Query: 181 gcttgtgtatgggatccagaggggaacaagtatattgattttctatctggttactctgct 240
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 233 gcttgtgtatgggatccagaggggaacaagtacattgattttctatctggttactctgct 292
Query: 241 gttaatcagggacattgccatcctaaaattctgaaagcattacaagagcaggcagaaagc 300
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||
Sbjct: 293 gttaatcagggacattgccatcctaaaattctgaaagcattaacagaacaggcagaaagg 352
Query: 301 ctgactgtgagttcccgagccttctacaatgatcgctttccgctgtttgctgagtatgtg 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 353 ctgactgtgagttcccgagccttctacaatgatcgctttccgctgtttgctgagtatgtg 412
Query: 361 accaacatgtttggttatgatatggtgcttcctatgaataccggtgctgaaggtgtggaa 420
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 413 accagcatgtttggttatgatatggtgcttcctatgaataccggtgctgaaggtgtggaa 472
Query: 421 acagctatgaaattagcaaggaagtggggttatgaaaagaaaaggattcccaataatgag 480
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 473 acatctatgaaattagcaaggaagtggggttatgaaaagaaacggattcccaataatgag 532
Query: 481 gctcttatcgtctcatgctgtggctgctttaatggtcgtacactaggtgtcatatctatg 540
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 533 gctcttatcgtctcatgctgtggttgcttcaatggccgtacactaggtgtcatatctatg 592
Query: 541 agctgtgacaatgaagctacccggggttttggtcctttaatgccaggcaatcttaaagtt 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 593 agctgtgacaatgaagctacccggggttttggtcctttaatgccaggcattcttaaagtt 652
Query: 601 gattttggtgatgcagaggccctcgaaagaatttttaaagaacatggagacaaaatagct 660
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 653 gattttggtgatgcagaggcccttgaaagaatttttaaagaacatggagacaaaatagct 712
Query: 661 ggatttattttagaacctattcaaggtgaagctgggatcaaaatccctccagttggctat 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 713 ggatttattttagaacctattcaaggtgaagctgggatcaaaatccctccagttggctat 772
Query: 721 ttgaaagctgtaagagatctttgctccaaatataatgtgttgatgattgctgatgaaatc 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 773 ttgaaagctgtaagagatctttgctccaaatataatgtgttgatgattgctgatgaaatc 832
Query: 781 caatctggattaggaagagcagggaagatgctggcttgtgactgggaagatgtccgtccc 840
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct: 833 caatctggattaggaagagcaggaaagatgctggcttgtgactgggaagatgttcgcccc 892
Query: 841 gatgtagtgatactggcaaaagcattgggtggtggaattttaccagttagtgcagttctt 900
||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 893 gatatagtgatactggcgaaagcattgggtggtggaattttaccagttagtgcagttctt 952
Query: 901 gcagacaaagatgtcatgctttgtataaaacctggacagcatggaag 947
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 953 gcagacaaagatgtcatgctttgtataaaacctggacagcatggaag 999
>gnl|LJGI|GO005718 similar to UniRef100_Q38IW9 Cluster: Ornithine aminotransferase;
n=1; Glycine max|Rep: Ornithine aminotransferase -
Glycine max (Soybean), partial (38%)
Length = 617
Score = 1057 bits (533), Expect = 0.0
Identities = 539/541 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 141 ttaccatccacttcccattgtattttctcaagcaaagggagcttgtgtatgggatccaga 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 77 ttaccatccacttcccattgtattttctcaagcaaagggagcttgtgtatgggatccaga 136
Query: 201 ggggaacaagtatattgattttctatctggttactctgctgttaatcagggacattgcca 260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 137 ggggaacaagtatattgattttctatctggttactctgctgttaatcagggacatcgcca 196
Query: 261 tcctaaaattctgaaagcattacaagagcaggcagaaagcctgactgtgagttcccgagc 320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 tcctaaaattctgaaagcattacaagagcaggcagaaagcctgactgtgagttcccgagc 256
Query: 321 cttctacaatgatcgctttccgctgtttgctgagtatgtgaccaacatgtttggttatga 380
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 257 cttctacaatgatcgctttccgctgtttgctgagtatgtggccaacatgtttggttatga 316
Query: 381 tatggtgcttcctatgaataccggtgctgaaggtgtggaaacagctatgaaattagcaag 440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 tatggtgcttcctatgaataccggtgctgaaggtgtggaaacagctatgaaattagcaag 376
Query: 441 gaagtggggttatgaaaagaaaaggattcccaataatgaggctcttatcgtctcatgctg 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 gaagtggggttatgaaaagaaaaggattcccaataatgaggctcttatcgtctcatgctg 436
Query: 501 tggctgctttaatggtcgtacactaggtgtcatatctatgagctgtgacaatgaagctac 560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 tggctgctttaatggtcgtacactaggtgtcatatctatgagctgtgacaatgaagctac 496
Query: 561 ccggggttttggtcctttaatgccaggcaatcttaaagttgattttggtgatgcagaggc 620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 ccggggttttggtcctttaatgccaggcaatcttaaagttgattttggtgatgcagaggc 556
Query: 621 cctcgaaagaatttttaaagaacatggagacaaaatagctggatttattttagaacctat 680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 557 cctcgaaagaatttttaaagaacatggagacaaaatagctggatttattttagaacctat 616
Query: 681 t 681
|
Sbjct: 617 t 617
>gnl|LJGI|AU088859 similar to UniRef100_Q38IW9 Cluster: Ornithine aminotransferase;
n=1; Glycine max|Rep: Ornithine aminotransferase -
Glycine max (Soybean), partial (36%)
Length = 689
Score = 795 bits (401), Expect = 0.0
Identities = 483/512 (94%), Gaps = 1/512 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 104 cagtgattgacaaggagtataagcacagtgcccacaattaccatccacttcccattgtat 163
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 5 cagtgattgacaaggagtatcagcacagtgcccacaattaccatccacttcccattgtgt 64
Query: 164 tttctcaagcaaagggagcttgtgtatgggatccagaggggaacaagtatattgattttc 223
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 65 tttctcaagcaaagggggcttgtgtatgggatccagangggaacaagtacattgattttc 124
Query: 224 tatctggttactctgctgttaatcagggacattgccatcctaaaattctgaaagcattac 283
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 125 tatctggttactctgctgttaatcagggacattgccatcctaaaattctgaaagcattaa 184
Query: 284 aagagcaggcagaaagcctgactgtgagttcccgagccttctacaatgatcgctttccgc 343
||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 185 cagaacaggcagaaaggctgactgtgagttcccganccttctacaatgatcgctttccgc 244
Query: 344 tgtttgctgagtatgtgaccaacatgtttggttatgatatggtgcttcctatgaataccg 403
|||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 245 tgtttgctgantatgtgaccagcatgtttggttatgatatggtgcttcctatgaataccg 304
Query: 404 gtgctgaaggtgtggaaacagctatgaaattagcaaggaagtggggttatgaaaagaaaa 463
|||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||
Sbjct: 305 gtgctgaaggtgtggaaacatctatgaaattancaangaagtggggttntgaaaanaaac 364
Query: 464 ggattcccaataatgaggctcttatcgtctcatgctgtggctgctttaatggtcgtacac 523
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||
Sbjct: 365 ggattcccaataatgaagctcttatcgtctcatgctgtggttgcttcaatggccgtacac 424
Query: 524 taggtgtcatatctatgagctgtgacaatgaagctaccc-ggggttttggtcctttaatg 582
|| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 425 tangtgtcatatctatgaactgtgacaatgaaactacccnggggttttggtcctttaatg 484
Query: 583 ccaggcaatcttaaagttgattttggtgatgc 614
||| ||| ||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 485 ccaagcattcttaaanttgattttggtgatgc 516
>gnl|LJGI|BP049692 similar to UniRef100_Q8GUA8 Cluster: Ornithine aminotransferase; n=1;
Medicago truncatula|Rep: Ornithine aminotransferase -
Medicago truncatula (Barrel medic), partial (10%)
Length = 401
Score = 262 bits (132), Expect = 5e-69
Identities = 147/152 (96%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1262 gtcgggatgagattctggaagcttctaaggccctgtctgatgttctggaaactgatctgc 1321
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 401 gtcgggatgagattctggaagcctctaaggccctgtctgatgttctggaaactgatctgc 342
Query: 1322 caaagttgctgaagatgaagccaaaggatgctgctcctccagctgcccctgaagcatgtg 1381
| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 341 ccaagttgctgaagatgaagcccaaggatgctgctcctccagctgcccctgaagcatgcg 282
Query: 1382 atcgctgtggtcgagtcttgtatggttagacc 1413
||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 281 atcgctgtggtcgagtcttgtatagttagacc 250
>gnl|LJGI|TC81817 homologue to UniRef100_A8GCC7 Cluster: Threonine aldolase; n=1;
Serratia proteamaculans 568|Rep: Threonine aldolase -
Serratia proteamaculans (strain 568), partial (5%)
Length = 528
Score = 230 bits (116), Expect = 2e-59
Identities = 149/156 (95%), Gaps = 3/156 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1261 agtcgggatgagattctggaagcttctaaggccctgtctgatgttctggaaactgatctg 1320
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 232 agtcgggatgagattctggaagcttctaaggccctgtctgatgttctggatactgatctg 291
Query: 1321 ccaaagttgctgaagatgaagccaaagga-tgctgctcctccagctgcccctga-agcat 1378
|||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 292 ccaagcttgctgaagatgaagcccaaggactgctgctcctccagctgcccctgacagcat 351
Query: 1379 gtga-tcgctgtggtcgagtcttgtatggttagacc 1413
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 352 gtgactcgctgtggtcgagtcttgtatggttagacc 387